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结核蛋白芯片联合PPD皮试检测对肺结核病快速诊断价值的研究
肺结核病疫情在我国仍较严重,是危害人民健康的重要传染病之一.目前,肺结核病的快速诊断依然是迫切需要解决的问题.结核免疫学诊断是结核病诊断和鉴别诊断的重要方法之一[1].为提高结核病快速诊断水平,通过对结核病患者进行血清结核蛋白芯片检测及PPD皮试,观察结核蛋白芯片联合PPD皮试对肺结核病的诊断意义,评价其用于临床诊断的应用价值.
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利用基因芯片检测二异氰酸甲苯酯所致小鼠基因表达
接触二异氰酸甲苯酯(TDI)可引起过敏反应,包括接触性皮炎、哮喘、刺激和咳嗽等,但TDI及其他许多化学物诱导过敏反应的分子机制尚不十分清楚.我们采用基因芯片技术研究了二异氰酸甲苯酯诱导的过敏反应的基因表达情况.
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PRL型垂体瘤患者血清miRNA表达谱的检测及初步筛选分析
目的:检测及初步筛选分析PRL型垂体瘤患者血清miRNA表达谱。方法采集20例PRL型垂体瘤患者和20例健康志愿者血清,通过RNA提取技术、miRNA TLDA芯片技术检测血清miRNA、采用软件DataAssistTM Software进行数据分析和处理,筛选出差异性表达的miRNA。结果以差异表达量大于2倍,芯片检测的相对定量平均CT值小于40为标准,初步筛选出PRL型垂体瘤患者血清miRNA表达上调的有3个,表达下调的有25个,共计28个。结论 PRL型垂体瘤患者和健康志愿者血清miRNA具有内源表达的差异性,可以为进一步验证特异性血清miRNA的表达,探索药物临床疗效机制研究提供理论和实验依据。
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AKT、 ATM、 D4-GDI和p534条细胞凋亡通路基因在大鼠肝再生过程中的表达变化
目的 探讨AKT、ATM、D4-GDI和p534条细胞凋亡通路基因在肝再生(LR)过程中的表达变化.方法 将大鼠随机分为实验组和对照组,每组6只,雌雄各半,用Rat Genome 230 2.0芯片检测大鼠部分肝切除(PH)后不同恢复时间点4条细胞凋亡通路基因表达情况,并用生物信息学方法对其进行分析.结果 AKT、ATM、D4-GDI和p53 4条细胞凋亡通路中63、8、6和7个基因与肝再生相关.它们主要在肝再生启动阶段起始表达.表达的相似性分为均上调、上调占优势、均下调、下调占优势、上调和下调相近等5类,大多数基因表达加强,少数基因表达降低.它们表达的时间相关性分为11组.基因协同作用模型(Et)分析表明,AKT通路几乎在整个肝再生中抑制细胞凋亡;ATM、D4-GDI和p53 3条细胞凋亡通路几乎在整个肝再生中促进细胞凋亡.结论 AKT、ATM、D4-GDI和p53 4条细胞凋亡通路与再生肝生长、发育和肝量控制密切相关.
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人鼻型NK/T细胞淋巴瘤表达谱基因芯片的筛查研究
Ko等[1]对7例鼻型NK/T细胞淋巴瘤进行了比较基因组杂交和杂合性缺失分析,发现在染色体2q、3q、5q、10q、13q、17q和21q等处有DNA拷贝数增加;而在1p、17p、6q、12q和13q有基因缺失.Oka等[2]对NK/T细胞淋巴瘤细胞系NK-YS作了初步的基因芯片检测,发现蛋白酪氨酸蛋白磷酸酶SHP-1基因表达下调.本研究旨在初步筛选和观察部分肿瘤相关基因差异性表达的情况.
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肝炎基因诊断芯片检测肝炎患者血清及肝组织中HBVDNA、HCVRNA的临床研究
肝炎基因芯片是根据肝炎病毒的特征基因片段设计探针序列,将探针以微阵列形式排列在经过特殊处理的玻片上,从待测血液、组织标本中抽取微量肝炎病原体DNA(RNA),与探针杂交,用特有的荧光波长扫描芯片,通过计算机软件进行分析诊断.我们用病毒性肝炎基因诊断芯片,分别双盲检测40份乙型肝炎患者和健康人、丙型肝炎患者血清,99份肝炎后肝硬化肝组织蜡块标本,15份慢性乙型肝炎患者肝组织活检标本;同时用荧光微粒子定量法测定血清中乙型肝炎病毒标志物HBcAg,PCR法检测血清中HBVDNA、HCVRNA,用免疫组化法、原位分子杂交法分别检测肝组织HBcAg、HBVDNA.结果报道如下.
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蛋白芯片检测丙型肝炎病毒分片段抗体的临床意义
丙型肝炎是一种严重威胁人类健康的世界性血源性传染病,加强血源及血液制品的监控是有效防止感染丙肝病毒的重要手段.目前检测丙型肝炎以检测血清中抗HCV抗体的ELISA法较为普遍,但仍有不足之处.
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先兆子痫胎盘中细胞因子信号转导相关基因表达的变化
为探讨细胞因子与先兆子痫病理发生关键事件之间的关系,采用基因芯片检测技术观察了细胞因子信号转导相关基因在先兆子痫胎盘组织中的表达.胎盘组织取自我科住院病例,正常及先兆子痫患者(各3例)的年龄均限制在24~25周岁,2组患者的一般情况基本一致.基因芯片购自日本Takara生物技术公司,分别点样有约220种人类细胞因子相关基因和约220种人类环境激素相关基因,每枚芯片上还点样有包括β-actin、α2-tublin、GAPDH等在内的看家基因共计56点或48点作为内参照.
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基因芯片检测泌尿生殖道三种病原体的初步应用
目前在临床性病检验中,对常见的3种病原体淋病奈瑟菌(淋菌)、沙眼衣原体和解脲脲原体的检验效率较低,一次只能检测一种病原体,花费时间轼长,急需研制一种快速、简便、准确的检测方法.
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基因芯片检测拉米夫定治疗慢性乙型肝炎中HBVYMDD变异25例
目的:应用基因芯片新技术检测拉米夫定治疗慢性乙型肝炎过程中发生HBVYMDD变异的情况,进一步探讨YMDD变异与临床的关系.方法:对应用拉米夫定治疗6-19mo的25例ALT异常的慢性乙肝患者进行肝功能、乙肝病毒血清学标志、耐药基因芯片检测,9例患者进行了肝活检肝组织病理学检查.结果:25例中,HBVDNA阴性4例,21例阳性,其中检出HBVYMDD变异5例,检出率为23.8%,并与用药时间长短有关,6mo,7-12mo,13-19mo变异检出率分别为12.5%、20%和66.7%.HBV-YMDD变异者ALT均大于300U/L.9例病理学报告肝组织内有不同程度的炎症活动和肝纤维化发生,8例肝组织中HBsAg和/或HBcAg阳性.结论:服用拉米夫定时间越长,HBVYMDD变异检出率越高.对ALT异常的患者应定期随防,若发现ALT水平明显升高时应考虑HB VYMDD变异的可能.血清中HBVDNA转阴并不表明肝组织中HBVDNA也已转阴.基因芯片检测HBVYMDD变异可以多位点同时进行,有较好的重复性和准确性,值得推广.
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基因芯片技术检测HBV HCV及HBV YMDD变异株
目的:探讨基因芯片技术在乙型肝炎病毒(HBV)、丙型肝炎病毒(HCV)及HBV YMDD变异株检测中的应用.方法:采用HBV、HCV联合基因芯片检测40份血清标本,并与HBV,HCV基因定量检测方法比较;采用HBVYMDD变异株芯片检测20份血清标本,并与错配PCR及DNA序列测定方法比较.结果:HBV,HCV联合基因芯片与HBV DNA定量检测的符合率为85%(34/40),HBV检出率为83%(19/23),假阳性率为12%(2/17);与HCV RNA定量检测的符合率为85%(34/40),HCV检出率为58%(7/12),假阳性率为4%(1/28).HBV YMDD变异株芯片与本室设计的错配PCR符合率为70%(14/20),5份芯片检测的标本与DNA序列测定结果一致,该芯片尚可检测出不同病毒体或变异体的混合感染.结论:HBV,HCV联合基因芯片对HBV的检测有较高的敏感性,但存在一定程度的非特异性;对HCV的检测敏感性偏低,但特异性较高.HBV YMDD变异株芯片敏感性和特异性均较高,同时能检测出病毒变异体的共生现象.
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乙、丙型肝炎病毒基因联合诊断芯片的研制及应用
目的:制备一款肝炎病毒检测芯片,能同时实现对乙型肝炎病毒(HBV)、丙型肝炎病毒(HCV)、HBV YMDD变异株及HCV基因型的检测,并与其他检测方法进行比较,以探讨基因芯片技术临床应用的可行性.方法:根据HBV、HCV的序列设计出探针,采用点样法制备芯片.收集HBV DNA阳性和HCV RNA阳性血清各20份,YMDD变异株阳性血清20份,HBV DNA阴性和HCVRNA阴性血清各10份,用基因诊断芯片检测,并与荧光定量法、错配PCR及测序法比较.结果:HBV DNA阳性标本和HCV RNA阳性标本用芯片检测均为阳性;芯片法检测HBV YMDD变异株和错配PCR法的符合率为75%,和测序法的符合率为95%;芯片法检测HCV基因型和测序法的符合率为75%.结论:基因诊断芯片的敏感性和特异性较高,且能检测出不同病毒株的共生状态,但在检测HCV基因型方面存在一定的假阴性和假阳性.
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乙型肝炎病毒P基因YMDD变异的意义
目的:了解拉米夫定治疗慢性乙型肝炎过程中HBV P基因YMDD变异的意义,为临床治疗提供指导.方法:用定量PCR监测40例拉米夫定治疗期间的HBV DNA动态变化,对治疗48 wk时HBV DNA仍为阳性的患者,采用uniarray技术和基因芯片检测YMDD突变.结果:拉米夫定治疗48wk时,HBV DNA转阴者23例(57.5%).HBVDNA仍为阳性者17例,其中8例在治疗过程中出现HBV DNA定量反跳.用基因芯片法与uniarray技术共检测出7例YMDD变异(5例出现于8例HBV DNA定量反跳者),变异率为17.5%(7/40).结论:拉米夫定治疗过程中,可导致部分患者的HBV YMDD发生变异.该变异使多数患者HBV DNA定量反跳.检测HBVYMDD变异对慢性乙型肝炎的台疗具有重要的指导意义.
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组织芯片检测肝细胞癌中Ezrin蛋白的表达、定位及意义
膜细胞骨架连接蛋白Ezrin与包括肝细胞癌( hepatocellular carcinoma,HCC)在内的多种肿瘤的增殖、侵袭力、转移、临床预后有密切关系[1].我们利用组织芯片技术检测HCC及癌旁良性组织中Ezrin蛋白的表达,探讨在HCC及癌旁良性组织中表达的亚细胞定位特点、与临床病理因素的相关性及临床意义.
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临床上利用全基因组测序对常见胎儿非整倍性进行非侵入性产前检查结果进行验证
文章发表在2013年6月的《Gynecoloncol》杂志上。
作者通过5个案例报道临床上利用全基因组测序对常见胎儿非整倍性进行非侵入性产前检查(NIPT)的次要发现。这5个案例分别为:案例1, NIPT发现染色体18p 的巨大的复制,这一结果被羊水细胞CG H 芯片分析结果所支持,终核型分析证实为18p 四体镶嵌性;案例2,NIPT 怀疑母源性的18q近端缺失,被 CGH 芯片检测母亲白细胞DNA证实;案例3,NIPT筛查结果显示21和18三体阴性,但随后常规产检中发现胎儿结构异常,回头深度分析早期NIPT 结果的缺失或重复,结果通过核型分析证实为3 q近端缺失;案例4,NIPT正确预测局限性胎盘嵌合体,包括 X、7、21染色体三体嵌合;案例5,NIPT 正确检测到一种先前不知道的45X母源性嵌合。 -
肝脏原发性恶性黑色素瘤一例
患者 女,47岁.间断腹痛1个月余入院.患者无明显诱因出现右上腹疼痛,呈间断性发作,以进食后加剧,伴恶心、纳差,约2 h缓解.既往无病毒性肝炎、自身免疫性疾病及代谢性疾病史.体检:生命体征正常,皮肤巩膜无黄染,浅表淋巴结无肿大,肝掌和蜘蛛痣阴性,心肺听诊未见异常;腹软、腹水征(-),肝脏右锁骨中线肋缘下8 cm,剑突下6 cm,质地硬,边缘欠光整,表面欠光滑,轻压痛,肝区叩痛;脾脏不大;双下肢无水肿,余检查未见阳性体征.实验室检查:丙氨酸转氨酶(ALT)75 IU/L、天冬氨酸转氨酶(AST)49 IU/L、γ-谷氨酰转肽酶(γ-GGT)233IU/L、碱性磷酸酶(AKP)304 IU/L,乙肝表面抗原(HbsAg)阴性、C-12肿瘤标志物蛋白芯片检测均正常.
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生物芯片,为健康预警
无论你在家里还是户外,关于你身体里的各种生物信息都将被人体内所携带的生物芯片检测到,通过全球通信系统,将数字信号传递给医生,医生分析后开出医嘱,再立即传回给你;或者是在你突发意外送往医院急救时,医生可及时从生物芯片中调阅出你的过往病历,及时作出判断以进行合理施救.
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全反式维甲酸处理NB4细胞的微小RNA表达谱分析
微小RNA是一类高度保守的非编码小RNA,它通过抑制mRNA的翻译或直接使mRNA降解,在转录后水平使基因产生沉默,从而对细胞的增殖,分化、凋亡、个体的发育和肿瘤的发生等方面进行调控[1].微小RNA作为基因表达调控的一种重要方式,与白血病的发生发展密切相关.全反式维甲(ATRA)能够诱导急性早幼粒细胞白血病(APL)细胞分化[2],因此成为治疗APL的首选药物.我们选用微小RNA表达谱芯片检测人APL细胞系在ATRA处理前后微小RNA的表达差异,期望发现在细胞分化中起调控作用的微小RNA,从而为研究APL及其他肿瘤的发病机制和诊断治疗提供新的思路.
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儿童肺结核表现为肺不张3例临床分析
例1,患儿,男,8岁,主因间断咳嗽、咳痰2个月入院.两个月前感冒后出现咳嗽、咳痰,午后低热、乏力.外院拍胸部X片发现右肺上叶大片状高密度阴影,诊断为大叶性肺炎,经抗炎治疗后效果不佳,症状无好转,乏力进一步加重.体格检查:一般情况尚可,右肺上呼吸音弱,两肺未闻及干湿啰音,心腹无阳性体征.实验室检查:血白细胞6.8×109/L,中性粒细胞0.80,淋巴细胞0.20,血沉33 mm/h.痰结核菌涂片3次均为阴性,结核菌素试验(PPD)强阳性.结核蛋白芯片检测脂阿拉伯甘露糖(Lam)为阳性,16 KDa抗体为阴性,38 KDa抗体为阳性.肝功能正常.纤维支气管镜检:右肺上叶管口处可见大量黏痰.
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生物芯片检测儿童呼吸道病毒的临床价值
呼吸道病毒是指一类能侵犯呼吸道,引起呼吸道局部病变或仅以呼吸道为入侵门户,主要引起呼吸道外组织器官病变的病毒.临床上的急性呼吸道感染中有90%~95%是由这群病毒引起,其特点是传染性强、发病急、潜伏期短.同一病毒反复感染,不同病毒引起同一疾病的发生是呼吸道病毒的又一显著特点[1].