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中国长春地区汉族人转化生长因子β1(TGF-β1) 基因-509C/T多态性与IgA肾病易感性的相关性
原发性IgA肾病作为一种常见的原发性肾小球疾病,在我国占据着很大比例.迄今确切的发病机制尚未完全阐明,遗传因素与原发性IgA肾病发病间的关系一直是肾病学者们思考的问题.转化生长因子-β1(TGF-β1)作为一种具有多种生物学活性的细胞因子,近年来持续受到各科学者的广泛关注.TGF-β1在抑制生长、促进细胞分化、调节细胞外基质代谢及促间质纤维化等方面起重要作用,同时也是重要的致肾小球硬化和肾间质纤维化的细胞因子之一[1].TGF-β1基因定位于19q13.1-3,TGF-β1基因-509C/T单核苷酸多态性位于基因上游转录起始点前509 bp[2],作为遗传变异的一种普遍形式,单核苷酸多态性与很多疾病的发生、发展密切相关.本文以我国常见的原发性IgA肾病为研究对象,检测了其TGF-β1基因-509C/T的多态性,并与同一地区健康汉族人进行比较,以探讨TGF-β1基因-509C/T的多态性与IgA肾病发生发展的相互关系.
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高同型半胱氨酸血症与脑卒中研究进展
同型半胱氨酸（homocysteine，Hcy）是甲硫氨酸代谢过程中产生的一种含硫氨基酸，其水平主要取决于日常饮食和维生素摄入状况。当叶酸和／或维生素 B12缺乏会导致高同型半胱氨酸血症（hyperhomocysteinemia，HHcy），也可由遗传变异引起，如 MTHFRC677T 编码的 N5，N10－亚甲基四氢叶酸还原酶基因突变。已被证实 HHcy 与许多疾病相关，如在心血管疾病、神经退行性疾病、糖尿病、肾功能不全、骨质疏松、肿瘤等疾病的发生或发展中可观察到升高的 Hcy 水平［1］。来自实验室及临床的诸多证据表明 HHcy 对心血管和神经系统有直接毒害作用。尽管 HHcy 在多种病理生理条件下被关注，但 HHcy 对脑卒中的影响仍缺乏共识，降低 Hcy 水平对脑卒中的临床意义观点不一。本文将对相关文献进行综述，了解 HHcy 与脑卒中的相关性。
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染色体9p21遗传变异与中国汉族人群冠心病的关联性
目的:分析染色体9p21区域rs2383206和rs2383207位点遗传变异与中国汉族人群冠心病的关联性,探讨染色体9p21区域是否为冠心病的易感区域.方法:采用病例-对照方法,选择580例冠心病患者为病例组,选择性别、年龄与其匹配的非心血管病患者或正常人539例为对照组.采用Sequenom MassARRAY飞行时间质谱法对受试者rs2383206和rs2383207位点进行基因分型.结果:2组受试者吸烟史、腰臀比(WHR)、高血压病史、糖尿病史、收缩压(SBP)、舒张压(DBP)和总胆固醇(TC)水平比较差异均有统计学意义(P＜0.05),病例组冠心病患者吸烟史、高血压病史和糖尿病史所占比例明显高于对照组(P＜0.01),WHR、SBP、DBP和TC水平也明显高于对照组(P＜0.05或P＜0.01).rs2383206位点的基因型在病例组和对照组人群中频数比较差异无统计学意义(x2 =4.623,P＞0.05);rs2383207位点基因型在病例组和对照组人群中频数比较差异有统计学意义(x2=8.936,P＜0.05),其中AA基因型在病例组频数(8.3％)分布明显低于对照组(13.6％)(P＜0.05).结论:吸烟、WHR、高血压病史、糖尿病史、SBP、DBP和TC可能是冠心病的危险因素;9p21区域rs2383207位点AA基因型可能是冠心病的保护基因型.
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SNPs与冠心病的相关性研究
冠心病(CHD)是当今世界影响人类健康的主要慢性病之一,随着人口老龄化的发展,发病率和死亡率仍逐年上升[1].CHD是由环境因素和遗传因素共同作用所导致的,其中遗传因素在疾病的发展中可能起着关键性的作用,因此,CHD的发病与人类的基因、遗传因素以及基因的多态性相关.1 SNPs与人类疾病的相关性单核苷酸多态性(SNPs)是指在人类的一条DNA等位序列上,由于单个核苷酸的缺失、插入或被替代为其他核苷酸,从而引起的差异,属于生物体基因组中的一种可遗传的变异,在所有的遗传多态性中,大约90％以上的变异是由此导致的[2].人类的基因序列上大致有1 500万个SNPs位点,其中平均300 ～ 600 bp就存在一个碱基的突变[3].SNPs主要是由单个核苷酸在基因水平上的变异从而引起DNA序列的多态性,并且突变基因频率＞1％的SNPs在基因编码区和非编码区中都存在.据DNA元素百科全书的项目表明,至少有80％的人类基因组在生物化学方面有表达作用[4],并且发现在蛋白质编码区外,将近90％的SNPs与人类疾病具有一定的相关性.近年来,研究揭示了与人类CHD相关的大量基因组区域或易感基因,先后发现了50个CHD的易感位点[5].对导致CHD的许多不同的遗传因素提供了深入的见解,为遗传学研究提供了重要的理论依据,也为进一步揭示其发病机制奠定了基础.
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重庆地区中蜂囊状幼虫病病毒型特异性遗传变异分析
目的 分析重庆地区中蜂囊状幼虫病病毒(Chinese sacbrood virus,CSBV)的遗传多样性.方法 采用RT-PCR法从重庆地区中蜂囊状幼虫病病死幼虫体内扩增CSBV的2段结构蛋白和1段非结构蛋白的编码序列,并克隆至pMD18-T载体进行双向序列测定,所得序列在NCBI上进行BLAST搜索,以进行同源性分析；应用ClustalW2软件进行多序列比对分析；应用SNAP软件计算同义替换率(Synonymous substitution rate,dS)、非同义替换率(Nonsynonymous substitution rate,dN)及其比值(dS/dN);采用MEGA 4软件的邻接法(Neighbor-joining)中的大可能性算法(Maximum likelihood method)构建系统进化树.结果 CSBV重庆分离株片段SBl-2、SB6-7和SB14-15的序列同源性高于99.06％,序列保守,3个片段序列均只发现少数点变异碱基,属于亚洲型,与东方蜜蜂广州分离株和韩国分离株的亲缘关系近；CSBV重庆分离株存在特有的核苷酸和氨基酸位点,且与亚洲型分离株存在广泛的共有基序；亚洲型分离株的替换率高于欧洲型分离株.结论 CSBV分离株存在型特异的遗传变异规律.
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组胺脱羧酶基因多态性与原发性高血压的关系
高血压研究的主要任务是阐明血压升高的遗传机制,也就是寻找高血压相关基因.对这一研究的突破不仅能使我们更好地理解高血压发生的病理生理,还能指导原发性高血压的早期诊断、预防和治疗.目前已经发现了很多高血压相关基因,但结果不一.人群的遗传变异、不同种群高血压产生原因的个体差异以及对血压这一表型测定的不精确性,都可能是导致产生不同结果的原因.
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原发性肝癌染色体8p、16q遗传变异的研究
目的:分析人肝癌(HCC)组织中染色体8p、16q部分基因及染色体片段的遗传变异及与临床病理关系,初步筛选HCC相关的抑癌基因.方法:应用聚合酶链反应-变性聚丙烯酰胺凝胶-银染法分析45例HCC组织标本中染色体8p和16q的杂合性丢失(LOH)及微卫星不稳定性(MSI).结果:发生LOH的总频率为68.89%(31/45),其中D16S511位点的发生LOH率高为53.33%(24/45),其次是D8S261(39.02%,16/41)和D8S499(34.88%,15/43).MSI出现的总频率为11.11%(5/45),出现在三个微卫星位点(D8S261、D8S499及D16S511)上.结论:染色体16q23、8p22-21.3及8p12区域的LOH发生频率高,其可能存在与HCC发生发展相关的新的抑癌基因,特定位点的遗传变异可能与HBV感染、临床病理恶性程度等预后因素相关.
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白三烯生物合成通路遗传变异与缺血性脑卒中相关性研究进展
缺血性脑卒中(IS)是一种复杂的多因素、多基因遗传变异性疾病,遗传因素在其发病机制中起重要作用.动脉粥样硬化作为一种慢性炎症性疾病,是缺血性脑卒中的主要病因.白三(LT)烯生物合成通路参与炎症反应,引发血管炎症和动脉粥样硬化的形成.本文对白三烯生物合成通路遗传变异影响、缺血性脑卒中发病的分子机制及两者的相关性研究做一综述.
关键词： 缺血性脑卒中(IS) 白三烯(LT) 遗传变异 相关性研究 -
易性癖1例报告及分析
易性癖是指向往异性生活方式,伴有对自己性解剖特征的厌恶感和不适感,希望进行外科手术或激素使自己尽可能的与所偏爱的性别一致,要求转换性别的欲望至少存在两年以上.排除了遗传变异、性染色体异常及雌雄间体,排除其他的精神障碍.现将我院收治的1例患者报道如下.
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上呼吸道感染疾病的症状诊断与合理的药物治疗
上呼吸道感染((URTI或URI))是在一般人群中常见的急性疾病.症状往往涉及呼吸系统的一个或多个部位,包括鼻窦,鼻腔,咽和喉.这将导致相当数量的患者去初级保健提供者和急诊室就诊,并终由当地的药店提供处方药或非处方药缓解症状.药师应熟悉这些感染的病因和潜在的治疗方法.普通感冒与"感冒"相关的症状,实际上是由至少有五种主要的呼吸道病毒引起的,包括鼻病毒和冠状病毒.鼻病毒至少导致成人患者的50％感染,包括至少100个类型和一个亚型.遗传变异限制了疫苗开发的能力,以及人体对"普通感冒"获得免疫力的能力.
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霍乱弧菌的越冬机制研究进展
霍乱弧菌至今已引起7次世界性的霍乱大流行,人们对于霍乱弧菌生物学特性的了解取得了很大进展,但关于霍乱弧菌在疫区流行间歇期的季节性生存(即越冬机制)问题仍远未清楚.霍乱弧菌的生理和生化变化、遗传变异的理论尚无法解释其越冬生存,而霍乱弧菌复杂的微生态学特征、水环境宿主等方面为理解霍乱弧菌越冬过程和新出现霍乱的流行机制提供新的思路.本文就温度对霍乱弧菌的生存影响、霍乱弧菌的遗传变异、水生态学及环境宿主(包括浮游生物、自由生活阿米巴原虫包囊内)方面阐述霍乱弧菌的越冬机制.
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异常白蛋白血症的分子研究进展
已命名的异常白蛋白血症目前已超过了100多种,大约存在60多个位点的氨基酸突变(定期更新的网址http://www.albumin.org/).异常白蛋白的发生率大约为1:3 000～1:10 000,我院的调查结果发病率为1/6 050[1].根据DNA突变发生在白蛋白整条链上的位置不同分3大类:(1)突变位点在前肽链或附近,使白蛋白原不能转变成白蛋白(白蛋白原氨基端的6个氨基酸残基突变后不被信号肽酶识别);(2)DNA单点突变位点位于氨基酸残基313～382之间;(3)突变位点在多肽链C末端.
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代谢综合征发病机制的探讨
目前的研究显示,遗传变异、肥胖、胰岛素拮抗激素水平的变化、药物、炎症以及低出生体重均可导致代谢综合征(metabolic syndrome,MS).在研讨会上,北京大学人民医院纪立农教授介绍了对MS发病机制的认识.
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湖北钉螺种群内AFLP分子标记遗传变异分析
目的探讨湖北钉螺种群内的遗传变异及其程度.方法采用扩增片段长度多态性(AFLP)分子标记技术对9省(云南、四川、广西、福建、湖南、湖北、江西、安徽、江苏)13种群湖北钉螺基因组DNA进行扩增,分析钉螺种群内的遗传变异.结果湖北钉螺13种群AFLP扩增片段位点数为403～472,江西星子钉螺种群内遗传多样性较高,多态位点频率、Nei's基因多样性指数和Shannon's信息指数分别为93.2%、0.345和0.510,而广西宜州钉螺种群内遗传多样性较低,以上3指标分别为55.8%、0.191和0.287;广西宜州钉螺种群内的相似性较大,相似系数(中位数)为0.904,而江苏丹徒钉螺种群内的相似性较低,相似系数(中位数)为0.748;13种群内的遗传变异差异显著(P＜0.01).结论我国广泛分布的湖北钉螺,种群内存在一定程度的遗传变异.不同地区湖北钉螺种群内遗传变异程度不同,有的相差较大.
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子一代实验室钉螺细胞色素c氧化酶Ⅰ、细胞色素b基因序列分析
目的了解钉螺子一代(F1)实验室钉螺群(湖北钉螺湖北亚种)内的遗传变异.方法实验室饲养的F1钉螺,单个抽提基因组DNA,PCR扩增细胞色素c氧化酶Ⅰ(COI)、细胞色素b(Cytb)基因并测序,用GENETYX-MACver.9软件进行同源排序、DNA和氨基酸序列分析,同时与GenBank相同基因序列比较.结果实验室螺群内,COI基因差异为12.2%,94个氨基酸发生变化.Cytb基因差异6.4%,有25个氨基酸发生变化.湖北亚种与滇川亚种COI基因序列差异率为13.5%.与GenBank中湖北钉螺滇川亚种Cytb基因序列比较,差异为13.6%,在203个氨基酸中6个氨基酸发生变化.结论F1实验室钉螺群内核苷酸与氨基酸序列均发生变异.
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应用同工酶技术研究我国湖北钉螺(腹足纲:麂眼螺超科:圆口螺科)不稳定螺群内的遗传变异(续)
[目的]研究我国湖北钉螺(腹足纲:麂眼螺超科:圆口螺科)不稳定螺群内的遗传变异及作为不稳定螺群在哈笛-温伯期望值中的变化.[方法]同工酶用微量水平淀粉胶电泳进行研究.两次采集于同一地点的同工酶数据按实验时间平均分成4部分,每个部分研究34个位点,每个位点研究72～180个钉螺.[结果]4个部分每个位点的等位基因数平均1.5～1.9个;多态位点率38.2%～17.6%.平均杂合率低:0.033～0.049与哈笛-温伯期望值差异无显著性意义.去除第一部分的10个位点11个等位基因,多态位点数从19个降至10个.5个有数量较多等位基因的位点与哈笛-温伯期望值有显著性差异.Nei氏与Wright氏的遗传距离分别为0.003±0.001和0.054±0.006.[结论]①在早期实验,初的结果记录中有差错.此差错不能重复.②早期的差错发生在记录位点和较少出现的交互位点上.但这些差错对遗传距离无影响.③Wright氏遗传距离用于相对比较接近的群体的研究.4个部分间,Nei氏遗传距离差异无显著性意义;两次采集的螺群Wright氏遗传距离差异具有显著性意义.原因是长江每年的洪水引起不同地点的钉螺混杂.④主要多态位点不在哈笛-温伯期望值中,与预期的不稳定螺群模型一致.⑤研究种群遗传学和寻找相对较少的等位基因时,个体数量必须达到25个或25个以上.
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表位疫苗:疫苗研制新策略
人类通过接种疫苗已控制了许多重大感染性疾病并且消灭了天花,这是有史以来,人类征服疾病为辉煌的成绩.传统疫苗是将病原体灭活或减毒而制成的,但存在生物危害性和遗传变异致使原疫苗效力丧失等问题.表位疫苗(epitope vaccine)是用抗原表位制备的疫苗,包括合成肽疫苗(synthetic peptide vaccine)、重组表位疫苗(recombinant epitope-based vaccine)及表位核酸疫苗(epitope DNA vaccine,minigenes/epigenes),是目前研制感染性疾病和恶性肿瘤疫苗的方向.
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三地钉螺线粒体DNA两个分子的遗传变异研究
目的 分析广西、云南、湖南三地钉螺线粒体DNA细胞色素C氧化酶Ⅰ(CO1)基因和细胞色素氧化酶b(Cytb)基因的遗传变异.方法 收集广西靖西、云南洱源和湖南岳阳三地钉螺,提取其基因组DNA,PCR法扩增线粒体CO1和Cytb基因并测序.用Clustal W(1.82)软件对所测基因序列排序,用MEGA(3.1)计算其碱基组成、转换及颠换;用Kimura双参数法计算遗传距离,用非加权组平均法(UPGMA)和大简约法(MP)构建系统发生树.结果 PCR扩增获得CO1和Cytb基因大小分别约为700及600 bp(含两侧引物).三地钉螺CO1基因中共检测到106个多态性位点,约占核苷酸总数的15.9%,Cytb基因中多态性位点为165个,约占核苷酸总数的28.5%.广西靖西与湖南岳阳、广西靖西与云南洱源的钉螺CO1基因和Cytb基因的遗传距离分别为0.051、0.158和0.031、0.405.根据CO1和Cytb的基因序列,用上述两种方法构建的系统发生树结果均一致.广西靖西与湖南岳阳的钉螺同属一个支系,云南洱源钉螺单独形成另一支系.结论 广西、湖南和云南的钉螺CO1和Cytb基因总体上具有相对丰富的多态性.
关键词： 钉螺 细胞色素c氧化酶Ⅰ基因 细胞色素氧化酶b基因 遗传变异 -
日本血吸虫线粒体DNA两个分子的遗传变异
目的从线粒体DNA的2个分子,探讨我国日本血吸虫的遗传变异.方法试剂盒抽提基因组总DNA后,以特异性引物对线粒体还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NADH)脱氢酶1(ND1)和细胞色素c氧化酶Ⅰ(COI)进行PCR扩增,将PCR产物分别测序,并以生物信息学方法加以比较,构建系统进化树.结果序列系统进化树显示日本血吸虫中国大陆株与中国台湾株之间差异较大,在树状图中可归为2类;中国大陆山区型地域株,即云南洱源和四川天全在树状图中归为1类;中国大陆湖沼洲滩型地域株,即湖南岳阳、江西新建和安徽贵池3个地域株在树状图中处于并列位置;湖北省境内不同地域株在树状图中归为1类.结论我国各地日本血吸虫存在不同程度的遗传变异,各地域株间亲缘关系密切,存在共同的起源.
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2型糖尿病的遗传学研究:2008年现实评价
2型糖尿病的遗传学领域中正在进行一场真正的革命.不久以前,这方面的综述通常会先介绍糖尿病遗传的流行病学基础,继而谈谈方法 学问题,再重点讨论罕见的单基因糖尿病,后才提到肯定与2型糖尿病有关的一些遗传变异作为对未来的展望.而如今,数量激增的全基因组关联研究(GWAS)正在发现越米越多影响人类复杂性状的位点.本文着重阐述2型糖尿病遗传学研究的现状,并从实际应用的角度试述临床医师可能获益之处.
