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应用碱裂解法研究淋病奈瑟菌质粒谱
淋病奈瑟菌(淋菌)的质粒谱(plasmid profiles)是淋菌分子流行病学研究和淋病监控的对象.本研究利用碱裂解法对2000年1月~2001年10月门诊分离的淋菌进行了质粒抽提及质粒谱分型研究.报告如下.
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乙型肝炎病毒基因组前-前-S基因区的分子流行病学研究
目的:探讨乙型肝炎病毒(HBV)基因组是否存在前-前-S编码基因,并探讨前-前-S基因与HBV基因型分布之间的关系.方法:自慢性乙型肝炎患者血清中提取病毒基因组DNA,首先应用多引物-多聚酶链反应(PCR)进行HBV基因型分型,之后将前-前-S区扩增,TA克隆到pGEM Teasy载体后进行单克隆测序,利用Vector 8.0软件进行序列分析.结果:选择15例患者,经过HBV基因型分型实验确定基因型为B型者1例,B/C混合型者5例,C型9例.自15例患者血清中提取的HBV基因组中扩增出前-前-S基因片段,TA克隆后选择31个克隆进行测序,测序结果证明这31个克隆均编码前-前-S基因.结论:前-前-S区编码在B、C基因型中均为普遍存在的现象.
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乙型肝炎病毒基因组前-X区的分子流行病学研究
目的:探讨乙型肝炎病毒(HBV)基因组是否存在前-X编码基因,并探讨前-X基因与HBV基因型之间的关系.方法:自慢性乙型肝炎患者血清中提取乙型肝炎病毒基因组,首先应用多引物-多聚酶链反应(PCR)进行HBV基因型分型.之后将前-X区扩增,TA克隆到pGEM Teasy载体后进行单克隆测序,利用Vector 8.0软件进行序列分析.结果:17例患者中,A型者1例,B型3例,B/C混合型者3例,C型10例.克隆测序的45个克隆中,27个(60%)克隆编码前-X多肽,其中18个(66.7%)克隆来自C基因型.有3种形式突变导致前-X区编码不能.前-X区多肽具有个体化突变现象.结论:前-X区编码在B、C基因型中均为普遍存在的现象,其编码具有C型倾向性.
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结核病分子流行病学研究进展
分子流行病学是传统流行病学与分子生物学相结合的一门学科.结核病分子流行病学的建立和广泛应用使我们对结核病的传播规律和特点有了新的认识,解决了许多传统流行病学方法难以解决的问题,在结核病近期传播、暴发流行的调查、实验室污染的鉴定、内源性复燃和外源性再感染的区分、高危人群的鉴定等方面取得了一系列成果.国内已有这方面的综述[1],我们对近年来结核病分子流行病学研究进展作一综述.
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重症轮状病毒感染
自1973年发现轮状病毒(rotavirus,RV)以来,研究不断深入.RV是世界范围内儿童急性腹泻病重要的病原之一,全球每年约有87万儿童死于RV感染,并且主要是在发展中国家.人类RV分为A、B、C 3组,分子流行病学研究显示,世界范围内广泛流行的主要为A组,但B、C组也有报道.在我国流行的A组轮状病毒一直以G1型为主,G2型次之,G3型、G4型再次之.然而近年来,全国分离出的G3型毒株明显增多.B组轮状病毒,是我国分离鉴定的新轮状病毒,仅在我国大陆流行.C组轮状病毒感染在世界各地有局部的发病和流行,但感染率不如A组.英格兰和威尔士的血清学调查表明,C组轮状病毒感染,年长儿和农村的儿童感染率更高,推测是动物传染给人的可能性比较大,但详细和确切的证据有待进一步探讨[14].
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CYP450和GST基因多态性与肿瘤易感性研究进展
研究发现95%以上的致癌物进入体内需经代谢途径激活后才能与DNA等生物大分子结合,引起早期生物学反应,终导致癌变.在这种激活反应过程中涉及两种主要酶系即细胞色素P450(Cytochrome CYP450)和谷胱甘肽转硫酶(Glutathione s-transferase GST).CYP450是体内重要的激活酶(又称Ⅰ相酶),GST是体内重要的灭活酶(又称Ⅱ相酶),所以致癌物能否引起靶细胞的癌变很大程度取决于这两类酶的活性及彼此的平衡.近年来,关于这两种酶基因多态性与肿瘤易感性关系的研究已逐渐成为肿瘤分子流行病学研究的热点,笔者仅对CYP450和GST与肿瘤关系的国内外研究进展作一简要概述.
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冠心病危险因素研究进展
目前冠心病(coronary artery disease,CAD)是遗传、环境和不良生活习惯等多因素所致疾病.已经确定的CAD发病危险因素包括年龄、性别、不良嗜好(吸烟、酗酒等)以及血脂代谢紊乱、高血压病、糖尿病等[1,2].近年来随着检测技术,特别是分子生物学技术的迅速发展,以及临床流行病学、分子流行病学研究的开展和完善,在确证上述危险因素的同时,新发现的CAD危险因素的生化标记物不断出现,这将帮助临床医生更好地判断患者的危险度,并为患者提供更完善的干预和治疗.现即综述报告目前国内外该领域的研究成果.
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胎盘组织在乙型肝炎病毒宫内传播中的作用及其机制研究
乙型肝炎病毒(HBV)在子宫内经胎盘引起的传播无法用乙型肝炎(简称乙肝)疫苗加以阻断,危害十分严重。因此,HBV宫内传播及其机制的研究已是控制乙肝的关键课题之一。我们从1992年开始在西安地区对此进行了分子流行病学研究,初步确定了主要危险因素,提出了HBV宫内传播的假设:存在:血源性与细胞源性两条途径的假设[1,2]。1997年至1998年在太原地区作了重复性观察,并对胎盘组织“细胞转移”HBV的机制进行了进一步的研究。 一、对象和方法 1.研究对象与标本收集:(1)研究对象与血标本:收集1997年2月至1998年7月太原市传染病院妇产科分娩的全部HBsAg阳性孕妇及其新生儿作为研究对象,共171例。(2)胎盘标本:可供研究使用的胎盘标本共158例,占研究对象的92%。
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高危人群中抗HIV-1阴性者HIV的感染状况
HIV-1感染及由其引起的AIDS严重地威胁着人类的健康.分子流行病学研究显示目前世界上流行的病毒株有HIV-1及HIV-2两型,HIV-1型又有M(包括A-J10个亚型)及O两群,我国主要流行株为M群的B、B'/C、C亚型,而O群毒株只在喀麦隆留学生中发现.在对高危人群的研究中发现有些人虽有明显的高危行为但不被HIV感染,或已被感染而抗HIV抗体阴性,后者对健康人群具有很大的威胁性,在流行病学上有重要意义.为此,本文就此方面的研究作一综述
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医院感染的分子流行病学研究方法及应用
医院感染是当前影响向医疗质量提高的重大障碍之一,及时判定感染的发生及其来源是进一步控制和预防医院感染的基础.分子流行病学为医院感染研究提供了快速而可靠的工具.
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结核分枝杆菌rpoB基因的套式PCR扩增及其DNA测序
现代分子药理学研究发现,结核分枝杆菌(Mtb)的利福平耐药是由于其RNA聚合酶β亚单位基因(rpoB基因)突变所致.近年来,国内外学者通过"临床标本→Mtb培养鉴定→PCR→DNA测序(或sscp等分析)"的技术路线进行了临床病例研究[1、2、3].但该技术路线不适于大样本的分子流行病学研究,并因为费时,尚不能服务于临床.鉴于套式聚合酶链反应(nested Polymerase Chain Reaction, nPCR)的灵敏度和特异性明显优于传统PCR,因此我们建立了Mtb的rpoB基因nPCR扩增体系.通过"临床标本→Mtb nPCR→DNA测序"技术路线对临床病例直接进行Mtb感染诊断和Mtb利福平耐药检测.
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乙型肝炎病毒前前-S真核载体的构建与表达
前前-S位于乙型肝炎病毒(HBV)基因组前-S1区上游,长135 bp,编码45 aa,相对分子质量约45 000[1].杨倩等[2,3]对前前-S基因启动子序列分子生物学研究以及小样本的北方分子流行病学研究证实,前前-S基因广泛存在于我国HBV基因组中.
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江苏省三起甲型副伤寒爆发菌株与散发菌株的基因型及药物敏感性比较
目的 比较江苏省三地区连续发生的甲型副伤寒爆发与散发菌株在分子水平的联系,及其药物敏感性.方法 采用随机扩增多态性DNA(RAPD)分析方法,对爆发及散发菌株进行基因分型,采用K-B法对两类菌株进行药敏测定.结果 31株菌呈四个基因型图谱,爆发与散发菌株中基因Ⅰ型皆占优势,爆发株对链霉素、氨苄西林、头孢拉啶的耐药率从4.6%~25.9%.结论 RAPD方法能给予表型相同的甲型副伤寒菌株进行基因分型,基因Ⅰ型为江苏省甲型副伤寒的优势菌株.
关键词: 随机扩增多态性脱氧核糖核酸 甲型副伤寒菌 分子流行病学研究 -
重症监护室鲍曼不动杆菌的分子流行病学
目前,具多重耐药性的鲍曼不动杆菌已成为医院感染的重要病原菌,其临床分离率仅次于铜绿假单胞菌.该菌获得多重耐药性的速度很快,并常导致严重的医院感染如菌血症、脑膜炎或肺炎.西班牙报道[1,2],1990年,在入住ICU患者分离到的常见病原菌中,鲍曼不动杆菌位居第8位,检出率为3.7%.2年后跃居为第3位,检出率达8.2%.尽管在众多医院均有鲍曼不动杆菌的爆发流行报道,但这些感染流行病学上的分布仍不清楚.因此,针对这种趋势,有必要对此菌进行分子流行病学研究,以探讨其宿主来源及临床解决方案.
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肿瘤分子流行病学研究
研究人类肿瘤的病因及预防离不开流行病学调查.从1700年Ramazzini对修女乳腺癌的观察至今肿瘤流行病学研究巳有300多年历史.随着当今化学、生物学、免疫学、仪器分析尤其是分子生物学等学科的发展,流行病学已经从传统的描述性研究、分析性研究,发展成分子流行病学研究.随着人类基因组DNA测序的完成以及人类功能基因组学研究的进展,分子流行病学将在人类肿瘤病因和预防的研究中起着极为重要的作用.下面就肿瘤分子流行病学研究谈一些个人的观点.
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痛风与高尿酸血症的分子流行病学研究进展
高尿酸血症和痛风是遗传和环境因素共同作用的结果.近年来,随着分子生物学和流行病学研究的进展,有关高尿酸血症和痛风的分子流行病学研究亦不断深入,本文简要介绍这一领域的研究进展.
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几种常见皮肤癣菌的随机扩增多态性DNA分型
随机扩增多态性DNA(RAPD)分析技术在真菌分类鉴定和分子流行病学研究方面具有一定优势,近年的一些研究也证实了其在此方面的应用价值[1-4].本实验采用该方法对临床分离的几种常见皮肤癣菌进行了基因鉴定,同时对30株红色毛癣菌进行了种内基因分型,探讨DNA型别与感染来源、传播及感染部位之间的关系.
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淋球菌对抗菌药物的耐药性研究
淋病是重要的公共卫生问题之一,及时而有效的治疗对治愈患者、阻断传播链、减少并发症的发生和减轻疾病负担十分重要.但全球范围内淋球菌对抗菌药物的耐药性日益严重,使可选择的价廉而有效的治疗药物减少.就国内外淋球菌耐药现状、耐药性监测、耐药机制以及耐药菌株的分子流行病学研究情况作一回顾,以期加强我国对淋球菌耐药性的监测和研究,促进对淋病的控制.
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淮安市社会经济因素与食管癌胃癌关系的病例对照研究
江苏省淮安市是上消化道癌高发区之一.其食管癌、胃癌标化死亡率分别为122.38/10万和65.33/10万,是江苏省平均水平的4.11倍和2倍.为探寻该地区食管癌、胃癌高发原因,我们于1996年至1997年间从环境因素、个人饮食习惯、社会心理因素及宿主因素等多方面进行了分析流行病学和分子流行病学研究.本文报告淮安市社会经济因素与食管癌、胃癌的关系.
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生物标志物在环境肿瘤分子流行病学应用进展
环境肿瘤分子流行病学研究中,生物标志物对于环境致癌物的暴露估计、危险评价和预测等方面起了重要作用,因此得到广泛应用.