首页 > 文献资料
-
广西百色地区壮族人群乙型肝炎病毒基因型分布初步调查
为了解广西百色地区壮族人群乙型肝炎(乙肝)病毒(HBV)基因型分布特点及其与疾病进展的相关性,我们对30例壮族慢性乙肝患者进行了HBV基因型检测.
-
静脉吸毒者SEN病毒基因型检测和序列测定
SEN病毒(SENV)是一种新发现经输血、静脉吸毒等方式传播的DNA病毒.为此,我们采用套式聚合酶链反应(nPCR)检测方法,初步获得了SENV-D和SENV-H两个亚型在湖北地区静脉吸毒者(intravenous drug users,IVDUs)中的感染情况.
-
血管紧张素Ⅱ-1型受体基因多态性与原发性高血压的相关性研究
血管紧张素Ⅱ-1型受体(AT1R)基因是肾素-血管紧张素系统(RAS)中介导血管收缩、水盐代谢及血管平滑肌增生和功能调节等生理学效应的重要组分,该基因位于3'端的A1166C多态性被认为与原发性高血压(EH)相关[1,2],但也有研究得到了不一致的结论,认为该多态性对于EH的发生无重要作用[3-5].本研究对136名健康者(对照组)和141例EH患者(EH组) 进行AT1R基因型检测,同时进行问卷调查、医学体检和血液生化项目检测,旨在探讨浙江省居民AT1R基因A1166C多态性与EH的关系,并从分子水平探讨EH的发病机制,为EH的早期防治提供依据.
-
结核分枝杆菌耐药机制及耐药性检测的研究进展
自20世纪80年代以来,结核病疫情重新上升,成为严重危害公共卫生的问题之一。据世界卫生组织估计,目前全球约有20亿人感染结核分枝杆菌(结核菌),其中约有5 000万人感染耐药结核菌[1]。因此对结核菌耐药机制和耐药性检测的研究意义重大。结核菌的耐药性的产生主要是由于不合理用药引起的结核菌内抗结核药物作用靶基因突变所致[2]。目前检测结核菌耐药性的方法有表型检测和基因型检测两大类。 一、结核菌的耐药机制 染色体基因变异是结核菌产生耐药性的主要机制。结核菌95%以上的基因变异是直接由于抗结核药物引起[2]。细菌可以通过染色体自身突变或者外源遗传因子如质粒或转座子而获得耐药性,但迄今为止结核菌中尚未发现质粒和转座子介导的耐药[2]。Musser等经大量研究发现大约12种基因突变和结核菌的耐药性有关。已确定主要为基因突变引起耐药性的抗结核药有利福平(RFP)、异烟肼(INH)、链霉素(SM)、吡秦酰胺(PZA)、乙胺丁醇(EMB)、喹诺酮类等。 1.RFP通过和结核菌中DNA依赖的RNA聚合酶的结合来抑制转录过程,导致细胞死亡[3]。96%RFP耐药菌株的产生是因为编码该酶β亚基的rpoB基因发生改变所致。这些改变主要是集中在rpoB中的81个碱基区域(利福平耐药决定区)内的各种突变,也有少量碱基插入或缺失,共35种,其中43%为531-Ser错义突变,此位点突变常见;36%为526-His错义突变。rpoB基因中513、526、531位点突变导致RFP高度耐药(MIC>32 μg/ml),尤以513位点突变产生的耐药性高;514、521、533位点突变导致RFP低度耐药(MIC<12.5 μg/ml)[4]。已知rpoB基因的9种突变同时和结核菌对利福布丁(refabutine)、利福喷丁(refapentine)等的耐药有关[3]。 2.INH被结核菌内过氧化氢-过氧化物酶(由katG基因编码)激活,作用于enoyl-ACP还原酶(由inhA基因编码),抑制杆菌酸和细胞壁合成。结核菌耐INH的机制比较复杂,katG基因的突变、部分缺失是主要机制,该基因的完全缺失在INH耐药株中只占很小一部分但导致高度耐药[5]。多数文献都对KatG基因中315位AGC突变成ACC及463位CGG突变成CTG作了报道,认为这两个突变和耐药性关系密切[6]。但近年来有些学者认为R463/L突变无意义[7]。inhA、katA、ahpC等基因和结核菌对INH的耐药关系正在研究之中,近又提出kasA可能是一个耐药相关基因[8]。InhA 突变也对乙硫异烟胺1314th(ETH 1314th)耐药[3]。
-
错配PCR技术在快速检测耐药结核分枝杆菌中的应用
耐药结核病的早期快速诊断是结核病控制中亟待解决的关键问题之一.利用基因型检测耐药性包括PCR产物直接测序法,错配PCR法等[1-2].错配PCR技术早由Newton等于1989年建立并用于人抗胰岛素基因缺陷的检查,目前已广泛应用于基因点突变的检测[3-4].根据PCR引物设计的不同,可将其分为间接错配PCR,即引物与野生型完全互补,以突变株为模板不能扩增得到PCR产物,和直接错配PCR,即引物与特定的点突变完全互补,以野生株为模板不能扩增得到PCR产物.已有用间接错配PCR方法检测结核分枝杆菌利福平耐药的报道[5-6].本研究以检测耐利福平的结核分枝杆菌rpoB基因531位点的点突变为对象,建立了直接错配PCR法,并与间接错配PCR法进行了比较.
-
丙型肝炎病毒基因分型的研究进展
丙型肝炎病毒(HCV)属于黄病毒科(Flaviviridae),其基因组为单股正链RNA,易变异,目前可分为6个基因型及不同亚型,根据2005年新达成的HCV基因型命名规则共识[1],以阿拉伯数字表示HCV基因型,以小写的英文字母表示基因的亚型(如1a、2b、3c等).由于1型和4型对于聚乙二醇干扰素联合利巴韦林标准化治疗较2型和3型更为耐药,因此HCV基因型检测在临床上具有重要意义.2004年中国<丙型肝炎防治指南>[2]指出,HCV RNA基因分型有助于判定治疗的难易程度及制定抗病毒治疗的个体化方案.
-
109例尖锐湿疣患者的 HPV 型别特点分析
目的:了解尖锐湿疣患者人乳头瘤病毒(human papilloma virus, HPV)感染的型别特点,为疾病的治疗和预后的判断提供理论依据。方法采用流式荧光-液态芯片技术对109例尖锐湿疣患者(男76例,女33例)进行 HPV 基因型别检测,分析男女患者感染 HPV 基因型及感染类型特点。结果尖锐湿疣患者的 HPV DNA 阳性检出率为87.16%,阳性检出率前6位的基因型分别为 HPV6、HPV11、HPV16、HPV39、HPV18、HPV51。男女患者之间 HPV DNA 阳性检出率差异无统计学意义;在 HPV 感染类型方面,女性多重感染率为78.57%,男性为53.73%,女性明显高于男性(P <0.05);在感染型别方面,女性高危型感染率为49.21%,男性为25.20%,女性明显高于男性(P <0.05)。结论尖锐湿疣患者感染的HPV 以低危亚型、多重感染为主,亦有一定比例的高危型感染。不同性别的尖锐湿疣患者感染 HPV 的特点有差异,男性患者以低危型别和单一类型感染为主,而女性以高危型别和混合的多重类型感染为主。HPV 感染对女性影响要大于男性,要重视对成年女性的 HPV 的筛查,做到及早发现及早治疗,改善女性的生活质量。
-
多引物对巢式PCR法检测HBV基因型的流行病学分析
目的:掌握我国北方地区乙型肝炎病毒(HBV)感染者HBV基因型分布情况,为了解其流行病学及临床意义提供基础.方法:首先采用巢式PCR法对801份血清进行HBV DNA检测,其中包括154份健康人血清、594份HBV感染的各类肝病患者及53例抗HCV阳性血清标本.再采用HBV A-F六个主要基因型特异性多引物对巢式PCR法对HBV DNA进行基因型检测及分析.结果:在801例血清标本中有464例(57.9%)检测到HBVDNA,其中154名健康人血清阳性率为8.4%(13/154),594例不同临床表现的乙肝患者血清HBV DNA总检出率为74.4%(442/594),二者相比差异显著(P<0.01);抗HCV阳性血清中检出HBV DNA占17%(9/53).464例HBV DNA阳性标本中,HBV基因型检出率分别是:A型为5.2%(24/464),B型为7.1%(33/464),C型为77.2%(358/464),D型2.4%(11/464),未检出E和F型,但尚有14例(3%)同时检出B型和C型,有24例未检出型别.急性肝炎、慢性生肝炎、肝硬化、原发肝癌各不同临床表现组间基因型分布无统计学差异.结论:结果看出,我国北方地区感染的HBV基因型存在A、B、C、D四个型别,其中C型为主(77.2%),各临床表现组基因型分布也均以C型为主,组间无统计学差异.
-
胎儿ABO血型的产前诊断
母儿血型不合中以ABO血型不合多见,常导致早期流产、胎儿贫血、水肿、甚至胎死宫内.为探讨产前诊断胎儿ABO血型的简便、准确、敏感性高、特异强的方法,我们根据B基因、A2基因、O1基因、O2基因与A1核苷酸序列突变位点的不同,设计出相应的特异性引物,用特异性序列-聚合酶链反应法,对2000年3月~2001年9月,在我院产科分娩的56例未破膜孕妇(新生儿、胎儿)及其丈夫[其中足月分娩28例(剖宫产23例,阴道分娩5例),引产28例(死胎9例,妊娠合心脏病2例,肺部恶性肿瘤1例,再生障碍性贫血2例,胎儿畸形8例,妊娠合并糖尿病酮症酸中毒1例,重度妊高征2例,羊膜带综合征1例,胎儿生长受限并巨细胞病毒感染2例)]进行羊水细胞A1、A2、B、O1、O2血型基因型检测.
-
DNA芯片技术用于贝母的基因分型和种类鉴别
目的通过对贝母几个种遗传多态性的研究来开发在分子水平上用于鉴别贝母基因型及不同种类的DNA芯片技术.方法用PCR扩增法和DNA直接测序法确定核苷酸多态性,用DNA芯片进行基因检测.结果首先提取来自多种贝母根茎的基因组DNA,对26S rDNA基因D2与D3区的多态性片段进行扩增和测序,然后将不同种属多态性片段的特异性寡核苷探针点置于经多聚赖氨酸处理包被的芯片.用来自不同种贝母的荧光素标记的PCR产物与DNA芯片进行杂交,可在芯片特定位置检测到不同种贝母的荧光信号.结论本研究显示DNA芯片技术可为植物种属的验证与质量控制提供一种快速、高通量的检测工具.
-
心房颤动合并感染患者华法林剂量调整的病例分析
目的:结合基因型检测为患者提供合理的华法林个体化抗凝治疗。方法通过参与1例因心房颤动发作、肺部感染加重、心功能不全的老年女性患者抗凝治疗过程,分析国际标准化比值(INR)升高的原因,结合基因型结果(CYP2C9*1/*1和VKORC1-1639 GA)调整华法林剂量,并进行用药教育以加强自我抗凝管理。结果与结论患者病情好转出院,出院前1天INR为1.46且处于上升趋势。临床可结合患者伴随疾病、合并用药、饮食等因素,在基因型检测指导下,缩短INR达标时间,提高抗凝治疗的有效性和安全性。
-
60例HIV/AIDS患者体内HIV-1耐药基因变异特征分析
目的:研究HIV/AIDS患者体内HIV-1遗传基因变异情况,并分析其耐药性.方法:从60例患者血浆中提取病毒RNA,运用RT-PCR和套式聚合酶链反应(Nested-PCR)扩增HIV-1 pol区基因片段,并对扩增的目的片段进行测序,将测序结果提交Web站点db.stanford,edu分析耐药性变异情况.结果:蛋白酶编码区和逆转酶编码区分别发生了V32AV、M46IM和TAMs、MI84V、K103N、Y181C等多种耐药位点变异,造成对NFV、ATV/r、FPV/r、IDV/r、LPV/r蛋白酶抑制剂和多种逆转酶抑制剂的耐药性.蛋白酶和逆转酶耐药发生率分别为1.67%(1/60)和53.33%(32/60).旦Fisher确切概率法统计结果显示不同治疗方案组之间耐药性差异无统计学意义(P>0.05).结论:耐药变异是导致抗艾滋病毒治疗失败或疗效降低的主要原因,河北省应加强对HIV/AIDS患者的耐药性监测,适时更新治疗方案以获得较好的疗效.
关键词: 人类免疫缺陷病毒Ⅰ型 抗病毒治疗 基因型检测 耐药变异 -
NAD(P)H:醌氧化还原酶1基因与2型糖尿病相关性研究
NAD(P)H:醌氧化还原酶1(NQO1)是一个含274个氨基酸的黄素蛋白,又称DT-黄递酶,可催化双电子还原以及降解醌及其衍生物的毒性,从而保护细胞对抗氧化还原循环以及氧化应激[1].由于醌及醌异构体可以抑制胰岛素的分泌,因此,NQO1对β细胞以及胰岛素分泌也具有保护作用.研究发现,NQO1基因P187S纯合突变可导致NQO1蛋白活性的丢失[2].我们应用PCR-RFLP方法对198例中国汉族人进行基因型检测,旨在研究NQO1基因P187S多态性与2型糖尿病的相关性,报告如下.
-
氯吡格雷抗血小板治疗个体化用药基因型检测指南解读
氯吡格雷(clopidogrel)是心血管疾病中广泛用于抗血小板的药物.氯吡格雷治疗可明显改善经皮冠状动脉介入治疗术(PCI)术后患者的主要心血管预后,但仍有5%~15%的患者在1年内会出现包括死亡、心肌梗死和脑卒中在内的临床终点事件.产生个体差异的原因除了患者的依从性、冠心病危险因素(肥胖、糖尿病、吸烟)和药物之间的相互作用等因素外,基因变异也扮有重要作用,特别是直接参与这些药物处置、代谢、转运的基因变异.2010年3月,美国食品药品监督管理局(FDA)宣布氯吡格雷抵抗的“黑框警告”,提醒应用氯吡格雷后出现心血管不良事件与CYP2C19功能缺失的等位基因有关.本文结合中国人的临床证据,解读临床药物基因组学实施联盟(CPIC)的CYP2C19基因检测和氯吡格雷个体化治疗的证据和指南[1-2].
-
利巴韦林治疗器官移植患者慢性戊型肝炎病毒感染的疗效
【据《N Engl J Med》2014年5月报道】题:利巴韦林治疗器官移植患者慢性戊型肝炎病毒感染的疗效(作者Kamar N等)
目前针对戊型肝炎病毒感染还没有明确的治疗方案。为了评估利巴韦林单药治疗接受实体器官移植患者长期感染戊型肝炎病毒的病毒血症的疗效。Kamar N等回顾了59名曾经接受实体器官移植患者的记录(37名肝肾移植,10名肝移植,5名心脏移植,5名肾及胰腺移植,2名肺移植)。在确诊戊型肝炎病毒感染后的平均时间达到9个月(1~82个月)开始治疗,利巴韦林平均治疗剂量为600 mg/d(29~1200 mg/d),相当于每天每公斤体重8.1 mg(0.6~16.3 mg)。患者服用利巴韦林的平均时间为3个月(1~18个月),66%的患者服用利巴韦林3个月或少于3个月。所有患者在利巴韦林起始治疗时存在戊型肝炎病毒血症(54名进行基因型检测者均为3型)。治疗结束时,95%的患者达到了戊型肝炎病毒清除。其中有10名患者在停用利巴韦林后出现戊型肝炎复发。59人中有46人(78%)达到持续病毒学应答,即利巴韦林治疗终止至少6个月后血清中检测不出戊型肝炎病毒RN A。有4例持续病毒学应答的患者出现了戊型肝炎复发,其治疗又延长了很长一段时间。利巴韦林起始治疗时较高的淋巴细胞计数增加了持续病毒学应答的可能性。贫血是其主要副作用,有29%的患者需要减少利巴韦林的剂量,54%使用促红细胞生成素,12%的人输血。 -
浅谈进行HPV-DNA负荷量及基因型检测在诊断宫颈病变中的效果
目的:分析进行HPV(人乳头瘤病毒)-DNA负荷量及基因型检测在诊断宫颈病变中的效果。方法:选取近期我院收治的76例宫颈病变患者,将其作为本次研究的对象。这些患者的病情均经阴道镜活检予以确诊。对这些患者均进行HPV-DNA负荷量及基因型的检测,然后观察其检测结果。结果:对这76例患者进行HPV-DNA负荷量及基因型检测的结果显示,在这些患者中,有4例宫颈糜烂患者,有9例CINⅠ患者,有11例CINⅡ患者,有15例CINⅢ患者,有37例宫颈癌患者。这76例患者均出现HPV感染,其感染的类型主要为单一感染,其感染HPV的基因型主要为HPV16。患者HPV-DNA 的负荷量越大,其病情越严重。结论:对宫颈病变患者进行HPV-DNA负荷量及基因型的检测,可以明确地判断出患者宫颈病变的类型及程度。此检测方法具有较高的临床应用价值。
关键词: HPV-DNA负荷量 基因型检测 宫颈病变 诊断 应用效果 -
CYP2C19基因型检测指导P2Y12受体阻滞剂应用的研究进展
急性冠脉综合征(Acute coronary syndrome,ACS)是全球范围内引发猝死的主要原因,其发生是由于血小板聚集引起冠脉急性闭塞所致.阿司匹林和氯吡格雷已经成为ACS及经皮冠状动脉介入治疗(Percutaneous coronary intervention,PCI)术后患者抗栓治疗的基石,防止PCI术后发生主要不良心血管事件(Major adverse cardiovascular events,MACE).然而,尽管接受阿司匹林及氯吡格雷双联抗血小板治疗,部分患者仍可再发缺血性心血管事件,考虑存在抗血小板药物抵抗.研究表明,亚洲人群中氯吡格雷抵抗(Clopidogrel resistance,CR)发生率较高,且受多种因素影响,其中基因多态性起着至关重要作用.全面了解不同基因型对氯吡格雷反应的差异,结合血小板聚集率检测,合理选择P2Y12受体阻滞剂,可以显著改善ACS患者预后.
-
CYP2C19基因型检测对PCI术后氯吡格雷应用的指导作用
抗血小板药物的应用是冠心病治疗的关键环节.为防止支架内血栓形成等不良心血管事件,第二代P2Y1 2-ADP受体拮抗剂氯吡格雷已广泛应用于经皮冠状动脉介入术后的抗血小板治疗.研究发现,氯吡格雷疗效的个体差异性与功能丧失的酶P450系统中的CYP2C19基因有关.该文主要介绍CYP2C19基因型测定对PCI术后氯吡格雷应用的指导价值.
关键词: 氯吡格雷抵抗 CYP2C19基因多态性 基因型检测 -
乙型肝炎病毒B、C基因型感染者特异性、非特异性细胞毒性T淋巴细胞的变化和意义
对120例慢性乙型肝炎(CHB)患者行HIBV基因型检测,比较CHB患者B、C基因型之间HBV特异性CTL及非特异性CTL的差别,并探讨其临床意义,现报道如下.
-
中国北方地区乙型肝炎病毒基因型分布的临床意义
近年发现,根据HBV DNA-S区的碱基不同,HBV的基因型可分为A~H 8个基因型,不同基因型在各地区的感染率各异,感染后临床表现及对药物治疗反应有区别,为深化研究乙型肝炎的流行、预防和治疗特点,对我院收治的北方地区慢性HBV感染者进行了HBV DNA基因型检测,结合被检测者的临床情况作简要分析,发现其中一些规律,报告如下.