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戊型肝炎病毒基因型地域分布特征的演变
自Reyes1990年首次克隆出缅甸株HEV基因序列以来,国内外不同基因型的HEV毒株陆续被发现.科学家们对已分离的HEV毒株进行了全基因及部分基因的克隆及测序,借助于系统软件的分析对HEV进行了基因分型,发现在世界范围内HEV基因型地域分布特征发生了很多变化.本文回顾了HEV基因型地域分布演变的过程,概括了HEV基因型新的地域分布特征.
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北京地区麻疹野病毒基因型特征分析
对北京市18个区(县)及铁路等疾病预防控制中心1998-2006年4月采集的210例麻疹疑似病例标本(318份)进行了病毒分离和基因序列分析.
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不同基因型丙型肝炎病毒混合感染者体内丙型肝炎病毒基因型和序列的分布
应用套式PCR从一例维吾尔族丙型肝炎病毒(HCV)感染者血清[职业献血员,有多次献血史,无自觉肝炎症状,抗-HCV(+),PCR基因分型为Ⅰ/Ⅱ/Ⅲ混合型]中,扩增出C区部分基因片段(357bp),将其克隆于T载体中进行基因型分析,并对不同基因型的C区片段进行序列测定.
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乙型肝炎病毒基因型对阿德福韦酯抗病毒疗效的影响
目前治疗慢性乙型肝炎重要和有效的方法是通过抗乙型肝炎病毒(HBV)药物抑制病毒复制[1].核苷(酸)类似物具有高效、低毒、服用方便等特点,在临床上得以广泛应用[2].阿德福韦酯是一种新型核苷(酸)类抗病毒药物,临床研究表明阿德福韦酯对HBV野生株以及对拉米夫定及其他抗HBV药物出现耐受变异株的HBV均有很强的抗病毒活性.探讨HBV基因型和抗病毒疗效的相关性及其机制,对于指导临床选择有效抗病毒药物、预测抗病毒疗效具有重要的参考价值和理论意义.笔者观察了不同HBV基因型对阿德福韦酯抗HBV疗效的影响,现将结果报告如下.
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麻疹病毒新基因型和麻疹病毒基因型在全球分布的新研究
1背景麻疹病毒分子特征分析是麻疹监测的重要组成部分,有助于加强麻疹监测和流行病学调查,以分析辨别麻疹病毒的来源和追踪病毒的传播途径.
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美国1999年麻疹发病情况
1999年美国各州和地方卫生部门共向美国疾病控制和预防中心(C DC)暂报100例确诊麻疹病例,与1998年报告的病例数相等。自199 7年以来美国麻疹发病率一直维持在≤0.5/100万水平。 1999年报告的100例病例中,33例为输入病例,67例为本土病 例(指在美国本土感染的病例)。67例本土病例中,33例与输入有关,3 4例不知病毒来源。尽管一些与输入有关的病例有病毒学证据,但没有只依靠 病毒学证据进行分类的报道。 输入病例占全部麻疹病例的33%,延续了自1992年以来输入病例所 占比例增长的趋势。输入病例中14例为国际旅行者,19例为美国居民在国 外旅行期间感染。 按世界卫生组织(WHO)区域划分,这些输入麻疹病例有10例来自西 太平洋区,东地中海、欧洲、东南亚区分别有6例,美洲区有2例,非洲区有1例, 有2例不知来源。 输入病例将麻疹病毒传播给了33个输入相关麻疹病例。每1例输入病例 平均传染了1例输入相关病例(范围:0~14)。在7个传播链中发现了输 入的病毒学证据,包括7个输入病例和26个输入相关病例。每个链中,分离 出的病毒的基因型与输入病例所在国正在循环的病毒基因型一致。与从英国、 意大利、瑞典输入病例,分离出了一个新的麻疹病毒基因型。与WHO麻疹病毒中心数据库 比较将这个基因型定为D7。 1999年,分类为不明来源的病例占全部病例的34%,自1995年 以来这个比例一直在降低。在34例不明传染源的病例中,10例为孤立病人 ,与其他麻疹病例无流行病学意义的联系,其余的24例发生在4起暴发中。 1999年,31个州和哥伦比亚特区报告无确诊麻疹病例,10个州报告 的病例数占全部病例的86%,9个州报告了不明传染源病例。33周内所有 报告的麻疹病例均为输入相关病例(未报告不明传染源病例),其中包括连续 12周(第19~30周)报告的病例。 在美国3*!140个县中,16个(占0.5%)报告了不明传染源病例。 在这些县中,有10个县第1周内发生不明传染源病例,第2和第4周之间有 5个县发生了不明传染源病例,1个县在不连续的11周发生不明传染源病例。
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我国流行性乙型脑炎病毒基因型研究
国外20世纪80年代开始流行性乙型脑炎病毒(乙脑病毒)分子生物学研究,目前结合生物信息学等技术可以进行病毒基因分型、病毒分子流行病学研究等,并用基因分型和进化理论揭示病毒的起源和疾病的预防控制.我国此项工作起步较晚,尤其对乙脑病毒分子特征如毒株基因型别及其在我国的分布等缺乏了解.但是近几年发展很快,有些研究已经达到国际水平.本期杂志收集了一些我国近几年有关乙脑的研究报告,包括疾病的流行,宿主和媒介以及新分离乙脑病毒病原学研究成果,文章不仅报告了病毒分离与鉴定情况,还包括病毒基因分型研究,将病毒学与分子生物学结合起来,是近年来我国乙脑病毒乃至虫媒病毒研究领域的极大进步.
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本溪地区乙肝患者病毒基因型分析
根据乙型肝炎病毒S基因序列的同源性可将该病毒分为A、B、C、D、E、F、G 7种基因型,各种基因型的分布与感染状况又表现不同的特点.我们对我国东北部重工业基地--本溪地区乙型肝炎患者病毒基因型进行了检测.
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进一步控制经输血传播的病毒感染
输血所致病毒感染一直是国内外输血界所关注的。近10年来,各国对献血者乙型肝炎(乙肝)病毒(HBV)、丙型肝炎(丙肝)病毒(HCV)和人类免疫缺陷病毒(HIV)进行了免疫筛查,使经输血传播的病毒感染率有了显著下降。但因病毒基因型的变异、检测试剂的敏感性以及新病毒的发现,经输血传播病毒感染依然存在。因此,与输血相关的病毒感染的危险性及基因扩增技术(GAT)筛查献血者的价值已成为医学领域中一个研究热点[1]。
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检测乙型肝炎病毒基因型的分子杂交方法有何特点?
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乙型肝炎病毒基因型及其临床意义的研究
目的:建立乙型肝炎病毒(HBV)前S基因巢式聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(nested PCR-RFLP的基因分型方法,并分析不同基因型与临床疾病谱的相关性.方法:设计nested PCR扩增前S基因,建立分型方法.并对32例慢性无症状携带者(ASC)、35例慢性乙型肝炎(CHB)、37例乙肝肝硬化(LC)、36例慢性重型乙型肝炎(HCH)患者的HBV DNA进行分型及分析.结果:广州地区分型结果:A型(2.9%)B型(30%),C型(67.1%);LC患者与ASC、CHB患者的基因型分布有统计学差异,前者以C型为主(分别为P<0.01,P<0.05).而HCH与ASC、CHB、LC患者的基因型分布并无统计学差异.结论:新的基因分型方法结果可靠,运用范围更广.广州地区以C型和B型为主,其中C型与B型相比,前者与更严重的肝损害相关.C型发展为肝硬化的可能较大,相对B型的预后则较好.
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影响拉米夫定相关乙肝病毒YMDD变异的因素
拉米夫定是抗乙肝病毒的主要药物之一,因其抗病毒作用确切而被广泛用于治疗慢性乙型肝炎.随着拉米夫定的广泛应用,由拉米夫定导致的耐药问题逐渐成为人们关注的焦点诱发乙肝病毒YMDD变异是引起拉米夫定耐药的主要机制.当YMDD变异病毒株成为优势株时就会影响拉米夫定的抗病毒疗效,出现耐药,导致病毒重新活跃,甚至病情的加重或死亡.目前研究认为影响拉米夫定相关YMDD变异的因素有:(1)拉米夫定用药时间.用药时间越长,发生YMDD变异的几率越大;(2)用药前病毒荷量、ALT水平及HBeAg状态.基线HBV DNA滴度高、ALT水平低或HBeAg阳性者较易发生YMDD变异;(3)前C区变异;(4)乙肝病毒基因型;(5)联合用药.
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慢性丙型肝炎患者外周血单个核细胞IFNAR2 mRNA的表达
目的:探讨慢性丙型肝炎患者外周血单个核细胞(PBMCs)干扰素-α/β受体(IFNAR2)mRNA的表达,及其与干扰素(IFN)抗病毒疗效的关系.方法:密度梯度离心法分离26例慢性丙型肝炎患者PBMCs,RT-PCR法扩增IFNAR2 mRNA,计算其表达水平.结果:慢性丙型肝炎患者PBMCs IFNAR2 mRNA表达显著高于健康对照者;其表达与血清病毒载量、病毒基因型及PBMCs HCV-RNA无关;干扰素治疗完全应答组PBMCsIFNAR2 mRNA表达显著高于部分应答及无应答组.结论:PBMCs IFNAR2 mRNA表达与干扰素疗效相关,可作为一个独立因素,用于预测慢性丙型肝炎患者干扰素疗效.
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多对型特异性引物巢式PCR检测湖南省乙肝病毒基因型
目的:采用多对型特异性引物,通过巢式PCR法检测湖南省乙肝患者血清中乙型肝炎病毒(HBV)基因型的分布情况.方法:根据从前Sl基因到S基因中的保守序列设计出10条内外引物,并将其中8条内引物分成A、B两组,分别扩增A、B、C和D、E、F型HBV,然后将第2轮PCR的两组产物分别用3%琼脂糖进行电泳,根据PCR产物片断大小直接判定HBV基因型.与目前常用的PCR-RFLP法进行了比较,并做重复试验以证实该方法的可靠性和准确性.用此法检测了220例湖南籍慢性乙肝血清中的HBV基因型,以了解湖南人群的HBV基因型分布情况.结果:多对型特异性引物巢式PCR与PCR-RFLP法的检测结果完全一致,重现率(100%);湖南人群HBV基因分型结果为B型190例(86.4%)、C型30例(13.6%).结论:这种新的巢式PCR分型法能清晰直观地辨别HBV基因型,结果准确可靠.用此法证实了湖南人群的HBV优势基因型以B型为主,C型次之.
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乙型肝炎病毒基因型流行病学与临床
HBV是小的人类DNA病毒,其基因组全长仅为3200个碱基,以部分环状双链存在.其中负链为完整的环链,包括4个相互重叠的读框:前C/C基因、P基因、S基因和X基因.1988年,Okamaoto等比较了18株HBV全基因序列,将它们分为4组,并命名为A~D,并指出,依据核苷酸序列异质性≥8%可将HBV毒株分成不同的基因型,这个分型标准延用至今.进一步研究HBV全基因序列以及它们之间的进化关系,发现了另外4个基因型:E、F、G和H.以下结合我们在HBV基因型研究方面的工作,介绍有关研究进展和初步共识.
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EV71和CoxA16病毒的区别与联系
手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)是婴幼儿常见传染病,主要表现为发热,手、足和口腔部的疱疹,由非脊髓灰质炎肠道病毒属的柯萨奇病毒(Coxsackievirus)A(CoxA)和B组,埃可病毒(ECHO viruses)4、6、7型等感染引起,CoxA16和人肠道病毒71型(enterovirus 71,EV71)感染尤其常见。1958年,加拿大首次分离出CoxA16[1],1969年,加利福尼亚首次报道了EV71[2],至1972年美国纽约、孟加拉国、澳大利亚陆续出现中枢神经系统感染流行时才真正分离出EV71病毒[1]。早期发现的手足口病病原体主要为CoxA16,20世纪70年代后,EV71与CoxA16感染交替出现,成为手足口病的主要病原体[3]。二者均在世界范围内引起多次暴发。CoxA16:美国(1968年)[4]、日本(1970年)[5]、澳大利亚(1991年)[6]、台湾(2006至2008年)[7]、西班牙(2009年)[8];EV71:马来西亚(2000至2003年)[9]、新加坡(2000年)[10]、泰国(2008至2009)[11]、韩国(2008至2009年)[12]、中国阜阳(2008年)[13]。显然,手足口病已成为一种世界性疾病,已引起了全世界人民的重视。本文拟从病原学、临床表现、病毒基因型和核苷酸序列与临床表现的关系以及发病机制方面,对手足口病的两种主要病原体,即EV71和CoxA16的区别和联系进行综述。
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乙型肝炎病毒基因型与血清型的关系及临床意义
乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)是已知的引起人类疾病的小DNA病毒,HBV感染呈世界性分布.传统上根据乙肝病毒外膜蛋白上的个别氨基酸的改变,将乙肝病毒分为4种主要的血清亚型:adr、adw、ayr和ayw,上述亚型可进一步细分为9种血清亚型:adw2、adw4、ayw1、ayw2、ayw3、ayw4、ayr、adrq+和adrq-.
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乙型肝炎病毒基因型及临床
HBV在其复制过程中,容易发生核苷酸的错误配对,故经常发生基因突变.这种同一病毒核苷酸序列的差异,表现为HBV不同的基因型.而各基因型的分子生物学、流行病学及临床表现及预后等,可能也各有异同.
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乙型肝炎病毒基因型与治疗
一、HBV基因型检测方法分析病毒全碱基基因序列以分子系统树判定HBV基因型的方法,需时、费力且欠实用.作者早年研究证实,单依S基因序列即完全可以确定.然而这也需要处理大量检体,颇为繁琐,遂行深入探索,终于开发出了应用S基因区为引物的PCR检测法.此即采用能识别各基因型特异性序列的限制酶并依其限制性片段长度多态性(restriction fragment length polymor-phism:RFLP)而确定基因型的技术.尔后,又研究成功采用识别前-S2区基因型特异性区氨基酸的单克隆抗体的EIA检测法,更简化了检测手续.只是采用本法由于引物结合部位的甚微变异或抗体识别部位变异,仍可有百分之几病例不能获得确定.对于此类病例,则必须根据S基因序列的实测结果再依系统树分析判定.
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乙型肝炎病毒基因型与干扰素抗病毒治疗相关性的探讨
乙型肝炎病毒是严重危害人类健康的病毒之一,是引起肝脏疾病的主要致病因子之一.目前全世界慢性HBV感染者至少有3.5亿,我国占其中的1/3左右,我国是乙型病毒肝炎的高发区,人群中乙型肝炎表面抗原(HBsAg)携带率高达约8%-10%.