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结核分支杆菌弱毒株H37Ra减毒机制的初步探讨
目的:通过结核分支杆菌H37Rv和H37Ra蛋白质组分析,以期了解与H37Rv毒力相关的基因和H37Ra减毒机制.
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SERPA技术及其在微生物学研究中的应用
血清蛋白质组分析技术(serological proteome analysis,SERPA)是蛋白质组学与免疫学结合产生的一种高通量筛选和鉴定疾病相关抗原、抗体的新技术.
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肿瘤蛋白质组学研究进展
随着后基因组时代的到来,蛋白质组学成为一个发展迅速、日益重要的研究领域.高分辨率的双向聚丙烯酰胺凝胶电泳与质谱技术、生物信息学的结合使蛋白质组分析及其在临床疾病中的应用成为可能.尽管所有的细胞都拥有同样的基因组,但在不同的细胞内会有不同的基因处在活跃状态,从而合成不同的蛋白质.同样,病变细胞和正常细胞的差异在很大程度上也是由功能基因及其合成蛋白质的不同来决定的.恶性肿瘤是一种多基因参与的复杂疾病.蛋白质组学研究直接定位于蛋白质水平,从整体、动态、定量的角度去研究基因的功能.肿瘤蛋白质组学研究不仅有助于进一步揭示恶性肿瘤的发病机制,亦可应用于发现能进行早期临床诊断的肿瘤标记和寻找新的治疗靶标.蛋白质组学同时又是一门由技术推动、受技术限制的科学,需不断完善、发展其相关技术.
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肝病患者血清蛋白电泳分析
肝脏是蛋白质合成的重要器官,各种慢性肝病患者肝脏功能受损程度不同,血清蛋白质组分也发生不同的变化.因此,血清蛋白质各组分定量测定在肝病诊断与治疗上有重要参考价值[1].血清蛋白电泳是目前分离血清蛋白的常用方法之一,本研究分析了不同肝病患者血清蛋白电泳谱,现报告如下.
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血浆高密度脂蛋白中蛋白质组分与冠心病的关系研究
目的:高密度脂蛋白(high density lipoprotein,HDL)中蛋白组分变化被认为与冠心病的发生发展有关,本研究旨在探讨血浆与高密度脂蛋白中的载脂蛋白A-I(apolipoprotein A-I)与血清淀粉样蛋白A1(serum amyloid A protein1,SAA1)与冠心病的关系。
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冠心病患者服用他汀类药物后血浆HDL蛋白组分变化的研究
目的:高密度脂蛋白(high density lipoprotein,HDL)是目前研究热点,其蛋白组分是揭示HDL生物学功能的新的切入点。他汀类药物除具有调节血脂作用外,还能抑制炎症反应,稳定粥样斑块,改善血管内皮功能和抗血栓等作用,为临床常用药物。目前已知,冠心病(coronary heart disease,CHD)患者的HDL蛋白质组分发生变化。但是未见关于CHD患者服用他汀类药物后,HDL组分的变化。本研究旨在采用蛋白质组学技术比较他汀类药物使用前后HDL组分的变化,以探讨其与患者的疗效关系。从另一角度即HDL组分的变化来探讨他汀类药物的作用机制。
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神经蛋白质组学-神经科学研究的新方向
2001年2月人类基因组的全序列测序的完成,标志着生命科学的研究进入了后基因组时代.后基因组时代的任务就是研究基因组的功能活动,即从揭示生命的所有遗传信息转移到在整体水平上对生物功能的研究.澳大利亚Macquarie大学的M.R.Wilkins和K.L. Wiliams于1994年首次提出了"蛋白质组"(proteome)的概念.1999年
杂志将蛋白质组定义为:在一个细胞的整个生命过程中有基因组表达的以及表达后修饰的全部蛋白质.需要指出的是,蛋白质组的定义中包含了时间和空间的概念.由于蛋白质的种类和数量总是处在一个新陈代谢的动态过程中,同一细胞的不同周期,其所表达的蛋白质是不相同的,同一细胞在不同的生长条件下(正常、疾病或外界环境刺激)所表达的蛋白质也是不同的.另外,研究对象的大小和范围(细胞、组织或生物体)不同,其相应的蛋白质组也不相同.因而,蛋白质组的研究,需要对研究对象以及特定的时间和空间进行界定.因为蛋白质性质的多样性特征,催生出众多的蛋白质组分析技术,这些技术基于不同的生物、化学等方法整合而产生的.当前大多数蛋白质组研究平台的基本技术主要分为与蛋白分离技术相结合的质谱技术和蛋白芯片技术. -
蛋白质分析中生物信息学的应用
生物信息学是生物学与计算机科学及应用数学等学科相互交叉形成的一门新兴学科.它通过对生物学实验数据的获取、加工、存储、检索与分析,进而达到揭示数据所蕴涵的生物学意义的目的,被认为是21世纪生物学的重要组成部分[1].生物信息学涵盖生物数据库、生物学软件、生物大分子模拟三方面内容[2].在后基因组时代的蛋白质组分析中,生物信息学必将会扮演重要角色[2].
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蛋白质组学在呼吸系统疾病中的应用
人类基因组计划(HGP)在2003年基本全部完成,这是人类科学发展史上的一个重要里程碑.由于生物基因组表达的类型及表达程度存在严格调控的时空特异性,mRNA的表达水平常不能代表细胞内活动蛋白质的数量;基因序列不能预示蛋白质转录后的修饰,而这对蛋白质的功能和活性可能是必须的;大量蛋白质尤其是重要调控蛋白质的化学修饰(如糖基化、磷酸化)、剪切加工(如酶原降解、结构域拼接),不但可以改变其立体结构,而且是实施其功能的重要结构基础.所有这些只有依赖于对其终的功能蛋白进行分析.因此,蛋白质组学的兴起将是人类科学发展史上又一个重要的里程碑.蛋白质组是一种基因组、一种细胞/组织或一种生物在精确控制其环境条件下,特定时刻所表达的全套蛋白质[1].其研究对象是研究体系内所有蛋白质组分的理化、生物学性质与功能,包括表达变化和翻译后加工等各方面的大规模信息[2].反映了研究体系内的动态代谢变化过程,有助于认识疾病的发生机制,从而早期发现疾病,做到合理诊断和治疗.
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蛋白质组分析在医学中的应用
随着人类基因组计划(HGP)的实施和完成,基因研究以近顶峰而进入后基因时代,后基因组研究以基因组学为中心,同时分化出代表生命科学不同侧面的多种"组学"研究,如蛋白质组学(proteome)、药物基因组学、比较基因组学等[1],在这些领域中蛋白质作为生命活动的"执行者",参与了DNA的合成、基因转录激活、蛋白质翻译、修饰和定位以及信息传导等重要的生物过程,已经成为新的研究焦点.
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蛋白质组学与卵巢癌研究
随着后基因组时代的到来,蛋白质组学已成为一个发展迅速、日益重要的研究领域,高分辨率的双向聚丙烯酰胺凝胶电泳(two-dimensional polyacrylamide gel electrophoresis,2-D PAGE)与质谱分析技术(mass spectrometry,MS)和生物信息学的结合使蛋白质组分析及其在临床疾病中的应用成为可能.
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尿蛋白和生物标志物的现代分析与鉴定技术对肾病诊断的意义
肾病,肾脏的各种病证.如何诊断肾病,并进行早期干预是临床上迫切需要解决的问题.本文将着重介绍尿液的蛋白质组分析及其前景、挑战和仍未实现的生物标记物的检测方法;这类方法可以实现肾病的早期诊断、患者的预后诊断评估和患者对治疗的反应.1蛋白组学应用于肾病诊断的意义早在17世纪,一些医生已经采用了一种类似于蛋白组学的方法来诊断病理性蛋白尿.这种方法主要是通过观察尿液及其发泡情况来间接地判断.1975年,O’Farrell[1]介绍了双向凝胶电泳分离大肠杆菌蛋白的实验,但他并未意识到自己正在从事蛋白组学方面的工作.
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现代统计方法在蛋白质组信息分析中的应用
随着蛋白质组学研究近年高速的发展,需要进行蛋白质结构的预测,功能的识别,以及生物标记物的预测与鉴别等,由此产生了亟待分析的海量数据,并对传统统计分析处理方法提出了新的挑战,许多统计专业人员纷纷涉足于该领域的研究,提出了许多新的分析模型.本文就目前在蛋白质组分析中用到的一些现代统计分析方法做一个综述.
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粉尘螨滴剂中硫柳汞限度的比色检查
在<中国生物制品规程>中,硫柳汞含量测定采用样品经氧化破坏后,以硫酸铁铵为指示剂,硫氰酸铵滴定法进行测定.该方法繁琐费时,不适合大批量样品测定.全爱顺等采用丙酮-双硫腙-氢氧化钠显色,建立了硫柳汞含量测定的紫外分光法.但应用该方法在检查粉尘螨滴剂中硫柳汞的限度试验中发现,由于粉尘螨滴剂中蛋白质组分干扰,影响硫柳汞的显色稳定性.作者首次在检测硫柳汞中引入离心超滤技术,将有效避免蛋白质的干扰,使得硫柳汞显色稳定,结果判断准确,而且适合大批量样品的快速检测.
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双向电泳技术在蛋白质组研究中的应用体会
双向电泳(two-dimensional electrophoresis,2-DE)作为蛋白质组研究的三大核心技术之一,是目前分离复杂蛋白质组分常用的工具.双向电泳分离蛋白质的优势在于具有高分辨率、高重复性和高信息量,因此日益受到人们的广泛关注.其原理是第一向根据蛋白质的等电点(pI)分离蛋白质,第二向是等电点相同的蛋白质根据蛋白质的分子量(MW)不同,再次得到分离.
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体检人群蟹蛋白质特异性IgG水平及所识别蛋白质组分分析
目的 分析体检人群对蟹过敏原食物不耐受情况及蟹特异性IgG所识别的蛋白质成分.方法 用丙酮去脂、PBC浸取法提取中华绒螯蟹蛋白质液,用粗提蛋白质作为包被抗原,用间接ELISA法检测391例体检人群血清中特异性IgG抗体,分析不同年龄、性别间对蟹的不耐受率差异;用SDS-PAGE分析粗提蛋白质组分,并以筛选出的抗体效价较高的血清作为识别抗体,用western blot分析提取液中主要与特异性IgG结合的成分.结果 在391例血清中,蟹不耐受率为39.9%,其中轻度不耐受率为35.1%,中度不耐受率为4.9%.青年组中蟹不耐受率为25.4%,中、老年组中蟹不耐受率为65.0%,差异有统计学意义;男、女对蟹的不耐受率无明显统计学差异.不同个体血清的western blot图谱(条带)存在差异.结论 人群中某些个体存在蟹蛋白质的特异性IgG抗体,但只有部分个体抗体效价较高,并且特异性抗体所识别的蛋白质组分存在个体差异.
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二维凝胶电泳技术在病原生物学中的应用
1 背景蛋白质组分析的三大主要步骤是:(1)分离复杂的蛋白质混合物;(2)鉴定分离出的多肽;(3)数据库比对.与此相对应的三大核心技术分别是二维凝胶电泳技术、质谱技术、生物信息学.
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比较蛋白质组分析在病原细菌研究中的应用
随着多种病原体和模式生物基因组测序工作的顺利完成,做为后基因组时代主要内容的蛋白质组研究已成为全球性热点,给生物学和分子生物学研究带来了前所未有的机遇和手段,同样在各种病原体研究中得以广泛应用.本报告仅从比较蛋白质组分析这一蛋白质组学的分支入手,介绍一下在病原细菌研究领域的应用及应用前景.
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宫颈鳞癌细胞蛋白质组的分析
目的 分析高同质性宫颈鳞癌细胞与正常宫颈细胞蛋白质的表达差异,以期获取宫颈鳞癌的分子标志物.方法 利用激光捕获显微切割(LCM)技术分离获取宫颈鳞癌和正常宫颈组织细胞,双向凝胶电泳和质谱法检测两者表达的差异蛋白.结果 双向凝胶电泳得到 20个差异蛋白点,质谱鉴定显示,其中ETS1、HSP60、Bcl-2、C-myc、TIF1-β等5种蛋白在宫颈鳞癌细胞中表达明显增高(P均<0.01).结论 应用LCM技术可以成功获取同质宫颈癌细胞和正常细胞; 宫颈鳞癌和正常宫颈细胞的2-DE蛋白质图谱具有明显的差异表达,该表达差异蛋白可望作为宫颈鳞癌的分子标志物.
关键词: 宫颈肿瘤 宫颈癌 蛋白质组分 激光捕获显微切割技术 -
蛋白质组分析技术在医学研究中的应用
蛋白质是生命活动的真正执行者,基因的主要功能是通过其表达产物-蛋白质来实现的,而蛋白质在合成之后又具有相对独立的修饰、转运和相互间的作用能力,同时还具有对外界因素发生反应的能力.因此,仅仅从基因的角度进行研究尚不能解决基因的表达时间、表达量、翻译后修饰等问题,只有从蛋白质组学的角度对所有蛋白质的总和进行研究,才能更加贴近对生命现象和本质的掌握,揭示生命活动的本质和活动规律.正因为如此,目前生命科学的前沿热点已从基因组学转向蛋白质组学 (proteomics).