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评估纸片扩散法与 Vitek2-compact GN13测定肠杆菌科细菌体外药敏及 ESBLs 可靠性的研究
目的：评估纸片扩散法与Vitek2-compact GN13测定肠杆菌科细菌体外药敏及ESBLs的可靠性。方法本研究选取了2011—2012年从21家医院腹腔感染患者中分离的93株肠杆菌科细菌。分别采用纸片扩散法、Vitek2-compact GN13、微量肉汤稀释法测定其对氨苄西林-舒巴坦、哌拉西林-他唑巴坦、厄他培南、头孢他啶、头孢曲松、头孢吡肟、亚胺培南、阿米卡星、环丙沙星和左氧氟沙星的体外敏感性。以微量肉汤稀释法作为参考方法，分别评估纸片扩散法、Vitek2-compact GN13与参考方法的分类一致率（ CA％）。利用PCR及测序法，在大肠埃希菌、肺炎克雷伯菌、产酸克雷伯菌和奇异变形杆菌中筛选超广谱β-内酰胺酶（ ESBLs）耐药基因，评估纸片扩散法与Vitek2-compact GN13表型确证试验筛选ESBLs的敏感性、特异性、阳性预测值和阴性预测值。结果纸片扩散法和Vitek2-compact GN13与参考方法的一致率均＞90％；但在使用Vitek2-compact GN13测定厄他培南、氨苄西林-舒巴坦、头孢他啶和头孢吡肟时，会出现一定比例的大错误（ ME，3．2％）和极大错误（ VME，2．2％）。此外，纸片扩散法和Vitek2-compact GN13对产ESBLs菌株测定的敏感性、特异性、阳性预测值、阴性预测值分别为96．7％（29／30）、100％（20／20）、100％（30／30）和95％（19／20）。结论无论是纸片扩散法还是Vitek2-compact GN13，对肠杆菌科细菌体外药敏及ESBLs的测定均比较可靠。但在采用Vitek2-compact GN13测定厄他培南、氨苄西林-舒巴坦、头孢他啶和头孢吡肟时，应注意可能出现ME及VME。
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乙型肝炎病毒蛋白表型定义初探
目的:探讨乙型肝炎病毒(HBV)基因型的分型方式,并根据病毒蛋白结构提出新的病毒蛋白分型方式.方法:自GenBank中按基因型搜索符合要求的HBV基因组序列,并应用Vector NTI suite 8.0版软件进行基因组核苷酸及各基因编码蛋白质序列比较,并利用软件分析前前-S基因、前-X基因和前-C基因的存在状态.结果:在GenBank中根据HBV基因型分型搜索出119个病毒株全基因组,比较后发现选择病毒株基因组核苷酸序列总阳性率和总一致率分别为95.7%和147.7%;选择病毒株编码的全C蛋白、全S蛋白、全X蛋白和多聚酶的总阳性率分别为98.6%、87.3%、57.2%和95.2%,总一致率分别为37.4%、24.1%、27.7%和43.5%.在病毒群中,33.61%的病毒株编码前前-S多肽,14.3%的病毒株编码前-X多肽,26.1%的病毒株不编码前-C多肽,94.1%编码前-X多肽的病毒株同时编码前前-S多肽.基因组1-700 nt一致率30.6%,1 103-1 653 nt一致率20.8%,为高变区;基因组1 654-1 950 nt的一致率为74.2%,为高保守区.4种病毒蛋白各有其相应的高变区和高保守区根据病毒蛋白前导性序列的变异情况提出新的分型方法,命名为蛋白表型.蛋白表型分7型,Ⅳ型为主要流行表型,占39.5%,V型和VⅦ型各占19.3%.亚洲HBV蛋白分型分布分散,Ⅰ、Ⅳ、Ⅴ和Ⅶ型所占比例均大于20%;欧洲Ⅳ型占58.3%,Ⅶ型占25.0%,Ⅴ型占13.9%.结论:在综合分析HBV基因组的基础上,初步划分出HBV基因组和病毒蛋白内部存在的高变区和高保守区提出蛋白表型的新概念,并综合展示基因核苷酸突变所导致的病毒蛋白的结构差异.
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乙型肝炎病毒基因组高变区界定的初步研究
目的:探讨乙型肝炎病毒(HBV)基因组是否存在高保守区或高变区,并探讨前-前-S基因和前-X基因的存在方式.方法:自GenBank中按血清型搜索符合要求的HBV全基因组序列,并应用Vector 6.0版软件进行核苷酸序列同源性的分析和比较.结果:GenBank中搜索出28个adr血清型和22个adw血清型HBV病毒株全基因组,比较后发现2种血清型的核苷酸序列总一致率分别为76.6%和73.9%;adr血清型病毒株存有高度变异区和高度变异区,一致率分别为54.5%和92.1%;adw血清型基因组内部含有高度保守区,一致率为85.0%,不含有高度变异区.前-前-S区的存在是较为普遍的现象,而前-X区的编码具有adr血清型特异性特点,在某些病毒基因组中,因为存在A2608→C/T和C/A2733→T替换突变,导致其前-X基因编码区起始密码子突变,因此部分HBV基因组无前-X基因结构区.结论:HBV基因组内部可能存在高度保守区,前-前-S区的存在是一个重要的现象,而前-X编码区具有adr血清型特异性的特点.
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揭秘糖尿病的遗传性
糖尿病的遗传性有多大在所有类型的糖尿病中,1型与2型糖尿病是常见的,其中又以2型糖尿病为常见,且有家族聚集倾向.虽然1型和2型糖尿病都具有遗传性,但均属于多基因遗传病,故其遗传率并不像符合孟德尔遗传定律的苯丙酮尿症等遗传病一样精确.国内外也有一些小型研究总结出的糖尿病遗传率可供我们参考(如下表).此外,研究还发现2型糖尿病患者的1级亲属(包括其父母、子女和同父同母所生的兄弟姐妹)患糖尿病的几率是背景人群的3.5倍;同卵双胎发生2型糖尿病的一致率为70％,异卵双胎仅为10％;而一些特定的少数民族和纯种土著人也表现出了极高的2型糖尿病患病率(其中Pima印第安人可高达21％).
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广东省成人代谢综合征流行特征及其不同诊断标准的对比研究
目的 了解广东省18岁及以上人群代谢综合征(MS)的患病情况,比较2004年中华医学会糖尿病学分会(CDS)标准、2007年中国成人血脂异常防治指南制订联合委员会(JCDCG)标准和2009年国际联合暂定声明(JIS)标准在广东省18岁及以上人群中应用的差异.方法 采用多阶段分层整群抽样方法抽取广东省6个监测县(区、市)18岁及以上居民中的3591人为研究对象,采用统一制定的调查表进行问卷调查,同时进行体格检查及血生化检测.两两比较采用t检验,率的比较采用X2检验.结果 采用CDS(2004)、JCDCG(2007)和JIS(2009)标准计算的MS患病率(标化患病率)分别为21.1％(19.0％,756例)、28.6％(25.4％,1026例)和44.5％(40.6％,1599例);3种标准诊断为MS者中存在3个及以上危险因素聚集的比例分别为97.5％(737例)、98.4％(1010例)和100.0％(1599例);CDS与JIS、JCDCG与JIS、JCDCG与CDS两两间的一致率(Kappa值)分别为74.8％(0.46,2688例)、82.1％(0.63,2950例)和87.8％(0.68,3153例).以JIS为参照标准,绘制ROC曲线,CDS的曲线下面积为0.719,JCDCG的曲线下面积为0.802.结论 广东省18岁及以上居民MS患病率已经达到较高水平,建议加强MS高危人群的综合防治力度.三种MS诊断标准中,JIS标准诊断MS的患病率、灵敏度和危险因素聚集的检出率高.
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评估纸片扩散法与Vitek-2 Compact仪器法检测洋葱伯克霍尔德菌体外药物敏感性
目的 评估纸片扩散法与Vitek-2 Compact仪器法检测洋葱伯克霍尔德菌体外药敏试验的可靠性.方法 收集2017年1月至2017年12月绍兴市人民医院临床分离到的34株洋葱伯克霍尔德菌,分别采用纸片扩散法、Vitek-2 Compact仪器法和微量肉汤稀释法检测其对头孢他啶、复方磺胺甲噁唑、左氧氟沙星、哌拉西林/他唑巴坦、替加环素、美罗培南、氯霉素、米诺环素和头孢哌酮/舒巴坦共9种抗菌药物的体外敏感性.以微量肉汤稀释法为参考方法,分别评估纸片扩散法、Vitek-2 Compact仪器法与参考方法的分类一致率(CA%).结果 微量肉汤稀释法检测头孢他啶、复方磺胺甲噁唑、左氧氟沙星、美罗培南和氯霉素5种抗菌药物95%可信区间(95%CI)分别为6.2~13.2、0.5~0.8、3.8~6.3、3.7~7.3和5.0~10.0;纸片扩散法检测头孢他啶、复方磺胺甲噁唑、替加环素、氯霉素和米诺环素的体外敏感性结果与参考方法一致率均＞ 90%;Vitek-2 Compact检测头孢他啶、复方磺胺甲噁唑和左氧氟沙星的体外敏感性结果与参考方法的一致率均＞ 90%;纸片扩散法和Vitek-2 Compact仪器法检测哌拉西林/他唑巴坦体外敏感性与参考方法一致率低,均＜ 80%;Vitek-2 Compact检测替加环素的大错误(ME)为50%;以微量肉汤稀释法为标准,体外敏感性好的抗菌药物为复方磺胺甲噁唑和米诺环素(均为100%),敏感性差的抗菌药物为左氧氟沙星(38.2%).结论 纸片扩散法和Vitek-2 Compact仪器法检测洋葱伯克霍尔德菌体外药物敏感性,对头孢他啶和复方磺胺甲噁唑均具有较好的可靠性;应用纸片扩散法检测哌拉西林/他唑巴坦和头孢哌酮/舒巴坦的药物敏感性时,应注意可能出现极大错误(VME)及ME.
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炎症性肠病诊治进展炎症性肠病发病机理进展
克罗恩病(Crohn's disease,CD)与溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)统称为炎症性肠病(inflammatory bowel disease,IBD).IBD在欧美常见,流行率0.1%～0.2%,年发病率约2～4/10 000人.IBD病因现代学说胃肠黏膜炎症的发生,与几个基因和环境因子的存在有关.它们联合作用的结果对黏膜抗原产生免疫反应,而细菌可导致黏膜T细胞的失控.目前了解到环境因子、细胞因子和分子效应器在IBD发病机理上的重要性.1 遗传和环境因子流行病学研究有力的证实基因在IBD发病上的重要作用.包括不同人种、家庭聚集和单合子双胞胎一致率(concordance rate)增加,认为IBD时在杂合子双胞胎中一致率是相等的.环境因子及其改变在免疫的发展上可影响疾病基因型的表型表达.基因与免疫功能有关,在IBD病人检出的特异免疫基因有:主要组织相容性复合体(MHC)、T细胞受体、免疫球蛋白、免疫调控基因(补体、各种细胞因子和细胞粘附分子)等.
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调节神经支配与近视关系的研究进展
近几十年来,近视的流行颇受关注,近视的发展究竟是受遗传还是环境的影响也争论了很久[1].近视的病因相当复杂,许多研究者通过人群研究、系谱分析及双生子研究肯定了遗传基因的作用,而另一方面,近视与遗传的同卵一致率、相关系数、遗传指数等又表明遗传不是惟一决定因素,环境也起着一定作用[2],特别是当今社会近距工作需求的加强更是加剧了近视的流行.如Saw等[3]研究发现在年龄较小的儿童中近距离阅读与近视的发生密切相关,尤其是7～9岁者,在年龄较大者该相关性相对变小.当然也有部分学者的研究发现,近距离工作跟近视、青少年性近视无关[4-5].问题的关键是,近距工作的加强是如何影响遗传敏感性的呢?一些研究人员提出长时间近距工作时,自主神经系统失衡可能导致调节反应不正常,导致或加剧近视[6].现就自主神经系统对调节的控制及睫状肌调控对近视发生的影响的研究综述如下.
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三种代谢综合征诊断标准在锡林浩特市人群中应用的比较
目的 比较三种代谢综合征(MS)诊断标准在内蒙古锡林郭勒盟人群中应用的差异.方法 2006年9月-2007年3月,对在内蒙古锡林郭勒盟医院体检的企事业单位20岁以上职工进行流行病学调查(1060人),分别采用国际糖尿病联盟(IDF,2005)、美国国家胆固醇教育计划成人组第三次报告(NCEP-ATP Ⅲ,2005)和中华医学会糖尿病分会(CDS,2004)标准计算MS患病率,比较三种标准在锡盟人群应用中的一致性和差异.结果 IDF、ATPⅢ和CDS三种标准下,锡盟人群MS标化患病率分别为25.0%,27.9%和22.5%.IDF与ATPⅢ诊断一致性高,Kappa值为0.929,IDF与CDS、ATPⅢ与CDS的Kappa值分别为0.726,0.763,基本一致.与ATPⅢ比较,IDF、CDS诊断的非MS人群中分别有4.3%和10.8%的人具有3种及以上代谢异常组分.蒙古族男性腰围90 cm,女性BMI≥25 kg/m2时,灵敏度及特异度较好,ROC曲线距离短,预测MS危险因素聚集的能力相对好;而汉族则以男性BMI≥25 kg/m2、女性腰围80 cm时相对好.结论 三种MS诊断标准中,ATPⅢ标准对MS及危险因素聚集个体的检出率高,适合心脑血管病高危人群的筛查.IDF与ATPⅢ的腰围标准较适合锡盟蒙占族男性,而CDS的标准较适合汉族男性,提示肥胖评价指标应联合采用腰围和BMI.
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三种乳腺癌筛查方案的准确性及成本效益分析
本研究对顺德区机关事业单位35岁以上妇女进行问卷调查，并同时全部进行临床检查、彩色多普勒超声、钼靶等3项检查。将检查手段分解为3种不同模式：临床检查+彩色多普勒超声+钼靶（模式A）、临床检查+彩色多普勒超声（模式B）、临床检查+钼靶（模式C）。采用3种不同组合模式分别对整个体检人群进行结果分析，比较3种筛查模式的灵敏度、特异度、一致率、阳性预测值、阴性预测值，以判断3种不同模式的准确性；同时比较分析3种模式的乳腺癌检出率及成本效益。
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评估VITEK2-COMPACT GN13与纸片扩散法测定粘质沙雷菌对亚胺培南药敏结果的可靠性研究
目的 评估法国生物梅里埃VITEK2-COMPACT GN13药敏系统(VITEK2法)和纸片扩散法(K-B法)检测粘质沙雷菌对亚胺培南药敏结果的可靠性.方法 本研究选取了50株金华市中心医院2014年6月至11月临床标本中分离出的非重复的粘质沙雷菌,分别采用VITEK2法、K-B法和微量肉汤稀释法测定其对亚胺培南的体外敏感性,以微量肉汤稀释法作为参考方法,评估VITEK2法、纸片扩散法与参考方法的分类一致率(CA％).结果 K-B法与参考方法的一致率为94.0％ (47/50),仅有6.0％的小错误(MIE),未出现大错误(ME)和极大错误(VME);而VITEK2法与参考方法的一致率仅为48.0％ (24/50),其中VITEK2法测定为敏感的菌株与参考方法的一致率达95.6％,但VITEK2法测定为耐药或中介的菌株与参考方法的一致率仅为7.4％,小错误率(MIE％)和大错误率(ME％)分别为55.6％和37.0％,未出现极大错误(VME).结论 K-B法检测粘质沙雷菌对亚胺培南的药敏结果是比较可靠的;VITEK2法检测粘质沙雷菌对亚胺培南敏感的结果也是可靠的,但对亚胺培南非敏感结果的错误率(ME+ MIE)高达到92.6％,实验室日常工作中若发现此类结果应采用K-B法或微量肉汤稀释法重新复核.
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解脲支原体与宫颈疾病之间的相关性研究
本文对142例门诊患者和88例手术切除或活检宫颈组织标本,通过检测UU、HPV及其感染一致率,来分析UU与宫颈糜烂、宫颈上皮内瘤变、宫颈癌的关系及其与宫颈癌组织学分型、分期的相关性.
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上海市浦东新区计算机断层扫描和磁共振成像设备使用技术水平研究
目的 分析计算机断层扫描(computed tomography,CT)和磁共振成像(magnetic resonance imaging,MRI)设备检查在上海市浦东新区区属公立医院临床诊疗中的作用.方法 在该区区属公立医院中随机抽取2016年出院且做过CT和MRI检查的病案1008份,对这两个设备的检查结果及其与临床诊断的一致性进行分析.结果 CT和MRI检查阳性率与检查必要性无同向的关联性;CT和MRI检查结果与临床诊断一致率需要控制;上海市浦东新区区属公立医院间的CT和MRI检查阳性率和一致率存在显著差异.结论 需要严格监控CT和MRI的利用.
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系统性红斑狼疮基因表达谱的芯片分析
系统性红斑狼疮(SLE)是一种慢性自身免疫性疾病,其发病机制复杂,主要包括遗传因素和环境因素.SLE的遗传性很强,同胞的患病率/一般人群患病率(λs)大于20,同卵双生子发病一致率为24%～65%,而异卵双生子发病一致率仅2%～9%[1].
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重庆地区汉族人群FcRL3基因rs945635多态性与Graves病的关联
Graves病(GD)是一种常见的自身免疫性疾病,其发病机制包括遗传易感和环境诱发两大因素.GD的发病具有明显的家族聚集性,双生子流行病学研究显示,同卵双生子的发病一致率远高于异卵双生子,说明遗传因素在GD的发病中起到很重要的作用[1].FcRL3的结构与经典的FcγRs有较高的同源性,这些受体均是参与免疫反应较强的候选基因,在自身免疫性疾病的发病机制中起重要作用.
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5种国产与进口E-test药敏条的一致性比较
目的 比较5种药物国产E-test药敏条(简称国产条)(青霉素、万古霉素、氯霉素、两性霉素B和氟康唑)与进口E-test 药敏条(简称进口条)的一致性.方法 收集2014至2015年北京协和医院临床分离菌共294株,用E-test法测定其低抑菌浓度(MIC)值,国产条与法国生物梅里埃公司进口条平行检测的MIC值超过|±1|个倍比稀释倍数(细菌)/|±2|个倍比稀释倍数(真菌)或体外敏感性判定结果不一致时,采用微量肉汤稀释法进行验证.结果 56株菌进行青霉素E-test药敏条检测,其中52株MIC值在|±1|个倍比稀释倍数范围内,4株菌MIC值超出此范围,经微量肉汤稀释法验证,有2株菌MIC值与进口条更接近;其中3株菌体外敏感性判读存在差异,且均为国产条较进口条敏感,经微量肉汤稀释法验证,有2株菌药敏结果与国产条一致.62株菌进行万古霉素E-test药敏条试验,其中完全一致16株(16/62,25.8％),|±0.5|个倍比稀释倍数43株(43/62,69.4％),|±1 |个倍比稀释倍数2株(2/62,3.2％),仅1株菌MIC值超出|±1 |个倍比稀释倍数(14W00916,粪肠球菌),经微量肉汤稀释法验证后,该菌MIC值介于进口条和国产条之间;62株菌体外敏感性判读与进口条100％一致.其余3种抗菌药物(氯霉素、两性霉素B、氟康唑)的基本一致(essential agreement,EA)率和分类一致(categorical agreement,CA)率均为100％.结论 5种国产条(青霉素、氯霉素、万古霉素、两性霉素B、氟康唑)所测定MIC值和体外敏感性判定结果准确可靠,与进口条一致性较好,可满足临床和实验室需求.
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判断临床意见符合率的指标
自从Kappa值被作为两名观察者之间调整机会后的一致率的量度以来,人们发现了其解释中的几个难点.这是因为Kappa值不仅测量一致率,而且还受观察者间存在的偏性,以及各范畴的数据的分布,即流行率的复杂的影响.笔者介绍了几个新的指标,这些指标提供了偏性、流行率以及观察一致率的独立的测量,并且得到了一个以这三个指标表达的Kappa值公式.在进行一致率研究之间的比较时,单独地报告Kappa值常导致错误,研究者还应同时报告偏性和流行率的定量指标.
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微小RNA在精神分裂症中的研究进展
精神分裂症病因不明.大量的研究显示遗传因素在精神分裂症发病中起着重要的作用[1],但同卵双生的发病一致率仅为41％ ～ 65％[2]的研究结论也提示该病与环境因素同样密切.微小RNA( microRNAs,miRNAs)参与调节人体三分之一蛋白质编码基因表达的调控,推测其可能是大脑紊乱性疾病的分子基础[3],其在精神分裂症发病中的作用值得研究.本文就miRNA 在精神分裂症中的相关研究进行综述.
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河南食管/贲门癌高发区双胞胎胃体、胃窦黏膜组织病理学比较
目的:比较同卵、异卵双胞胎胃体、胃窦黏膜组织病理学变化,为进一步阐明遗传和环境因素对胃癌前病变和癌发生发展的影响提供依据.方法:对190对双胞胎(同卵双胞胎147对,异卵双胞胎43对)进行胃镜检查、胃黏膜活检及组织病理学检查.结果:组织病理学结果发现3对胃癌(1对双发,2对单发);27对不典型增生(胃体部2对均为单发,胃窦部3对双发,22对单发),一致率为11.1%(3/27);31对肠上皮化生(胃体部2对均为单发,胃窦部10对双发,19对单发),一致率为32.3%(10/31).结论:双胞胎二位成员胃癌前病变和癌检出率低且明显不一致,提示环境因素在胃癌前病变和癌的发生发展中可能起主导作用.
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耳垂长“皱纹”早防冠心病
人到中年,心脑血管疾病高发.有心人也许会发现,很多心血管病人的耳垂外侧会有一条明显的斜行皱纹,而相关研究数据也表明,这种耳垂皱纹的出现与冠状动脉疾病的发生一致率高达七成以上.专家提醒,耳垂长"皱纹"需要提防冠心病.美国芝加哥大学医疗中心研究人员曾对上千人进行长期观测后发现,耳垂有皱纹的人中有74％患有冠状动脉疾病,而患有冠状动脉疾病的人中有72％耳垂上有皱纹;耳垂上有皱纹的人患心脏病的可能性是没有皱纹者的8倍,一侧耳垂有皱纹的人冠状动脉中的阻塞情况,比没有耳垂皱纹的人要严重,而两侧耳垂都有皱纹的人,冠状动脉中的阻塞情况为严重.
