首页 > 文献资料
-
永久性房颤的转录组分析及miRNA调控网络的建立
目的 探索永久性房颤(pAF)发病相关的关键miRNAs及其调控的靶基因.方法 联合应用表达谱芯片和miRNA芯片分析pAF患者(n=7)和健康成人(n=4)的左房组织,筛选pAF相关差异表达的miRNAs,进行靶基因预测后,与表达谱芯片的筛选结果进行负相关分析后的基因集合进行显著性功能分析(GO-analysis);利用miRNA与靶基因之间的靶向调控关系,构建差异miRNA与交集靶基因的调控网络(miRNA-gene-network),得到网络中起核心调控作用的miRNA和被调控的关键靶基因;采用RT-qPCR方法检验另一组pAF患者(n=5)和健康成人(n=4)的左房组织标本.结果 表达谱基因芯片发现610个mRNA有显著性改变(fold change>2,P<0.05),miRNA-靶基因调节网络发现与pAF显著相关的20个miRNAs和107个靶基因,相关度高的是miR-144、niR-1284、miR-1827、miR-1、miR-3613-3p和miR-101;其调控的重要靶基因包括CACNB2、EFNB1、PTEN、TAOK1、RUNX1和TPM3等;RT-qPCR验证结果显示这些miRNAs和靶基因密切相关.结论 通过表达谱基因芯片与miRNAs芯片联合分析pAF左房组织标本,构建miRNA调控网络,发现pAF重要的miRNA-靶基因调控及功能,结果更加准确.
-
哺乳动物雷帕霉素靶向抑制剂靶向治疗肿瘤的进展
细胞生长受到复杂、精细的网络调控,哺乳动物雷帕霉素靶向(mammalian target of rapamycin,mTOR)在该调控系统中的作用尤为重要[1].
-
哮喘儿童不同病期IL-12表达水平的检测
已经证实,哮喘气道高反应性及慢性炎症改变与淋巴细胞和细胞因子组成的免疫网络调控异常有关.在成人哮喘中,经肺泡灌洗技术及纤维支气管镜对气道粘膜活检发现激素敏感型、激素耐药型及哮喘急性期、缓解期IL-12的变化.肺泡灌洗及纤维支气管镜作气道粘膜活检,是判断气道炎症程度可靠的方法,但在儿科临床依从性差.
-
永久性心房颤动患者心房组织相关微小核糖核酸调控网络研究
目的:寻找永久性心房颤动(pAF)发病相关的关键微小核糖核酸(miRNA)及其调控靶基因.方法:表达谱芯片比较pAF患者(n=7)和窦性心律健康成人(n=4)的左心房组织的转录组,miR-NA芯片筛选pAF相关差异表达miRNA,进行靶基因预测,与表达谱芯片的筛选结果进行负相关分析后的基因集合进行显著性功能分析(GO-Analysis),得到显著性、低误判率、靶向性的功能以及对应的靶基因;利用miRNA与靶基因之间的靶向调控关系,构建差异miRNA与分析后得到的显著性GO所属交集靶基因的调控网络(miRNA-Gene-Network),得到网络中起核心调控作用的miRNA和被miRNA调控的关键靶基因;采用qRT-PCR方法检验另一组pAF患者(n=5)和窦性心律健康成人(n=4)的左心房组织标本,验证所寻找的miRNA和被调控的关键靶基因.结果:26个差异表达的miRNA(16个上调、10个下调)和610个靶基因有显著性改变(fold change>2,P<0.05),与miRNAs芯片预测靶基因负相关后建立miRNA-靶基因调节网络发现与pAF显著相关的20个miRNA和107个靶基因,相关度高的是miR-144、miR-1284、miR-1827、miR-1、miR-3613-3p及miR-101;其调控的重要靶基因包括PTEN、TAOK1、RUNX1及TPM3等,参与心房电生理改变、成纤维细胞及胎儿基因表达等心房重构机制.qRT-PCR验证结果提示,这些主要的miRNA和靶基因与pAF发生密切相关.结论:通过表达谱基因芯片与miRNA芯片联合分析pAF左心房组织标本,构建miRNA-靶基因调控网络,是发现pAF相关关键miRNA及其调控靶基因一种方法.
-
耐多药肺结核患者细胞因子网络调控及一氧化氮水平变化的研究
为进一步研究耐多药肺结核患者(MDR-TB)的免疫发病机制,探讨细胞因子(CK)网络调控及一氧化氮(NO)水平变化在MDR-TB中的病理作用,我们采用双抗体夹心酶联免疫吸附测定(ELISA)法检测25例MDR-TB、25例药物敏感肺结核患者(DS-TB)和25例正常对照组血清γ-干扰素(IFN-γ)、白细胞介素-12(IL-12)、白细胞介素-10(IL-10)和β型转化生长因子(TGF-β)的水平,并采用Griess反应检测血清NO的水平.
-
成纤维细胞生长因子受体-1、2在维甲酸致大鼠神经管畸形发生中的作用
神经管畸形(neural tube defect,NTD)是人类出生缺陷中常见和为严重的一组畸形,由神经管的发生和分化异常而引起.许多文献报道神经管的关闭过程受多种基因形成的网络调控及环境因素的影响,成纤维细胞生长因子(fibroblast growth factors,FGF)信号途径及叶酸代谢与NTD关系密切.
-
热性惊厥患儿外周血单个核细胞间黏附分子1和淋巴细胞功能相关抗原1的表达及临床意义
在各类小儿惊厥中,热性惊厥(FS)约占30%[1],患病率为2%~5%,呈明显的年龄依赖性,多发生于3个月~6岁的儿童.近年来认为免疫网络调控异常是FS发病机制之一.
-
牙胚发育信号调控网络研究进展
牙胚的发育源于上皮与间充质间众多信号分子的相互作用,这种上皮-间充质间的相互诱导促进细胞的分化及器官的形成、发育的模式是近端诱导的经典材料.在此过程中,有Wnt家族,Hox基因家族,TGF-β超家族(包括BMP),Shh族基因以及其他间充质来源的转录因子,构成复杂的信号调控网络,指导细胞的增殖、分化、凋亡和牙胚器官的发生发育,形态的形成.本文对牙胚发育过程中主要调控因子的相关研究作一综述.
-
肺纤维化中细胞因子网络
目前,细胞因子网络在介导炎症及肺纤维化过程中所起的作用日益受到重视.根据分泌细胞因子不同将Th细胞分为I型辅助性T细胞(Th1)和Ⅱ型辅助性T细胞(Th2)两种类型.I型细胞因子具有抗纤维化作用,可抑制成纤维细胞的增殖及纤维的形成.Ⅱ型细胞因子可促进成纤维细胞的增生、导致胶原蛋白合成增加、抑制胶原蛋白的降解.
-
重要的是“土壤”,而不是“雨水”--兼论“经络是生命体一类涉及多层次的网络调控结构”
中国科协香山会议是中国科学界级别高的“神仙会”。每年中国科协资助各个学科开12~15次新观点、新学科学术沙龙。通常由各学科有影响的两三位专家做坛主(主席),有全国20~30位相关的该权威参与讨论一些前沿性话题。上一次有关中医的是36届(2009.9)会议,主席是何裕民、刘力红、陈珞珈3位知名教授,讨论主题是“中医药学发展的战略问题”。相隔一年多,科协又开了与中医相关的第45届香山会议,主题是“象思维与经络实质研究”。主席是中国中医科学院的首席教授黄龙祥和上海中医药大学的何裕民教授。
-
牙周炎患者病变牙龈中白细胞介素6mRNA及蛋白的表达
牙周炎时,各类细胞因子形成网络调控着疾病的发生发展,在宿主反应过程中,一系列的炎症介质,特别是众多的细胞因子起到了至关重要的作用,包括白细胞介素1(IL-1)、白细胞介素6(IL-6)、白细胞介素8(IL-8)、肿瘤坏死因子(TNF)和前列腺素E(PGE)等,它们不仅可以直接导致牙周组织的破坏,还可以进一步影响宿主的炎症和免疫反应进程,加重牙周组织的破坏[1,2].
-
FXR 蛋白在肝癌组织中的表达情况
我国肝癌发病率居全球首位,患者在确诊后即使经过治疗,仅有19%的患者能存活一年,Yang[1]发现 FXR 基因敲出的27只大于15个月龄的小鼠全部自发肝脏肿瘤,而同月龄的17只野生鼠无肿瘤发生,首次证实了 FXR 与肝癌的发生有密切关系。同年 Kim[2]报道了类似的结果,在12个月龄的FXR 基因敲除小鼠肝脏中发现了腺瘤、肝细胞癌及肝胆管细胞癌,进一步证实了 FXR 的缺乏将导致小鼠肝脏肿瘤的发生。可见 FXR 缺失与肝癌发生具有密切关系,这与 FXR 对机体代谢稳态的网络调控密不可分。而 FXR 在人类肝癌组织中的表达情况仍罕见报道。为了解 FXR 在人肝癌组织及正常组织的表达情况,我们收集了6例术后的肝癌组织及周围正常组织标本,通过 Western blot 法检测 FXR蛋白表达情况。
-
肝细胞核因子4在肝细胞分化和肝细胞癌中的作用
肝细胞核因子(HNFs)是肝脏优势表达的转录因子.HNFs家族不同成员之间互相网络调控,在转录水平调控肝脏重要功能基因表达,对肝脏发育,肝脏结构和功能维持起核心作用.其中肝细胞核因子4a(HNF4a)是细胞核激素受体家族的转录因子,处于转录因子"网络调控"上游,是肝细胞分化和功能维持为关键的转录因子[1].
-
雷光文冠心病患者血清IL-6及CRP检测的临床意义
炎症是冠心病(CHD)的病理基础,动脉粥样硬化(AS)是一个炎症性疾病过程[1].而感染性炎症与细胞因子和细胞因子间的网络调控在AS的发生、发展中起着重要作用,IL-6是机体炎症反应的标志物之一,在炎症和免疫反应中均起着重要作用.
-
试论中医"阴阳平衡"与类风湿关节炎细胞因子网络调控的相关性
类风湿关节炎(RA)患者滑膜组织和外周血中存在大量促炎症细胞因子,刺激滑膜细胞和软骨细胞产生基质金属酶、胶原酶等,导致滑膜炎症、软骨破坏,同时可激活破骨细胞,产生骨溶解.致炎细胞因子网络需要大量的抑炎性细胞因子平衡其作用,以维持内环境的稳定,当这些细胞因子表达降低时可导致持续性滑膜炎症.正常情况下这一网络处于动态的"阴阳平衡",而RA 患者因感受外邪或机体内环境的病理性代谢产物扰乱了正常的功能,这种平衡遭到破坏,表现为阳证或阴证,出现寒湿痹阻、湿热痹阻、寒热错杂等证型.治疗宜调控细胞因子网络,恢复动态"阴阳平衡".
-
神经干细胞增殖和分化相关信号通路的研究进展
神经干细胞(neural stem cells,NSCs)是一类来源于中枢神经系统的干细胞,具有自我更新能力及分化为神经元、星形胶质细胞和少突胶质细胞的潜能,为中枢神经系统损伤和退行性疾病的治疗提供了新的治疗选择[1].但如何让NSCs在复杂的信号网络调控中实现有序的增殖、分化,修复受损的神经组织[2],目前研究还未完全清楚.本文对涉及NSCs增殖和分化相关信号通路的新进展做一综述.
-
肺动脉高压时肺血管内皮间质转化相关miRNAs网络调控的生物信息学分析
目的:探索肺动脉高压( pulmonary hypertension,PH)时肺血管内皮间质转化( EndMT)相关miRNAs及其下游靶点的网络调控。方法利用文献挖掘PH相关基因及End-MT/EMT相关miRNAs。利用Biological General Repository for Interaction Datasets( BioGRID)数据库得到基因相互作用关系。利用生物信息学( DIANA3、Miranda4、PicTar5、Tar-getScan6、miRDB7和microT-CDS8)预测相应miRNAs的靶基因关系,超几何分析预测与肺动脉高压 EndMT 相关 miR-NAs,通过对miRNAs参与功能分区中的情况筛选评分高的miRNAs并选择部分进行实验验证,利用Cytocape 3软件构建miRNAs与其下游靶点的相互作用网络。结果根据文献挖掘出与PH有关的基因230个,与EndMT/EMT相关miRNAs共189个,对应成熟体322个。其中98个miRNAs可能与PH时EndMT有关。其中,仅有22个miRNAs同时参与了TGF-β/BMP、低氧和炎症3个功能通路,评分高,分别为 miR-let-7家族、miR-124、miR-130家族、miR-135、miR-144、miR-149、miR-155、miR-16-1、miR-17、miR-181家族、miR-182、miR-200家族、miR-204、miR-205、miR-21、miR-224、miR-27、miR-29家族、miR-301a、miR-31、miR-361和 miR-375。对let-7g、miR-21、miR-124及miR-130家族进行实时荧光定量PCR验证发现其在低氧诱导PH大鼠肺动脉中表达均明显变化。结论利用生物学信息技术从大量 miRNAs中筛选得到的22个miRNAs同时参与TGF-β/BMP、低氧和炎症信号通路,可能与PH时EndMT相关,为后续深入研究PH时EndMT提供了重要的理论依据。
-
人心力衰竭心肌microRNA表达谱分析及基因调控网络的初步研究
目的:应用人类全基因组芯片及microRNA芯片技术,获得心力衰竭(心衰)患者与正常人心肌细胞差异表达基因及microRNA,并进行功能和通路分析,构建完整的心衰基因调控网络,发现网络中起核心调控作用的基因及microRNA.方法:14例心衰患者及8例脑死亡的人正常心肌标本,分别杂交人全基因组芯片和microRNA芯片.对差异基因进行功能和通路分析,构建心衰组和正常组的基因调控网络;分析差异表达microRNA的靶基因与差异基因,构建microRNA的功能调控网络,终得到网络中的核心基因和microRNA.结果:①与正常组比较,心衰组上调基因207条,下调150条.经KEGG通路分析,差异基因参与了显著性上调的通路20个,下调的仅有2个.构建心衰组和正常组的基因调控网络,得到22个关键基因.②与正常组比较,心衰组上调microRNA 58条,下调41条.通过搜索TargetScan数据库以及其明公司microRNA预测引擎,得到差异microRNA调控的所有靶基因22 074条.③差异microRNA靶基因与差异基因交集后得到153条基因,构建microRNA调控网络,得到7个关键microRNA(包括microRNA-200b、181c、-340、557、19a、-19b及-548f),主要调节蛋白质氨基酸的磷酸化、多细胞的机体发育和免疫应答等功能.结论:心衰时心肌细胞的基因及microRNA表达谱发生了明显变化,基因调控网络存在显著不同,构建完整的心衰基因调控网络,有助于发现核心基因,深入理解心衰发生发展的分子机制,提供新的治疗靶点.
-
MicroRNA参与肿瘤发生发展的调控机制
MicroRNAs (miRNAs)具有瘤基因或抑瘤基因的功能,其表达异常影响细胞增殖、凋亡、侵袭和转移等肿瘤恶性表型,从而参与肿瘤的发生发展及其转录调控网络。转录因子与miRNA,miRNA与靶基因之间一对多及多对一的调控关系,增加了miRNA调控的复杂性,从而影响肿瘤的生物学特征;miRNA加工过程中,Drosha和Dicer的表达和活性影响成熟miRNA的加工合成;竞争性內源RNA (ceRNA)与miRNA的靶基因竞争相同的miRNA,从而作为miRNA的拮抗子影响miRNA功能的发挥,ceRNA表达和结构异常是肿瘤发生发展的又一重要分子机制。这种多维调控模式构成了miRNA调控的复杂网络,参与肿瘤发生发展的精细调控,从而为肿瘤诊断和治疗提供了新的靶点。
-
细胞因子网络与心力衰竭研究进展
充血性心力衰竭(CHF)的发生与初始的心肌损伤(血液动力学负荷过重、心肌缺血缺氧、原发性心肌疾病)有关,心肌由代偿到失代偿发展过程中存在复杂的调控机制,其确切机理尚不完全清楚.既往提出的"神经激素"学说并不能完全解释CHF的全部进程.近年来,有的学者提出了心力衰竭发病的"细胞因子假说",认为细胞因子之间的网络调控对于CHF的发生、发展具有重要作用[1.2].