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个体化用药的基因诊断—检验医师培养新方向
人类基因组计划(human genome project,HGP)确定、阐明和记录了组成人类基因组的全部DNA序列信息,基因组序列的公布,为传统医学向个体化医疗的转化开启了大门.继人类基因组计划后,国际人类基因组单体型图计划建立了人类全基因组遗传多态图谱,描述了人类基因组中常见遗传多态位点的目录、形式及位置,展现了遗传差异在同一群体内部和不同人群间的分布状况,为疾病的易感性研究及个体化诊疗提供分子基础.个体化用药是个体化治疗的重要组成部分,基因水平研究的不断深入使得以基因为导向的个体化用药从理论走向了现实.
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G蛋白偶联受体激酶4基因多态与原发性高血压关联研究
人类G蛋白偶联受体激酶4基因定位于染色体4p16.3参与机体对血压的调控.本研究采用等位基因特异性聚合酶链反应(PCR)结合实时荧光分析的方法,对中国江苏南通地区93例健康人,102例原发性高血压患者的G蛋白偶联受体激酶4基因变异(GRK4γ)多态位点A486V进行基因分型,探讨GRK4基因多态与原发性高血压的相关性.
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冠心病合并高血压病、糖尿病与载脂蛋白E基因多态性
目的载脂蛋白E(apolipoprotein E,ApoE)是低密度脂蛋白、极低密度脂蛋白和部分高密度脂蛋白的结构蛋白,在脂质代谢中起重要作用.ApoE基因存在多态位点,检测250例不同组合患者及90例对照组ApoE基因型,研究ApoE基因多态性与高血压病(essential hypertension,EH)、2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus,T2DM)及冠心病(coronary heart disease,CHD)的关联.
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GRK4基因多态A486V与原发性高血压关联研究
我们采用等位基因特异性PCR结合实时荧光分析的方法,对中国江苏南通地区326例健康人和342例高血压患者的GRK4基因多态位点A486V进行基因分型,探讨GRK4基因多态与原发性高血压的相关性.
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从青少年起病的成人型糖尿病基因看多基因糖尿病易感性
近年研究表明,单基因糖尿病致病基因的高频多态位点可能影响多基因糖尿病的遗传易感性.这些高频多态本身对基因表达或活性的影响比较微弱甚至并不明显,但可增加个体的糖尿病患病风险.
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荧光定量-聚合酶链反应技术产前快速诊断染色体异常的临床应用
预防重大出生缺陷已经成为社会及每个家庭关注的问题之一.大多数染色体异常为21、13、18号染色体及性染色体的非整倍体异常,占高风险人群的99.8%~99.9%.血清筛查结果为高风险及年龄在35岁以上的孕妇均需进行产前诊断.而产前诊断染色体异常的传统方法是核型分析,染色体核型分析结果一般需要2~3周.荧光定量-聚合酶链反应(FQ-PCR)技术通过对染色体等位基因多态位点上的重复序列扩增来检测染色体数目,24~48 h即可给出诊断结果,缩短了从检测到终止妊娠的时间,为缓解孕妇压力及决定是否终止妊娠争取了宝贵的时间.现将结果报道如下.
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β-纤维蛋白原基因-148C/T和448G/A多态性与脑血栓形成的关系
血浆纤维蛋白原(fibrinogen, FIB)水平升高是动脉血栓性疾病的一个重要独立危险因素,研究发现β链的合成是构成完整FIB分子的限速步骤.目前发现FIB基因中存在20多个多态位点,而与FIB基因表达密切相关的主要成分位于β链转录起始点上游启动子区.目前国内该类报道较少.
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中国汉族人凝血因子Ⅶ基因中三个多态位点的研究
近年来,凝血因子在动脉血栓形成中的地位倍受关注.研究表明,凝血因子Ⅶ(FⅦ)是动脉血栓形成的危险因子[1].遗传因素与环境因素对FⅦ有很大影响,遗传因素主要是FⅦ基因内的几个多态位点:FⅦ基因启动子区域0或10 bp的插入(5′F7)、内含子7中的可变数目串联重复序列(IVS7)及FⅦ蛋白催化区域353位谷氨酰胺代替精氨酸(R353Q).目前尚未见到中国人FⅦ基因内各个多态位点等位基因频率及基因型频率的系统报道,我们用PCR技术结合酶切方法进行了这方面的研究.
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大气污染程度与哮喘病人GSTP1基因多态性
支气管哮喘是一种以气道高反应性和慢性炎症为特征的变态反应性疾病,其发病涉及遗传、免疫、环境等诸多因素.目前研究认为该病是由环境因素和基因易感性相互作用而形成的多基因病.外环境致敏物质是哮喘发生的诱因.谷胱苷肽S-转移酶是机体重要的Ⅱ相代谢解毒酶,可分为α(GSTA1)、μ(GSTM1b)、ψ(GSTM1a)、ρ(GSTP1)、δ(GSTT1)等.其中GSTP1在肺泡、肺泡巨噬细胞和支气管中表达量较其它型多[1].目前已知GSTP1基因有2个多态位点,分别位于5号外显子和6号外显子内,并发现5号外显子105位点氨基酸基因多态性与肿瘤、慢性阻塞性肺病(COPD)等疾病易感性有关[2,3].本文通过分析沈阳市大气污染不同地区的哮喘病人和正常对照组GSTP1基因第5外显子多态性(A/G)与哮喘的相关关系,以及与大气污染的交互作用,初步探讨哮喘的发生机制.
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XPG遗传多态位点His46His和His1104Asp与卵巢癌患者铂类药物敏感性关系探讨
目的 探讨核苷酸切除修复基因XPG单核苷酸多态性与卵巢癌患者对铂类药物敏感性的关系.方法 2002年6月至2009年6月在广西医科大学附属肿瘤医院以聚合酶链-限制性片段长度多态性( PCR-RFLP)和DNA序列测定方法检测接受含铂类药物化疗的102例卵巢上皮细胞癌患者的XPGHis46His及XPGHis1104Asp的多态基因型,并比较不同基因型与化疗敏感性的关系.结果 His1104Asp多态性在卵巢癌铂类药物化疗敏感组中分布与耐药组差异无统计学意义(P>0.05).而XPGHis46His在化疗敏感组T/T,T/C,C/C的基因型频率明显高于耐药组(P=0.016),与携带XPG46T/T基因型比较,携带至少一个46C等位基因(即T/C和C/C基因型)的卵巢癌患者对铂类药物化疗敏感性增加3.096倍(95% CI 1.330~7.208).COX风险比例回归模型结果显示XPG遗传多态位点His46 His和His1104Asp不是卵巢上皮癌患者的独立预后因素(P<0.05).结论 核苷酸切除修复系统中XPGHis46His遗传多态可能与卵巢癌患者对铂类药物敏感性相关.
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白细胞介素4受体基因rs3024608、rs1110470、rs3024685多态性与哮喘的相关性研究
哮喘是常见的呼吸道疾病,也是一种多发病,全球约有3亿哮喘患者,其中我国约有2 000万人催患此病[1].随着工业化的进展及生活方式的改变,哮喘发病率和死亡率在大多数国家呈上升趋势,己成为严重的公共卫生问题.然而,哮喘发病机制至今尚不十分清楚.结合文献我们选择白介素4受体(Interleukin-4 receptor,IL-4R)基因的rs3024608、rs1110470、rs3024685共3个多态位点,探讨青岛地区成人中该基因多态性与哮喘的相关性,以期进一步揭示哮喘的遗传学发病机制,有利于哮喘的预防、早期诊断和治疗.
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中国汉族人群15个STR基因座遗传多态性研究及法医学应用
短串联重复序列(STRs)属微卫星DNA序列,重复单位为2~7 bp.STR位点在人类基因组含量丰富,估计3~4核苷酸重复STR多态位点约有20万,平均每隔15~20 kb就出现一个[1],是第二代遗传标记,已广泛应用于群体遗传学研究、亲权鉴定、个体识别,国内对Penta D和penta E两个基因座尚鲜见报道.本研究采用四色荧光PCR复合扩增技术对中国汉族D3S1358、THO1、D21S11、D18S51、D13S317、D7S820、D16S539、CSF1PO、Penta D、vWA、D18S1179、TPOX、FGA及Amelogenin等位基因频率进行研究,并应用于各种生物检材.
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L28B 多态性与慢性丙型肝炎抗病毒疗效相关性的研究进展
慢性丙型肝炎病毒(HCV)的慢性感染是慢性肝炎、肝硬化和肝细胞癌的一种重要病因,目前针对丙型肝炎的标准治疗方案是聚乙二醇干扰素联合利巴韦林。联合抗病毒治疗的疗效受到宿主遗传因素的影响,尤其是 IL28B 基因多态性的影响。近期,欧美多个研究组对自愈和经过治疗的慢性丙型肝炎患者进行了全基因组关联分析(Genome-wide association study,GWAS),证明 IL28B 基因(编码 IFN-λ3)的单核苷酸多态位点(single nucleotide polymorphism,SNP)影响 HCV 患者的治疗效果和自然清除率,同时可对其应答进行预测。现就IL-28B 基因多态性与慢性丙型肝炎治疗应答的关系及其影响应答可能机制分述如下。
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中华白蛉微卫星DNA序列的分离和多态位点筛选的初步研究
目的 分离中华自蛉的微卫星DNA序列,并筛选其中具有多态性的位点.方法 应用中华白蛉基因组DNA的酶切片段与生物素标记的寡核苷酸探针(AAT)_(17)、(GA)_(25)、(CCT)_(17)和(TG)_(18)杂交,亲合素富集和超滤离心浓缩目的 片段,扩增放大后克隆并测序,构建中华白蛉微卫星DNA库.挑选合适的微卫星位点,建立PCR扩增体系.应用中华白蛉现场标本对不同的微卫星DNA进行扩增,聚丙烯酰胺凝胶电泳筛选具有多态性的位点.结果本研究分离中华白蛉微卫星DNA的方法效率高,重组克隆阳性率为78.6%.构建的微卫星DNA库含有118条序列,GenBank登录号为FJ919812~FJ919932(登录号为FJ919833、FJ919836和FJ919869除外),其中典型微卫星DNA序列72条(占61.0%),非典型序列46条.在构建的中华白蛉微卫星DNA库中选择22个位点进行多态性筛选,电泳结果显示14个为多态位点,双核苷酸重复的位点比三核苷酸和多核苷酸重复位点的多态性高.结论 首次构建了含有118条序列的中华白蛉微卫星DNA库,共获得14个新的多态微卫星位点.
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MTHFR基因遗传多态性与ALL相关性研究进展
叶酸是一种水溶性维生素,其辅酶形式为四氢叶酸,它在酶促反应中的主要作用为参与各种一碳单位的转移.从流行病学、动物和人体实验研究的证据来看,叶酸可影响某些组织发生肿瘤的危险性,其中研究多的是结、直肠,叶酸缺乏时可增加其肿瘤的发生率[1].近年来,叶酸与急性淋巴细胞性白血病(ALL)的关系也被发现,研究表明,叶酸代谢过程中各关键酶基因在人群中存在遗传多态性分布[2],其分布状况通过影响相关酶的活性参与白血病的发生.甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)是叶酸代谢途径中的一个重要关键酶,该基因存在2个重要多态位点:C677T及A1298C,这些突变均可影响MTHFR活性,现就近年来MTHFR基因遗传多态性与ALL相关性进行综述如下.
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β2-肾上腺素能受体基因单核苷酸多态性及在汉族人群中的分布(摘要)
目的研究中国人β2-肾上腺素能受体(beta2-adrenoceptor,β2-AR)基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP),并观察这些SNPs在汉族人群中的多态性分布.方法应用荧光标记自动测序法测定来自安徽大别山地区80名非亲缘关系人群β2-AR基因序列,确定单核苷酸多态位点及基因型.结果在3.8kb长度范围内共发现8个SNPs,其中5个位于编码区,平均274bp出现1个SNP;3个位于调控区,平均721 bp出现1个SNP,与国外报道相比,-468C→G,-367T→C,-47C--→T,-20T→C,+79C→G,+100G→A,+491C→T,+1 098T→C未在本研究人群中检测到.各SNPs等位基因频率在人群中的分布符合Hardy-Weinberg平衡.结论β2-AR基因SNPs呈不均匀分布,且具有很大的种族差异;其等位基因频率在人群中分布符合Hardy-Weinberg平衡.
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ADAM33基因多态性与东北汉族银屑病的相关性
目的:确定解整合素金属蛋白酶( ADAM33)基因与东北地区汉族人群银屑病的相关性。方法:利用多重SNaPSHOT方法检测东北汉族400例银屑病患者和398名正常对照的ADAM33基因中rs2787094、rs512625、rs597980位点的基因分型。比较患者和对照组间、不同临床表型组间的基因型、等位基因和单体型频率分布的差异性。结果: ADAM33基因 rs2787094CC、CG基因型和2个单体型( H3和H5)可能为银屑病的危险因素( P<0.05),rs512625AA基因型和3个单体型( H1、H4和H7)可能是银屑病的保护因素(P<0.05)。 rs597980的基因型和等位基因在病例和对照组间无差异(P>0.05)。rs2787094CC基因型和C等位基因可能与晚期发病和/或无家族史的患者具有相关性,与病情严重程度和性别无关。结论: ADAM33基因的多态位点与东北地区汉族人群银屑病具有相关性。
关键词: 银屑病 解整合素金属蛋白酶33 多态位点 -
干扰素治疗慢性丙型肝炎诱发肾病综合征及甲亢1例报告
患者男,27岁,2010年8月发现丙型肝炎抗体阳性,既往于6岁时患急性甲型病毒性肝炎曾接受输血治疗,无肾病和甲状腺功能(甲功)异常病史及家族史,未曾使用免疫抑制剂及抗丙肝治疗.2011年4月丙型肝炎病毒载量(HCV-RNA)为8.3×104IU/mL,诊断为慢性丙型病毒性肝炎(CHC).2011年6月开始隔日1次注射重组人干扰素α-2b 600万U,口服利巴韦林900 mg/d,治疗基线HCV RNA为1.04×106 IU/mL,HCV基因型为1b,IL-28B单核苷酸多态位点(SNP) rs8099917、rs12979860、rs12980275基因型分别为G/T、C/T、G/A,血常规、血脂、肝功能、肾功能、甲功、尿常规、空腹血糖、肝胆彩超均正常,自身免疫性抗体阴性.治疗后每个月复查HCV-RNA、血常规、肝功能,每3个月复查甲功、肾功能,每6个月复查肝胆彩超.
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南方汉族人群肿瘤坏死因子α基因启动子区中多态位点的检测
单核苷酸多态性(SNPs)作为基因组中普遍的序列差异,在生物学、遗传学等诸多领域如复杂性疾病病因研究、药物敏感性研究中发挥着越来越重要的作用[1].
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浙江地区汉族人群p53、FaS基因中多态位点的检测
随着人类基因组计划在全球范围的不断开展和实施,人类基因组全部核苷酸序列已经由"工作框架图"(working draft)阶段进入到"完成图"(finishing map)阶段,除了解析人类基因组的全部核苷酸序列,尽可能全面的寻找功能基因外,人类基因组计划的另一个重要目标是阐明在特定基因组区域内的序列差异[1].