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多维生素转运体
维生素利用一直是科学家及医学工作者所热衷的主题,与人类健康息息相关.目前已发现某些水溶性维生素的吸收过程是由专有的转运体介导的.本文主要综述了泛酸、生物素、硫辛酸共用的转运体的基因结构,蛋白质结构、组织分布、克隆表达后的功能特点、染色体定位及转运过程的调控,此转运体因三种维生素共用而称多维生素转运体(SMVT),有着明显的底物特异性,广泛的存在于机体各组织中,可能是Na+依赖的葡萄糖载体家族成员,由蛋白激酶C介导的通道调节,其基因位于人染色体2P23.此转运体的发现为研究维生素缺乏病及如何促进维生素利用提供了新的途径.
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6A8 α-甘露糖苷酶基因的mRNA表达与染色体定位
目的对6A8 α-甘露糖苷酶基因作染色体定位,比较6A8 α-甘露糖苷酶mRNA在人多种免疫细胞株的表达。方法用Fish原位杂交作染色体定位,用RT-PCR检测mRNA表达。结果 6A8 α-甘露糖苷酶基因定位于人第13号染色体长臂的31~32区。6A8 α-甘露糖苷酶mRNA在B细胞株SKW 6高表达,在B细胞株3D5、BJAB、CESS、Daudi、Nalm 6中度表达,在B细胞株Navalm,T细胞株GM、Jurkat,组织细胞瘤细胞株U937弱表达,在T细胞株Peer,慢性髓性白血病细胞株K562极弱表达。结论 6A8 α-甘露糖苷酶基因定位于人第13号染色体长臂的31~32区,其mRNA表达水平在各种人免疫细胞株不同。
关键词: 6A8α-甘露糖苷酶 染色体定位 mRNA表达 -
帕金森病的遗传学研究进展
帕金森病的发病机制至今仍不清楚.近年来流行病学调查,双生子研究以及作为孟德尔性状分离的家系遗传连锁分析等均证明帕金森病的发病具有遗传病原学原因.目前,研究已发现10个染色体定位以孟德尔遗传方式与帕金森病连锁(表1).其中,5个涉及常染色体显性(Autosomal dominant, AD)遗传4个以常染色体隐性(Autosomal recessive, AR)遗传方式传递,1个可能属于晚发性散发帕金森病.在这些染色体定位中有4个基因已被克隆:α-synuclein(又名突触核蛋白)基因、parkin基因、DJ-1基因和UCH-L1基因.
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Sp蛋白家族及其表达对胰腺癌的重要作用
Sp1蛋白(specificity protein 1)是第一个为人类所识别与克隆的转录因子,该蛋白分布广泛,具有与特定序列DNA结合并对多种基因进行激活的功能.近年来,与Sp1蛋白结构类似,功能相关的多种蛋白相继被识别与克隆,并被称为Sp蛋白家族.该文就业已发现的Sp蛋白种类、分布、染色体定位、蛋白结构、发挥激活功能的机制,以及近期研究发现Sp蛋白家族成员Sp1、Sp3、Sp4在胰腺癌细胞中的重要作用进行综述.
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人类胆固醇结石的遗传学研究进展
胆石病是人类常见的胃肠疾病之一,它的发病机制还构未完全清晰,但已较清晰地建立了以胆汁分泌、成核和胆囊动力--三方面缺陷为基础的胆石形成机制的学说.近年来遗传流行病学和动物模型的分子生物学研究表明,遗传性是胆石病的重要特点之一,并已成功发现20个LITH基因,有45个胆石病侯选基因在小鼠模型和在人类的染色体定位,现将已经进行的人类胆固醇结石的易感基因作一综述.
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维甲酸诱导的基因RA109染色体定位和蛋白质定位
目的确定全反式维甲酸诱导肺腺癌细胞系GLC-82表达上调的基因RA109在染色体上的位置及其编码蛋白在细胞中的位置。方法应用辐射杂交细胞系(RH)定位的方法进行染色体定位,应用绿色荧光蛋白(GFP)基因作为报告基因,结合荧光显微摄影进行蛋白质定位。结果将RA109基因定位在5号染色体长臂5q35,RA109蛋白定位在细胞核。结论 RH定位是一个快速、简捷、精确的染色体定位方法,以此方法可将RA109定位在5号染色体长臂的一个疾病基因富含区。利用GFP进行蛋白质定位简单明了,以此可将RA109蛋白定位在细胞核这个重要的细胞结构中。
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PINK1基因与帕金森病
帕金森病(Parkinson's disease,PD)是一种常见的神经系统退行性疾病,病理以黑质多巴胺能神经元的丧失和路易体(Lewy body)的形成为特点.大多数PD患者无家族史,约15%患者有家族史.研究已发现11个染色体定位以孟德尔遗传方式与PD连锁,其中5个呈常染色体显性(autosomal dominant,AD)遗传,4个呈常染色体隐性(autosomal recessive,AR)遗传(表1).
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HIV基因结构及遗传信息传递研究
人类基因组计划接近完成,随后的基因组后计划是进一步寻找和确定大量致病基因并了解其功能,这要求我们进一步研究像HIV、HBV等病原体的基因结构和特点,基因组的表达和调控,从基因序列构成,染色体定位,基因组变异等方面入手,为抗HIV治疗开辟一条新途径.
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初发鼻咽癌差异基因的染色体定位及功能分析
目的 利用基因芯片技术探索初发鼻咽癌(primary nasopharyngeal carcinoma,pNPC)与鼻咽黏膜慢性炎症组织(chronic nasopharyngitis tissue)差异基因的染色体定位和功能分析.方法 用Affymetrix Gene 1.0 ST芯片检测pNPC与鼻咽黏膜慢性炎症组织基因表达谱差异,并利用生物信息学方法对差异基因进行染色体定位和功能分析.结果 差异倍数3倍以上共有102个基因,其中表达上调25个,表达下调77个;差异基因染色体定位分析,发现5个差异基因未知其定位,其余97个差异基因在1号染色体上分布多,包含16个,其次为3号染色体,包含13个;从差异基因功能分类看,属于酶活性基因多,其余依次为蛋白结合、免疫、钙黏合等,以上4大类共占差异基因总数65.6%.结论 pNPC差异基因散在分布在各染色体,以1、3号染色体多;4大类(酶活性、蛋白结合、免疫相关、钙黏合)相关基因异常在癌变过程中发挥重要作用.
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复发鼻咽癌差异基因分析及染色体定位初步研究
目的 通过基因芯片和生物信息学来筛选复发鼻咽癌(recurrent nasopharyngeal carcinoma,rNPC)差异基因及染色体定位和功能分析.方法 选择初发鼻咽癌(primary nasopharyngeal carcinoma,pNPC)和rNPC,应用Affymetrix Gene1.0 ST芯片筛选差异基因;应用生物信息学对差异基因进行染色体定位和功能分析.结果 差异基因共44个,其中下调基因36个,上调基因8个.基因功能分类显示,下调基因大部分属于酶活性基因(10个,27.8%),其次为钙黏合基因(7个,19.4%)、蛋白结合基因(5个,13.9%),这3类基因占了下调基因总数的61.1%,另外,受体活性基因(4个,11.1%),转录因子基因和三磷酸腺苷黏合基因各2个(各占5.6%),细胞外基质黏合基因和生长因子黏合基因各1个(各占2.8%),4个基因的功能未知(11.1%);上调基因中,3个基因的功能未知(37.5%),酶活性基因(2个,25.0%),受体活性、钙黏合、电压门压通道调控基因各1个,各占12.5%.这些差异基因分布在大多数染色体上,主要分布在1和17号染色体上.1号染色体上包含10个基因(22.7%),17号染色体包含5个基因(11.3%).结论 差异基因分布在大多数染色体上,但主要分布在1和17号染色体上,酶活性、钙黏合及蛋白结合基因这三类差异基因可能在rNPC中扮演着重要的角色,需要进一步深入研究.
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人分化相关基因Ndr3的克隆、组织表达谱及亚细胞定位研究
目的:研究人源分化相关新基因Ndr3的克隆、组织表达谱及亚细胞定位.方法:采用电子拼接和PCR扩增技术,从人22周孕龄胎肝cDNA文库中获得与人Ndr1基因同源的一段表达性序列标签,继而从成人脑cDNA文库分离出Ndr3的全长cDNA;采用点杂交分析和多组织Northern杂交分析方法,确定其组织表达谱;将其亚克隆入绿色荧光蛋白表达载体pEGFP-N1,用脂质体介导法转染COS-7细胞,确定其亚细胞定位.结果与结论:Ndr3的全长cDNA为2879bp,其开放阅读框(ORF)编码375个氨基酸,染色体定位为20q12-11.23.Northern 杂交和点杂交分析显示,NDR3在脑组织和睾丸中高表达,在肾、心肌和前列腺中有一定量的表达,在胚胎组织的表达较低,在8种人肿瘤细胞中的表达极低.与绿色荧光蛋白融合表达的实验结果显示,该蛋白定位于核外胞浆内.
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两个非综合征型唇腭裂家系染色体定位研究
目的:通过对两个非综合征型唇腭裂家系基因连锁分析,寻找与非综合征型唇腭裂紧密连锁的染色体区域.方法:对非综合征型唇腭裂家系成员进行全基因组扫描,并对结果中有连锁意义的区域进一步精密扫描,将扫描数据用参数连锁、非参数连锁和交互连锁分析,确定哪些染色体区段存在连锁.结果:1q32.2-41区域的参数和非参数连锁分数值在精密扫描中均明显升高;2p25.1-24.2区域参数结果并无意义,但非参数分析却显示了积极的连锁意义;交互乘法模型分析1q32.2-41和2p25.1-24.2区域存在积极的交互相乘作用.结论:本研究中的2个非综合征型唇腭裂家系,1q32.2-41和2p25.1-24.2区域可能存在易感基因,且1q32.2-41和2p25.1-24.2区域存在着相乘交互作用.
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两个大肠癌负相关新基因的研究
目的在分子水平寻找与人大肠癌的发生发展相关的新的因素,研究两个大肠癌负相关基因的结构与功能.结果已完成两个新基因的全长cDNA序列分析及染色体定位等结构研究,并进行了两基因的核酸与蛋白表达研究及功能研究.SNC6基因全长3168pb,定位于染色体22q13区带,共有12个外显子及11个内含子.SNC19全长3152bp,定位于染色体11q24区带.两个基因于1998年被国际命名委员会分别命名为ST13、ST14基因,并被列入人类基因组图谱中.对比二个新基因在正常大肠粘膜及癌组织核酸水平表达情况,癌组织低于正常粘膜,在不同肿瘤细胞系及组织中表达不一.两基因均已获得了表达蛋白.ST13已制备了单抗,经免疫组化检测表达与核酸表达结果相似,经体内外研究ST13基因有抑制大肠癌细胞系生长的作用.ST14已明确为丝氨酸蛋白酶家族成员.结论SNC6与SNC19基因可作为新的大肠癌相关基因加以研究,利用.目前仍需继续深入研究该两基因的功能.
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极低密度脂蛋白受体与脂代谢研究进展
极低密度脂蛋白受体(very low density lipoprotein receptor,VLDLR)是一种细胞膜表面的蛋白质,它主要负责结合和内移含载脂蛋白E的脂蛋白,如极低密度脂蛋白(very low density lipoprotein,VLDL),向肝外组织提供甘油三酯作为能量来源.早在20世纪80年代初期,同济医科大学冯宗忱等人就发现了VLDL可以被巨噬细胞摄取、降解,推测可能存在自身受体代谢途径,提出了"VLDLR假说".1992年,Takahashi等成功的克隆了兔的VLDLR,并且阐明了其氨基酸序列和功能域.1994年,Sakai等[1]成功的分离了人的VLDLR基因,分析了其结构和染色体定位.目前,随着人们对VLDLR的研究不停的深入,已经逐步认识到该受体对脂代谢紊乱,动脉粥样硬化,胰岛素抵抗方面有着重要的影响,并且开始运用分子生物学的技术挖掘它的治疗潜力.
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第二代法医DNA指纹的研究
1985年英国科学家Jeffreys等人应用基于限制性片段长度多态性的多基因座探针技术(DNA fingerprinting,DNA指纹),克服了传统法医物证检验鉴别机率低的缺陷,使法医学个人识别和亲子鉴定实现了从只能排除到高概率认定的飞跃,标志着法医物证检验技术新纪元的开始.然而,DNA分型技术作为一种崭新的科技手段应用于法庭审判,在世界各国引起了巨大的争论与关注.近年研究证明,应用Jeffreys的DNA指纹法进行法医物证检验有一定限制.DNA指纹分析在标准化方面的困难和对检材需求量的苛求,至今难以克服.加之,DNA指纹分析无法确定每条谱带的染色体定位以及各位点之间的独立性,其概率计算至今仍有争论.因此,大多数国家转向了以单基因座多态性为基础的DNA分析技术.
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小鼠先天性骨肾畸形综合征致病基因ldgene所在染色体的确认
通过对C57BL/6.KM-ld同源导入近交系小鼠的19条染色体上的29个微卫星位点进行SSLPs分析,表明,ld基因与2号染色体上的D2Mit30,D2Mit62和D2Mit63连锁,与其它染色体上的位点不发生连锁,因此,我们可以初步将ld基因定位于2号染色体上.
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肿瘤坏死因子在肝癌研究中的应用
肿瘤坏死因子(TNF)是一种多功能的细胞因子,研究表明,单核巨噬细胞、淋巴细胞均能产生TNF,分别称之为TNFα、TNFβ,而由NK细胞产生的TNF定名为TNF-γ,三者的氨基酸组成及细胞来源有差别,但基因结构、染色体定位和生物活性极为相似.近年来有关TNF的基因研究和临床应用日益受到重视,现就TNF在肝癌研究中应用作一综述.
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肿瘤抑制因子——白细胞介素24的研究进展
在对肿瘤基因治疗的研究中,用成纤维细胞IFN-β(干扰素-β)和MEZ(Mezerein,蛋白激酶C活化剂抑制毒素)处理人的黑色素瘤细胞,产生了不可逆的生长阻遏和终末分化,并引起细胞程序性凋亡[1].为了研究并解释发生这种现象的原因,1995年Jiang等[1]采用了消减杂交的方法,终鉴定出了mda-7(Melanoma differentiation associated gene-7)基因,根据它的结构,包括与已知细胞因子的同源性、染色体定位、原始信号肽、分泌类型、免疫功能等才可以说明IL-24是一种细胞因子,而且是目前发现的唯一一种具有肿瘤抑制和免疫刺激作用的双重因子[2].
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动脉粥样硬化易感基因挖掘与生物信息学分析
目的 挖掘动脉粥样硬化(AS)易感基因,为寻找 AS 正确的诊断和治疗方法提供线索和数据支撑.方法 从 PubMed、OMIM 和GEO数据库检索AS相关数据,利用SMD在线工具对AS易感基因进行染色体定位,并通过DAVID和STRING10.0软件进行基因功能注释和蛋白互作分析.结果 共获得AS易感基因454个,其染色体定位分布不均匀,以1、11、2和4号分布较多,Y染色体多于X染色体上的分布;AS易感基因富集在24个生物学功能注释单元中,其中44个编码蛋白存在互作关系,涉及多种生物学过程和分子功能.结论 AS易感基因的控掘与生物信息分析为AS的分子水平机制研究提供了数据平台,为多基因复杂疾病的基因挖掘提供了有效方法.
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噬菌体整合酶--基因转移的工具酶
噬菌体整合酶是整合位点序列特异性的酶类.由于这一特性,它可用于向染色体定位特异性地导入目的基因,在遗传工程、基因治疗、转基因动物等领域极具应用前景.本文综述噬菌体整合酶的发现与分类、结构与功能及其应用前景.