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消化功能差试试喝羊奶
乳类及其制品是人类优质的食品之一.单从动物奶类的角度来看,牛奶与羊奶没有本质区别,都含有较优质的蛋白质、脂肪,而且矿物质含量,尤其是钙含量都很丰富.由于牛奶的产量高,所以经常食用的是牛奶,少见羊奶.首先羊奶的蛋白结构与牛奶不同,羊奶中酪蛋白含量比牛奶低,乳清蛋白比例高,更接近于人奶,蛋白微粒小,更容易被人体吸收;而且羊奶中异体蛋白含量也较少.因此,对牛奶过敏和体质较弱的人群可以试试选用羊奶.其次羊奶中脂肪粒比牛奶细小,更易吸收.
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南宁分离株A(H3N2)流感病毒神经氨酸酶遗传变异及蛋白结构分析
目的 应用生物信息学方法分析南宁市2007-2012年A(H3N2)亚型流感病毒分离株神经氨酸酶NA的遗传变异规律、二硫键、酶活性中心位点、抗原决定簇位点、糖基化位点及蛋白结构变化情况. 方法 通过RT PCR扩增H3N2病毒NA基因并测序,运用生物软件对所测序列进行拼接和同源比对;通过构建系统进化树分析进化规律,通过同源建模分析蛋白结构的变化. 结果 系统进化树将40株NA基因序列分为4个类群,呈多侧支流行;毒株的二硫键高度保守,酶活性中心位点224和位点276出现氨基酸的替换,部分毒株NA抗原决定簇328、332、336、434氨基酸位点发生替换;所有毒株200、329和402糖基化位点全部丢失,部分毒株在367位点增加一个糖基化位点,在234位点丢失一个糖基化位点;HA晶体结构分析氨基酸突变位点主要发生在β折叠部位和无规则卷曲部位. 结论 南宁分离株A(H3N2)亚型流感病毒变异活跃,抗原决定簇位点、酶活性中心位点、糖基化位点均出现氨基酸的替换.因此应继续加强对南宁市的流感监测,及时了解当地流感的流行趋势和病毒的抗原变异情况,为全国的流感预防、控制、预测及流感疫苗株的开发提供理论依据.
关键词: A(H3N2)亚型流感病毒 神经氨酸酶 遗传变异 蛋白结构 同源建模 -
2013-2014年南宁市A(H3N2)亚型流感病毒病原学特征分析
目的 分析南宁市2013-2014年A(H3N2)亚型流感病毒的病原学特征及流行趋势. 方法 通过RT-PCR扩增毒株A(H3N2)病毒血凝素(HA)基因和神经氨酸酶(NA)并进行同源比对,采用Mega5.1(N-J法)构建系统进化树,统计氨基酸位点的差异,同源建模后分析蛋白结构的变化. 结果 构建系统进化树,20株毒株HA基因与NA基因均分为4个类群,呈多侧支流行;部分毒株的HA蛋白A抗原决定簇144位点及B抗原决定簇156和158位点发生突变,二硫键和糖基化位点高度保守,未发生变化;NA蛋白抗原基本稳定,只有A/Nanning/43/2014(H3N2)毒株抗原决定簇312位点发生突变,二硫键、酶活性位点、糖基化位点及耐药性位点均未发生变化;HA和NA蛋白晶体结构分析显示氨基酸突变位点主要发生在β折叠部位和无规则卷曲处. 结论 南宁市A(H3N2)亚型流感病毒株变异活跃,在HA基因和NA基因进化树上疫苗株明显滞后于南宁市流行株,抗原决定簇位点出现氨基酸的替换,但关于疫苗的预防效果尚需进一步验证.
关键词: A(H3N2)亚型流感病毒 血凝素 神经氨酸酶 蛋白结构 同源建模 -
基因克隆技术及其进展
基因克隆技术,又称重组 DNA技术,是将目的基因与具有自主复制能力的载体 DNA进行体外重组,获得新的重组 DNA后导入受体细胞中表达相应蛋白,以研究蛋白结构与功能及其与其他分子的相互作用。近,随着非编码 RNA的发现,这项技术也用于 RNA的研究。基因克隆技术从发明到现在经历了三个发展阶段。第一个阶段是20世纪70年代初经典的基因克隆技术的创建[1-2]。经典的基因克隆技术是需要限制性内切酶和连接酶的克隆方法,至今仍被广泛应用。第二个阶段是20世纪90年代初不依赖连接酶的克隆方法的出现[3]。这种方法不需要连接酶的参与,不受限制性内切酶的限制,使得基因克隆更加灵活。第三个阶段是21世纪初将重组酶运用到基因克隆中[4],使基因克隆更加强大,靶向性更强,操作更简便。本综述从基因克隆技术发展的这三个阶段入手,概述各项方法的原理和特点,方便人们根据自己的需求选择合适的基因克隆方法。
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内在抗病毒因子Trim5α抗HIV-1作用研究进展
2004年Stremlau等在恒河猴体内发现Trim5α蛋白能有效地阻断HIV病毒的感染[1]。Trim5α属于三重基序蛋白( tripartite motif protein,Trim)家族中的一员,该家族蛋白结构中包含一个典型的RING结构域,一个或两个B-Box结构域及一个卷曲螺旋Coiled-Coil结构域,因此又被称为RBCC蛋白。目前已发现的人类Trim家族基因超过70余种,Trim蛋白家族的基因散在地分布在人类染色体上,其编码的蛋白广泛分布于细胞核及细胞质中。Trim蛋白家族涉及的生物学功能广泛,与细胞的分裂、生长、分化、成熟及免疫都有密切关系[2]。许多Trim家族成员,还具有限制反转录病毒感染的能力[3],其中Trim5α蛋白的抗HIV-1活性引起了众多研究者的关注。
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一例HBV/HDV重叠感染患者血清中HDAg的基因克隆、表达及细胞内定位
丁型肝炎病毒( hepatitis Dvirus,HDV)属于缺陷病毒,其借助乙型肝炎病毒(H BV)的核壳蛋白完成自身生命周期.研究已证实,HDV感染可抑制机体内HBV的复制,但临床上却加剧病情迅速恶化.HDV的基因组仅含1个开放读码框架,分别编码S-HDAg和LHDAg两种功能蛋白.尽管两者在蛋白结构上基本相似,但功能截然相反,因此探讨HDAg某些特殊或重要功能结构域仍是该领域研究热点.基于此,我们从1例HBV/HDV重叠感染患者血清中成功克隆出了HDAg基因,并对其蛋白的生物学特点进行了初步分析.
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大鼠肝再生相关基因LRRP1的克隆化
目的:利用抑制性消减杂交技术构建大鼠肝脏部分切除术后差异表达基因的cDNA文库,并通过同源引物反转录PCR的方法克隆大鼠肝再生相关基因LRRP1的全长序列.方法:分别提取肝脏部分切除术后24h以及对照大鼠肝脏mRNA,以之为模板合成cDNA,称为测试和驱动.酶切消化后将测试分成两组,分别与不同的接头连接,分别与驱动进行杂交,然后混合两份杂交液,加入过量的驱动不经变性进行第二次杂交即消减杂交.之后进行两次PCR扩增,将产物克隆入质粒载体,构建差显文库,测序后以生物信息学技术进行序列同源性比较.通过同源引物反转录PCR的方法克隆基因全序列,并用软件分析其蛋白结构.结果:成功构建大鼠肝脏部分切除术后的cDNA差显文库,消减效果良好.将所得的部分基因进行测序分析,选择一个未知序列,通过同源引物反转录PCR的方法克隆到大鼠肝再生相关基因LRRP1的全长序列,并初步分析了其蛋白结构.结论:确定了大鼠肝再生相关蛋白LRRP1的基因序列,并证明其在大鼠肝再生过程中高度表达.
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功能基因组学中的功能缺失研究策略
0引言在功能基因组学(functional genomics)研究中,阐明各种蛋白的结构和生物学功能是其核心任务,不仅是生物学的主要研究方向,而且也是医学研究的主要内容,毕竟细胞的功能和表型是由细胞中的蛋白来主导的,许多疾病都是蛋白结构与功能、表达水平与调节的异常引起的.研究蛋白的功能,常常通过改变蛋白的表达水平,观察细胞的生物学特性的变化,来研究蛋白相应的生物学功能.这种研究策略包括强制性地升高特定蛋白的表达水平,也包括蛋白表达水平的缺失.研究表明,在功能基因组研究中,功能缺失(loss of function,LOF)策略具有特殊重要地位.
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乙型肝炎病毒和丙型肝炎病毒与增生细胞核抗原的关系
0引言增生细胞核抗原(proliferation cell nuclear antigen,PCNA)位于真核细胞中,为一环形发夹样蛋白结构,与复制因子和细胞周期蛋白p21(Cip1/Waf1)相互作用,是DNA延长的"分子开关".他不仅对于DNA的复制,而且对于细胞的许多功能都是必需的,因此对于PCNA调节DNA复制及阐明蛋白相互作用的确切机制的理解是非常重要的.
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丙型肝炎病毒复制子的研究
0引言丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)的感染是急、慢性肝病的主要致病因素之一,他的感染通常是亚临床的,或只出现轻微的症状,但大约80%的患者难以清除病毒,发展为慢性感染,从而更易演变为肝硬化和肝细胞肝癌,目前世界范围都大约有1.7亿人口感染了HCV[1],由于其高流行性、隐匿的病程和持续感染的诊断不足使得其成为严重的医学和社会经济学问题.病毒基因组约在10a以前就被鉴定出来,并且引起了对HCV基因结构、病毒蛋白结构和生化特征的研究.但由于HCV基因组表现出显著的序列变异,尤其是在E2包膜蛋白编码区的高变区,并且在全球范围内,HCV的基因型多达30个[2].
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巨噬细胞移动抑制因子的研究进展
1人类巨噬细胞移动抑制因子介绍
1.1 MIF基因及蛋白结构人类巨噬细胞移动抑制因子(macrophage migration inhibitory factor,MIF)基因小于1kb,包括3个外显子和2个内含子,外显子长度为66、107、172个碱基,内含子为94个和188个碱基。D-多巴色素互变异构酶的基因(DDT)是唯一与MIF具有同源性的基因,与MIF共同定位于22号染色体[1]。提示,MIF与DDT基因可能来源于同一个原始基因,在不断进化中变成具有不同生物功能的2个基因,哺乳动物MIFs与DDT高达90%的同源性。 -
锁骨颅骨发育不良家系致病基因突变及蛋白结构变化
目的:检测一个锁骨颅骨发育不良综合征( CCD )家系RUNX2基因突变情况,分析突变体蛋白结构的变化。方法对家系患者进行X线片检查,抽取外周静脉血,提取基因组DNA,采用聚合酶链反应( PCR)扩增RUNX2基因并测序,对测序结果进行Blast分析。运用Swiss-Model软件预测, SWISS-Pdb、 Ras-Mol浏览器分析突变体蛋白构像。结果 CCD家系患者RUNX2基因编码序列在外显子3发生错义突变c.674 G>T (p.R225L)。蛋白结构预测分析显示,突变体蛋白由于亲水性精氨酸为疏水性的亮氨酸所替代,引起分子内部分氢键基团丢失以及分子表面静电势能改变。结论 RUNX2基因c.674G>T (p.R225L)杂合突变是该家系发病的分子基础,氨基酸序列的改变对蛋白质的空间结构产生影响。
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FMS样酪氨酸激酶3及其突变与白血病
FMS样酪氨酸激酶3(FMS-like tyrosine kinase-3,FLT3),也称为胎肝激酶2(fetal liver kinase-2, FLK-2)和人干细胞激酶1(human stem cell kinase-1, STK-1),是Ⅲ型受体酪氨酸激酶(class Ⅲ receptor tyrosine kinase, RTKⅢ)家族成员之一,于1991年由两个研究小组分别克隆.FLT3与其他RTKⅢ家族成员包括集落刺激因子1受体(CSF1R或FMS)、血小板衍化生长因子(PDGFR)、干细胞因子受体(KIT)等基因序列非常相似,其蛋白结构均包括5个Ig样结构域组成的胞外区,一个跨膜区,一个近膜区(juxtamembrane, JM),以及胞内由激酶插入区分隔而成的两个酪氨酸激酶(tyrosine kinase,TK)区.
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Sp蛋白家族及其表达对胰腺癌的重要作用
Sp1蛋白(specificity protein 1)是第一个为人类所识别与克隆的转录因子,该蛋白分布广泛,具有与特定序列DNA结合并对多种基因进行激活的功能.近年来,与Sp1蛋白结构类似,功能相关的多种蛋白相继被识别与克隆,并被称为Sp蛋白家族.该文就业已发现的Sp蛋白种类、分布、染色体定位、蛋白结构、发挥激活功能的机制,以及近期研究发现Sp蛋白家族成员Sp1、Sp3、Sp4在胰腺癌细胞中的重要作用进行综述.
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细胞因子在急性胰腺炎发病中的作用
细胞因子是一个多种低分子蛋白(通常16~25 kD)的组群,它们由许多细胞产生而作为一种细胞与细胞间通讯的方式.已知的细胞因子数量不断增多,目前已超过30种,每一种均伴有一个明显蛋白结构和生物活性范围,尽管这些单个蛋白质间有明显不同且常常对立的生物学特性,它们均共有几种重要的特点.
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端粒酶和滋养细胞及相关疾病研究进展
染色体末端特殊的核蛋白结构端粒是维持染色体稳定的重要因素.没有新的合成,每一次有丝分裂均可丢失部分端粒,造成端粒的进行性缩短,而当端粒缩短到一定程度,会诱发复制衰老或凋亡.因此,端粒被认为是"有丝分裂钟",计算着细胞进行过有丝分裂的次数.
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色素上皮源性因子抑制眼新生血管的研究现状
色素上皮源性因子(PEDF)是丝氨酸蛋白酶抑制剂超家族成员之一,有多种生物学功能,是眼组织中有效的新生血管抑制剂。本文概述了PEDF的基因、蛋白结构、在眼组织的分布,重点阐述了PEDF抑制眼新生血管的作用和临床应用前景。
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马方综合征突变型微纤维蛋白-Ⅰ基因蛋白模型的计算机构建和分析
目的 运用计算机建模分析中国马方综合征单纯晶状体脱位患者突变型微纤维蛋白-Ⅰ(FBN1)物理结构的改变,以阐明其在晶状体脱位发病机制中的作用.方法 对照实验研究.运用SWISS-MODEL软件预测、SWISS-Pdb浏览器观察与分析野生型和R545C、R1530C突变型微纤维蛋白-Ⅰ的蛋白构型.结果 与野生型微纤维蛋白-Ⅰ比较,突变型微纤维蛋白-Ⅰ具有显著的二维结构的改变.R545C突变型微纤维蛋白-Ⅰ造成α螺旋结构缺失、氢键距离缩短、蛋白表面水溶性改变和分子负电荷势能下降.R1530C突变型微纤维蛋白-Ⅰ造成氢键缺失、蛋白表面水溶性改变和分子负电荷势能上升.结论 突变型微纤维蛋白-Ⅰ基因显著改变了该蛋白的二维结构,进一步支持了微纤维蛋白-Ⅰ在马方综合征晶状体脱位发病机制中具有一定作用的理论.
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雷帕霉素作用与mTOR结构关系的研究进展
目的 阐述雷帕霉素(RAP)作用与哺乳类动物雷帕霉素靶蛋白(mTOR)的构效关系.方法 参考国内外文献,介绍mTOR的基因及蛋白结构,阐述mTOR基因突变体对RAP作用的影响.结论 mTOR基因突变、mTOR蛋白一级结构及构象均可影响mTOR与RAP、FKBP12所形成复合物的结合,从而改变mTOR活性,影响RAP的作用.
关键词: 雷帕霉素 哺乳类动物雷帕霉素靶蛋白 基因 蛋白结构 -
核输出蛋白在流感病毒感染与传播中的作用
核输出蛋白(NEP)是一个由甲型流感病毒第8段基因编码的约为14 kD的蛋白.NEP初被认为参与病毒核糖核蛋白复合体的出核.相对于流感病毒的其他几个蛋白,关于NEP的研究很少被报道.近年来,随着蛋白立体结构的确定、研究的不断深入,NEP在流感病毒活动中很多意想不到的作用不断被发现.这些研究显示NEP参与病毒的转录和复制,促进H5N1禽流感病毒在哺乳动物体内的适应以及参与病毒的出芽.本文系统总结了NEP的功能,包括参与病毒核糖核蛋白复合体的出核的过程、调节病毒聚合酶的活性以及帮助H5N1禽流感病毒实现跨种间传播等,为进一步研究NEP奠定基础.