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戊型肝炎病毒的分子生物学研究进展
戊型肝炎病毒(HEV)是一类新发现的RNA病毒.由于缺少可靠、方便的常规细胞培养系统和病毒感染的小动物模型,而从自然感染的人或实验感染的非人灵长类动物中获取的病毒量太少,对HEV的生物学和病理学研究受到严重限制.近几年来,主要利用亚基因组表达策略研究HEV基因产物的特性和功能,取得很多重要进展.本文以此为重点,概述了近年HEV的分子生物学研究成果
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蛋白组学及其在食品科学研究中应用分析
随着基因组研究不断深入,人们对生命科学的研究已经发展到分子方向,通过生物体遗传信息可研究生物体日常代谢,即蛋白质代谢活动研究——蛋白组学.蛋白组学定义 上世纪末外国生物学家提出的基因组表达全部蛋白质叫做蛋白质组,主要内容包括蛋白质、修饰体、亚型蛋白质等.在分子水平研究蛋白质功能、修饰等特性,其主要研究就是蛋白质的表达和功能.蛋白组学主要研究技术 蛋白组学核心技术为分离技术和鉴定技术.通过蛋白质信息学进行蛋白质结构功能分析,并对可能存在的功能进行预测.当前主要由3中较为常见的蛋白组学技术,即质谱鉴定技术、抗体芯片表面增强激光解析电离法检测技术、质谱联用蛋白质鉴定技术.研究中采用何种方法主要取决于实验条件及研究目的.
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中药干预心室重构的可能机制探讨
高血压、心肌梗死、心衰等心血管系统的常见病、多发病往往伴有重构的发生和发展.所谓重构,是指心肌损伤后由基因组表达改变引起的分子、细胞和间质的改变,分子改变表现为白细胞介素、基质金属蛋白酶和生长因子等的表达增加,细胞的改变包括心肌细胞的肥大、凋亡和纤维母细胞的增殖等,间质的改变表现为细胞外基质的产生,主要为胶原聚集(纤维化).重构还应该包括冠脉的间质组织和动脉外膜内的Ⅰ型和Ⅲ型胶原的聚集.
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运用微波原位杂交技术检测常规标本组织的基因表达
核酸原位杂交技术已广泛应用于组织和细胞的基因表达、定位及定量分析,以及病毒基因组表达的检测.但常规的原位杂交技术涉及多步骤处理,检测周期长,且石蜡包埋标本显示信号较弱.为了提高常规外检组织基因表达,缩短杂交时间,本文应用微波处理技术进行探索,取得了良好效果.
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心肌梗死后心室重构研究进展
心肌梗死(myocardial infarction,MI)后心室重构(ventricular remodeling,VR)是指心肌损伤后由于基因组表达改变引起的分子、细胞和间质的改变,分子改变表现为炎症因子、基质金属蛋白酶和生长因子等的表达增加,细胞的改变包括心肌细胞的肥大、坏死、凋亡和成纤维细胞的增殖等,间质的改变表现为细胞外基质的降解及胶原聚集又称纤维化,它们之间关系复杂,共同促进MI后VR的发生发展.据调查资料显示2008年全球急性心肌梗死(acute myocardial infarction,AMI)患病率为208/1 000 000,近些年以来随着医疗水平的进步特别是介入治疗技术的发展,AMI的存活率明显提高,AMI一个月内死亡率已由1999年的10.5%降低至2008年的7.8%[1].但MI后VR致心力衰竭的死亡率明显增加,因此干预MI后VR成为冠心病治疗的热点及难点问题.本文着重阐述MI后神经体液系统--肾素血管紧张素醛固酮系统(RAS)的激活与VR之间的关系,以及MI后基质金属蛋白酶及相关细胞学的研究进展.
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病毒性肝炎发病机制中的反式调节机制
病毒性肝炎的发病机制中涉及到复杂的反式调节(transregulation)机制.肝炎病毒的反式调节机制至少包括三方面的含义:一方面是肝炎病毒蛋白对于肝细胞基因组表达调节的反式调节,即肝炎病毒蛋白与肝细胞基因组启动子DNA结合,对于肝细胞基因表达谱产生影响;第二方面是肝细胞蛋白对于肝炎病毒基因表达的反式调节.肝炎病毒属于简单的生物类型,要完成其生活周期,必须借助于肝细胞中的蛋白成分,肝细胞中特有的一些蛋白成分,与肝炎病毒基因组DNA/RNA结合,对于肝炎病毒基因表达进行调节,这也是决定肝炎病毒嗜肝特性的重要的分子生物学机制;第三方面是肝炎病毒蛋白对于肝炎病毒基因组表达的反式调节.这是所有病毒复制和表达调节的一般机制.关于肝炎病毒反式调节机制的研究,主要是阐明肝炎病毒为何在肝细胞中的复制和表达处于佳状态,阐明肝炎病毒的致病机制,有助于据此设计新型的抗肝炎病毒的治疗技术和治疗方法.
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乙型肝炎病毒和丙型肝炎病毒蛋白对亮氨酸拉链蛋白LZIP的调节
乙型肝炎病毒(HBV)和丙型肝炎病毒(HCV)的感染,不仅引起急、慢性病毒性肝炎,而且与肝纤维化、肝细胞癌(HCC)的发生密切相关.虽然HBV、HCV感染与肝细胞癌之间的关系已经得到确定,但是具体的分子生物学机制还有许多工作要做.其中肝炎病毒编码蛋白对于肝细胞基因组表达的反式调节作用,即肝炎病毒蛋白与肝细胞基因组启动子DNA结合,对于肝细胞基因表达谱产生影响,从而调节肝细胞的生长、代谢、凋亡及恶性转化,在病毒感染致病机制中起着重要作用[1-5].人碱性亮氨酸拉链蛋白LZIP是碱性亮氨酸拉链蛋白家族重要成员之一,在肝炎病毒致肝细胞癌发生过程中发挥重要作用.
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乙型肝炎病毒蛋白反式激活基因的研究
0引言乙型肝炎病毒(HBV)的感染,不仅引起急、慢性病毒性肝炎,而且与肝纤维化、肝细胞癌的发生、发展过程密切相关[1-5 ].病毒进入到肝细胞之后,肝炎病毒蛋白在肝细胞内不是孤立存在的,病毒基因组在肝细胞内具有两种调控方式:其一是顺式调节,如启动子及增强子序列,以直接方式影响另外一些基因组的功能,是基因组内部调节方式;其二是反式调节,即基因组中一部分基因片段通过其转录或翻译产物产生对另一部分基因片段表达的调节方式,如病毒基因组表达的反式激活蛋白,以其表达产物的间接方式参与另外一些基因的功能调节,可以对基因组内部的基因片段,甚至可以对另外细胞或病毒的基因组有调控作用.这种病毒蛋白对肝细胞基因组的反式调节作用,影响了肝细胞的基因表达谱,是病毒感染慢性化以及引起感染的肝细胞发生恶性转化的重要的分子生物学机制之一[6-8].
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牛磺胆酸钠诱导的急性坏死性胰腺炎大鼠基因表达谱变化
基因芯片技术是高通量的差异基因表达研究手段.通过杂交后的生物信息学分析有助于全面了解复杂基因和信号转导通路在急性坏死性胰腺炎(ANP)中的作用.因此,利用全基因组表达谱方法分析ANP基因的变化较单个基因的研究具有理论上的优势.李磊等[1]曾报道,腹腔注射雨蛙肽诱导的急性水肿性胰腺炎(AEP)基因表达谱的变化,但尚未见类似临床重症急性胰腺炎(SAP)的ANP模型的胰腺组织基因表达谱的报道.故本实验观察ANP大鼠胰腺组织基因表达谱的变化.
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神经蛋白质组学-神经科学研究的新方向
2001年2月人类基因组的全序列测序的完成,标志着生命科学的研究进入了后基因组时代.后基因组时代的任务就是研究基因组的功能活动,即从揭示生命的所有遗传信息转移到在整体水平上对生物功能的研究.澳大利亚Macquarie大学的M.R.Wilkins和K.L. Wiliams于1994年首次提出了"蛋白质组"(proteome)的概念.1999年
杂志将蛋白质组定义为:在一个细胞的整个生命过程中有基因组表达的以及表达后修饰的全部蛋白质.需要指出的是,蛋白质组的定义中包含了时间和空间的概念.由于蛋白质的种类和数量总是处在一个新陈代谢的动态过程中,同一细胞的不同周期,其所表达的蛋白质是不相同的,同一细胞在不同的生长条件下(正常、疾病或外界环境刺激)所表达的蛋白质也是不同的.另外,研究对象的大小和范围(细胞、组织或生物体)不同,其相应的蛋白质组也不相同.因而,蛋白质组的研究,需要对研究对象以及特定的时间和空间进行界定.因为蛋白质性质的多样性特征,催生出众多的蛋白质组分析技术,这些技术基于不同的生物、化学等方法整合而产生的.当前大多数蛋白质组研究平台的基本技术主要分为与蛋白分离技术相结合的质谱技术和蛋白芯片技术. -
蛋白质组学在术后认知功能研究中应用的展望
蛋白质组(proteome)是指一种细胞乃至一种组织、一种生物所表达的全部蛋白质,它主要着眼于一个基因组所表达的蛋白质构成的整体.1999年Nature杂志将蛋白质组定义为:"在一个细胞的整个生命过程中有基因组表达的以及表达后修饰的全部蛋白质",这一定义中引入了时间和空间的概念,从整体水平上研究细胞内蛋白质的组成和活动规律,不仅对细胞内蛋白质进行测量和鉴定,还包括其定位、修饰、活性、功能以及相互作用,终目的是建立完整的蛋白质文库.蛋白质组学研究主要涉及两条发展线:一是表达蛋白质组学(express proteomics)(或称结构蛋白质组学,structural proteomics),指在整体水平上研究生物体蛋白质表达的变化,是对细胞或组织中的蛋白质表达量化谱的反映;二是功能蛋白质组学(function proteomics),主要研究蛋白质在细胞内的行为、运输及相互作用,从而构建细胞谱蛋白质组学(cell map proteomics).当前蛋白质组研究侧重点在建立正常细胞和组织的蛋白质组表达图谱及蛋白质组数据库,比较分析在病理或治疗干预下蛋白质组变化,通过比较分析,筛选具有特定功能的蛋白质群体.2001年Science杂志就已经把蛋白质组学列为人类六大研究热点之一,可以说蛋白质组研究的开展不仅是生命科学研究进入后基因组时代的里程碑,也是后基因组时代生命科学研究的核心内容之一.
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HPLC法测定不同年龄人参DNA的甲基化水平
甲基化是指由DNA甲基转移酶介导,在胞嘧啶或腺嘌呤碱基上的第5位碳原子上加上一个甲基的化学修饰过程,这种甲基化现象广泛存在于各种有机体中.DNA甲基化参与植物基因表达的调控,在植物的生长发育中起着非常重要的作用[1,2],可以用来作为一个反应基因组表达的指标.
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蛋白质组学在呼吸系统疾病中的应用
人类基因组计划(HGP)在2003年基本全部完成,这是人类科学发展史上的一个重要里程碑.由于生物基因组表达的类型及表达程度存在严格调控的时空特异性,mRNA的表达水平常不能代表细胞内活动蛋白质的数量;基因序列不能预示蛋白质转录后的修饰,而这对蛋白质的功能和活性可能是必须的;大量蛋白质尤其是重要调控蛋白质的化学修饰(如糖基化、磷酸化)、剪切加工(如酶原降解、结构域拼接),不但可以改变其立体结构,而且是实施其功能的重要结构基础.所有这些只有依赖于对其终的功能蛋白进行分析.因此,蛋白质组学的兴起将是人类科学发展史上又一个重要的里程碑.蛋白质组是一种基因组、一种细胞/组织或一种生物在精确控制其环境条件下,特定时刻所表达的全套蛋白质[1].其研究对象是研究体系内所有蛋白质组分的理化、生物学性质与功能,包括表达变化和翻译后加工等各方面的大规模信息[2].反映了研究体系内的动态代谢变化过程,有助于认识疾病的发生机制,从而早期发现疾病,做到合理诊断和治疗.
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蛋白质组学与IgA肾病
IgA肾病是亚洲地区如日本[1],我国[2]乃至全球发达国家[3]范围内发病率高的原发性肾小球疾病之一,其预后不佳,将近20%~50%的患者在10年或20年后进入尿毒症期[4]。
蛋白质组( proteome )的概念是由 Marc Wilkins 和 Keith Williams于1994年首次提出,意指基因组表达产生的所有相应的蛋白质[5]。1995年,Wasinger等第一次使用了该词,并定义为在一种细胞内存在的所有蛋白质,同时提出了蛋白质组学( proteomics)的概念[6]。随着科技的日新月异,蛋白质组学技术被不断应用于肾脏病学科,被用来从传统的血浆、血清、尿液中甚至肾穿标本中提取所需要的样本开展研究。蛋白质组学在肾脏病研究中展示着它巨大的优势,对此方面的研究也从未间断[7~9]。 -
蛋白组学技术在肿瘤诊断和治疗研究方面的应用
蛋白组是1994年澳大利亚Macquarie大学的科学家Wilkins在意大利的一次科学会议上首次提出,并首次在1995年7月的"ELECTROPHORESIS"发表.后来经不断完善定义为细胞内全部蛋白的集合体,包括基因组表达的蛋白质,还包括各种形式修饰后的蛋白质.蛋白组是基因组后兴起的一项新的研究领域.它以蛋白组为研究对象,从整体的角度分析细胞内动态变化的蛋白组成与活动规律.蛋白组学的研究领域包括:(1)对蛋白质进行大规模鉴定并阐明其转录后修饰的特征;(2)差异显示蛋白质组学,对各种疾病进行表达水平的比较;(3)通过各种技术,如质谱分析和酵母双杂交体系来研究蛋白质间的相互作用,并绘制蛋白质作用的图谱.在肿瘤研究方面,对于肿瘤蛋白标志物的筛选及鉴定肿瘤的特异性表达,肿瘤的发生机制,肿瘤的治疗评价方面蛋白组无疑是前沿的研究领域.是目前研究热点之一.蛋白组学的核心技术是双向凝胶电泳(2DE),质谱分析(MS),生物信息学(Bioinformatics),而临床样本分析应用广泛的技术是2-DE和MALDI-MS[1,2].
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蛋白质组学在肝纤维化和肝硬化中的研究进展
"蛋白质组"指的是由一个基因组表达的全部蛋白质[1],这一概念由澳大利亚学者Wilkins和Williams于1994年提出.蛋白质组学是从整体的角度研究生物机体、组织、细胞甚至细胞器基因编码的全部蛋白质,包括蛋白的组成、种类、分布、功能、代谢特征及其动态变化规律等[2].蛋白质组学技术在肝纤维化研究中的应用,具有潜在价值.中医药治疗肝纤维化和肝硬化具有优势疗效,蛋白质组学研究肝纤维化和肝硬化的中医证候,为证候研究提供客观依据,一定程度上阐明中医药的作用机制,进而指导临床用药,从而提高临床疗效.
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蛋白质组学在消化系统非肿瘤疾病中的研究进展
"蛋白质组"指的是由一个基因组表达的全部蛋白质[1],目前理解为生物机体、组织、细胞在特定的时间和空间表达的所有蛋白质.
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血管内皮抑素的临床应用进展(文献综述)
内皮抑素(endostatin,ES)是一种能特异性作用于内皮细胞,并能抑制血管生成的内源性血管生长调节因子.自1997年美国哈佛大学O'Reilly从鼠血管内皮细胞瘤株的培养液中分离出内皮抑素,经纯化和氨基酸测序后,发现它是胶原蛋白的ⅩⅤⅢ的一个片段,并证实它是一种潜在的内源性抗血管新生因子.经多个实验证实,ES能有效抑制多达60种以上不同种类肿瘤,并能调节12%的人类基因组表达,从而下调病理性血管发生而没有毒副作用,也无耐药性,是迄今发现的好的血管生成抑制因子之一[1].现将ES在临床上的研究和应用进展简要综述如下.
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蛋白质组学在尖锐湿疣研究中的应用
尖锐湿疣(CA)是由人乳头瘤病毒(HPV)感染所致的皮肤黏膜良性增生物,蛋白质组是指基因组表达的全部蛋白质及其存在方式.本文运用蛋白质组学的方法对尖锐湿疣进行了初步研究.
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蛋白质组学在药物研究中的应用
蛋白质组是指基因组表达的所有相应的蛋白质,是指细胞或组织或机体全部蛋白质的存在及其活动方式.蛋白质组具有多样性和可变性,同一机体的不同细胞中,蛋白质的种类和数量是各不相同的,即使是同一种细胞,在不同时期、不同生理条件下,其蛋白质组都是在不断变化之中,在病理过程或药物作用下,细胞蛋白质的组成及其变化,与正常生理过程也是不同的.