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HCV NS3丝氨酸蛋白酶及以其为靶位的抗感染研究进展
丙型肝炎病毒感染显著的特征是慢性化,已经成为严重的社会公共卫生问题.目前治疗方法仅限于干扰素-利巴韦林联合使用,持续疗效有限而且副作用大,因此迫切需要寻找特异有效的抗病毒药物.HCV NS3基因编码的NS3蛋白具有丝氨酸蛋白水解酶、解旋酶和磷酸核苷酶活性,在病毒RNA复制和多聚蛋白前体的加工成熟中有着重要作用.因此,NS3丝氨酸蛋白酶的抑制剂是抗病毒的理想药物.本文就HCV NS3丝氨酸蛋白酶及以其为靶位的抗感染研究综述如下.
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丙型肝炎病毒基因编码的蛋白及其功能
丙型肝炎病毒(HCV)基因组是一单股正链RNA,全长9 600个碱基对(bp),含有一个大的开放读码框架(ORF),编码约3 010个氨基酸的病毒前体蛋白,HCV基因组5'端(5'UTR)和3'端(3'UTR)为非翻译区,或称非编码区(UCR),前者位于ORF上游;后者位于下游,含有poly A或ply U尾巴.
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脂肪肝患者血清瘦素水平的测定及意义
瘦素是肥胖基因编码的一种肽类激素,可控制食物的摄取和能量的消耗从而与身体脂肪代谢密切相关.本研究对32例脂肪肝患者及20名健康人血清瘦素水平进行了测定,以探讨脂肪肝与瘦素水平变化的关系.
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β-半乳糖苷酶催化合成低聚半乳糖的研究
β-半乳糖苷酶的研究进展 β-半乳糖苷酶来源及作用机理.β-半乳糖苷酶(β-galactosidase)普遍存在于动物(幼小动物的肠中)、植物(杏、苹果等)及微生物(细菌、霉菌等)中,能够将乳糖水解为葡萄糖及半乳糖供生物体代谢使用.在生物体体内,β-半乳糖苷酶是由LacZ 基因编码翻译而成的蛋白质酶类,通过提取动物、植物及微生物中的乳糖酶蛋白,发现来自于不同物种体内的蛋白同源性较高,进而对乳糖酶基因进行深入分类研究,并建立了β-半乳糖苷酶基因库,其中大部分基因均来自于细菌[1].
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饮食、公共场所从业人员HBV DNA感染水平调查及意义探讨
饮食、公共场所从业人员HBV感染率有很多报告,其传染性多以乙肝病毒标志物(HBVM)来评价,目前认为HBVM是病毒基因编码的产物,只有HBV DNA才是乙肝病毒复制、传染的直接证据,而且传染水平与HBV DNA的浓度相一致.[1]为了解两大行业HBV感染者的传染水平,制定有效的乙肝防治措施,我们应用PCR对577例HBV感染者进行了HBV DNA的定量检测,同时用固相放免(RIA)检测HBVM.在了解传染水平的同时对PCR定量检测HBV DNA与RIA之间的关系进行了初步探讨和评价.
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肾细胞癌中VEGF的表达与MVD关系的研究进展
现就VEGF、MVD的生物学行为与肾细胞癌(RCC)的关系作简要的综述.血管内皮生长因子(VEGF)与肾细胞癌的生物学行为关系VEGF也称血管渗透因子,人类VEGF基因定位于染色体6P2l-3,全长14kb,包括8个外显子和7个内含子.VEGF基因编码分子量为45kD左右的同源二聚体糖蛋白,纯化后的VEGF表现为一种具有肝素活性的同源二聚体多肽,相对分子量为34 000~37 000.在正常胚胎发育时,有广泛表达,在正常成年人的组织呈低水平表达,但在肿瘤形成的病理过程中,有广泛表达.
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表观遗传流行病学
一、表观遗传学和表观遗传流行病学近年研究表明,高等生命遗传信息的复杂性不仅在于基因组有更多的结构蛋白基因编码,还在于基因表达调控机制的复杂性.因此基因表达调控是现代分子生物学的核心.
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高渗应激早期伤寒沙门菌RpoE调节因子对基因表达的影响
伤寒沙门菌是一种革兰阴性肠道致病菌,常通过污染的食物进入体内,可造成严重全身性感染[1-2].作为食源性致病菌,必须遭遇人体消化道的高渗环境,但目前对其克服高渗应激的具体机制尚不清楚.RpoE调节因子由rpoE基因编码,是肠杆菌科细菌中一个重要的σ因子,在大肠杆菌响应高渗应激时发挥着重要的作用[3],在伤寒沙门菌中也应当十分重要.
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中国地区丙型肝炎病毒的NS5A基因序列及干扰素敏感决定区特征分析
丙型肝炎病毒(Hepatitis C virus,HCV)NS5A基因编码的ISDR、PKRBD和V3等区域氨基酸序列的变异与HCV对干扰素-α( interferon-α,IFN-α)治疗的不同反应性有关[1-6],了解NS5A基因的序列特征及干扰素敏感决定区(IFN Sensitivity Determining Region,ISDR)的氨基酸序列有助于进一步研究中国地区HCV的致病性及HCV相关肝炎的药物治疗与预后.笔者选取了美国国立生物技术信息中心数据库(NCBI)中发表的中国地区HCV多聚蛋白的核苷酸和氨基酸序列及NS5A蛋白的部分氨基酸片段,对NS5A基因序列及ISDR氨基酸序列进行多序列比对、聚类分析、相似性分析及氨基酸变异位点分析,分析中国地区HCV的NS5A基因序列及ISDR特征,现将结果报道如下.
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磷酸化蛋白质组学技术进展及其在预防医学中的应用
生物体能迅速对体内外环境的变化产生的应答反应依靠复杂的调控机制调节,而其中大多数调控机制是由蛋白质构象变化所介导的.蛋白质本身的构象变化常常通过边蛋白质结构上发生的各种共价修饰来实现,其中蛋白质磷酸化是常见、重要的共价修饰方式[1].在脊椎动物基因组中,有5%基因编码的蛋白质是参与到磷酸化和去磷酸化过程中的激酶(kinase)和磷酸酯酶(phsphatase)[2].
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多聚人血清白蛋白受体检测及其临床意义
多聚人血清白蛋白受体(polymeried human serum albumin receptor简称PHSA-R)具有种属特异性,存在于人类乙型肝炎病毒(HBV)颗粒(又称Dane颗粒)表面,也存在于肝细胞膜上。PHSA-R具有HBV DNA长链上的前-S2基因编码。PHSA-R与多聚人血清白蛋白(PHSA)的结合是通过氢键,疏水相互作用等非特异性结合。在HBV侵入宿主肝细胞,并在肝细胞复制过程中PHSA起着桥梁作用。
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组织相容性复合体DQ异二聚体与I型糖尿病的相关性
I型糖尿病是一种多基因遗传的慢性自身免疫性疾病,组织相容性复合体(HLA)构成其遗传因素的60%,是I型糖尿病的主效基因。研究资料表明:HLA-Ⅱ类基因区DQA1基因编码的DQα链第52位和DQB1基因编码的DQβ链第57位氨基酸残基的性质是I型糖尿病易感性的决定因子;由于DQα链和DQβ链形成的异二聚体与I型糖尿病存在着易感相关性,而且这种相关性存在一定的人种差异。中国人无此方面的研究报道,因此本课题应用聚合酶链反应和斑点杂交技术对研究对象的HLA基因进行分型并对中国人HLA-DQ异二聚体与I型糖尿病的易感相关性进行了研究。 本课题选取54例I型糖尿病患儿为实验组,患儿均符合WHO I型糖尿病诊断标准,且均为汉族人。选取40例健康成年献血员为正常对照组。首先从研究对象的外周静脉血中提取基因组DNA,用聚合酶链反应(PCR)技术特异性扩增HLA-DQA1,DQB1基因的第二外显子区,然后用地高辛标记的序列特异性寡核苷酸探针进行斑点杂交从而对HLA基因进行分型。DQA1,DQB1引物的扩增产物分别为229bps和214bps。本课题选用的9种探针分别为:DQA1*7504、5503、5502、4102,DQB1*3702、5707、5703、7005、2301。 本课题研究结果表明(表1):DQA1*0501/DQB1*0201二聚体(病人组50%相对于正常对照组的20%)和DQA1*0301/DQB1*0201二聚体(病人组44.4%相对于正常对照的10%)在病人中的频率显著增加:DQA1*0103/DQB1*0601(P/P)二聚体在对照中的频率显著增加(病人组1.85%相对于正常对照的22.5%);其余二聚体在病人及对照中的频率分布无显著性差异。 DQα/β异二聚体是指由HLA-DQA1/DQB1基因组合编码的产物组合而成的Ⅱ类分子。DQA1*0501-DQB1*0201基因组合位于DR3单倍型上,本研究中,该基因组合与I型糖尿病易感性显著正相关。DQA1*0301-DQB1*0201基因组合常出现于中国人的DR3/DR4和DR3/DR9杂合子中,本研究中,该基因组合对I型糖尿病构成显著的易感性,与白人,日本人结果一致。DQA1*0103-DQB1*0601基因组合位于DR2或DR8单倍型上,在日本人及本次研究的中国北方人中,该基因组合均对I型糖尿病构成显著的保护性。
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瘦素及Ⅰ和Ⅲ型胶原蛋白在肝纤维化大鼠肝组织中的变化
瘦素(Leptin)足一种由肥胖基因编码的分泌型蛋白质,其与肝病的关系受到关注[1].本实验研究了大鼠肝纤维化发生发展Leptin及Ⅰ和Ⅲ型胶原蛋白的变化.1 材料方法1.1 试剂:RT-PCR两步法试剂盒(上海捷瑞),引物(上海生工).兔抗大鼠Leptin与Ⅰ、Ⅲ型胶原抗体(武汉博士德).
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冠心病病人载脂蛋白E与血脂水平的相关性
人类载脂蛋白E(apo E)有三种主要异构体E2、E3、E4,是由三个等位基因编码,不同的apo E异构体受体结合活性不同,从而影响了脂蛋白的代谢,出现异常的脂蛋白血症.本实验研究探讨天津地区汉族人群apo E等位基因的频率分布及对血脂水平的影响,分析正常人与冠心病病人apo E基因分布频率的差异.
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NET-1、PTEN蛋白在脑星形细胞肿瘤中的表达及意义
PTEN基因编码的蛋白具有抑制细胞增殖、诱导细胞凋亡作用,NET-1基因编码的蛋白表达与细胞增殖有关,显著上调癌形成过程.本文就脑星形细胞肿瘤中NET-1和PTEN蛋白的表达及病理意义进行研究.
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噬菌体随机肽库技术及其在寄生虫学领域的应用
1985年Smith率先将EcoRI内切酶的部分基因片段插入丝状噬菌体fl的外壳蛋白基因Ⅲ区,使目的基因编码的多肽呈现在噬菌体表面,并建立了噬菌体表面呈现技术(Phage display techniques).在此基础上,1990年Scott首次将编码随机序列肽的DNA与丝状噬菌体外壳蛋白基因Ⅲ整合,使随机肽与噬菌体蛋白以融合形式表达,并呈现在噬菌体表面,从而建立了噬菌体随机肽库技术(Phage display random peptide libraries).近年来,噬菌体随机肽库已成为探索受体与配体之间相互作用结合位点、寻求高亲和力生物活性的配体分子、探测未知蛋白空间结构表位的有利工具,在抗原表位(抗原决定簇)定位和模拟蛋白相互作用位点定位、功能配体或药物的筛选、新型疫苗的研制以及肿瘤治疗上拓宽了研究者的思维,提供了新的途径.目前,该技术在寄生虫学领域同样受到研究者的青睐.本文就噬菌体随机肽库技术及其在寄生虫学领域中的应用作一综述.
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治疗性人源抗狂犬病毒抗体研究进展
狂犬病是由狂犬病毒(rabies virus,RV)引起的人兽共患疾病,发病后死亡率几乎达百分之百.狂犬病毒属弹状病毒科(Rhabdoviridae)狂犬病毒属(Lyssavirus),基因组编码五种结构蛋白,其中由G基因编码的糖蛋白,是病毒与宿主细胞结合的配体,能诱导机体产生中和抗体,与病毒的毒力、致病性密切相关.
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蛋白质组学及其在糖尿病相关疾病中的应用
随着人类基因组计划的实施和推进,生命科学研究已经进入了后基因组时代.在这个时代,生命科学的主要研究对象是功能基因组学,包括结构基因组研究和蛋白组研究等.蛋白质组学是对基因编码的蛋白质进行大规模分析的一门新兴学科,是目前研究的热点.其对于寻找疾病的诊断标志物、筛选药物作用靶点及进行毒理学研究等具有重要的实际意义,因此成为医药研究的一个新方向.目前作为一种新的研究手段,蛋白质组学技术已用于研究1型糖尿病(T1DM)、2型糖尿病(T2DM)、胰岛素抵抗的发病机制以及抗糖尿病药物的开发.
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C-Jun 氨基端激酶与胰岛素抵抗
C-Jun 氨基端激酶(c-Jun N-terminal kinase,JNK),又称应激活化蛋白激酶(stress-activated protein kinase ,SAPK),是在哺乳动物体内发现的第3类促分裂原活化蛋白激酶(mitogen activated protein kinase,MAPK)的家族成员之一[1].JNK 广泛参与胚胎发育、细胞分化和凋亡、免疫反应以及胰岛素抵抗(insulin resistance,IR)等多种生理病理过程.JNK 蛋白可由Jnk1 、Jnk2 、Jnk3 等3个基因编码,其中Jnk1 基因和Jnk2 基因在全身各组织中广泛表达,Jnk3 基因则选择性地在脑、心脏、睾丸组织中表达.
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胃肠道间质瘤的分子分型与靶向治疗
胃肠道间质瘤(gastrointestinal stromal tumors, GIST)是胃肠道常见的间叶源性肿瘤,通常c-kit(CD117)免疫表型阳性,对传统的化学治疗和放射治疗不敏感.该类肿瘤一般具有c-kit基因(75%~85%)或PDGFRA基因(5%~10%)的突变[1-2].这两个基因编码两个功能相似的酪氨酸激酶蛋白受体,其突变造成配体非依赖性的c-kit或PDGFRA受体二聚化,导致信号通路不需诱导持续激活,在GIST发病过程中发挥关键作用[3-4].c-kit或PDGFRA基因在GIST中的突变有一定的热点区域和规律,并且与GIST的临床病理学特征及预后存在非随机的联系.