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2.117肠易激综合征病人5-羟色胺转运体基因多态性分析
目的探讨5-羟色胺转运体(SERT)基因多态性在肠易激综合征中的意义.方法肠易激综合征(IBS)81例,其中便秘型IBS(C-IBS)30例,腹泻型IBS(D-IBS)32例,交替型IBS(A-IBS)19例,对照组48例.从肠黏膜组织或外周静脉血提取DNA,采用PCR技术对SERT基因的2个多态性位点进行研究.
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CYP2C19基因多态性对氯吡格雷代谢的影响
在人群中不同个体间对药物的反应、毒性和治疗效应存在着很大的差异,产生这种个体差异的原因有很多,如患者的年龄、性别、病程进展、心理状态等。其中遗传因素,即药物代谢酶、转运体和药物作用靶点(如受体)的遗传多态性是一个重要的影响因素。不同个体间药物代谢相关物质遗传多态性的存在,可能导致相应药物在治疗中出现药效和不良反应的个体差异。随着药物代谢基因组学研究的不断深入,不同个体基因多态性导致个体对药物反应差异性的研究已成为国内外研究热点[1]。CYP2C19,作为细胞色素P450(cytochrome P450,CYP450)家族中一类重要的亚型,在多种药物应用中体现出其重要性。氯吡格雷作为一种常见的抗血小板药物,其代谢也受CYP2C19多态性的影响,不同基因型患者对氯吡格雷的治疗反应性不同。本文就CYP2C19的几个主要基因多态性位点对氯吡格雷代谢影响作一简要综述。
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凝血酶激活的纤溶抑制物编码区基因多态性与脑梗塞亚型的关系
凝血酶激活的纤溶抑制物(thrombin-activatable fibrinolysis inhibitor,TAFI)是近年来发现的存在于血浆中的一种以无活性的酶原形式存在的单链糖蛋白,其活化产物TAFIa主要通过使纤溶酶失去与纤维蛋白的结合作用位点抑制纤溶,所以TAFI在血栓性疾病如缺血性脑血管疾病的发生、发展过程中发挥重要作用,而参与TAFI生成的编码及调控的基因多态性位点也得到了医学界很大的关注.
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云南省三民族人FⅧ基因XbaⅠ限制性片段长度多态性研究
血友病甲是由于凝血因子Ⅷ(FⅧ)基因缺陷所致的X染色体连锁隐性遗传性疾病[1],FⅧ基因定位于X染色体长臂末端2区8带(Xq28)全长约186 kb,包括26个外显子和25个内含子.目前多利用DNA限制性内切酶片段长度多态性(RFLPs)[2]和可变数目串联重复顺序(VNTR)[3,4]作为遗传标志进行有缺陷基因的连锁分析和产前诊断.但多态性位点在不同人种、不同民族、不同地区人群中出现的频率各异,为获得不同民族FⅧ基因的遗传多态性及其信息量,我们应用聚合酶链反应(PCR)技术特异性扩增了云南省傣、彝、汉族人群FⅧ基因22内含子XbaⅠ限制性内切酶片段长度多态性位点的DNA序列,以确定该位点在上述三个民族中的诊断价值.
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PCR-焦磷酸测序法快速检测和鉴定临床常见致病菌的研究
焦磷酸测序(Pyrosequecing)技术为近年新一代短片段DNA序列分析技术.国外主要用于分子流行病学的单个核苷酸多态性位点大容量快速检测[1]和临床微生物菌种鉴定与分型[2-3],但国内尚未开展.本研究用该技术对针对不同细菌的独特分子标志,设计基于PCR技术的快速菌种鉴定方法,以提供从分子水平快速鉴定菌种的新的可靠方法.
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中国汉族人HIV辅助受体CCR5编码区新SNP位点研究
[摘要] 目的 普查中国汉族人群HIV-1协同受体CCR5编码区的基因多态性位点,为中国的艾滋病防治提供依据.方法CCR5编码区用2对引物进行PCR扩增,设计测序引物依次测序,样本数为45例,用DNAstar分析测序结果,寻找SNP位点.
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TNF-α基因启动子多态性与HBV感染转归的关系
目的:探讨中国汉族人肿瘤坏死因子-α(tumor necrosisfactor-α,TNF-α)基因启动子单核苷酸多态性与乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)感染结果之间的关系.方法:慢性乙型肝炎患者131例,HBV感染自愈者165组应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性分析方法,检测HBV感染自愈者和慢性乙型肝炎患者TNF-α基因启动子-238G/A,-308G/A,-857C/T和-863C/A单核苷酸多态性位点基因型.结果:对慢性乙型肝炎组和HBV感染自愈组人群TNF-α基因启动子区域的-238G/A,-308G/A,-857C/T和-863C/A 4个SNP位点进行基因型分析,共发现12种启动子基因型,以GG·GG·CC·CC,GG·GG·CC·CA,GG·GG·CT·CC和GG·GA·CC·CC基因型多见,约占85%.通过对慢性乙型肝炎患者和HBV感染自愈者TNF-α基因启动子4个位点基因型联合分析发现,GG·GG·CC·CC,GG·GG·CC·CA和GG·GA·CC·CC基因型在慢性乙型肝炎组和HBV感染自愈组分布差异有显著性,其中携带GG·GG·CC·CC基因型的个体患慢性乙型肝炎的机会比(odds ratio,OR)为2.15,95%可信区间为1.34-3.45;而携带GG·GG·CC·CA或GG·GA·CC·CC基因型的个体患慢性乙型肝炎的OR分别为0.48(95%可信区间为0.27-0.86)和0.35(95%可信区间为0.14-0.89).HBV感染的清除可能与GG·GG·CC·CA(X2=6.14,P=0.013<0.05)和/或GG·GA·CC·CC(X2=5.18,P=0.023<0.05)基因型有关.进一步对各位点单核苷酸多态性分析发现,慢性乙型肝炎患者和HBV感染自愈者TNF-α基因启动子-238G/A、-857C/T位点基因型分布频率差异无显著性,而-308G/A,-863C/A位点基因型分布频率差异有显著性(-308G/A位点,X2=6.53,P=0.011<0.05,OR=3.05;-863C/A位点,X2=4.33,P=0.037<0.05,OR=1.69).结论:TNF-α基因启动子-308G/A、-863C/A位点多态性与中国汉族人HBV感染后的结果有关,其中TNF0-α308G/A和/或-863C/A位点A等位基因的存在可能有利于HBV感染的清除.
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汉族人群花生四烯酸细胞色素P450ω-羟化酶4A11基因编码区结构的研究
目的花生四烯酸由细胞色素P450ω-羟化酶催化生成的19-和20-羟烷四烯酸(19-,20-HETE).在多种疾病过程,尤其是高血压病中,20-HETE扮演着重要角色.寻找人群中该酶基因之一的CYP4A11的编码区多态性位点分布情况,可以为研究高血压病的基因机制提供新的依据.方法采集50例血压正常、无血缘关系的汉族人外周静脉血白细胞;提取基因组DNA;设计特异性引物,PCR法分段扩增基因编码区序列,电泳检测后回收目的片断;测序,与参考序列比对后统计结果.结果 CYP4A11共发现16个多态性位点,其中5个有意义:1个5'端非编码区的突变位点A-54G,4个引起氨基酸改变的多态性位点,分别为A6890C、A7207G、T7394A和T8590C.其余为同义突变或者位于内含子区.结论 (1)多态性位点存在种族差异;(2)突变位点大多数位于内含子区,或者为同义突变,仅有少数有意义;(3)发现的多态性位点可能引起蛋白质构象进而改变蛋白质功能,或者引起基因转录活性的改变,并为下面的蛋白质组学研究和大样本人群研究奠定了基础.
关键词: 花生四烯酸ω-羟化酶 CYP4A11 多态性位点 -
抵抗素基因299G/A多态性与2 型糖尿病的相关性研究
2001年Steppan等[1]研究罗格列酮药理作用时发现并提出抵抗素可能是连接肥胖和糖尿病(DM)之间的桥梁.迄今已发现30多个抵抗素基因多态性位点,Osawa等[2]认为其中的内含子2区 299G/A多态性可能与2型糖尿病(T2DM)某种表型相关.本研究拟探讨抵抗素基因299G/A多态性与中国汉族人T2DM的相关性.
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血管内皮生长因子基因启动子多态性和糖尿病足溃疡的相关性研究
目的 研究VEGF基因启动子区-460T/C与-1154G/A多态性位点在中国北方汉族人群中与糖尿病足溃疡(DFU)之间的关系. 方法 基于病例-对照研究方法,采用PCR-RFLP技术检测209例T2DM患者(其中单纯T2DM患者112例,DFU患者97例)和健康对照(NC)者188名VEGF基因启动子-460T/C和-1154G/A的多态性,比较各组的基因型与基因频率. 结果 VEGF基因启动子-1154G/A多态性在患者和NC者间差异无统计学意义(P>0.05).与单纯T2DM患者相比,DFU患者中携带C等位基因的个体频率显著降低(T/C+C/CvsT/T,P=0.0109,OR=0.4708,95%CI=0.2625~0.8444).DFU患者与NC者比较,携带C等位基因的个体频率也显著下降(P=0.0037,OR=O.4784,95%CI=0.2891~0.7916). 结论 DFU患者的C等位基因频率较低,可能是由于该等位基因增加了血管生成,对患者具有保护作用.
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中国汉族人群中NEURL基因和TBX5基因变异与心房颤动的关联研究
目的:近一项联合基因关联研究、基因表达数量分析性状定位分析技术(cis-eQTL)以及生物功能学方法的研究在欧洲和日本人群中证实了6个单核苷酸多态是心房颤动的易感位点。另外,近年来多项研究表明与Brugada综合征或PR间期相关的多态性位点与心房颤动也有相关性。本研究旨在探讨这些位点与我国汉族人群心房颤动的相关性。
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载脂蛋白基因多态性与冠心病易感性的研究进展
冠心病(coronary artery disease,CAD)是由遗传因素和环境因素相互作用导致的,其高发病率和高死亡率,严重威胁着人类的健康,对于其发病机制多数学者从分子遗传学角度进行研究。关于冠心病候选基因的研究主要集中在载脂蛋白基因,血管紧张素受体基因,细胞因子基因,脂蛋白受体基因,基质金属蛋白酶基因等,其中载脂蛋白基因是研究的热点之一。常见的载脂蛋白(Apo)有ApoA1、ApoA2、ApoA4、ApoA5、Apo B100、Apo B48、ApoC1-4、ApoD、ApoE等,载脂蛋白在结合和转运脂质及稳定脂蛋白结构、调节脂蛋白代谢关键酶活性、参与脂蛋白受体识别上发挥着重要作用,其结构和功能的改变常导致血脂代谢异常,而血脂异常已被证实为冠心病的独立危险因素。编码这些载脂蛋白的基因存在多态性,与冠心病易感性研究较多的有载脂蛋白A5、B、C3、E基因,本文仅对这些载脂蛋白基因的常见多态性位点与冠心病易感性的关系综述如下。
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支气管哮喘患者IgE高亲和力受体β链基因多态性与血清总IgE关系的研究
IgE高亲和力受体β链(FcεRI β)基因定位于染色体11q13区,被认为是特应性和支气管哮喘(简称哮喘)易感性的主要候选基因之一[1].FcεRI β基因存在数个单一核苷酸变异的多态性位点[2] , 其中Ile/Leu181、Val/Leu183、Glu/Gly237的3个位点与哮喘相关研究国内已有报道,而启动子区-109C/T位点的研究报道较少,我们应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法对-109C/T位点进行分析, 研究江西籍汉族人群中该位点与哮喘发病及其血清总IgE水平之间的关系.
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硒、谷胱甘肽过氧化物酶-1与地方性扩张型心肌病的交互关系
克山病是我国缺硒地区特有的地方性扩张型心肌病,病因至今未明.硒缺乏是主要的条件致病因子,但并不是惟一的致病因子.同样处在低硒环境下个体的克山病患病风险存在很大差异,提示病区个体可能存在遗传背景差异.本研究旨在筛选与克山病相关的GPx-1基因单核苷酸多态性位点,针对相关的基因位点进行深入的功能研究,以终明确GPx-1基因多态性位点在克山病发病机制中的作用.
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老年人冠心病与凝血因子VII基因多态性的关系
近年来,有学者认为外源性凝血途径在血栓形成过程中具有重要意义,凝血因子VII在外源性凝血途径的启动中起关键性作用,在动脉血栓形成过程中意义重大.凝血因子VII水平受遗传因素与环境因素及其相互作用的影响,遗传因素主要指存在于凝血因子VII基因中的多态性,其中比较重要的多态性位点有: (1)位于凝血因子VII启动子区域323 bp处的10 bp插入/缺失多态性;(2)位于凝血因子VII 8号外显子353位氨基酸(R353Q);(3)凝血因子VII基因内含子7的37 bp串联可变重复序列多态性(HVR4).我们采用了PCR-RFLP的方法研究老年冠心病患者的凝血因子VII 5′F7、R353Q、HVR4多态性,探讨老年人冠心病与凝血因子VII基因多态性的关系.
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2型糖尿病患者胰岛素受体底物-2基因G1057D突变频率及意义
胰岛素抵抗(IR)的分子机制,特别是分子靶点及细胞内信号转导机制的研究,成为近年2型糖尿病(T2DM)的研究热点,其中胰岛素受体底物(IRS)备受关注.基因剔除研究显示[1,2],IRS-1纯合突变(IRS-1-/-)鼠仅出现轻度的IR,不发展为糖尿病.IRS-2-/-鼠则出现中、重度IR及T2DM的全部特征,提示IRS-2基因突变可能参与T2DM的发生.人类IRS-2基因定位于13q8.6,IRS-2基因G1057D系编码区的单核苷酸多态性(SNP)使氨基酸序列1057位发生了G→D替代,但该多态性位点的功能学意义,国外报道结果不尽一致.由于基因变异存在种族及地区性差异,故本研究以其为遗传标记,运用PCR-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)分析方法,对辽宁省汉族人群该突变进行检测,同时结合生化及放免指标的变化,明确该突变与T2DM的相关性.
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2012年美国糖尿病学会年会杰出科学成就奖对我国糖尿病遗传学研究的启示
美国糖尿病学会(ADA)将2012年度杰出科学成就奖授予了David Altshuler教授,Altshuler教授现为哈佛大学医学院和麻省总医院的医学及遗传学系教授,同时兼任哈佛大学和麻省理工学院的Broad 研究中心副主任.他同时也是多个基因研究计划的倡导者之一,包括单核苷酸多态性国际联合会项目(The SNP Consortium)、国际人类基因组单体型图计划( International HapMap Project)和千人基因组计划( 1000 Genomes Project)等.这些国际性的研究课题总体宗旨是:更加完整地鉴定出人类疾病相关的基因多态性位点,从而为基因变异和疾病的相关性分析提供完整的数据资料;为未来的基因型测定平台提供更完备的核苷酸多态性和探针筛选数据;完善的数据库能为各国科学家提供科研资源,也能用来更加深入地了解基因突变和重组的过程和机制[1].
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骨代谢相关基因单核甘酸多态性在脊柱后纵韧带骨化发生中的作用
脊柱韧带骨化症是以后纵韧带骨化(ossification ofthe posterior longitudinal ligament,OPLL)与黄韧带骨化为代表的临床常见病,其发病机制尚不清楚[1~4].该病呈进展性,可导致脊髓压迫及神经功能障碍.随着分子生物学的发展及基因研究的深化,发现该病具有显著的遗传倾向,考虑为多基因单核甘酸多态性位点变异为特征的家族病.作者就其相关基因单核甘酸多态性方面的进展综述如下.
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胆囊结石病与脂蛋白脂肪酶基因多态性关联的研究
近年研究发现,在脂蛋白脂肪酶(LPL)基因的非编码区存在多种遗传多态性位点,其中第Ⅷ内含子HindⅢ位点的限制性片段长度多态性(RFLPs)与人群中高甘油三酯(TG)血症、低高密度脂蛋白胆固醇(HDL-ch)血症有关.本研究探讨人类LPL基因遗传多态性的分布规律以及和胆石成因的关系.
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内皮型一氧化氮合酶基因多态性与维吾尔族妇女妊娠期高血压疾病发病的关系
妊娠期高血压疾病是产科常见并发症,是引起孕产妇和围产儿死亡的主要原因之一.流行病学资料表明,妊娠期高血压疾病有家族遗传倾向.临床观察发现,维吾尔族(维族)孕妇妊娠期高血压疾病患者明显多于汉族,我们运用聚合酶链反应-限制性内切酶片段长度多态性(PCR-RFLP)方法,检测内皮型一氧化氮合酶基因(eNOS)中两个多态性位点与维族孕妇妊娠期高血压疾病发病之间的关系.现将结果报道如下.