首页 > 文献资料
-
DLX3基因罕见变异与发育性髋关节发育不良
目的:筛查DLX3基因(NM_005220)中发育性髋关节发育不良(DDH)相关的致病变异.方法:本研究对192例DDH患者和188例健康对照组的DLX3基因全部外显子区进行Sanger测序,排除已知高频单核苷酸多态性(SNP)位点(小等位基因频率MAF≥1%)和对照组中存在的变异位点,结合功能性预测和保守性分析,终筛选出DDH候选致病变异.结果:经过分析,终在一个DDH患者中筛选出一个错义杂合变异DLX3 c.G736C:p.D246H(rs3744539)可能为其致病突变,此变异在物种进化过程中高度保守且致病的可能性较高.结论:本研究首次对DLX3整个外显子区进行变异筛查,并发现新的DDH候选致病变异p.D246H.
关键词: 发育性髋关节发育不良 DLX3基因 错义变异 致病突变 -
1例遗传性迟发型耳聋大家系临床特点及其基因检测
目的 探讨内蒙古地区发现的1例遗传性迟发型耳聋大家系的临床特点及其致病基因,为该类疾病的早期筛查和诊断提供依据.方法 通过家系调查,对家系成员进行听力学检测及全身体格检查;绘制系谱图,整理分析家系资料;抽取外周血提取DNA;利用候选基因捕获测序方法对先证者进行127个已知基因排查性检测,将捕获到的基因突变位点进行PCR扩增和Sanger测序验证.结果 该家系共6代,可追溯的有53人,耳聋患者19例,均为语后聋,表现为迟发性和渐进性听力下降,发病年龄为10~40岁,患者听力损失表现为双侧对称性轻度至重度感音神经性耳聋.先证者检测结果确定1个临床意义未明的潜在基因致病突变位点:GJB3,c.400A>G.后续经直接测序验证,此突变位点在家系中无共分离现象.结论 该遗传性迟发型耳聋家系属于常染色体显性方式遗传,从先证者检测捕获的GJB3,c.400A>G基因突变位点不能确定为该家系的致病突变,还需进一步通过全基因组测序技术对其致病基因进行探索.
关键词: 遗传性迟发型耳聋家系 候选基因捕获测序 GJB3基因 致病突变 -
线粒体tRNATEU(UUR)基因点突变与1型糖尿病关系的研究
近年来发现线粒体tRNALEU(UUR)基因点突变是糖尿病的致病突变之一[1,2],我们对线粒体tRNALEU(UUR)基因3243位点A→G突变与1 型糖尿病的关系进行了研究,旨在揭示该基因点突变在我国东北地区汉族1型糖尿病患者中的情况以及与自身免疫导致的1型糖尿病有无关联。 材料与方法 1.实验对象:选取57例1型糖尿病患者,祖籍三代均为东北地区汉族居民,其中以酮症起病者23例,男性12例,女性11例,平均年龄14.9±1.6岁,发病年龄10.0±1.5岁,体重指数17 .8 4±1.55kg/m2;缓慢进展型1型糖尿病34例,男性21例,女性13例,平均年龄45.2±2.0岁,发病年龄40.7±2.5岁,体重指数22.25±1.64kg/m2。
-
产前诊断除外肌营养不良蛋白基因外显子44移码突变一例
先证者,男,1+岁,临床诊断为杜氏肌营养不良症(Duchenne muscular dystrophy,DMD).该病发生主要原因是编码肌营养不良蛋白(dystrophin)基因的大片段缺失或突变[1].首先采用多重聚合酶链反应技术针对先证者及其父母的肌营养不良蛋白基因26个外显子(包括3、4、6、8、12、1 3、16、17、19、32、34、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、60、Pm、pb)进行检测,未见上述外显子缺失.进而采用多重连接依赖的探针扩增(multiplex ligation-dependcnt probe amplification,MLPA)法检测肌营养不良蛋白基因79个外显子,均未见缺失或重复.终经全基因测序发现先证者第44号外显子一处移码突变:NM_004006.1:c.6391_6392delCA(p.Gln2131AsnfsX3),而先证者父母的44号外显子同步测序均未见异常,且此突变未见报道.通过寡核苷酸多态性数据库(www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP)、国际人类基因组单体型图计划(www.hapmap,org)和“华大基因千人基因组计划( www.genomics.cn)”中72个中国人样本的数据分析排除多态可能,同时经PDB数据库(www.pdb.org)蛋白功能预测可能造成膜蛋白结构域的改变,因此考虑此突变为新发或生殖腺嵌合造成的致病突变.
-
Frataxin与弗里德赖希共济失调
弗里德赖希共济失调(Friedreich ataxia,FRDA)是国外常见的遗传性共济失调之一,其遗传方式为常染色体隐性遗传,发病年龄常在儿童早期,病程呈进行性发展,多于40~50岁死亡.发病率约1~2/50 000.FRDA的临床特征,包括进行性姿势和步态的共济失调,上运动神经元功能障碍的体征,如构音障碍、腱反射消失、深感觉丧失、心肌病、糖尿病及继发性骨骼畸形等.其致病基因为X25,编码产物为frataxin,位于第1内含子上的GAA三联密码子重复扩展突变为其致病突变.该重复扩展可导致frataxin蛋白的表达严重减少从而致病.近年来在frataxin及其与弗里德赖希共济失调发病机制的关系研究取得较大研究进展,现综述如下.
-
骨骼发育不良的分子遗传学研究进展
骨骼发育不良(SD)是一组以全身骨骼生长发育障碍为特征的遗传性骨骼系统疾病,其临床表型具有多样性和复杂性.分子诊断技术可帮助临床医师明确疾病的类型、病因和转归.全外显子组测序(WES)目前作为基因组学中被广泛应用的技术,在SD的致病突变和发病机制研究中取得了显著成果.本文就近3年来应用WES在SD领域的分子遗传学研究进展进行综述.
-
男性脆性X综合征快速筛查
脆性X综合症(FraX)是较为常见的遗传性智力低下疾病,发病率仅次于唐氏综合征的遗传性智力低下综合征,在xq28存在两个脆性位点FRAXA,FRAXE,以FRAXA为常见,该病是由于脆性X智力低下基因FMR1功能丧失所致,约占全部儿童的0.05%,呈X隐性遗传,占X连锁智能低下的40%,分子遗传学研究表明,脆性X综合征主要的致病突变FMR1基因5′-非翻译区中不稳定的三核苷酸重复序列(CGG)n扩增.
-
眼科遗传学研究取得重大进展
本报通讯员、天津市眼科医院(300022) 管大尉报道 天津医科大学、天津市眼科医院赵堪兴教授、王立教授及其课题组与旅美学者、人类分子遗传学专家王擎博士合作,在国家自然科学基金资助下,经过近2年遗传学研究,应用分子生物学技术成功检测出我国人群视网膜色素变性患者致病突变原因.
-
人类胚胎基因编辑研究
据2017年8月2日Nature报道,在中国深圳国家基因库、美国Salk生物学研究所、俄勒冈健康与科学大学、韩国基础科学研究院的国际合作组的通力协作下,科学家第一次成功地利用CRISPR-Cas9系统在人类早期胚胎中对导致肥厚型心肌病(HCM)的基因突变进行了安全修复.HCM是以心室肌肥厚为突出特征的原发性心肌病,患病率约为 1/500,是一种全球性疾病,也是青壮年运动员猝死的主要原因之一.多数的HCM均由基因突变导致,MYBPC3基因突变是为常见的遗传突变.利用基因编辑技术在胚胎中修复MYBPC3致病突变,为从根本上治愈该种家族性遗传疾病带来了希望.
-
"深度结合技术"可查出致病突变
美国加州食品与农业研究学会科学家提出一项名为"深度结合"的新技术手段,通过运用机器学习技术分析蛋白质与DNA和RNA的结合方式,查出可阻断细胞进程的致病突变.美国加州食品与农业研究学会高级研究员布伦丹-弗雷运用"深度学习"技术,新研发出一项可查出致病突变的科技手段."深度学习"是一种机器学习技术,早由美国加州食品与农业研究学会成员在"中性计算与自适应感知"科研项目中率先创导,现已被谷歌和脸谱等科技公司广泛运用.
-
一个导致先天性白内障的CRYBA4基因新突变鉴定及产前诊断
目的 检测一个先天性白内障家系的致病基因突变,以此为依据进行该家系的产前诊断.方法 收集该家系患者和正常表型成员的临床资料,采集外周血提取基因组DNA,采集胎儿绒毛提取基因组DNA.应用高通量测序法筛查、Sanger测序法验证CRYBA 4基因新突变位点.在对照人群中筛查该突变.结果 该家系患者中存在CRYBA 4基因c.277 T>C(p.Ser 93 Pro)错义突变,该突变导致其编码蛋白beta-crystallin A 4第93位氨基酸由丝氨酸变为脯氨酸(p.Ser93Pro).在家系正常成员和831例对照人群中未检测到相同变异.该突变在ExAC、1000 G、dbSNP等数据库中未见报道.Mutation t@sting预测该突变为有害突变.结论 CRYBA4基因c.277T>C(p.Ser93Pro)错义突变是该家系的致病原因,据此突变位点可进行产前诊断.
-
人SNCA及其致病突变基因的逆转录病毒pEGZ/MCSHA载体的构建
目的:克降人野生型SNCA基因,构建野生型SNCA基因及其致病突变Ala30Pro、Ala53Thr的逆转录病毒表达载体.方法:通过逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)方法从人胎脑扩增SNCA基因,T-A克隆后测序.在此基础上利用单核苷酸差异引物定点诱变法构建其致病突变Ala30Pro、Ala 53Thr的SNCA基因的逆转录病毒载体,并用这些重组逆转录病毒载体转染宿主细胞.结果:PCR、酶切及测序证明逆转录病毒表达载体构建成功.目的基因序列在宿主细胞成功表达.结论:人野生型SNCA基因及其Ala30Pro、Ala53Thr突变基因的重组逆转录病毒pEGZ/MCS HA载体的成功构建,为进一步构建表达野生型及Ala30Pro、Ala53Thr突变型SNCA的PD细胞模型奠定基础.
-
常染色体显性遗传性痉挛性截瘫遗传学进展
遗传性痉挛性截瘫(HSP)是一类具有显著临床和遗传异质性的神经系统退行性疾病,临床主要表现为缓慢进展的双下肢无力和痉挛所致的步态异常或障碍.临床上,根据遗传方式可分为常染色体显性遗传、常染色体隐性遗传、X连锁隐性遗传和线粒体母系遗传.根据临床表型的复杂与否,可分为单纯型和复杂型.至今HSP已发现或报道了78个致病基因相关位点,59个致病基因已被克隆;常染色体显性HSP已发现20个致病基因相关位点,13个致病基因已被克隆.该文就常染色体显性HSP的遗传学特征及研究进展进行综述.
-
SCN4A基因突变导致的一个先天性副肌强直家系研究
目的 分析一个疑似先天性副肌强直家系致病突变,为产前分子诊断提供依据.方法 针对该家系临床表型进行分析,确定待测基因.用PCR-直接测序法分析目标基因的外显子及其侧翼序列,寻找致病突变.对筛查出的突变用PolyPhen和NCBI网站进行致病性与保守性分析,同时结合家系分析评估突变位点的致病性.结果 对目标基因SCN4A进行突变分析,发现家族中患者均存在c.3473C>T杂合突变,健康成员均未发现该突变,属于常染色体显性遗传;生物信息学分析该突变位点编码氨基酸由脯氨酸变成亮氨酸,突变所在区域高度保守,该突变具有高度致病性.结论 证实了一个先天性副肌强直家系中SCN4A基因的新致病突变c.3473C>T,为患者选择胚胎植入前诊断健康婴儿提供了依据.
-
常染色体隐性遗传性耳聋
常染色体隐性遗传性耳聋是指与耳聋表型相关的基因位于常染色体上,此类耳聋只有在两个分别来自父母的等位基因均携带致病突变时才出现耳聋。有关常染色体隐性遗传性耳聋的描述早出现在16世纪,Schenck描述了一个家系中的多名兄弟姐妹均患有先天性重度耳聋,而他们的父母听力完全正常。
-
一个斑驳病家系的KIT基因新突变鉴定
目的:对一个斑驳病家系进行致病基因突变检测。方法收集一个呈常染色体显性遗传的斑驳病家系患者及家系成员的临床资料,采集外周血提取基因组 DNA,应用聚合酶链反应和 Sanger 测序法筛查所有家系成员的 K IT 和 SNAI2基因。结果先证者 K IT 基因第18外显子存在 c.2585T>C突变,与 c.2586G>C 多态性共同导致肥大细胞/干细胞生长因子受体第862位氨基酸由亮氨酸变为脯氨酸(p.Leu862Pro)。c.2585T>C 突变在家系中呈基因型-表型共分离,在 dbSNP142数据库等公共数据库中均未见报道。在 SNAI2基因上未发现突变。结论 K IT 基因 c.2585T>C 突变可能是导致该家系斑驳病表型的原因。
-
肺癌的基因影像学研究
随着生命科学的发展,基因诊断与影像诊断为探讨肺癌的生物学行为及其发展规律提供了新的途径和方向,现就肺癌的基因影像学研究作一综述.1 基因影像学的相关概念基因诊断是探测基因的存在,分析基因的类型和缺陷,及其表达功能是否正常,即鉴定致病突变,找出基因突变与疾病相关联的基因,从而达到诊断疾病的目的.它是利用DNA重组技术,通过分析基因结构和功能的改变,进行有关疾病(包括肿瘤)发病机制研究和诊断的一种方法[1].
-
人SNCA基因真核表达载体的构建及其在PC12细胞中的表达
目的:构建含人野生型及致病突变A30P、A53TSNCA基因的重组真核表达载体pEGFP-C3-SNCA,并通过稳定转染获得过表达人野生型及致病突变A30P、A53T α-synuclein(SNCA)的单克隆PC12细胞株.方法:通过RT-PCR方法扩增SNCA基因,T-A克隆后测序.在此基础上利用单核苷酸差异引物定点诱变法相继构建含SNCA基因编码区EcoR Ⅰ、BamH Ⅰ两酶切位点的同义突变及其致病突变G88C(Ala30Pro)、G209A(Ala53Thr)的重组真核表达载体pEGFP-C3-SNCA,并以PCR、双酶切、测序鉴定.以重组质粒pEGFP-C3-SNCA通过脂质体转染方法转染PC12细胞;以G418进行筛选;以有限稀释法进行亚克隆获得稳定过表达人野生型及致病突变A30P、A53T α-synuclein的单克隆PC12细胞株,并以稳定转染pEGFP-C3的PC12细胞作为对照组细胞,通过RT-PCR、Western blot及荧光显微镜鉴定各单克隆PC12细胞株.结果:PCR、酶切及测序证明重组真核表达载体pEGFP-C3-SNCA构建成功.RT-PCR、Western blot及荧光显微镜确认目的基因序列在PC12细胞稳定过表达.结论:成功地构建SNCA基因WT及A30P与A53T突变型的重组真核表达载体pEGFP-C3-SNCA;成功获得过表达人野生型及致病突变A30P、A53T α-synuclein的单克隆PC12细胞株.