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中国东北人群遗传多样性研究
作为中国人类基因组计划的参与者之一,我们研究室承担了我国东北地区少数民族遗传样品建库与保存的工作.基于东北地区丰富的人类遗传资源,我们进行了一些疾病相关以及民族亲缘关系的研究.本文综述了遗传多样性研究的基本内容,以及我们近年来的一些研究成果.
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染色体1q21-q25基因变异与2型糖尿病关系研究进展
2型糖尿病是一种多因素复杂疾病,遗传因素在其中占有很重要的地位.人类染色体1q21-q25区域富含与代谢、炎性反应、信号转导与基因转录等相关的基因,其与2型糖尿病的连锁关系已在不同人群中得到印证.本文就染色体1q21-q25区域的基因变异与2型糖尿病关系的研究进展进行综述.
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FGF20基因多态性与精神分裂症的关联研究
目的:既往研究表明,染色体8p21区与精神分裂症连锁,位于8p21.3-p22区的成纤维细胞生长因子20(fibroblast growth factor,FGF20)基因可能与精神分裂症关联,本研究旨在探讨FGF20基因与汉族人群精神分裂症的关联.方法:本研究采用聚合酶链式反应-限制性片断长度多态性方法,分析301例精神分裂症患者和319例正常对照者中FGF20基因5'端单核苷酸多态性rs1721100与精神分裂症的关联.结果:与正常对照组相比,精神分裂症患者rs1721100多态性的基因型(x2=21.977,df=2,p＜0.001)和等位基因(C＞G,x2=5.249,df=1,p＜0.001,OR=1.67,95%CI:1.32-2.11)的频率差异有显著性.结论:本研究结果提示FGF20基因遗传多态性可能与精神分裂症存在关联.
关键词： 精神分裂症 成纤维细胞生长因子20 关联研究 -
脯氨酸脱氢酶基因1945(T/C)多态性与精神分裂症的关联研究
目的:旨在探讨PRODH基因与汉族人群精神分裂症的时空联系.方法:采用聚合酶链式反应-限制性片断长度多态性方法,分析330例精神分裂症患者和344例正常对照者中PRODH*1945(T/C)多态性的基因型,比较病例组与对照组之间该多态性的基因型及等位基因的频率差异,进一步分析携带不同基因型的精神分裂症患者的发病年龄.结果:与正常对照组相比,精神分裂症患者PRODH*1945(T/C)多态性的基因型(x2=8.171,df=2,p=0.016)和等位基因(C＞T,x2=5.249,df=1,p=0.021,OR=1.37,95%CI:0.56-0.96)的频率差异有统计学意义,携带风险等位基因C的精神分裂症患者发病年龄小于携带T者,差异存在弱显著性(CC+CT:20.43±4.71岁,TT:22.57±5.23岁,t=2.173,p=0.045).结论:PRODH*1945(T/C)基因多态性可能参与精神分裂症发病机制及影响精神分裂症的发病年龄.
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补位机制与降低回车率的关联性研究
"回车率"主要是指院前急救机构在受理120急救电话时因没有救护车调派而无法满足或不能及时满足呼救需求而回绝对方出诊要求的一种现象.回车率的存在,既有投入不足导致的配置问题,也有机制缺失导致的管理问题,亦有能力不足导致的水平问题,甚至还有服务意识淡薄导致的责任问题.建立补位机制是在现有条件下有效降低回车率的重要举措,本文系统论述了补位机制与回车率之间的关联性.
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新版RUCAM：药物和草药诱导性肝损伤的重要评估工具
药物诱导性肝损伤（drug induced liver injury ，DILI）和草药诱导性肝损伤（herb induced liver injury ，HILI）病情复杂，临床特点多样，诊断和处理颇具挑战性［1］。目前的研究主要集中于对肝损伤病例的调查和处理，包括病例定义和表型的标准化等［2］。而基因组关联研究已发现，遗传易感因素是发生DILI和HILI的相对危险因素［3］，特别是人类白细胞抗原（human leucocyte antigen ，HLA ）基因型，和／或经由细胞色素 P450（cytochrome P450，CYP）的生物活化途径（I相代谢）、解毒反应（II相代谢）及排泌和运输（III相代谢）过程中相关功能分子的基因多态性。其他危险因素包括预先存在的基础肝病、同时服用多种药物、药物的亲脂性及较高的日剂量等［4］。
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白细胞介素-28B基因多态性与乙型肝炎e抗原阴性的慢性乙型肝炎患者自然病程关系的回顾性研究
全球超过3．5亿人感染 HBV ，感染后的自然病程可分为免疫耐受期、免疫清除期、病毒低水平复制或无复制期。有些HBV感染者可终生处于免疫耐受期，而有些感染者易出现肝功能反复波动。且慢性HBV感染者是发生失代偿性肝病及肝细胞癌（HCC ）的高危人群，而未经抗病毒治疗的HBeAg阴性的CHB患者发生 HCC的概率高于 HBeAg 阳性者［1］。有研究认为，CHB自然病程受病毒因素和宿主因素的影响［2］。近，全基因组关联研究（GWAS ）显示， IL‐28B单核苷酸多态性（SNP）与 HCV的病毒清除及抗病毒治疗的持续病毒学应答（SVR）相关［3］，但 IL‐28B SNP 与HBV感染是否相关的研究鲜见报道。本研究旨在探讨HBeAg阴性的CHB患者自然病程与IL‐28B SNP的关系。
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迟发性自身免疫性糖尿病患者血管紧张素Ⅰ转换酶基因多态性与其慢性合并症的关联研究
迟发性自身免疫性糖尿病(LADA)患者病情虽缓慢进展,仍然发生糖尿病微血管病变.本研究试图探讨LADA患者血管紧张素转换酶(ACE)基因多态性与其慢性合并症关系.一、对象和方法1.研究对象:LADA组:共50例(男36,女14),所有患者选择谷氨酸脱羧酶(GAD)和(或)胰岛细胞抗体(ICA)阳性者(3个月复查仍为阳性),初次发生酮症或酮症酸中毒的时间均为6个月以上,排除速发1型糖尿病.mtRNAA3243G检查排除线粒体糖尿病.根据ACE基因型不同分3组,一般资料(表1).糖尿病肾病根据连续2次24小时尿白蛋白定量＞30 mg.糖尿病视网膜病变根据眼底照相或眼底造影检查.
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2型糖尿病的遗传学研究:2008年现实评价
2型糖尿病的遗传学领域中正在进行一场真正的革命.不久以前,这方面的综述通常会先介绍糖尿病遗传的流行病学基础,继而谈谈方法 学问题,再重点讨论罕见的单基因糖尿病,后才提到肯定与2型糖尿病有关的一些遗传变异作为对未来的展望.而如今,数量激增的全基因组关联研究(GWAS)正在发现越米越多影响人类复杂性状的位点.本文着重阐述2型糖尿病遗传学研究的现状,并从实际应用的角度试述临床医师可能获益之处.
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中国汉族人群TCF7L2基因多态性与2型糖尿病的关联研究
目的 研究中国汉族人群TCF7L2(transcription factor 7-like 2)基因单核苷酸多态性(SNP)与2型精尿病的相关性.方法 应用限制性片段长度多态性(RFLP)方法 ,对749例重庆及周边地区汉族人(其中2刭糖尿病患者446例、正常对照303名)的rs7903146和rs12255372进行基因分型;同时进行人体测量学及代谢指标的检测,并用稳态模型评估胰岛素抵抗(HOMA-IR)和胰岛13细胞功能(HOMA-p). 结果 (1)rs7903146位点的T等位基因频率、CT和TT基因型频率在2型糖尿病组均明显高于正常对照组(分别为0.093、0.150、0.018和0.043、0.079、0.003,均P<0.01);与CC型相比,CT/TT基因型患2型糖尿病的危险显著增加(OR=2.25,95%C/为1.39～3.62,P=O.001);CT/TT基因型与胰岛素分泌减少有关.(2)rs12255372位点G、T等位基因及基因型频率分布在正常对照组、2型糖尿病组中均无显著性差异.结论 TCFTL2基因rs7903146多态性位点的T等位基因是2型糖尿病的风险等位基因,提示TCF7L2基因可能是中国汉族人2型糖尿病的易感基因之一.
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心境障碍与5-HT受体基因多态性关联研究的进展
传统遗传学研究已证实遗传因素在心境障碍的发病中起重要作用,随着分子遗传学的发展,遗传学研究开始着重于探索精神疾病的致病基因或易感基因.近年来,较多证据均支持5-HT系统与心境障碍的发病有关,目前已知人类至少存在7种5-HT受体,即5-HT1、5-HT2、5-HT3、5-HT4、5-HT5、5-HT6和5-HT7受体,每种受体又进一步分成若干亚型,且大多数受体已被克隆[1].于是较多学者以5-HT受体基因作为心境障碍的候选基因进行研究,其中,与5-HT1A、5-HT2A、5-HT2C、5-HT6及5-HT7受体基因多态性的关联研究较多,而与5-HT3、5-HT4及5-HT5受体基因的关联研究尚未见报道.
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MTR基因rs1805087位点多态性与非综合征性唇腭裂的关联性研究
目的:研究蛋氨酸合成酶(methionine synthase,MTR/MS)基因rs1805087位点单核苷酸多态性与山西人群非综合征性唇腭裂(NSCL/P)的相关性.方法:采用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法对135个NSCL/P核心家庭、150例正常新生儿及其母亲的MTR基因rs1805087位点多态性进行检测;用人群关联研究、病例组核心家庭的传递不平衡检验(TDT)和单体型的相对危险度(HHRR)进行统计分析.结果:本研究中GG基因型较少,故将AG和GG基因型合并后与AA基因型比较.病例组子代及母亲和对照组之间,基因型分布和等位基因频率比较,差异均无统计学意义(P＞0.05);唇裂组和唇腭裂组子代及母亲基因型分布和等位基因频率,与对照组差异均无统计学意义(P＞0.05);病例组核心家庭分析,TDT检验x2=0.083,P＞0.05,HHRR分析x2=0.112,P＞0.05,说明携带有突变基因G并不能增加NSCL/P的发病风险.结论:本研究结果未显示MTR基因rs1805087位点多态性与山西人群非综合征性唇腭裂之间存在相关性.
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下颌前突畸形遗传学病因的研究进展
下颌前突(mandibular proghathism,MP)是一种常见的颅颌面发育畸形,其病因较为复杂,是由环境和遗传因素共同作用引起的复杂疾病.由于下颌前突畸形有明显的家族聚集性,遗传因素在其病因中发挥的作用逐渐受到学者们的重视.近年来,随着遗传学检测和分析手段的发展,通过家系连锁分析和病例对照关联研究等,许多与下颌前突畸形相关的基因和基因多态被报道,这些研究进展有助于下颌前突遗传学病因和发病机制的理解.本文将对下颌前突畸形遗传学病因的研究进展从遗传模式、家系连锁分析、病例对照关联研究和microRNA的相关研究等方面做一综述.
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中国汉族人群5-羟色胺转运体基因启动子区多态性与精神分裂症的关联研究
目的 探讨中国汉族人群5-羟色胺转运体基因(SLC6A4)启动子区5-HTTLPR和rs25531 (A＞ G)与精神分裂症之间的关系.方法 应用聚合酶链反应以及限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术对624例精神分裂症患者和683例健康对照志愿者进行基因分型.结果 5-HTTLPR基因分型的结果包括short(S)等位基因、long(L)等位基因,以及extra-long(XL)等位基因.病例组和对照组5-HTTLPR基因型分布差异有统计学意义,S/XL基因型是精神分裂症的危险因素(P=0.042,OR=1.79,95％ CI 1.01 ～ 3.17);病例组和对照组5-HTTLPR-rs25531基因型分布差异有统计学意义,S/XLA和LG/XLA基因型是精神分裂症的危险因素(P=0.042,OR=1.79,95％ CI 1.01 ～ 3.17;P=0.034,OR=3.69,95％CI 1.01 ～ 13.48).结论 SLC6A4基因启动子区多态5-HTTLPR和rs25531 (A＞ G)与中国汉族人群精神分裂症存在关联性.
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补体成分2基因上rs9332739与年龄相关性黄斑变性的相关性研究
目的 探讨补体成分2 (C2)基因上单核苷酸多态性(SNP) rs9332739与晚期年龄相关性黄斑变性(AMD)的相关性.方法 研究对象为上海地区204名晚期AMD患者和352名健康对照组人群,采集静脉血样并用标准酚氯仿法提取DNA;选取补体成分2(C2)基因上SNP rs9332739,采用TaqMan基因分型技术进行该SNP位点基因分型;应用Fisher精确检验、卡方检验和logistic回归检验,分析rs9332739与晚期AMD的相关性.结果 SNP rs9332739的次要等位基因C,在晚期AMD组与对照组比较的比值比(OR)为1.61,P=0.55,无统计学意义;rs9332739基因型(CG/GG/CC)在加性模型和显性模型中,经年龄以及性别校正后,P=0.89,无统计学意义;rs9332739三种基因型在晚期AMD两种表现型干性AMD和湿性AMD的比较中,没有统计学上的显著性差异(P=0.51).结论 C2基因上SNP位点rs9332739的次要型等位基因C不是中国汉族人群晚期AMD发病的危险因素,基因型与AMD的发病无明显相关性;rs9332739在中国汉族人群中可能不是晚期AMD的主要遗传标记物,需要更大样本量做进一步验证研究.
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中国汉族人群SLC30A8基因rs13266634多态性与2型糖尿病的关联
目的 研究中国汉族人群solute carrier family 30,member 8(SLC30A8)基因 rs13266634单核苷酸多态性(SNP)的等位基因、基因型频率分布及其与代谢指标的关系,了解该基因与2型糖尿病(T2DM)的相关性.方法 应用聚合酶链结合限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法对765例[T2DM患者(T2DM组)454例、健康者(NC组)311名]重庆及周边地区汉族人rs13266634进行基因分型;同时进行人体测量学及代谢指标的检测,并分别采用稳态模型评估胰岛素抵抗指数(HOMA-IR)及胰岛B细胞分泌功能指数(HOMA-β)评估胰岛素抵抗和胰岛B细胞功能.结果 T2DM组中rs13266634的C等位基因频率、CC基因型频率分别为57.6%和33.5%,均显著高于NC组的50.6%和28.0%(P值均<0.05);而T2DM组的TT基因型频率为18.3%,显著低于NC组的26.7%(P<0.05).C等位基因携带者患T2DM的风险是T等位基因的1.36倍(OR=1.36,95%CI为1.11～1.67)}CT和CC基因型患T2DM的危险显著增加,分别为TT型的1.55倍(OR=1.55,95%CI为1.07～2.25,;(x2=5.42,P=0.02)和1.75倍(OR=1.75,95%CI为1.17～2.61,x2=7.38,P=0.006).此外,通过对代谢指标的比较分析发现C等位基因可能与胰岛素分泌减少有关.结论 SLC30A8基因rs13266634多态性位点的C等位基因可能是T2DM的风险等位基因,SLC30A8基因可能是中国汉族人T2DM的易感基因之一.
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尿酸水平与代谢综合征组分的关系研究
目的 研究血尿酸水平与代谢综合征组分的关系,探讨高尿酸血症与心血管危险因子的关系.方法 本研究采用以人群为基础的研究,基于健康体检人群慢病危险因素分析及评价研究的数据,采用线性相关及多因素Logistic回归分析,探讨尿酸与血压、总胆固醇(TC)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)、高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)、三酰甘油(TG)、体质量指数(BMI)以及血糖的相关性. 结果 (1)高尿酸血症组高血压、糖尿病、肥胖、高脂血症患病率均高于尿酸正常组,差异有统计学意义.(2)线性相关分析显示尿酸水平与性别、吸烟、血糖、TG、LDL-C以及BMI有关,其中男性尿酸水平与吸烟、BMI、TC、TG和LDL-C有关,女性尿酸水平与吸烟、收缩压、TC以及HDL-C水平有关.(3)≤60岁组,年龄、高血压、BMI、TG、LDL-C、HDL-C以及吸烟与尿酸升高有关,＞60岁组尿酸升高与年龄、TC和TG有关. 结论 不同年龄阶段、不同性别中尿酸与代谢综合征各组分的关系可能不同,在≤60岁人群中,尿酸与代谢综合征的各组分密切相关,而＞60岁人群中,尿酸只与血脂水平有关.
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肥胖相关基因rs9939609多态性与妇科肿瘤的相关性研究
经研究者发现，肿瘤与细胞增殖周期的失调相关，尤其是G1期启动的失调与肿瘤的发生密切相关。肥胖相关基因（fat mass and obesity associated，FTO）是全基因组关联研究中发现的与体质量指数（ BMI）显著关联的基因，正常人群中，携带单核苷酸多态性位点（ single nucleotide polymorphism， SNP ） rs9939609风险等位基因可使 BMI增加，肥胖发生风险增加［1］。李建新等［2］发现，女性更年期肥胖的发病率增高，且其肿瘤的发病率亦增加。到目前为止，许多流行病学研究发现，肥胖会提高一些肿瘤疾病的发病率［3］，如乳腺癌、食管癌、肝癌等。有报道显示，在美国新确诊的肿瘤病例中有3?2％要归咎于肥胖［4］。
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TCF7L2基因多态性与2型糖尿病发病关系的研究进展
2型糖尿病(77DM)是由环境和遗传因素共同作用而发生的多基因遗传病,具有明显的遗传倾向和显著的遗传异质性.近年来T2DM的发病率急速上升,预计到2030年全世界范围内的成年患者将达到3.6亿多.在遗传、肥胖、高血压、高血脂等T2DM发病的诸多危险因素中,遗传因素的作用为突出.近年来由于全基因组关联研究(genome-wide association,GWA)的发展,证实与T2 DM相关联的易感基因已达20种.
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青藏高原藏族人群HLA-DRB1基因与包虫病遗传抗性关联研究
目的 确定青藏高原地区藏族人群包虫病患者的人类白细胞抗原-DRB1(Human leukocyte antigen-DRB1,HLA-DRB1)等位基因中易感基因和抗性基因,为研究藏族人群包虫病的感染机制及遗传特点提供依据.方法 本研究采用病例对照法.病例组选取青海省玉树和果洛藏族自治州的世居藏族囊型包虫病63例和泡型包虫病73例;对照组选取该地区无血缘关系的藏族健康人,共计60例.应用聚合酶链反应-直接碱基序列基因分型(PCR-SBT)技术,比较等位基因频率.结果 泡型和囊型包虫病病例组HLA-DRB1*04等位基因频率均小于对照组(χ2=4.71、4.31,P均<0.05).结论 HLA-DRB1*04等位基因与青藏高原藏族人群囊型和泡型包虫病相关联,对其感染有保护作用,是其抗性基因.
