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  • 基于网络药理学探讨补肾强督治偻方治疗强直性脊柱炎的作用机理

    作者:邱冬妮;潘峰;谭希;赖勇辉;何晓红;周颖燕;何羿婷

    目的 通过网络药理学方法探讨补肾强督治偻方治疗强直性脊柱炎的作用机理.方法 运用中药系统药理学成分分析平台(BAT-MAN)数据库获取补肾强督治偻方的作用靶标基因,于CTD数据库中获取强直性脊柱炎疾病相对应的靶标基因,将两者取交集后获取疾病-药物蛋白靶基因,运用网络可视化软件STRING构建蛋白质间相互作用网络,并将结果进行网络可视化展示,通过网络结构和节点间加权重联系的计算分析算法筛选出重要的关键基因.借助DAVID在线工具进行疾病-药物交集靶基因的基因本体论(GO)分析和KEGG通路富集分析.后在CTD数据库中获取关键基因于强直性脊柱炎的疾病治疗作用.结果 补肾强督治偻方靶标基因与强直性脊柱炎疾病靶标基因的交集基因有705个.GO分析结果显示,补肾强督治偻方-强直性脊柱炎交集靶基因的生物功能主要包括基因表达的阳性调控、炎症反应、细胞增殖阳性调控等;信号通路富集结果显示,补肾强督治偻方-强直性脊柱炎交集靶基因的网络主要涉及肿瘤坏死因子信号通路、雌激素信号通路、T细胞受体信号通路等.获得关键基因23个,都与痛症、炎症性疾病及关节炎性疾病相关.结论 补肾强督治偻方治疗强直性脊柱炎是多靶点、多通路、多选择的复杂机制过程,其机制多与抗炎和镇痛相关.

  • 左归丸对去卵巢大鼠骨髓间充质干细胞基因表达谱时间序列的影响

    作者:赵旭;郝传铮;杨仁旭;徐俊伟

    目的 通过分析骨质疏松模型大鼠骨髓间充质于细胞(BMSCs)基因表达谱时间序列变化趋势,在基因组学层面探索左归丸防治绝经后骨质疏松症的分子机制.方法 72只大鼠随机分为假手术组、模型组、戊酸雌二醇组和左归丸组,每组18只.除假手术组外其余各组大鼠摘除双侧卵巢建立绝经后骨质疏松症模型.手术2周后,戊酸雌二醇组和左归丸组分别给予戊酸雌二醇片溶液(浓度为0.01 mg/ml)和左归丸溶液(浓度为0.5 g/ml)灌胃,假手术组和模型组用等量蒸馏水灌胃,每次1ml/100g,每日1次,灌胃至手术后第4、8和12周末(每个时间点6只大鼠).12周末时检测各组大鼠股骨远端骨密度、胫骨近端骨密、腰椎骨密度.无菌分离各组大鼠的股骨和胫骨,培养BMSCs,表达谱芯片检测各组BMSCs F2代细胞基因表达情况,采用SPSS18.0软件筛选差异表达基因(DEGs),并采用STEM法进行时间序列分析,通过DAVID进行功能与通路富集.结果 模型组大鼠股骨远端骨密度、胫骨近端骨密、腰椎骨密度均显著低于假手术组(P<0.01);左归丸组和戊酸雌二醇组大鼠3个骨骼位点的骨密度均高于模型组(P<0.05或P<0.01).左归丸组-模型组对比组中时间序列显著趋势DEGs多达56个.其中第4周末显著下调基因Ppig、Rb1 cc1、I16和Rock1富集到细胞增殖、自噬凋亡、信号通路和细胞分化等.结论 左归丸可能通过影响细胞增殖、自噬凋亡、信号通路和细胞分化等多途径,广泛调控BMSCs基因表达,终减少骨量丢失.

  • 肌层浸润性膀胱癌亚型的生物信息学分析

    作者:徐文彬;郑卫英;夏翃;华琳

    目的 通过生物信息学分析研究两种膀胱癌亚型(基底样膀胱癌和管腔型膀胱癌)之间不同的分子调控机制和分子特性,为更准确地区分膀胱癌亚型和探索潜在的治疗靶点提供帮助.方法 利用稳健的多芯片平均算法将由22个基底样膀胱癌和132管腔型膀胱癌样本组成的数据集进行标准化,并选择其中前1000个具有高标准差的基因进行两种亚型的差异表达基因分析.将得到的差异表达基因进行GO功能注释和KEGG通路富集分析.此外,选择前100个差异表达基因构建蛋白质互作网络.结果 得到基底样和管腔型膀胱癌差异表达基因共742,其中基底样亚型上调的基因405个,下调的基因337个.GO富集分析显示差异表达基因显著富集在细胞外区基质、趋化性、炎症等功能上,KEGG通路富集显示差异表达基因显著富集在细胞外基质受体相互作用的通路上.构建的蛋白质互作网络显示重要的hub蛋白质为LNX1、MSN和PPARG.结论 本研究得到的基底样和管腔型膀胱癌亚型分子机制的区别主要体现在细胞外区域的分子作用机制、细胞趋化性和炎症反应等,基因LNX1、MSN和PPARG为区别两种膀胱癌亚型的特征基因.

  • 基于芯片微阵列数据库对无精子症相关基因挖掘及生物信息学分析

    作者:邹自灏;邓楠;潘兆君;代冉冉;郑文忠;刘平;毛向明

    目的 从分子水平探讨非梗阻性无精子症的发病机制,为临床诊疗提供新思路.方法 从基因表达综合数据库(GEO)中下载人非梗阻性无精子症的相关基因芯片数据,使用R语言对其进行归一化处理并筛选差异表达基因;使用DAVID及KEGG数据库对其进行差异基因本体功能及信号通路富集分析;通过Cytoscape绘制差异基因共表达网络并使用CytoHubba插件计算筛选核心基因(hub基因);后使用ClueGo及Centiscape对核心基因进行富集分析.结果R语言筛选出518个差异表达基因,其中上调基因271个、下调基因247个;本体功能及信号通路富集分析结果提示这些差异基因在精子发生、精子染色质凝聚、精子顶体膜及囊泡形成、精卵细胞识别、细胞分化、ATP偶联及转录因子结合等生物学过程中发挥重要作用;差异基因共表达网络分析发现GAPDHS,PCSK4,TSSK1B,TSSK2等hub基因在精子发生及分化过程中发挥关键作用.结论 通过多维度挖掘GEO基因芯片数据并系统分析其内在信息,对明确非梗阻性无精子症发病的分子机制具有重要意义.

  • 基于疾病基因表达谱的糖尿病肾病治疗药物预测

    作者:史晓贤;李高文

    目的 探讨基因表达谱在筛选糖尿病肾病有效治疗药物中的应用效果.方法 在GEO数据库中搜索与糖尿病肾病相关的基因芯片,利用d-chip软件进行差异基因的表达分析,采用基因集富集的方法(GSEA)进行相关信号通路的富集分析,再利用Cmap筛选治疗糖尿病肾病的候选药物,并通过动物实验进行药效学评估.结果 通过对GSE31022芯片中的合格样本进行差异基因的有效分析,在获得的540个差异表达基因中,上调基因150个,下调基因390个;通过GSEA分析主要富集到NF-κB信号通路与糖尿病肾病为密切(P<0.05),并且筛选出甲砜霉素可能对糖尿病肾病有治疗作用(score=1),动物实验结果显示,与模型组比较,甲砜霉素组的肾小球硬化及系膜扩张明显改善,基本达到正常组水平,差异有统计学意义(P<0.05).此外,甲砜霉素组的尿蛋白和CD68、转化生长因子β、纤溶酶原激活物抑制物1及白介素6的mRNA水平低于模型组(P< 0.05).结论 基于糖尿病肾病相关基因表达谱作为疾病有效治疗药物的预测手段,为疾病的治疗药物发现提供了新思路.

  • 基于网络药理学预测当归贝母苦参丸治疗前列腺癌作用靶点及细胞内信号转导通路

    作者:胡杨;吴雄志

    目的:通过网络药理学方法预测分析当归贝母苦参丸治疗前列腺癌的潜在机制.方法:通过TCMSP数据库检索中药的化学成分和作用靶点,并于UniProtKB网络平台获取每种靶蛋白的基因名.借助CTD等数据库查询疾病靶点.在STRING数据库中构建蛋白-蛋白互作网络(PPI),于Cytoscape中进行网络可视化分析.通过DAVID数据平台对关键靶蛋白进行分析.结果:从TCMSP数据库中共筛选得到26个药物有效成分.PPI网络包括135个药物疾病交集靶基因,关键蛋白为34个.基因本体论(GO)分析这些靶基因涉及生物功能条目多,共290个.京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路主要涉及肿瘤信号通路等.结论:当归贝母苦参丸治疗前列腺癌是多靶点、多通路协同作用的结果,能够通过抑制细胞增殖,促进细胞凋亡,抑制迁移以及抑制肿瘤血管生成等多方面发挥其抗肿瘤作用.

  • 动脉粥样硬化易感基因挖掘与生物信息学分析

    作者:王文栋;常晓彤;杜华阳

    目的 挖掘动脉粥样硬化(AS)易感基因,为寻找 AS 正确的诊断和治疗方法提供线索和数据支撑.方法 从 PubMed、OMIM 和GEO数据库检索AS相关数据,利用SMD在线工具对AS易感基因进行染色体定位,并通过DAVID和STRING10.0软件进行基因功能注释和蛋白互作分析.结果 共获得AS易感基因454个,其染色体定位分布不均匀,以1、11、2和4号分布较多,Y染色体多于X染色体上的分布;AS易感基因富集在24个生物学功能注释单元中,其中44个编码蛋白存在互作关系,涉及多种生物学过程和分子功能.结论 AS易感基因的控掘与生物信息分析为AS的分子水平机制研究提供了数据平台,为多基因复杂疾病的基因挖掘提供了有效方法.

  • 平均血小板体积相关基因的富集分析

    作者:徐颜美;王立;李静;黄波;刘静;陈鑫;陈希敏;林晋;黄林凤

    目的 通过对平均血小板体积(MPV)相关的易感基因进行功能富集分析,为MPV的功能学研究提供理论指导.方法 整合所有全基因组关联研究(GWAS)报道的MPV易感基因作为分析的靶基因集合,通过生物网络基因本体论分析工具(BiNGO)及网页版基因富集分析工具(WebGestalt)对靶基因集合进行功能富集分析,并对两个软件富集的结果进行比较和讨论.结果 MPV易感基因主要富集于止血、体液水平调节和血小板激活等生物学途径,并且在KEGG(京都基因和基因组百科全书)和Wiki通路数据库中共享细胞凋亡、补体凝固系统和黏着斑通路.结论 用生物信息学分析工具对6篇GWAS发现的MPV易感基因进行功能富集分析,发现3条与MPV相关的重要通路,为MPV的功能学研究提供了重要的线索.

  • MMP家族基因与宫颈癌的关系研究

    作者:吴椒虹;马必东;陈育梅;陈新艳;吕杰强

    目的 利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库中宫颈癌的相关数据,研究人乳头瘤病毒(HPV)阳性宫颈癌人群与HPV阴性宫颈癌人群的基质金属蛋白酶(MMP)家族相关免疫基因的变化.方法 从TCGA数据库中收集宫颈癌患者137例及相关数据信息,分为HPV阴性宫颈癌组和HPV阳性宫颈癌组.利用EdgeR计算分析所有样本的转录组测序(RNA-Seq)数据,寻找两组之间差异表达的基因;并利用基因本体(GO)对表达差异的基因进行生物功能富集分析;利用RNA-Seq及拷贝数变异等数据,对MMP家族相关免疫基因进行分析;利用Kaplan-Meier分析评估MMP家族免疫特征基因对患者总生存期和无进展生存期的影响.结果 通过EdgeR计算分析发现,两组之间有2368个基因的表达差异有统计学意义(P<0.01);其中有823个基因表达上调,1545个基因表达下调.通过GO进行功能富集分析发现,表达上调的差异基因主要富集在免疫反应通路上.MMP家族3个免疫基因的变化在拷贝数变异和mRNA表达上相关联,当基因的拷贝数扩增时,mRNA表达相应上调,反之亦然.MMP-1、MMP-3、MMP-13基因对HPV宫颈癌患者的总生存期和无进展生存期均无明显影响.结论 与HPV阴性宫颈癌患者相比,HPV阳性宫颈癌患者中有大量差异表达的基因,表达上调的基因主要富集在免疫通路上,其中免疫基因MMP-1、MMP-3、MMP-13的mRNA表达与拷贝数变异类型相关联;有多种免疫通路上的基因都会影响MMPs家族免疫基因的改变,从而诱发癌症.

  • 胶质母细胞瘤中内源竞争RNA网络介导的长链非编码RNAs功能研究

    作者:李乾鹏;嵇江淮;安奕;李黎;赵磊;李冬果

    胶质母细胞瘤是人类常见的且恶性程度极高的一种脑部肿瘤.大量研究表明长链非编码RNAs (long non-coding RNAs,lncRNAs)在GBM的进程中发挥着重要的作用.本研究通过整合lncRNA-miR-NA/mRNA-miRNA 关系对和GBM 表达谱数据,构建GBM 相关的内源竞争 RNA ( competing endogenous RNA,ceRNA)背景并分析网络中lncRNAs和mRNAs的拓扑属性.然后,我们筛选度和中介中心性前5%的节点作为hub节点,进一步构建GBM中lncRNAs介导的hub-ceRNA网络并分析预测网络中lncRNAs的功能,从而识别GBM诊断和治疗相关的靶点基因.本研究进一步加深对GBM中lncRNAs功能研究的认识,识别出新的GBM风险基因和潜在的治疗靶点.

  • 卵巢癌干细胞基因表达谱共有特征分析

    作者:鞠宝辉;田菁;黄宇婷;陈春燕;冯慧;郝权

    目的 分析卵巢癌干细胞共有的差异基因表达特征.方法 将NCBI GEO数据库中获取的细胞系及患者来源的卵巢癌干细胞与各非干性癌细胞的全基因组表达谱进行整合比对分析,运用GeneSifter软件解析出卵巢癌干细胞共有差异表达基因,并对其共同涉及的生物学特性及信号通路进行富集分析.结果 卵巢癌IGROV1细胞系和进展期患者腹水来源的干性侧群细胞相比各非干性侧群细胞,以及OVCAR3细胞系来源的多细胞球相比其他非干性卵巢癌细胞的差异表达基因数分别为1 347、509、6 495个;其中,NAB1、JAK1、PIK3R1、TMOD1和S100A6等为共同上调的关键基因,而PROS1、GREB1、KLF9、CRABP2、GADD45B、Notch1、LATS2和SLFN 11等为共同下调基因(差异>1.5倍;P均<0.05).这些差异表达基因显著富集于表观遗传修饰、细胞周期调控、跨膜信号转导及化学排斥蛋白通道活性等分子功能,共同参与了细胞干性维持、细胞增殖调控、细胞分化程度降低及迁徙能力增高、细胞耐受及抗性增强等生物学进程,以及与卵巢癌发生、发展密切相关的ECM、ErbB和Hedgehog等信号通路.结论 各卵巢癌干细胞中存在共有的干性差异表达基因、共同富集的生物学特性及特异信号调控网络.

  • 利用生物信息分析筛选结肠癌发生潜在基因及机制

    作者:芦婷婷;邢承忠

    目的 通过生物信息学的方法来分析结直肠癌发生的潜机制.方法 利用GE02R分析差异基因表达,利用DAVID分析进行富集分析.利用STRING数据库进行蛋白相互作用分析.通过TCGA数据库对核心基因进行差异验证和预后分析.结果 通过差异分析,我们得到216个差异基因.通过富集分析发现,差异基因主要和细胞粘附有关,主要位于PPAR信号通路上.蛋白相互作用分析后,我们找到了8个核心基因(IL8、SST、SPP1、 GCG、CXCL12、LPAR1、 COL1A2和MMP1)和一个模型.经过TCGA数据库验证,我们发现8个基因都存在差异,同时两个基因预后有意义.结论 找到了8个风险相关的核心基因和2个预后相关基因,这些核心基因可能可以用做结直肠癌发病预测的靶标.

  • 胚鼠腭裂形成过程中腭胚组织全基因组DNA甲基化的研究

    作者:刘丹;舒申友;李珂;舒璇;董泽君;郎兴

    目的:分析胚鼠腭裂形成过程中腭胚组织全基因组DNA差异甲基化位点相关基因及基因组差异甲基化水平.方法:使用高效低成本全基因组DNA甲基化检测技术——甲基化修饰依赖性内切酶测序法(Methyl-RAD-Seq法)对妊娠第13.5天(GD13.5)、GD14.5和GD16.5(n=18)的胚鼠腭裂模型组和对照组腭胚组织进行全基因组DNA甲基化测序,比较基因组不同功能元件(3'端非翻译区、5'端非翻译区、TSS2000、内含子、外显子和基因间区)中甲基化位点的差异分布及甲基化水平差异基因,并对相关基因进行GO和KEGG通路分析.结果:(1)DNA不同元件的甲基化位点的峰值个数和峰值,对照组无明显变化,实验组甲基化整体水平随着时间推移逐渐降低;(2)GO功能富集和KEGG通路富集分析差异甲基化位点的基因及甲基化水平有差异的相关基因,其中与腭裂形成相关的基因为Fgf16、Jarid2、Kdm6a、Nr3c1、Tbx22和Trp53;(3)与腭裂形成相关的信号通路主要有MAPK、Wnt和TGF-β信号通路.结论:DNA甲基化在腭裂形成过程中可能起重要的调控作用.

  • 基于组学策略的脓毒症研究

    作者:肖献忠;王慷慨;张华莉;焦京;高敏;彭玥;蒋宇

    目的:针对脓毒症( sepsis)发病机制的复杂性和非线性特点,采用多种组学技术与系统生物学整合研究策略,以发现脓毒症新的生物标志物群,揭示脓毒症的组学/网络机制,探讨脓毒症多靶点整合性干预的新思路。方法:采用大鼠盲肠结扎穿刺脓毒症模型和选用部分脓毒症病人,采用GEO数据库查询和iTRAQ蛋白质组学技术分析其血清蛋白质组学变化,采用亚网络富集分析揭示重要节点蛋白和可能的干预靶点。结果:通过iTRAQ蛋白质组学技术,在脓毒症大鼠中发现47个差异蛋白,其中PTX3、MMRN1、FCN1、CPN2、PRSS1和PF4可用于脓毒症的诊断;MMRN1、PPBP、FGα和FGβ这4个生物标志物的组合可用于脓毒症的预后预测;PTX3在临床脓毒症患者的诊断和预后预测方面优于传统的降钙素原( PTC)和C反应蛋白( CRP), IL-1R2是诊断脓毒症和鉴别G-和G+菌脓毒症的新的血清生物标志物;采用亚网络富集分析发现CCAAT增强子结合蛋白( C/EBP)和内皮抑制素( endostatin)是脓毒症的重要节点蛋白和潜在干预靶点。结论:组学技术和系统生物学整合研究策略为脓毒症机制阐明和多靶点整合性干预带来新希望。

  • 人类习服高原早期血浆代谢组学研究

    作者:廖文婷;刘宝;陈建;崔建华;高伊星;刘福玉;徐刚;孙滨达;张二龙;袁志兵;张钢;高钰琪

    目的:从代谢调节角度探讨高原环境对人体血浆代谢的影响及可能机制。方法:分别采集60名健康成年男性在平原和进入高原(海拔5300 m)第4天的血浆样本,高效液相色谱-质谱联用和气相色谱-质谱联用结合多变量统计分析筛选进入高原前后的差异代谢物,Metabo Analyst 3.0数据库进行代谢通路富集分析,ELISA测定代谢通路中关键调节酶。结果:进入高原后受试者血浆中50个代谢物、8条代谢通路和5种关键酶发生了显著的变化。8条代谢通路涉及炎症反应相关代谢、能量代谢、胆酸代谢和血红素代谢。 ELISA结果显示调节以上代谢通路的5种关键酶进入高原后发生显著变化。结论:人类习服高原早期血浆中代谢物组、相关代谢通路和关键调节酶发生了重要变化,研究结果对寻找促进高原习服措施具有重要意义,通过阻断或修饰相关代谢通路将有望减轻急性高原反应症状、促进高原习服。

  • 糖尿病肾病相关miR-130b-3p靶点的生物信息学预测

    作者:常凯;江忠勇;任俊龙;熊怡淞;王艳艳;叶雨笙;朱紫衣;熊杰

    目的:预测miR-130b-3p靶基因,并对靶基因的分子功能、生物学进程和信号通路进行富集分析,为深入研究糖尿病肾病相关miR-130b-3p的靶基因功能提供理论基础.方法:通过NCBI和miRbase数据库检索基因.应用Vector NTI软件进行miR-130b-3p序列分析,应用TargetScan,picTar,RNA22,PITA和miRanda软件预测靶基因,通过DAVID和KEGG数据库进行靶基因功能与信号通路富集分析.结果:已知成熟的不同物种miR-130b-3p核酸序列高度保守.靶基因主要富集在核质和细胞溶质,分子功能主要富集在蛋白绑定和转录因子激活.经典的miR-130b-3p靶基因集合明显富集于KEGG数据库中的TGF-β、AMPK和内吞作用等7个信号转导通路.疾病富集分析与糖尿病高度相关.结论:成功预测miR-130b-3p靶基因,部分靶基因参与的功能及信号通路与糖尿病肾病发生发展过程密切相关.

  • 骨肉瘤相关基因富集分析

    作者:阳小进;杨俊涛;谭光华;王晓旭;谭文甫

    目的 富集分析骨肉瘤相关基因,深层次挖掘基因信息,阐明骨肉瘤发病的基因机制.方法 利用在线基因富集分析工具DAVID,针对(在线人类孟德尔遗传数据库)OMIM、系统分析基因功能(KEGG disease)、遗传协会数据库(Genetic Association Database)及PAGED数据库(PAged Data Soune)4个疾病相关基因数据库中检索得到的骨肉瘤相关基因进行分子功能、生物学途径及Pathway富集分析.结果 骨肉瘤疾病在基因损伤、损伤应激生物学途径及细胞周期信号通路等方面表现异常.结论 骨肉瘤是一种多基因病变疾病,富集分析可以深入阐述骨肉瘤发病的基因机制.

  • 顺铂耐药卵巢癌的差异表达基因和信号通路富集分析

    作者:胡万芹;赵洪波;梁宏;赵庆华;杨丽华

    目的 分析顺铂耐药卵巢癌的差异表达基因和信号通路.方法 用美国国立信息中心NCBI的GEO数据库获得顺铂耐药卵巢癌基因集GSE15372,通过R与Bioconductor软件进行差异表达基因分析;再利用DAVID在线工具对顺铂耐药卵巢癌差异表达基因进行GO本体分析、KEGG通路分析.结果 差异倍数在2倍以上、FDR值小于0.05为标准,筛选出上调差异表达基因和下调差异表达基因获得差异表达基因211个,其中上调基因120个,下调基因91个;基因富集分析发现差异表达基因集中在黏着斑、TGF-β信号通路等生物过程(P<0.05).结论 顺铂耐药卵巢癌存在一些特异的差异表达基因,有部分信号通路在顺铂耐药卵巢癌中明显富集.

  • 肺癌组织钙网蛋白高表达与患者生存期的相关性分析

    作者:王静;李子超;宋朝君;周佳义;张哲;张冠文;姜东伯;杨琨

    目的 探讨肺癌组织钙网蛋白(CALR)表达水平与肺癌患者生存的相关性及其机制.方法 采用免疫组织化学染色法检测180例肺癌患者肿瘤组织中的CALR表达水平,记录患者的生存期并绘制生存曲线.从癌症和肿瘤基因图谱(TCGA)数据库中获取535例肺腺癌患者的转录组信息进行基因本体(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)、基因集合富集分析(GSEA)的三类富集分析.结果 与CALR表达水平低的患者相比,肺癌组织中CALR表达水平高的患者生存期短.TCGA数据库富集分析结果提示CALR可能参与染色体分离调控、染色质沉默、癌中转录失调、过氧化物酶体增殖物激活受体(PPAR)、AMP激活蛋白激酶(AMPK)等肺腺癌细胞的多种生物学反应和信号通路调控.结论 肺癌组织CALR高表达与肺癌患者生存期呈负相关,可能通过多种途径参与肺腺癌的发生发展.

  • 银屑病易感基因的生物信息分析

    作者:郑文新;刘红;汪伟

    目的 分析银屑病易感基因的功能,筛选关键基因.方法 结合OMIM数据库以及近年来发表的文章收集银屑病易感基因,利用Gather在线服务对易感基因进行富集分析,蛋白质相互作用网络由String数据库构建,计算节点的度数,据此筛选关键易感基因.结果 银屑病的易感基因功能主要富集在免疫应答,防御反应,生物应激反应,有机生理过程,应激反应,对害虫寄生虫病原体的反应,对外部生物刺激的反应,对外伤的反应,抗原表达,抗原呈递及抗原加工等类别.我们通过计算易感基因所编码的蛋白质相互作用网络中节点的度数,按度数的高低,选出排在前十的10个基因,作为关键易感基因,功能分析和通路分析提示关键基因和很多功能明确与银屑病相关的基因相互作用.结论 易感基因分析提示,银屑病是与环境因素密切相关,具有遗传性的免疫性皮肤病.蛋白质相互作用网络分析提示,关键易感基因可以没有明确的功能,但是会和很多与银屑病相关功能明确的基因相互作用.

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