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视网膜色素变性显性遗传家系3号染色体连锁分析
目的:用连锁分析法对三个显性视网膜色素变性家系(CY、WN、ZH)3号染色体进行分析,确定致病基因.方法:随机选取3号染色体视紫红质(rhodopsin,RHO)基因上下约5厘摩(centimorgan cM)范围内的6对微卫星标记(marker),确立单倍体型,用两点法计算大优势对数(LOD SCORE)值.结果:所选微卫星标记与CY、WN家系表型间LOD值呈负相关关系,而ZH家系与位点D3S3606间LOD值为2.52.结论:RHO基因为CY、WN家系的非候选基因,RHO基因可能是家系ZH致病基因.
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先天性白内障一家系的致病基因初步筛查
目的:对常染色体显性遗传先天性白内障一家系的致病基因进行初步筛查。方法收集常染色显性遗传的白内障一家系23名成员的外周静脉血,提取基因组DNA,选取与已知常染色体显性遗传的先天性白内障的候选基因CRYGD、GJA3,采用软件Linkage对该家系2个基因附近共10个STR位点进行两点法连锁分析,筛查这2个基因是否为此家系的致病基因。结果对该家系的基因连锁分析表明,基因CRYGD、JGA3所有编码区及外显子与内含子交界处均未发现基因序列的突变。结论基因CRYGD、GJA3不是该家系的遗传致病基因,对该家系需进一步做全基因组扫描,以发现致病基因在染色体上的可疑区间。
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一个中国汉族痣样基底细胞癌综合征家系致病基因的定位研究
目的定位一个中国汉族痣样基底细胞癌综合征(NBCCS)家系的致病基因.方法选择SHH信号系统的基因作为该NBCCS家系致病基因的候选基因,用微卫星遗传标记在候选基因染色体区域定位致病基因.结果连锁分析结果发现,PTCH2基因所在染色体区域微卫星遗传标记D1 s2797 LODZMAX为1.31(平均遗传距离73.81)、D1 s2802 LODZMAX为1.26(平均遗传距离73.81),支持连锁.构建单体型发现家系内所有病变表型的个体D1s2797和D1 s2802的基因型一致,无交换重组现象.而SHH,PTCH,SMO基因染色体区域微卫星遗传标记连锁分析结果不支持连锁.结论这个中国汉族NBCCS家系的致病基因定位在PTCH2基因染色体区域1p32.3,遗传距离为1.85cM.
关键词: 痣样基底细胞癌综合征 连锁分析 单体型分析 -
一个致密核性先天性白内障家系致病基因的初步研究
目的 对一个致密核性先天性白内障家系的致病基因进行定位.方法 根据已报道的与先天性白内障相关基因的位置,选择紧密连锁的微卫星多态性标记,PCR扩增后进行基因分型,以分型结果为基础,利用等位基因共享分析和两点连锁分析对已知候选基因进行排除定位.结果 该家系临床表型为致密核性先天性白内障,目前尚无关于该表型致病突变的报道.已知的15个候选基因区域附近的微卫星位点均不存在等位基因共享;除D11S898外,其余27个微卫星位点的LOD值在重组率(θ)为0时均为-∝,致病基因与15个已知基因之间不存在连锁关系.结论 该家系的致病基因不是15个已知的先天性白内障相关基因,其致病基因有待进一步研究.
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常染色体显性遗传非综合征型耳聋致病基因的定位研究
目的 应用连锁分析方法对一个常染色体显性遗传非综合征型耳聋(DFNA)家系进行耳聋基因的定位研究.方法 通过进行家系调查、对家系成员进行全面查体及听力学检查,绘制遗传图谱.应用连锁分析的方法,首先排除此家系的遗传位点与表型相似的已知DFNA位点连锁,然后进行全基因组扫描.结果 该家系致聋基因定位在2号染色体2q13-q14.2上,大LOD值在D2S363处,为3.22.通过单倍型分析将遗传位点定位于微卫星标记D2S1888和D2S2224之间约8.4cM的区域.对区域内的候选基因PAX8进行突变筛查,没有发现突变.结论 本家系的耳聋基因定位在一个新的DFNA位点上.
关键词: 听力受损者 常染色体显性遗传非综合征型耳聋 连锁分析 -
精神分裂症高发家系13q的连锁分析
目的 在中国人群中验证精神分裂症易感基因是否与13q连锁.方法 收集4个精神分裂症高发家系,采集家系成员外周血,提取DNA.在13q14-13q33选取7个微卫星标记,进行部分基因组扫描,采用GENEHUNTER 2.1软件进行单点和多点的参数、非参数连锁分析.结果 单点非参数连锁分析D13S156、D13S170、D13S265、D13S159、D13S158位点NPL值分别为1.40、2.25、2.06、1.71和1.39.多点非参数连锁分析得到约50cM的阳性区域.单点和多点参数连锁分析也在一些位点得到阳性结果.结论 13q22.1-13q33.1染色体区域可能存在精神分裂症的易感基因.
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全基因组扫描定位毛囊闭锁三联征致病基因
目的 在1例4代毛囊闭锁三联征大家系中定位其致病基因所在区域.方法 用覆盖全基因组的微卫星标记对1例毛囊闭锁三联征大家系进行致病基因定位研究,用ABI3730测序仪进行微卫星标记的基因分型,利用Linkage软件(5.10 version)和Cyrillic软件(2.01 version)进行连锁和单倍型分析.结果 该家系符合常染色体显性遗传模式,当外显率为99.9%时,在1号染色体上的微卫星标记D1S2624处获得大LOD值为3.26(重组率θ=0.00).单倍型分析将该家系致病基因定位在微卫星标记D1S248和D1S2711之间的染色体1p21.11q25.3区域,遗传距离61.8 cM.结论 染色体1p21.11q25.3区域存在毛囊闭锁三联征的致病基因.
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IgA肾病的遗传学和免疫生物学发病机制的研究进展
IgA肾病是多基因多因素参与的复杂性疾病,糖基化异常IgA1分子的形成被认为是IgA肾病致病的关键环节,而近年来关于IgA肾病的全基因组关联分析(GWAS)研究发现数个易感基因与IgA肾病发病相关,主要涉及获得性免疫、先天性免疫及补体系统区域,进一步提示遗传因素及免疫生物学因素在IgA肾病发病机制中起关键作用,逐步揭示IgA肾病错综复杂的遗传发病和进展机制.如何将这些研究成果更好的与临床结合,对易感人群进行早期诊断和个体化治疗,这是未来面临的又一挑战.
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非胰岛素依赖型糖尿病基因定位研究进展
糖尿病是一种严重危害人类健康的多基因遗传病.根据其发病机制,分为胰岛素依赖型(ins ulin-dependent diabetes mellitus,IDDM)和非胰岛素依赖型(non-insulin-dependent di abetes mellitus,NIDDM)两大类,其中,NIDDM占所有糖尿病的90%左右.未来的10~20年内,许多遗传学家将致力于对它的研究.其中,NIDDM的基因定位及克隆将是一个热点.要想将NIDDM基因定位,关键的是寻找合适的家系.找到好的家系就如同发掘到了宝藏,这样说一点也不夸张,因为好的家系是连锁分析结果可信的保证.
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一常染色体显性遗传寻常型鱼鳞病家系致病基因的定位
目的 研究一常染色体显性遗传寻常型鱼鳞病家系的致病基因.方法 采用基因组扫描方法,利用1号染色体上的微卫星标记对该家系进行连锁分析,然后对候选基因FLG的部分编码区及外显子与内含子交界处进行突变检测.结果 在D1S2696得到大两点连锁LOD值3.46(θ=0),单体型分析将疾病基因定位在D1S2726-D1S305之间约15cM范围内;在FLG基因的外显子非重复序列及部分重复序列未发现与疾病相关的突变.结论 该寻常型鱼鳞病家系的致病基因位于D1S2696附近,其致病基因可能是除FLG以外的其他基因.
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国人2号染色体一区段与原发性高血压的连锁分析研究
目的在一项全基因组扫描研究中,我们曾报道2号染色体上三个微卫星标记(D2S168、D2S151和D2 S142)与原发性高血压间存在提示连锁关系.本研究进一步验证中国人家系中上述候选区域的连锁关系.方法在有856名原发性高血压患者的240个中国人家系中,对2号染色体进行遗传连锁研究.用9个位于2号染色体候选区段内的高度多态性的微卫星标记,对1080名家系成员进行基因分型, 两个相邻微卫星标记的间距为5 cM.用GENEHUNTER软件进行非参数连锁分析(NPL)、参数连锁分析和传递-不平衡检验(TDT)以判定有否连锁证据.结果不同方法(NPL、LOD分数值和TDT)的统计结果均证实2号染色体上D2S151和D2S142位点及其附近区段与高血压间存在连锁关系,但D2S168位点与高血压的连锁关系在本研究中未能证实. 结论本研究结果揭示在中国人中,2号染色体上D2S151和D2S142位点及其附近区段可能存在与原发性高血压发病有关的基因.
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家族性预激综合征与染色体7q3连锁
目的预激综合征为常染色体显性遗传性疾病.但其致病基因尚未定位、克隆.本实验摘要目的是探寻预激综合征的基因位点.方法应用基因分型的方法,以7q3上D7S505,D7S688和 D7S483为候选位点,对3个家族性预激综合征家系(共101名成员)进行了连锁分析.结果家族性预激综合征与上述3个位点均连锁,以D7S505 Lod值高,重组率(θ)为0.1时Lod=6.4;D7S483和D7S688位点Lod值分别为2.5和5.3.结论预激综合征的相关基因位于7q3上.
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家族性热性惊厥相关基因的研究
家族性热性惊厥(FC)是儿科常见的一类特殊的癫痫综合征,其发病机制不清,研究证实它有明显的遗传倾向[1].本课题组利用中国人FC家系进行微卫星标记的连锁分析,发现FC与19 p13.3连锁并将候选基因定位在D19S591和D19S395之间11.7 cm大小范围内[2].在这一区域内,根据基因功能我们选择NRTN、CAPS、GPX4和CSNK1G2基因作为候选基因,应用PCR技术扩增其外显子及侧翼区域并进行测序,寻找突变.
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常染色体隐性遗传性共济失调家系临床及致病基因定位研究
目的:探讨常染色体隐性遗传性共济失调家系的临床特征并排除已知的致病基因.方法:对可追溯5代32人,具有一级表兄妹婚配共济失调的 W 家系进行详细的神经系统临床和辅助检查,通过 OMIM 数据库查询及表型鉴别和连锁分析验证方法排除已知致病基因.结果:W 家系临床表现为常染色体隐性遗传性共济失调,通过2种方法排除了已知基因致病可能.结论:W 家系发病为未知致病基因的突变引起,本项研究为定位克隆新的致病基因奠定了基础.
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联合多个微卫星DNA位点进行血友病B基因诊断
目的建立简单、快速的血友病B遗传学诊断方法.方法应用PCR和Genescan等方法分别检测87名正常人和8个血友病B家系(35人)的8个STR位点的多态性,并进行家系遗传连锁分析.结果所检测的8个STR位点中 6个可提供遗传信息,其杂合度在50%~83%,PIC在0.39~0.80,个别识别能力在0.66~0.94.结论联合多个STR位点多态性检测是血友病B基因诊断的一种简便有效的方法.
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应用两种方法对血友病B家系进行产前基因诊断
血友病B(hemophilia B)是因凝血因子Ⅸ(FⅨ)基因缺陷引起的X-连锁隐性遗传出血性疾病,在男性中的发病率约为1/30 000,散发率可达患者总数的30%~50%~[1].由于目前还不能根治,对于携带者和高危胎儿进行基冈诊断非常必要.连锁分析和DNA序列分析是单基因遗传病有效的基因诊断方法.
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027 哮喘基因研究进展
支气管哮喘是一组多因子、多基因疾病.迄今已进行了88个候选基因连锁研究,找到7164个连锁位点,并进行了72项突变研究,发现4q、5q、6q、7q、11q、12q、16q等染色体区域中的众多基因与哮喘有连锁关系,以5q31~33基因丛关系为密切.同时对多种与哮喘发病有关的细胞因子、转录因子、蛋白酶的基因调控进行了研究.哮喘的基因治疗已初见端倪,目前重点需要解决的问题是寻找合适的载体,增加靶组织的选择性和特异性.
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支气管哮喘相关基因染色体定位研究进展
支气管哮喘(哮喘)是一种复杂的多基因遗传病,哮喘相关基因涉及5q、6p、11q、12q等多个染色体上的多个位点,对哮喘遗传学研究有重要意义.
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一个中国汉族遗传性出血性毛细血管扩张症家系致病基因的定位研究
目的定位一个中国汉族遗传性出血性毛细血管扩张症家系的致病基因.方法选择基因ALK-1及endoglin作为该HHT家系致病基因的候选基因,在候选基因染色体区域进行定位.结果连锁分析结果发现ALK-1染色体区域微卫星遗传标记D12s1586LODZMAX为1.82,D12s1677 LODZMAX为1.74,D12s1635 LODZMAX为1.65,D12s368 LODZMAX为1.87,支持连锁.构建单体型发现家系内所有患者在ALK-1染色体区域都连锁,无交换重组现象.而endoglin染色体区域微卫星遗传标记连锁分析结果不支持连锁.结论这个中国汉族HHT家系的致病基因定位在ALK-1染色体区域.
关键词: 遗传性出血性毛细血管扩张症 连锁分析 单体型 -
小家系资料连锁分析参数方法及应用
目的 对于小家系资料通过连锁分析寻找遗传性疾病相关基因.方法 运用小家系资料连锁分析参数的方法.结果 多位点连锁分析比两位点连锁分析基因定位更精确.结论 适用于小家系资料的多位点连锁分析,不仅能算出致病基因与标记的重组率和遗传距离,而且能把致病基因定位至遗传标记的一侧.