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六价铬致DNA损伤机制的研究进展
六价铬致DNA损伤的几种常见形式及机制包括DNA断裂、8-羟脱氧鸟嘌呤形成、DNA加合物的形成及碱基突变等.目前有效的拮抗六价铬致DNA损伤的物质主要包括维生素C和一些植物性的物质.本文主要对六价铬致DNA损伤的常见形式、机制及两种拮抗损伤的物质作一简述.
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1-03 塞替派诱发人支气管上皮细胞恶性转化的基因突变
目的了解药物致癌过程中的基因突变情况.方法利用以塞替派为致癌原诱导永生化人支管上皮细胞(BEAS-2B)发生恶性转化建立的癌前转化细胞(BEAS-TE)以及从软琼脂上筛选到了克隆化多倍体细胞,沿转化细胞代龄进行了转化进程中p53、p16和Ki-ras基因突变情况的动态观察.结果 p53、Ki-ras基因存在多位点、p16基因单位点的的碱基突变.结论 p53和Ki-ras基因的多位点突变是塞替派诱导细胞转化过程中发生的重要分子事件,p16基因非编码区单个碱基的缺失是细胞转化过程中的次要分子事件.
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HBV宫内传播过程中碱基突变的研究
晚孕期孕妇应用HBIG及新生儿HBIG联合HBvac免疫,能较好地预防HBV的宫内传播,但是否引起HBV的基因变化?我们研究了该条件下HBV-DNA S区碱基突变情况,报道如下.
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异烟肼耐药结核分支杆菌katG基因分析
结核分支杆菌(M tuberculosis, TB)的katG基因是位于细菌染色体上的结构基因,全长2223bp,它的编码产物是过氧化氢-过氧化物酶,而后者在维系异烟肼(Isoniazid, INH)杀菌毒性中,发挥重要作用.因此,katG基因结构的正确性是编码产生功能正常的过氧化氢-过氧化物酶的先决条件,也是发挥INH特有的药理作用的重要基础.通过检测katG基因的分子结构,尤其是检测某些关键位点的碱基突变,可以快速发现TB对INH耐药的变异情况,对及时的指导临床用药,具有重要的意义.
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二氢嘧啶脱氢酶基因多态性研究的现状与进展
药物代谢酶相关基因的研究始于20世纪80年代,因其对患者个体的合理化用药、疗效观察等有重要的指导作用而备受关注,尤其是与肿瘤治疗的药物代谢酶相关基因的研究更成为热点.目前研究已证实,二氢嘧啶脱氢酶基因(dihydropyrimidine dehydrogenase gene,DPYD)是与5-氟尿嘧啶(5-FU)治疗密切相关的一个药物代谢酶基因,其基因序列上的一些碱基突变或小片段缺失与5-FU治疗时产生的严重毒副作用有密切关系.
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大肠侧向发育型肿瘤线粒体DNA D-环区的突变
目的:了解大肠侧向发育型肿瘤(laterally spreading tumor,LST)线粒体DNA的突变,探讨其与肿瘤发生的关系.方法:提取LST线粒体DNA(mtDNA),扩增D-环区,产物用DNA自动测序法进行序列分析.结果:共检测到4个碱基突变.第16223位C突变为T,第16298位C突变为T,第16362位T突变为C,第16519位T突变为C.结论:线粒体DNA D-环区是一个具有高度多态性和突变性的区域,在LST中突变率较高.
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儿童B细胞淋巴瘤细胞及分子遗传学异常与预后的关系
儿童成熟B细胞淋巴瘤是一组高可治愈性的肿瘤,其病理亚型可分为以下几种:伯基特淋巴瘤(BurkittLymphoma,BL),伯基特样淋巴瘤(Burkitt-likeLymphoma,BLL)及弥漫大B细胞淋巴瘤(DiffuseLarge B-cell Lymphoma,DLBCL).细胞及分子生物学的研究表明,B细胞淋巴瘤均存在细胞及分子遗传学的异常,包括染色体易位、缺失、碱基突变等.
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阿尔茨海默病患者线粒体CO2基因片段的突变分析
长片段和短片段的巢式聚合酶链反应(PCR)已经成为监测DNA片段缺失的常用手段,2000年,我们利用PCR及巢式PCR技术扩增了阿尔茨海默病(AD)患者29例老年人(65~84岁)的编码910 bp细胞色素C氧化酶亚基Ⅱ的mtDNA片段(CO2),通过扩增片段的多态性分析和CO2片段的序列分析进一步探讨CO2基因缺失、重排和碱基突变在AD发生发展中的作用.
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巨颌症致病基因SH3BP2的功能学研究进展
SH3BP2基因是巨颌症的致病基因,其碱基突变能引发巨颌症.研究突变前后的SH3BP2蛋白功能变化有助于进一步了解其致病机制.本文将就SH3BP2蛋白功能及突变后该蛋白功能变化做一综述.
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RhD放散型相关的等位基因的鉴定
目的:为了探讨D放散型(Del)表型的分子基础.方法:采用序列分析方法分析26名Del表型个体RHD基因全长编码区和一名个体的RHD基因第7内含子部分序列;同时使用血清学方法检测全部个体的RhCcEe表型.结果:全部样品的第9外显子均存在RHD 1227G>A碱基突变,其余序列则与正常RHD基因一致,一名个体的第7内含子观察到一处碱基突变RHD IVS7+152c>a;血清学结果显示所有Del表型个体均为RhC抗原阳性个体.结论:由于1227A位于RHD基因第9外显子与第9内含子交界处,可能影响前RNA转录后mRNA的正常拼接,形成Del表型.
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PRKCI 基因在急性心肌梗死患者外周血白细胞中低表达及其临床意义
心肌梗死的发病率越来越高,且有年轻化的趋势。全基因组关联研究发现,基因的碱基突变可能是导致急性心肌梗死发生的原因之一[1-5]。课题组基因芯片研究发现,有559个基因在急性心肌梗死患者中的表达发生改变[6]。其中,PRKCI 基因为显著低表达, P =0.003517699, LogFC =-1.563554087。本研究拟在 RNA 水平及蛋白水平研究 PRKCI 基因在中国东北汉族急性心肌梗死患者中的表达,并对该基因的功能进行分析。
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肝脏脂肪酶基因A+651G突变的检测和临床意义
肝脏脂肪酶(HL)是涉及血浆脂蛋白尤其是高密度脂蛋白代谢的脂溶酶.主要是由肝脏合成.肝细胞合成分泌后,HL结合到肝血窦内皮细胞的表面.HL由476个氨基酸组成的蛋白质,基因位于染色体 15q21位,35 kb,9个外显子.已有很多证据表明HL启动子区域基因突变与HL活性和HDL-C浓度有关.是注射肝素后血管床释放的主要脂肪酶之一.HL能水解磷脂和甘油三脂,是脂酶超家族(包括脂蛋白脂肪酶和胰脂肪酶)成员之一.HL基因转录起始位点上游T514碱基突变与血浆HDL-C浓度升高有关.HL缺乏者HDL-C明显升高,而HDL-C与动脉粥样硬化(AS)的发病呈负相关,研究HL对于阐述AS发病机理有重要意义[1].
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MTHFR C677T和CBS T833C G919A基因突变与青年缺血性脑卒中的关系
血浆中同型半胱氨酸(Hcy)水平增高是缺血性脑卒中的独立危险因素.有研究认为,轻中度Hcy浓度增高与脑卒中的发生密切相关.N5,N10-亚甲基四氢叶酸还原酶是Hcy代谢的关键酶,胱硫醚β合成酶是Hcy代谢的相关酶,本研究拟采用聚合酶链-限制性内切酶片段长度多态性分析(PCR-RFLP)和扩增阻滞突变体系法,对血浆同型半胱氨酸(HCY)代谢关键酶N5,N10-亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)基因C677T位点和相关酶胱硫醚-β-合酶(CBS)基因T833C、G919A位点碱基突变与青年缺血性脑卒中的关系进行研究.
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1例新的弱D型的鉴定
目的 分析1例新的Rh血型弱D型个体的RHD等位基因及其红细胞D抗原表位.方法 采用常规血清学方法检测Rh血型D、C、c、E和e抗原表型,间接抗人球蛋白试验(IAT)确认D抗原,并分析D抗原表位;序列特异性引物-聚合酶链反应(PCR-SSP)测定RHD基因,然后分析RHD编码区全长序列,并检测RHD杂合型.结果 血清学显示该个例为D抗原弱表现型,Rh因子为D+C+c+E-e+,PCR-SSP检测RHD基因显示与正常Rh(D)阳性对照相同.RHD编码区序列分析发现第9外显子存在1 212 C>A碱基突变,其余外显子序列则与正常RHD基因一致(GenBank EF103573),RHD合子型鉴定为RHD+/RHD-杂合型,提示该个体基因型为CDe/cde.红细胞D抗原表位分析显示其具有基本完整D抗原表位.结论 该个例为RHD 1 212 C>A碱基突变形成弱D72型.
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Rh血型系统弱D及部分D研究进展
Rh血型系统弱D及部分D具有不同的分子遗传机制,形成弱D的氨基酸替换主要位于胞内和跨膜区域,表现为抗原位点数减少,但抗原表位数目基本不变.形成部分D(partial D)的氨基酸变异主要位于胞外区域,表现为缺失一个或多个D抗原表位,这也是部分D易产生抗体的原因所在.本文主要综述了近年来Rh血型系统弱D及部分D相关研究进展.
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几类主要病原需氧放线菌菌属的SecA1基因分析研究
目的 了解几类主要病原需氧放线菌不同菌属间SecA1基因碱基突变特点,为病原需氧放线菌的实验室诊断,分类及致病性提供一定的实验室理论数据.方法 以162株需氧放线菌为实验研究对象,通过分子生物学方法对需氧放线菌SecA1基因扩增测序,及收集NCBI数据库中已发表的需氧放线菌SecA1基因,运用多序列对比及DNAStar软件对需氧放线菌SecA1序列进行特异性基序分析及SecA1蛋白的二级结构和表位特性预测.结果 需氧放线菌不同菌属间SecA1序列在300~350 bp区域有着特异性差异,经预测该区域编码的SecA1蛋白二级结构属间大致相同,而蛋白质柔性区域、亲水性及表面可及性等性质在属间存在差异,其中以Mycobacteria菌属的差异较为明显.结论 需氧放线菌SecA1基因不同菌属间具有特异性的碱基突变,这种突变导致属间SecA1蛋白部分性质有差异,与各菌属致病性可能存在着一定的相关性.
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SARS冠状病毒S蛋白部分序列2的克隆与表达
构建SARS冠状病毒棘突蛋白部分序列2(S2)的原核表达质粒,分析其在大肠杆菌中的表达状况.采用逆转录聚合酶链式反应技术从SARS冠状病毒基因组中扩增出编码S蛋白的第2170到2814位碱基的基因片段,克隆至pMD18-T载体,PCR筛选阳性克隆并测序.用限制性内切酶消化后,目的片段亚克隆至表达载体pGEX-4T-2,转化大肠杆菌JM109,PCR和双酶切鉴定转化菌落.将阳性菌落经IPTG诱导,SDS-PAGE和免疫印迹分析靶蛋白的表达.RT-PCR扩增出S2特异片段,经测序与GenBank比对存在1处碱基突变.S2基因片段亚克隆至表达载体pGEX-4T-2构建成重组表达质粒,并在JM109中表达了S2融合蛋白.成功构建了SARS冠状病毒S2的重组表达质粒,并在大肠杆菌中表达了S2融合蛋白.
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罕见Bx亚型伴不规则抗-B抗体1例检测分析
ABO血型系统自从1900年被发现后,一直与临床安全输血有着密切的关系,因为它的抗原性是强的,错判血型会使受血者发生严重的溶血性输血反应,甚至危及生命.ABO亚型是造成血型正反不符的主要原因,可以造成临床输血困难.因此正确无误的血型亚型鉴定在输血工作中有极其重要的意义.本研究对1例Bx亚型伴不规则抗体进行检测.
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SLC35A1基因新突变致先天性糖基化障碍1例并文献复习
目的 探讨SLC35A1基因突变所致先天性糖基化障碍(CDG)的临床表现及基因突变特点.方法 总结1例携带SLC35A1新发碱基杂合突变的CDG-Ⅱf型患儿的临床表现、家系共分离验证、影像学表现、实验室检查及随访资料,并对目前已报道的CDG-Ⅱf型病例进行文献复习,分析CDG-Ⅱf型的临床特征.结果 本文患儿因肌张力低下、发育落后就诊,主要表现为大运动、精细运动、语言发育迟缓,异常面容,小头畸形,全身肌张力低下,生理反射减弱,心脏、肾脏畸形,反复感染免疫功能障碍,并既往血小板减少、凝血功能异常.患儿行全外显子测序发现SLC35A1基因碱基杂合突变c.719A>G/p.Y240C,c.719A>G碱基杂合突变来源于父亲,该基因是dsSNP、ExAC数据库中收录的CDG-Ⅱf型的致病突变,该碱基位点杂合改变为新发突变.目前国内外已报道的3例CDG-Ⅱf型患儿加本文1例共4例患儿,可表现为神经发育落后、异常面容、小头畸形、肌张力降低、血小板减少、免疫功能障碍等.结论 神经发育落后患儿伴有肌张力低下,异常面容,免疫功能、血小板、凝血功能等多系统功能异常的患儿,应高度怀疑SLC35A1-CDG,此类患儿多数生长发育迟缓,预后不良,通过基因测序可早期诊断.
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RANTES基因启动子G-403A多态性与2型糖尿病肾病的关系
据报道,糖尿病(DM)状态化学趋化信号的上调和单核细胞(MO)向肾脏聚集及分化为巨噬细胞(MФ)与糖尿病肾病(DN)发生发展有关[1,2].正常T细胞活化后表达和分泌的调节蛋白(RANTES)是化学趋化亚族趋化因子,主要作用于MO/MФ及某些T淋巴细胞亚群.RANTES基因缺陷大鼠可减少T细胞和MO向炎症部位的聚集[3].RANTES基因启动子-403位点的G碱基突变为A碱基,影响RANTES基因转录和表达水平,研究发现携带RANTESG-403A的基因型与多种疾病的病情进展有关[4-6].这些发现提示RANTES G-403A多态在炎症过程中起重要作用.我们选择湖南省汉族人为研究对象,探讨RANTES基因启动子G-403A多态性与DN的关系.