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5-羟色胺转运体启动子区域基因多态性位点与双相障碍的关联研究
目的：探讨5-羟色胺转运体蛋白基因启动子区域（5-HTTLPR）位点多态性与双相障碍之间的遗传学联系。方法：以中国西北地区汉族人群中51例双相障碍患者（患者组）的核心家系（父母组102名）共153人为研究对象；取每个成员血液样本 DNA，应用聚合酶链反应技术扩增5-HTTLPR 位点，以琼脂糖凝胶电泳法进行基因分型，对5-HTTLPR 位点多态性与双相障碍之间分子遗传学联系进行以家系为基础的连锁不平衡分析。结果：无论5-HTTLPR 位点各种基因型（L/ L、L/ LG、S/ L、S/ S、S/ LG ）还是等位基因（L、LG、S）频率在患者组和父母组比较差异无统计学意义（χ2=3.732，P >0.05；χ2=0.633，P >0.05）。基于基因型的单倍体相对风险分析（GHRR）以及传递不平衡分析（TDT）也未发现5-HTTLPR 与双相障碍存在连锁不平衡（GHRR：P >0.05；TDT：χ2=2.418，P >0.05）。结论：5-HTTLPR多态性位点在中国西北地区汉族人群双相障碍发病机制中不起主要作用，但不能排除微效作用的存在。
关键词： 双相障碍 5-羟色胺转运体启动子区域 基因多态性 关联研究 -
红细胞补体受体1分子水平及其基因单核苷酸多态性与系统性红斑狼疮的关联研究
目的 我国系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus,SLE)发病率居世界首位,治疗属世界难题.SLE的发病机制尚不明确,许多研究表明,SLE患者红细胞补体受体1(complement receptor type 1,CR1)分子水平及功能低下,但未见研究对CR1基因与SLE遗传易感性的关联进行报道.文中旨在探讨红细胞CR1分子水平及其基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)与SLE的关联.方法 检测SLE患者(SLE组)及健康人(对照组)红细胞CR1分子水平及5个标签SNP位点基因型,比较对照组CR1基因各SNP位点基因型对应CR1分子水平的差异,以及SLE组和对照组组间红细胞CR1分子水平和CR1基因各SNP位点基因型、等位基因的分布差异,计算比值比(OR)及其95%CI.结果 对照组CR1基因rs3818361C＞T/TT基因型携带者红细胞CR1水平低于CC、CT基因型者(P＜0.05),rs11118167T＞C/TC、CC基因型携带者红细胞CR1水平低于TT基因型者(P＜0.01),rs9429945C＞T/CT、TT基因型携带者红细胞CR1水平低于CC基因型者(P＜0.01).SLE组CR1几何平均荧光强度比值(geometric mean fluorescence intensity ratio,GMFIR)低于对照组(P＜0.01);有3个标签SNP位点与SLE发病关联(P＜0.01或P＜0.05),与非携带者比较,CR1-rs4844600G＞A/GG基因型(OR:8.672,95%CI:3.864～19.462)及G等位基因(OR:7.419,95%CI:3.425～16.073)、CR1-rs3818361C＞T/CC基因型(OR:1.872,95%CI:1.113～3.149)及C等位基因(OR:1.575,95%CI:1.067～2.325)、CR1-rs11118167T＞C/TT基因型(OR:2.083,95%CI:1.065～4.071)及T等位基因(OR:1.941,95% CI:1.050～3.588)携带者患SLE风险增加.结论 健康人CR1基因rs3818361C＞T/TT基因型、rs11118167T＞C/TC、CC基因型和rs9429945C＞T/CT、TT基因型携带者红细胞CR1水平低于该SNP位点其他基因型携带者.SLE患者红细胞CR1分子水平降低,CR1基因rs4844600G＞A、rs3818361C＞T、rs11118167T＞C等3个SNP位点与SLE发病关联,其易感基因型CR1-rs4844600G＞A/GG、CR1-rs3818361C＞T/CC和CR1-rs11118167T＞C/TT与SLE患者CR1分子水平低无关.
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74046例阿尔茨海默病确认11个新的易感基因位点的Meta分析
以往的文献报道确定了迟发性阿尔茨海默病( LOAD)的11个易感基因位点；然而，这种疾病大部分的遗传风险仍无法解释。本研究对欧洲人的全基因组关联研究( GWAS)进行了广泛、两个阶段的Meta分析。在第一(筛选)阶段，本研究使用基因分型和估算(包括7055881个SNPs数据)，对以前发表的4个 GWAS 数据集进行 Meta 分析，包括17008例阿尔茨海默病病例和37154例对照。在第二(验证)阶段，对8572例阿尔茨海默病病例和11312例对照的11632个SNPs进行基因分型和测试。结合初筛阶段和验证阶段的综合分析，除APOE基因(编码载脂蛋白E)之外，有19个位点达到全基因组显著性(P<5×10-8)，其中11个是与阿尔茨海默病相关联的新位点。
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ADCY2基因单核苷酸多态性与持续性变应性鼻炎 的关联研究
目的 探讨腺苷酸环化酶2(ADCY2)基因单核苷酸多态性(SNPs)与苏皖地区汉族人群由尘螨致敏的持续性变应性鼻炎(PER)的遗传相关性.方法 采用病例-对照研究,共纳入571例尘螨致敏的PER患者和677例健康对照者.采集所有受试者外周静脉血进行血清总IgE和特异性IgE测定,同时EDTA存储管采集抗凝血以提取DNA.预测、筛选ADCY2基因内含子区5个SNPs位点,进行基因分型.结果 校正年龄、性别后,ADCY2基因rs1864071位点的基因型频数在病例组和对照组的差异有统计学意义,且该位点在病例组和对照组中的相加模型(OR=1.226,95％CI=1.045-1.439;P=0.013)及显性模型(OR=1.343,95％CI=1.039-1.736;P=0.024)发生PER的风险明显增加.结论 在苏皖汉族人群中,ADCY2基因rs1864071位点与PER显著关联,该基因可能影响尘螨致敏PER的遗传易感性.
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C-反应蛋白基因多态性与代谢综合征的关联研究
目的:探讨C-反应蛋白(C-reaction protein,CRP)基因rs6677719位点多态性与代谢综合症(metabolism syndrome,MS)的关系.方法:研究对象来自从某乡镇6个村整群抽样调查人群,纳入301例MS对象作为病例组,同时选取年龄和性别与病例匹配的547例健康个体作为对照组,所有的研究对象完成了问卷调查、体格检查及临床生化指标检测.采用聚合酶链反应-限制性片段多态性(PCR-RFLP)方法完成CRP基因rs6677719位点基因分型,比较不同基因型在病例组和对照组中的分布差异,及其与血糖、血压和血脂等指标的关系.结果:关联分析结果表明,rs6677719位点变异与MS存在显著关联,相加模型和显性模型均有统计学意义,OR值(95％可信区间)分别为0.785(0.640～0.862)和0.659(0.489～0.889).对照组TC基因型TG水平显著低于TT基因型(P＜0.05),而高密度脂蛋白(HDL-C)和低密度脂蛋白(LDL-C)水平在TT、TC和CC基因型间存在显著线性关系(P＜0.05).结论:CRP基因rs6677719位点变异与MS存在显著关联,并影响人体TG、HDL-C和LDL-C代谢.
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结核易感基因-VDR基因的研究进展
随着人类基因组计划的完成和功能基因组学研究的进展,多种结核病易感基因被发现,其中VDR基因是主要的结核易感基因之一,国内外学者对其功能和作用机制进行了研究,并对其多态性在不同种族人群中进行了关联研究及家系连锁分析,探讨VDR基因的多态性与结核病易感性的关联,为揭示结核分枝杆菌感染的种族易感性差异机制奠定了理论基础.本文对这方面的研究进展做一综述.
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儿茶酚氧位甲基转移酶基因多态性与中国南方人群精神分裂症的关联研究
目的 探讨儿茶酚氧位甲基转移酶基因多态性与中国南方人群精神分裂症易感性及PANSS测评症状之间的关联.方法 采用Sequenom基因分型技术,在700例病例(壮族300例,汉族400例)和700例对照(壮族300例,汉族400例)中,对COMT基因rs4633 、rs4680和rs8185002进行基因分型,并采用阳性与阴性症状量表(PANSS)对患者进行症状测评.采用PLINK软件进行统计学分析.结果 分别在壮族样本、汉族样本中,这三个位点与精神分裂症易感性的关联差异无统计学意义(P＞0.05).合并两民族样本后,rs4633(I2=0.000,Pmeta=0.040)和rs4680(I2 =0.000,Pmeta=0.014)与精神分裂症易感性的关联差异有统计学意义;单体型T-A-T与精神分裂症易感性关联(P=0.049)差异有统计学意义.三个位点多态性与PANSS总分、阳性量表分、阴性量表分和一般精神病理量表分之间的关联均差异无统计学意义(P＞0.05).结论 COMT基因rs4633、rs4680多态性影响中国南方人群精神分裂症的发生.
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中国东北地区汉族人群强迫症易感受体基因的关联研究
目的 探讨中国北方汉族人群中单胺氧化酶A(MAOA)受体基因、儿茶酚-O-甲基转移酶(COMT)受体基因、多巴胺D3受体(DRD3)基因和5-羟色胺2C(5-HT2c)受体基因与强迫症的关系.方法 采用聚合酶链反应扩增片段长度多态技术测定164例强迫症患者包括103个核心家系的MAOA-T1460C、COMT-Val158Met、DRD3-Ser9Gly、5-HT2c-Cys23Ser四个位点受体基因多态性,并进行关联和连锁不平衡(TDT)分析.结果 病例组与对照组MAOA-T1460C、COMT-Val158Met、DRD3-Ser9Gly、5-HT2c-Cys23Ser受体基因的基因型和等位基因总体分布均差异无统计学意义(P＞0.05),四个受体基因位点均符合H-W平衡,其中MAOA-T1460C受体基因在女性病例组与对照组、早发组与对照组、既有强迫思维又有强迫行为组与对照组、仅有强迫观念组与对照组的基因型和等位基因总体分布差异有统计学意义(P＜0.05),且与家系组间存在连锁(P=0.0001);5-HT2c-Cys23Ser受体基因在男性病例组与对照组、既有强迫思维又有强迫行为组与对照组的基因型和等位基因总体分布差异有统计学意义(P＜0.05),且与家系组之间存在连锁(P=0.0389);COMT-Val158Met受体基因在此对照实验中均差异无统计学意义(P＞0.05),且与家系组间不存在连锁(P=0.0622);DRD3-Ser9Gly受体基因在此对照实验中均差异无统计学意义(P＞0.05),且与家系组间不存在连锁(P=0.1101).结论 MAOA-T1460C受体基因多态性位点和5-HT2c-Cys23Ser受体基因多态性位点可能为强迫症易感受体基因.
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甲基化CpG结合蛋白-2基因多态性与女性精神分裂症患者的关联性研究
目的 研究甲基化CpG结合蛋白-2(MeCP2)基因多态性与女性精神分裂症患者的关联性.方法 采用基于质谱微阵列技术的基因多态性分析法对符合DSM-Ⅳ诊断标准的126例精神分裂症患者和144例正常对照组患者MeCP2基因上的4个SNP位点进行基因分型,用x2检验比较上述4个位点的基因型频率和等位基因频率的组间差异.结果 MeCP2基因rs1616369位点G/A基因型分布频率(24.8％ vs34.3％)组间差异有统计学意义(R0.05)；rs3027933位点G/C基因型分布频率(25.6％ vs 34.8％)组间差异有统计学意义(P＜0.05)；位点rs17435基因型T/A分布频率(25.6％ vs 35.5％)组间差异有统计学意义(P＜0.05)；位点rs2239464基因型A/A分布频率(58.5％ vs 71.8％),组间差异有统计学意义(P＜0.05)；单体型GCCA分布频率在病例组为0.1581,在对照组为0.2389,组间差异有统计学意义(P＜0.05).结论 女性精神分裂症患者MeCP2基因的相关基因型可能跟精神分裂症发病有相关性,MeCP2基因可能是女性精神分裂症易感基因,单体型GCCA可能是女性精神分裂症发病的保护因素.
关键词： 甲基化CpG结合蛋白-2基因 多态性 女性 精神分裂症 关联研究 -
广西壮族、汉族精神分裂症与PRODH基因rs385440多态性的关联研究
目的 探讨PRODH基因的rs385440与广西壮族、汉族精神分裂症易感性及其临床症状严重程度之间的关联性,以进一步探明壮、汉族精神分裂症的遗传机制.方法 本研究采用病例对照研究方法,以ICD-10为诊断标准,纳入精神分裂症患者282例(壮族94例、汉族188例),健康对照282例(壮族94例、汉族188例).使用TaqMan MGB荧光定量实时PCR实验方法对PRODH基因的rs385440进行基因分型.使用PANSS对246例精神分裂症患者(壮族83例、汉族163例)的临床精神病性症状进行评定.使用SPSS13.0 for windows软件进行统计分析.结果 分别在壮族样本、汉族样本以及两个民族的合并样本中,rs385440不同基因型频率、不同等位基因频率在病例组和对照组之间的分布差异均无统计学意义(P＞0.05).在壮族精神分裂症病例中,A等位基因携带者的N4(被动或淡漠社交)条目分[(3.28 ±1.34)分]显著高于G等位基因携带者[(2.40±1.36)分],A等位基因携带者的G12(判断和自知力缺乏)条目为[(4.92±1.55)分]也显著高于G等位基因携带者[(4.12±1.85)分],均差异有统计学意义(P＜0.05).结论 PRODH基因的rs385440与壮族、汉族精神分裂症的易感性都不相关联,但rs385440与壮族精神分裂症的“被动或淡漠社交”、“判断和自知力缺乏”症状严重程度相关联.
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注意缺陷多动障碍儿童的脑电特征及与视觉注意功能的关联研究
目的 探讨注意缺陷多动障碍(Attention deficithyperactivity disorder,ADHD)儿童的脑电活动特征以及与视觉注意功能的关联性.方法 采用1:1病例对照研究方法,对6～14岁37例ADHD儿童和37例正常儿童分别进行脑电特征以及视觉注意功能测查,分析脑电频率、振幅、脑电功率、以及脑电功率与视觉注意的关系.结果 ADHD组θ波振幅变化[(20.48±14.99)μV]显著高于对照组[(12.37±8.06)μN,P<0.05],β波频率[(16.63±1.72)Hz]显著低于对照组[(17.65±0.25)Hz,P<0.05];ADHD组β波相对脑电功率值(5.24±1.24)显著低于对照组(6.30±1.19),(P<0.05);ADHD组θ/β比值(4.22±1.26)显著高于对照组(3.41±0.52),(P<0.05);左右眼数空缺成绩ADHD组分别为(56.76±19.16)分、(49.73±23.39)分,显著低于对照组成绩(72.43±17.23)分、(71.35±16.69)分;ADHD组θ波的相对功率与左眼、右眼的数空缺成绩都呈显著负相关(r值分别为-0.448和-0.361),(P<0.05),相对功率比值θ/β与右眼数空缺成绩呈显著负相关(r为-0.352),(P<0.05).结论 ADHD组儿童的脑电特征存在异常,视觉注意水平显著低于对照组儿童;关联性分析显示ADHD组儿童脑电功率变化对大脑注意资源的分配有明显影响.
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精神分裂症和不同亚型抑郁症患者DISC1基因rs821616多态性的对比分析
目的 探讨DISC1基因多态性与精神分裂症和不同亚型抑郁症之间的关联性,验证DISC1基因是否为精神分裂症和抑郁症共同的致病基因.方法 采用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)和聚丙烯酰胺凝胶电泳分离技术,检测260例精神分裂症(分裂症组),96例伴精神病性症状的抑郁症(抑郁症1组),124例不伴精神病性症状的抑郁症(抑郁症2组)和100名正常人(对照组)的基因型和等位基因分布情况.分析DISC1基因单核苷酸多态性(SNP)位点ra821616与精神分裂症和不同亚型抑郁症的关联性.结果 分裂症组T/T、A/T、A/A基因型频率分别为3.5%、28.O%、69.5%,T、A等位基凶频率分别为9.6%和90.4%;抑郁症1组分别为3.1%、24.0%、72.9%、15.6%和84.4%;抑郁症2组分别为2.4%、23.4%、74.2%、15.3%和84.7%;对照组分别为1.0%、16.0%、83.0%、17.0%和83.0%.经非参数检验的Kruskal-Wallis检验,四组之间基因型总体比较Chi-Square=8.072,P=0.045,差异有统计学意义.四组之间等位基因总体比较X2=8.564,P=0.036,差异有统计学意义.组间两两比较经MannWhitney检验(双尾),基因型(Z=-2.802,P=0.005)和等位基因(Z=-2.837,P=0.005)分布在分裂症组与对照组之间差异有统计学意义,其他各组之间两两比较差异均无统计学意义(P>0.05).结论 DISC1基因多态性与精神分裂症显著关联,与不同亚型的抑郁症均无关联,不支持DISC1基因是精神分裂症和抑郁症共同致病基因的观点.
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STR基因座多态性与强奸犯的关联研究
目的 通过对15个STR基因座多态性的分析,了解强奸犯与STR基因座相关等位基因的关联情况.方法 运用全基因组扫描的方法,对129名强奸犯与156名随机人群采用AmpFISTR Identifiler荧光标记复合扩增体系进行PCR复合扩增,然后应用ABI3100型基因分析系统对扩增产物进行电泳和基因检测.观察两个群体中15个STR基因座等位基因频率的分布差异.结果 15个STR基因座等位基因频率均符合Hardy-Weinberg平衡;D21S11-28(强奸犯组1.55%,对照组5.13%)、FGA-22(强奸犯24.03%,对照组16.99%)、FGA-23(强奸犯17.05%,对照组26.28%)、TH01-10(强奸犯1.16%.对照组4.17%)、TPOX-8(强奸犯55.77%,对照组63.77%)、TPOX-12(强奸犯4.26%,对照组1.28%)在2组人群中的检出率存在显著差异(P<0.05);其余STR基因座等位基因在两个群体中的检出率均无显著差异(P>0.05).结论 等位基因D21S11-28、FGA-22、FGA-23、TH01-10、TPOX-8、TPOX-12可能与性犯罪的发生有一定关系,在2号、4号、11号、21号染色体上可能存在与强奸犯相关的基因.
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精神分裂症与载脂蛋白E基因的关联研究
目的 探讨汉族人群载脂蛋白E(ApoE)基因与精神分裂症的相关性.方法 应用聚合酶链反应扩增技术及限制性片段长度多态性测定100例精神分裂症患者(男女各50例)及64例正常对照(男女各32例)的ApoE基因型分布和等位基因频率.结果 ApoE基因型总体分布患者组(ε2/2,1%;ε2/3,6%;ε2/4,1%;ε3/3,78%;ε3/4,13%;ε4/4,1%)和对照组(ε2/2,0;ε2/3,13%;ε2/4,3%;ε3/3,64%;ε3/4,19%;ε4/4,2%)差异无显著性(P＞0.05),ApoE等位基因总体分布患者组(ε2,5%;ε3,88%;ε4,8%)和对照组(ε2,8%;ε3,80%;ε4,13%)差异无显著性(P＞0.05).女性患者组与女性对照组的ApoE基因型分布存在显著差异,女性病人的ε3/3基因型频率(RR=3.84,P＜0.05)和ε3等位基因型频率(RR=3.06,P＜0.05)明显高于女性对照组.结论 ApoE基因对精神分裂症易患性的影响可能存在性别上的差异,ε3等位基因可能与女性精神分裂症的发病相关联.
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Meta-ANOVA方法在FTO基因rs9939609多态性位点遗传模式界定中的应用
目的:探索FTO基因rs9939609位点的遗传模式,综合评价该位点多态性与肥胖的遗传关联性.方法:全面检索国内外数据库,搜集符合纳入标准的研究资料,并按照排除标准排除.运用meta-ANOVA方法对FTO基因rs9939609位点AA、AT和TT3种基因型携带者的体重指数(BMI)的平均水平进行比较,得到设定的参数λ判断该位点的遗传模式.结果:共纳入文献48篇,按照年龄进行分层后,少年组9篇,成年组33篇,老年组6篇.3组的AA、AT和TT 3种基因型携带者BMI平均水平差异有统计学意义[少年组(P＜0.001),λ=0.5,β=0.656,95％CI(0.489～0.823);成年组(P＜0.001),λ=0.5,β=0.670,95％ CI(0.562～0.778);老年组(P＜0.001),λ=0.5,β=0.523,95％ CI(0.363 ～0.682)].3组的验证遗传模式均为加性遗传.结论:FTO基因rs9939609位点多态性与肥胖有关联性,A等位基因有使BMI增加的风险,该位点的遗传模式为加性遗传.
关键词： meta-ANOVA 遗传模式 关联研究 基因多态性 FTO基因 -
HLA Ⅱ类DR基因与肝炎
HLA与疾病关联研究始于1967年,至今研究过的疾病超过500种,但有关HLA与肝炎的研究却是从近些年开始的.
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SUMO-1基因rs7580433多态性与非综合征性唇腭裂的关联研究
目的:研究SUMO-1基因rs7580433的多态性与中国人群非综合征性唇腭裂(NSCLP)的相关性.方法:从国际人类基因组单体型图计划(HapMap)选取来自中国北京汉族人群的多态位点rs7580433为研究位点,在183名NSCLP患者和162名健康正常人对此位点进行基因分型从而进行病例一对照研究.结果:NSCLP患者的GA基因型频率比正常对照组明显降低,其差异有统计学意义(P=0.025).结论:SUMO-1基因rs7580433位点的基因多态性与中国人群NSCLP易感性相关.
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NME1基因多态性与疾病易感性、药物代谢的关联研究进展
非转移细胞(non-metastatic cells,NME)基因家族,系首个被发现的肿瘤转移抑制相关基因.NME1基因及其编码蛋白通过发挥酶活性和与多种细胞内蛋白相互作用,参与调节细胞增殖、分化和代谢、凋亡、骨架动力学、信号转导、基因调节等多种生理功能与病理过程.本文综述发现NME1基因启动子区rs16949649,rs3760468,rs3760469和rs2302254等单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)位点基因多态性与一些疾病易感性和预后存在关联,包括乳腺癌、妇科癌症、消化系统癌症、肺癌等,但结果并不完全一致;同时分析了NME1基因及其编码蛋白与嘌呤类药物和阿糖胞苷代谢的关联性.以上关联作用机制复杂且尚不完全清楚,需实施大规模、设计严谨临床试验,分析参与调控具体信号通路及NME1基因表达干预等内容,为临床常见恶性肿瘤精准靶向防治及嘌呤类药物个体化应用奠定基础.
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遗传流行病学研究中的H-W平衡检验
H-W平衡检验在遗传流行病学研究中处于基础地位. H-W平衡检验新方法有X连锁的单核苷酸多态性(SNPs)的H-W平衡、近亲系数(F)检验、不完全列举法、绘图法.在遗传流行病学研究时有必要进行H-W平衡检验,偏离H-W平衡时应进行校正.
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建筑工人咳嗽与吸烟暴露关联研究
目的：了解吸烟暴露对建筑工人咳嗽发生的影响。方法采用方便抽样方法，抽取204名建筑工人为研究对象，调查其吸烟暴露和咳嗽发生的情况。按照其吸烟暴露情况分为不吸烟组（18人）、被动吸烟组（66人）和主动吸烟组（120人）。结果204名建筑工人主动吸烟率为58．8％（120／204），每日吸烟率为51．5％（105／204）；非吸烟者被动吸烟率为78．6％（66／84），非吸烟者每日被动吸烟率为66．7％（56／84）。204名建筑工人偶尔咳嗽发生率为15．2％（31／204），经常咳嗽发生率为52．4％（107／204），咳嗽总发生率为67．6％（138／204）。主动吸烟组建筑工人偶尔咳嗽发生率高于被动吸烟组（23．3％vs 1．5％，P＜0．01）；被动吸烟组和主动吸烟组建筑工人经常咳嗽发生率均高于不吸烟组（54．5％ vs 22．2％，55．8％ vs 22．2％，P＜0．017）；主动吸烟组建筑工人咳嗽总发生率分别高于不吸烟组和被动吸烟组（79．2％ vs 33．3％，79．2％ vs 56．1％，P＜0．01）。建筑工人的咳嗽发生频率与吸烟暴露有关联，主动吸烟者偶尔咳嗽和经常咳嗽的发生风险均高于不吸烟者（比值比分别为5．958、6．990，P＜0．05），被动吸烟者经常咳嗽发生风险高于不吸烟者（优势比为3．536，P＜0．05）。结论吸烟暴露是导致建筑工人咳嗽的重要危险因素；应采取有效措施，加强建筑工人的控烟工作。
