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DRGs在复杂多发疾病分组的优化应用
目的根据新疆社会基本医疗保险支付方式情况,提供4种在本区域内复杂、多发的大病与慢病的DRGs主要分组因素和其他重点关注信息。方法采用通径分析对2011~2013年间在新疆样本医院住院病人数据库中由疾病谱排列前15位的复杂多发疾病如:慢性肾衰竭、高血压、2型糖尿病、心绞痛住院费用影响因素进行分析。获取主要分组因素,结合临床资料勾勒通径图,拟合相关指标,以80%以上的模型适配度为相应疾病模型选择值。结果样本医院4种疾病的DRGs主要分组因素,经临床资料验证获得佳分组模型及主要分组因素和重点关注信息。结论通径分析为复杂疾病的DRGs分组流程提供了更加丰富的信息。在今后相关研究中,可尝试采用通径分析处理与此类似问题,以达到佳控费效果。
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复杂疾病病因研究中基因间交互作用分析:基于基因型传递不平衡的多因子降维法
介绍复杂疾病病因研究中分析基因-基因交互作用的一种新方法:基于基因型传递不平衡的多因子降维法(MDR-PDT).文中简述MDR-PDT的基本原理、步骤及特点,并结合研究实例说明其应用过程.MDR-PDT是原始MDR的扩展,可用于多种结构类型的核心家系资料分析基因-基因交互作用.结论 MDR-PDT具有非参数、无需遗传模式的特点,并能充分利用家系中多个家庭成员的信息,在复杂疾病病因研究中分析基因-基因交互作用具有良好的效能.
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血清蛋白质组双向凝胶电泳技术优化
蛋白质组学已成为生命科学研究的重点,是寻求疾病标志物的重要源泉.通过血清蛋白质组学研究,寻找特定疾病的血清特异蛋白质标志物或发现新的疾病相关蛋白质,能为疾病的诊断或治疗提供新的依据,也可能进一步阐明一些复杂疾病的发病机制.自1975年O′Farrell[1]提出高分辨率双向电泳技术以来,该技术有了长足的发展,并与质谱技术、生物信息学技术成为蛋白质组学研究的三大核心技术 .
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后全基因组关联研究时代的机遇与挑战
自从2005年报道第一项视网膜黄斑变性的全基因组关联性研究(genome-wide association studies,GWAS)以来,利用GWAS策略进行复杂疾病关联分析的研究不断涌现.截止到2011年11月16日,包括国内在食管癌、胃癌和胰腺癌领域的研究[1-3],至今已有1449项GWAS公开发表,报道了5322个遗传变异与200多种疾病或性状的关联( http://www.genome.gov/GWAStudies/).
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单味中药治疗骨质疏松症的研究进展
骨质疏松症(osteoporosis,OP)以骨量减少,骨组织微观结构退化和骨的力学性能下降为特征,并增加骨脆性和骨折风险的[1,2].老年性骨质疏松症则以骨质形成减少为主,或因高原缺氧致脏器功能早衰形成.继发性骨质疏松症主要由疾病等原因和不良嗜好引发.骨质疏松症是一个跨学科的复杂疾病,随着我国人口老龄化而成为影响公共健康的严重问题之一,国家已将其列为国家重点攻关的三大老年疾病之一.本综述曾以中药功效分类介绍了部分具有抗OP 作用的单味中药,包括解表类药[3]、活血化瘀类药[4]、补肾类药[5,6],还有几味药因无法归类,故单独介绍如下.
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中药网络药理学研究进展
药物承担着防治疾病、提高人们健康水平的作用,同时,医药产业也已成为社会经济建设不可或缺的部分。传统药物的发现主要集中于单一靶点的高特异性抑制剂。然而,通过大规模功能基因组研究证实,只有不到10%的单基因敲除具有治疗价值[1],而且,单一分子靶点的高特异性药物对复杂疾病通常难以获得良效,传统新药研发遵循的“单基因-单靶点-单疾病”的线性模式遇到巨大瓶颈及严峻挑战。资料显示,美国食品药品管理局(FDA)2010年仅有21种新药通过评审,欧洲药品管理局(EMA)也仅批准了14个新药[2]。新药在Ⅱ期和Ⅲ期临床试验中因缺乏有效性和出现非预期的毒性所导致的新药失败率高达30%[3],使整个制药业在持续繁荣后陷入困境。中医药在诊断上注重整体的和功能的动态变化,治疗上强调辨证论治,通过中药等在整体水平上的调节,治疗局部性病变和恢复整体功能平衡,获得治疗效果[4]。因此,药物的研发和机制研究亟需借鉴中医药的诊疗思路,从整体出发,“多基因-多靶点-复杂疾病”模式着眼,寻求新的研究途径。
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网络生物学在中医药研究中的应用
随着人类基因组计划的完成,人们逐渐认识到生物系统的功能是通过基因、蛋白以及小分子之间的网络式相互作用完成的,同时发现复杂疾病往往是由于多个基因表达紊乱导致生物学过程失衡而产生的,这些促使了“多靶点”药物发现理念的兴起.中医药诊治疾病的特点是整体观和辨证论治;从分子水平上看,中药方剂具有多成分、多靶点的特点,从而可望为多靶点药物的开发提供借鉴.该文在6个方面阐述网络生物学在中医药研究中的应用,以期对中医药现代化研究提供一定参考.
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模块分析法:解密复杂疾病和药物作用机制的新策略
大部分复杂疾病并不是由单个致病基因引起的,药物作用于疾病网络的多个靶点,产生协同效应,从而干预疾病的发生和发展.与作用于单个分子或通路的传统方法不同,高通量数据构建的疾病-药物靶点网络形象地展示了药物、靶点和疾病之间的复杂关系.但此类网络通常极为复杂,为了降低分析的复杂性,必须对大网络进行分解,识别出模块结构.该研究从模块的概念、结构和识别方法、疾病-药物模块识别的重要性及应用4个方面对模块分析法的框架进行了概述.模块分析法以一个全新的视角来解密药物干预复杂疾病的机制,为揭示多组分多靶点药物作用机制提供了新思路和新途径.
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溃疡性结肠炎中西医治疗优势与对策
溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)是一种多因素、多变量、多层次复杂疾病.临床以腹泻、黏液脓血便、腹痛及里急后重为主要症状.本病病因未明,治愈难度大,复发率高,具有较高的癌变率,被世界卫生组织列为现代难治病之一.
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2型糖尿病易感基因研究进展
2型糖尿病是一种常见的具有明显异质性的多基因复杂疾病,为了阐明其发病机制,国内外学者应用定位克隆法、候选基因法等多种研究策略鉴定2型糖尿病的易感基因,取得了一定进展,本文对此作一简要介绍.
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利用决策森林构建复杂疾病驱动的基因网络
目前,癌症、糖尿病、心脏病、高血压等复杂疾病严重危害着人类的生命和健康,这些疾病并不是由孤立的单个基因发生改变所致,而是多基因联合作用的结果.从系统生物学的角度出发,针对以往基因网络重构算法非疾病驱动的问题,提出了一种利用决策森林构建复杂疾病驱动的基因网络的算法,着重关注基因间的协同作用与复杂疾病发病机理的关系.通过对结肠癌基因芯片数据的分析,识别出66个与结肠癌显著关联的基因互作,其中大部分互作关系参与细胞增殖、细胞凋亡、细胞分化、有丝分裂和免疫等与癌症密切相关的生物过程中.该方法从基因互作和通路的角度为系统研究疾病的遗传复杂性提供了一个崭新的思路.
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AIDS相关全基因组关联研究进展
全基因组关联分析( genomewide association studies,GWAS)是应用人类基因组中数以百万计的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)为标记进行病例-对照关联分析,以期确定疾病相关基因、易感区域或疾病的标记物,从而探究复杂疾病遗传机制的方法[1].该研究建立在常见疾病具有常见变异的假设基础上,其基本思想是在一定规模的实验组和对照组中比较全基因组范围内所有SNP位点的等位基因或者基因型频率在某种疾病中出现的差异.若某SNP位点的等位基因或基因型在患病人群中出现的频率明显高于或低于对照组,则认为该位点与疾病间存在关联性,进而根据该位点在基因组中的位置和连锁不平衡关系推测可能的疾病易感基因.
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肿瘤全基因组的关联分析研究进展
常见疾病如肿瘤、糖尿病和高血压等受多个基因和环境因素共同影响,每个基因的单独作用较弱,且往往存在多基因交互和基因环境的交互作用,因此,这些疾病被称作复杂疾病,其遗传机制的研究有助于开发新药物、发展新疗法和开展预防.
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晚发性阿尔茨海默病全基因组关联研究进展
阿尔茨海默病(Alzheimer disease,AD)是常见的神经退行 性疾病.临床表现为进行性学习记忆功能障碍和其他认知功能 损害.临床上以晚发性阿尔茨海默病(late-onset AD,LOAD)为 主.研究认为,LOAD 的发生是由于遗传、环境和免疫等多种因 素导致,其中60% ~80%发病危险和基因异常相联系[1] .载脂 蛋白E4(apolipoprotein E4,ApoE4)是目前惟一确定和LOAD 发 生相关的易感基因,ApoE4 基因携带者的LOAD 发病率是非携 带者的2 ~4 倍[2] .但是ApoE4 并不能解释所有的LOAD 的发 生,一种复杂疾病的发生大都是多基因的低频变异逐渐累积而 成的.以往常规的筛选候选基因的研究方法很难发现这些大量 低频变异位点.随着微阵列技术的发展,全基因组关联研究 (genome-wide association studies, GWAS) 可以帮助解决这个 问题[3] .
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多因素降维法介绍及其在复杂疾病研究中的应用
在人类遗传流行病学病例与多对照研究中,复杂疾病的基因型和表型问的复杂关系依赖于基因-基因、基因-环境因素交互作用.相对于传统的统计方法,多因素降维法(MDR)是目前成功应用的无参数、无遗传模式分析交互作用的方法.了解以及掌握这种方法的基本原理、步骤及特点,有助于更深入的研究复杂疾病的基因型和表型间的关系.
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2型糖尿病易感基因研究进展
2型糖尿病(T2DM)是遗传和环境因素共同作用导致的复杂疾病.T2DM的家族聚集性、同卵双生子发病的高一致性以及在某些种族人群中的高发率均强烈提示遗传因素在其发病中的作用.相关研究预计有30% ~70%的T2DM患者患病风险可归因于遗传易感性[1].同时,T2DM具有遗传异质性,其表型受到多基因遗传背景和复杂环境因素的共同控制.
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如何做好全基因组及候选基因病例/对照关联研究
基因型与表型关联研究(genotype-phenotype association study)目前采取的策略主要为全基因组关联研究与候选基因关联研究.我们所说的表型是指某种疾病所表现出的症状或人体本身具有的一些特征或生理生化指标等,如身高、体重、血脂、血糖、血压、心肌梗死等.根据"常见病多基因变异"的理论,上述研究策略可能会帮助我们找到多基因复杂疾病(如冠心病,糖尿病)的病因,阐明相同疾病为何l临床表现不同,相同疾病为何对治疗的反应(疗效,副作用)各异的原因,为建立预测、预警、预防的个体化医学体系储备知识.但是,由于目前大多数的关联研究普遍存在实验设计欠严谨,样本选择不当,样本量不足,没有完善的质控措施等原因,导致假阳性结果较多.我们参考了目前国际一流水平的全基因组或候选基因关联研究中普遍遵循的原则并将这些原则介绍给大家,以期引起国内同道的重视.同时,结合国际上有影响力杂志发表的关联研究类的论文,给大家介绍这些杂志对关联研究类论文的发表要求,希望对大家发表论文有所帮助.限于我们的学识及本领域一日千里的发展.不当之处在所难免,我们仅仅是抛砖引玉,欢迎批评.
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第八次全国医学遗传学学术会议在哈尔滨召开
2009年7月11日至12日,第八次全国医学遗传学学术会议(中华医学会2009年医学遗传学年会)在哈尔滨医科大学召开.此次会议由中华医学会医学遗传学分会主办,中国遗传学会人类和医学遗传学委员会、中国遗传学会教育教学委员会及黑龙江省遗传学会协办,哈尔滨医科大学承办.会议主题是"复杂疾病遗传学".
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表观遗传学基础和围产医学发展
遗传学的经典原理已为临床医师所熟悉并得到广泛应用;分子遗传学的核心是生命过程中所需要的各种蛋白质由基因决定,并因此决定生命体的表型.随着医学的发展,特别是遗传学和病理生理学的发展,许多临床现象和疾病机制难以用经典的遗传学原理加以解释,如源于分化的成熟体细胞的克隆动物未老先衰;具有相同DNA序列的同卵双生双胞胎在表型和疾病易感性方面表现出明显的差异;组织特异性基因在不同受体、组织的表达不同,以及复杂疾病的发生机制与遗传学理论不一致,等等.
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常见精神障碍的分子遗传学研究回顾和展望
精神障碍是一大类常见疾病,其不仅给家庭和社会带来沉重的经济负担,还经常威胁社会的安全与稳定.多数精神障碍的病因及发病机制至今未明,学术界普遍认为,遗传因素在精神障碍发病过程中发挥重要的作用,其遗传模式不符合孟德尔遗传规律,属于多因素复杂疾病(complex disease),即由多个微效基因协同并与环境因素共同作用导致的疾病.