首页 > 文献资料
-
遗传流行病统计分析软件SAGE简介
在研究人类遗传相关疾病的过程中,利用家系结构和群体调查资料进行连锁分析、关联分析或连锁不平衡分析已成为基因定位的重要方法.由于遗传学数据庞大,分析繁琐,结构复杂,需要专门的遗传统计软件进行分析.
-
同胞对连锁分析的三种统计方法比较
在很多物种中,无论是低等的酵母,还是高等的人类,许多基因的表达水平都展示出丰富的自然变异.而目前,很多科研工作都集中于研究疾病发展不同阶段的基因表达水平,较少研究健康人群基因表达的自然变化.事实上,健康人群个体间的遗传变异常常和人类复杂疾病的易感性及复杂疾病性状有密切联系.而人类基因组中广泛存在并被广泛应用的第三代基因遗传标记,即SNP标记,是一种能够稳定遗传的早期突变,研究者可以通过对SNP的相关分析和高密度的SNP图谱来定位一系列复杂疾病的相关基因.
-
瘢痕疙瘩候选基因与染色体2q23微卫星扫描及连锁分析的多家系研究
目的:从与瘢痕疙瘩发病町能存在密切关系的基因出发.分析中国汉族瘢痕疙瘩家系致病基因与染色体2q23区域是否存在连锁关系,以定位易感基因位点.方法:采用微卫星扫描及连锁分析方法,选取3个中国汉族瘢痕疙瘩家系中69名成员的外周静脉血标本,根据文献选择位于2q23区域11个微卫星标记,应用多重聚合酶链式反应(mPCR)扩增产物片断,测定PCR产物片段,获得每个样本的基因分型.运用连锁分析软件LINKAGE的MLINK程序计算每个标记位点的LOD值,根据两点间LOD值判断是否存在连锁关系.结果:在重组率θ=0-0.5时,这些微卫星标记的两点LOD值绝大部分都小于1,排除连锁关系存在.结论:中国汉族瘢痕疙瘩家系易感基因位点不在染色体2q23区域.说明瘢痕疙瘩易感基因位点存在异质性.
-
瘢痕疙瘩候选基因与染色体7p11微卫星扫描及连锁分析的多家系研究
目的:从与瘢痕疙瘩发病可能存在密切关系的基因出发,分析中国汉族瘢痕疙瘩家系致病基因与染色体7p11区域是否存在连锁关系,以定位易感基因位点.方法:采用微卫星扫描及连锁分析方法,选取3个中国汉族瘢痕疙瘩家系中69名成员的外周静脉血标本,根据文献选择位于7p11区域4个微卫星标记,应用多重聚合酶链式反应(mPCR)扩增产物片断,测定PCR产物片段,获得每个样本的基因分型.运用连锁分析软件LINKAGE的MLINK程序计算每个标记位点的LOD值,根据两点间LOD值判断是否存在连锁关系.结果:在重组率θ=0~0.5时,这些微卫星标记的两点LOD值绝大部分都小于1,排除连锁关系存在.结论:中国汉族瘢痕疙瘩家系易感基因位点不在染色体7p11区域.说明瘢痕疙瘩易感基因位点存在异质性.
-
遗传性心律失常基因检测技术
遗传性心律失常是指具有家族聚集倾向、临床上易于出现室性心动过速、心室颤动及猝死等表现的遗传性心脏疾病,可伴或不伴心脏结构的改变.对遗传性心律失常患者进行基因检测能够协助诊断及治疗.目前已有多种方法用于致病基因的检测,不同方法各有其优缺点及适用范围.对于单基因遗传性疾病,可应用单核苷酸多态性(SNP)等遗传标记对致病基因进行精细定位,对候选基因进行测序从而明确致病基因;对于多基因遗传病可通过连锁分析定位易感基因位点并通过群体关联研究缩小候选基因的范围.高通量测序和基因芯片的出现为致病基因检测提供了广阔的发展空间.
-
瘢痕疙瘩发病机理的研究进展
目的 综述瘢痕疙瘩发病机理的研究进展.方法 广泛查阅近年来有关瘢痕疙瘩发生的组织学、病理学、生理学、免疫学和遗传学方面的相关文献,并作综合分析.结果 经查阅发现,近的基因组扫描首次提供了瘢痕疙瘩易感基因位点在染色体2q23和7p11的遗传学证据.结论 识别瘢痕疙瘩易感基因将显著提高学者们对瘢痕疙瘩生物学发病机制的认识,这不仅有利于瘢痕疙瘩的诊断和治疗,而且有助于对创伤愈合机理产生新的认识.
-
中国人群瘢痕疙瘩家系与染色体 2q23 和 7p11 的连锁分析
目的 探讨中国人群瘢痕疙瘩家系是否与2q23和7p11存在连锁关系.方法 选择两个中国人群瘢痕疙瘩大家系,从中共选出51名成员,采集其外周静脉血样,提取基因组DNA;参照国外近相似研究的文献报道,在染色体2q23和7p11上,分别选取6个和4个微卫星标记,经多重PCR扩增,产物片断基因分型,再进行连锁分析.结果 在重组率θ=0时,这些微卫星标记的两点LOD值绝大部分都小于-2,排除连锁关系存在.结论 本研究首次发现了中国人群瘢痕疙瘩家系的易感基因位点不在染色体2q23和7p11上的遗传学证据,说明瘢痕疙瘩易感基因位点存在异质性.
-
中国汉族瘢痕疙瘩家系易感基因位点的定位分析研究
目的 定位中国汉族瘢痕疙瘩家系的易感基因位点.方法 采集2个4代发病的中国汉族瘢痕疙瘩大家系51例成员的外周静脉血样.提取基因组DNA;假定Fas基因为该家系致病基因的候选基因位点.选取位于10q23.31上Fas基因周围共约10Mbp范围内与细胞凋亡障碍有关的已知基因相邻的微卫星标记D10S1687、D10S1765、D10S1735和D10S1562,对这些微卫星位点进行PCR扩增,产物片断基因分型,再进行连锁分析.结果 在重组率θ=0~0.5时,这些微卫星标记的两点LOD值绝大部分都小于1,排除连锁关系存在.结论 研究发现中国汉族瘢痕疙瘩家系易感基因位点不在染色体10q23.31区域.
-
常染色体显性视网膜色素变性家系基因定位的研究与视紫红质基因突变的检测分析
目的:对一常染色体显性视网膜色素变性(autosomal dominant retinitis pigmentosa,ADRP)大家系进行基因定位,并检测该家系12名患者的视紫红质基因是否存在突变.方法:采用多个已知位点的遗传标记对该ADRP家系进行连锁分析,确定致病基因的大致染色体位置;在所定位的染色体区域将RHO基因作为侯选基因进行直接测序检测突变.结果:连锁分析结果发现遗传标记D3S1292,当θ=0.1时有大Lod值=2.732852,因此考虑该家系致病基因位于D3S1292附近.直接测序结果发现该家系中大部分患者在RHO基因的第3外显子序列,第182密码子的第2个碱基发生G→A置换突变,导致甘氨酸(Gly)变为天冬氨酸(Asp),命名为Gly-182-Asp突变,而在2例患者中则未发现突变;同时,在该家系正常成员以及正常对照者中均未发现此突变.结论:ADRP存在分子水平的遗传异质性,某些ADRP是由于RHO基因突变所致.但是由于本研究所涉及的ADRP家系中尚有2名患者未找到RHO基因突变,故不能将Gly-182-Asp突变认为是该家系的致病原因.在D3S1292与RHO基因之间可能存在新的基因,还需进一步研究证明.
-
单核苷酸多态性的特点及其在医学中的应用进展
1990年开始启动的人类基因组计划 ( HGP)揭开了人类遗传信息的秘密.随着研究的深入,人类基因组单核苷酸多态性 (SNPs) 的研究应运而生,并且得到迅猛的发展.SNPs数量大、分布广,且在不同人群中的分布频率也有差异, 这些差异可以代表某一种族或人群间的遗传差异.因此, SNPs的研究有助于解释个体间的表型差异、不同群体和个体对疾病,特别是对复杂性状疾病的易感性以及对各种药物的耐受性.此外,SNPs还可用于定位疾病相关基因、分析疾病的关联性、阐明疾病发生的分子遗传机制以及药物基因组学中的用药指导和药物设计等,目前已成为疾病基因组学、功能基因组学、药物基因组学和环境基因组学研究的重要内容.随着人类基因组计划的完成,人们越来越重视SNPs的医学意义及其应用,特别是在应用SNPs进行连锁分析、关联分析、定位和寻找疾病致病基因方面有了很大进展.本文对SNPs的特点及其在医学方面的应用作一综述.
-
下消化道疾病
一、克隆氏(Crohn)病1.Nod 2 从本病于一级亲属的发病率高和其在单卵双生儿及双卵双生儿的发病率有所差别看来,说明并非系单一性遗传病,其发病有复数基因参与.Hugot等依连锁分析发现,于16号染色体存在本病易感性基因IBD1,嗣后陆续又有IBD2(12号染色体)、IBD3(6号染色体)、IBD4(14号染色体)、IBD5(5号染色体,2001,加拿大)以及IL-4、IL-5、IL-13和IRF-1等候补基因的报道.Negoro(2002)报告在英国也证实有易感性基因IBD5存在,并多见于不具Nod 2变异的患者,但IBD5风险单元型在日本却极罕见.
-
BCCIP研究进展及其与卵巢癌相关基因的关系
卵巢恶性肿瘤起病隐匿,早期诊断困难,术后易复发,故其病死率高居妇科恶性肿瘤之首.癌基因的激活和抑癌基因的失活是肿瘤产生和进行性恶化的中心环节,迄今通过细胞遗传学研究、连锁分析、杂合性丢失研究、消除杂交、mRNA差异等方法,已鉴定出了一批抑癌基因,以及抑癌候选基因,如p53,p21、RBI、p16 MTSI、p15 MTS2, WTI、NP1、APC、PCC, BRCAI/2, MIT, FEN等.BCCIP是BRCA2在抑制肿瘤方面重要的辅助因子,是新近克隆成功的抑癌基因,是细胞生存、基因稳定不可缺少的基因,在细胞周期调控、DNA同源重组(HR)和细胞有丝分裂过程中都有重大作用.该文就BCCIP与卵巢癌相关基因关系及其研究进展综述如下.
-
应用荧光标记引物进行DMD家系连锁分析
目的 应用荧光引物建立进行性肌营养不良产前诊断连锁分析方法.方法 应用不同荧光染料标记7对dystrophy基因内部的短串联重复序列5'-5n4、DXS206、5'-7n4、DXS1238、DXS1237、DXS1236和DXS1235,经PCR扩增后,采用ABI3500测序仪进行毛细管电泳,对5个Duchenne型肌营养不良症(DMD)家系进行连锁分析,进行胎儿产前诊断.结果 2个胎儿被检测出携带与先证者相同的X染色体遗传片段,其中1个SRY基因检测阳性,建议引产;1个SRY基因检测阴性,建议继续妊娠;另外3个胎儿未检测出与先证者携带相同的X染色体遗传片段,建议继续妊娠.结论 该方法方法操作简便、敏感、准确,用于产前诊断和携带者检出,可在临床推广运用.
-
HLA-DQB1等位基因与高血压病的相关性研究
高血压病属于多基因疾病,遗传度达62%,但遗传机制尚不清楚.国外许多血清学或基因相关性研究、连锁分析均显示HLA抗原特异性或等位基因与高血压病的易感性相关,但存在种族特异性.
-
短串联重复序列连锁分析进行产前诊断前母血污染鉴定的研究
目的:建立一种简单易行,快速,准确的母血污染鉴定技术,应用于产前诊断前排除母血污染。方法在 X染色体上选取具有高杂合度和高多态性的6个短串联重复序列位点,应用连锁分析对10例羊水和10例脐带血标本进行母血污染鉴定。结果在10例羊水和10例脐带血标本中各发现1例标本发生母血污染。结论该方法可应用于临床实验室进行产前诊断前排除母血污染。
-
T淋巴细胞毒相关抗原-4启动子区基因多态性与系统性红斑狼疮易感性的meta分析
T淋巴细胞毒相关抗原-4(CTLA-4)主要表达在T细胞上,与同表达于T细胞的CD28分子具有较高的同源性,在发挥抑制T细胞活化和外周耐受中起着关键作用.CTAL-4的这种负性调节作用在自身免疫性疾病的发生发展中同样发挥着重要作用[1].系统性红斑狼疮(SLE)是一种典型的因产生自身抗体而累及多个器官的自身免疫性疾病.遗传因素被认为在SLE的发生中起着重要作用.连锁分析发现自身免疫性疾病的一个相关染色体区间是2q33-35,而CTLA-4基因正位于此区间[2].CTLA-4基因多态性在多种自身免疫性疾病的中发挥作用.
-
癫痫的分子遗传学研究进展
国内外大量的研究证明,遗传因素在癫痫(epilepsy,EP)的发病机制中占有重要的地位,由于EP表型的异质性以及遗传性癫痫遗传方式的复杂性,使得对癫痫基因水平的认识一直停滞不前.以分子生物学技术为基础的反向遗传学技术的创立使EP的分子生物学研究获得了突破性进展,该技术以染色体上具有高度多态性限制性片断(RFLP)、数目可变的串联重复序(VNTR)及核苷酸的串联重复序(VNDR)作为遗传标志,用连锁分析等方法已将6种癫痫及癫痫综合征的致病基因定位.研究证实一些"癫痫基因"可导致离子通道或受体功能的异常、脑发育障碍、进行性神经变性及脑能量代谢障碍[1].
-
小睑裂综合征致病基因研究进展
小睑裂综合征是常染色体显性遗传疾病,迄今为止,用连锁分析及细胞遗传学分析方法对小睑裂综合征家系进行了基因定位和致病基因的突变分析.本文就近年来在小睑裂综合征基因研究方面作一综述.
关键词: 小睑裂综合征(BPES) 连锁分析 3q23 FOXL2 -
儿童失神癫痫分子遗传学研究进展
儿童失神癫痫(childhood absence epilepsy,CAE)是特发性全身性癫痫的常见类型,其发病机制尚不完全清楚,但公认遗传因素在其发病过程中起重要作用.目前认为其遗传方式为多基因遗传。目前,国外学者通过全基因组扫描和连锁分析,已将CAE易感基因分别定位于染色体8q24以及染色体3p14.2-p12.1,奥地利学者研究发现CAE与位于染色体15q11.2-q12γ—氨基丁酸(GABA)A型受体亚单位β3基因(GABRB3)关联。同时,人们在CAE动物模型进行了针对儿童失神癫痫易感基因的研究,获得了一系列有益的提示。
-
全基因组筛查与2型糖尿病相关基因
2型糖尿病是一种多基因遗传性疾病,其发病是不同基因之间相互作用,基因与环境之间相互作用的结果.利用全基因组筛查与连锁分析的方法,目前已在多条染色体上确定了比如1q21-q24、2q37、3q27、4q、5q34一q35.2、6q21-23、12q24、20q12-13.1等多个染色体区域与2型糖尿病相关,并且在这些区域内发现了INSRR、PKLR、CAPN10、HNF1A、GLUT10等作为2型糖尿病易感基因的候选基因.