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新疆家犬体内存在细粒棘球绦虫G1(羊)株和G6(骆驼)株的分子证据
目的收集家犬体内的细粒棘球绦虫成虫以建立新疆棘球蚴病的分子流行病学资料. 方法对家犬体内成虫细胞色素c氧化酶Ⅰ基因序列进行测定以确定其亚株型. 结果所有感染犬体内成虫的基因型为G1型.特别是1条家犬体内发现存在细粒棘球绦虫G1(羊)株和G6(骆驼)株混合感染的情况. 结论在新疆阻断羊犬和羊骆驼循环圈是预防棘球蚴病的重要措施.作为终末宿主的家犬与人类的感染密切相关,对感染犬的管理应该加强.
关键词： 细粒棘球绦虫 细胞色素c氧化酶Ⅰ基因 棘球蚴病 -
DNA条形码技术在鼠疫疫区啮齿动物残体鉴定中的应用
目的 应用DNA条形码技术对陕西省鼠疫疫区啮齿动物残体进行宿主分类鉴定,分析DNA条形码技术鉴定方法的可行性.方法 收集外形经形态学鉴定的7个鼠种8个不同部位62份残体样本,提取组织中DNA,经PCR、电泳、测序及结果比对等步骤,分析线粒体细胞色素C氧化酶Ⅰ亚基(COI)基因序列.将COI基因序列利用美国国家生物技术信息中心(NCBI)运行BLAST程序进行序列同源性比较;利用邻接(NJ)法构建COI基因序列的NJ系统树.结果 除3份毛发外,足部、尾巴、皮毛、肌肉、肋骨、耳朵、眼球均扩增出COI基因,扩增产物片段的大小与预期片段的大小相近(700 bp),且条带单一.DNA测序获得了59份残体标本的COI基因,其中长爪沙鼠、黑线仓鼠、子午沙鼠、三趾跳鼠、小毛足鼠、褐家鼠、五趾跳鼠序列同源性比较显示,COI基因与对应宿主所对应的基因均具有高度的同源性(99.0％,98.1％,99.8％,98.9％,99.5％,99.1％,98.3％).NJ法显示,59份残体标本的COI基因构建出7个序列的NJ系统树,同鼠种不同标本聚为一类.结论 DNA条形码技术能够对鼠疫疫区啮齿动物残体进行物种分类鉴定,鉴定结果可靠.
关键词： DNA条形码 细胞色素c氧化酶Ⅰ基因 宿主残体 鉴定 -
三地钉螺线粒体DNA两个分子的遗传变异研究
目的 分析广西、云南、湖南三地钉螺线粒体DNA细胞色素C氧化酶Ⅰ(CO1)基因和细胞色素氧化酶b(Cytb)基因的遗传变异.方法 收集广西靖西、云南洱源和湖南岳阳三地钉螺,提取其基因组DNA,PCR法扩增线粒体CO1和Cytb基因并测序.用Clustal W(1.82)软件对所测基因序列排序,用MEGA(3.1)计算其碱基组成、转换及颠换;用Kimura双参数法计算遗传距离,用非加权组平均法(UPGMA)和大简约法(MP)构建系统发生树.结果 PCR扩增获得CO1和Cytb基因大小分别约为700及600 bp(含两侧引物).三地钉螺CO1基因中共检测到106个多态性位点,约占核苷酸总数的15.9%,Cytb基因中多态性位点为165个,约占核苷酸总数的28.5%.广西靖西与湖南岳阳、广西靖西与云南洱源的钉螺CO1基因和Cytb基因的遗传距离分别为0.051、0.158和0.031、0.405.根据CO1和Cytb的基因序列,用上述两种方法构建的系统发生树结果均一致.广西靖西与湖南岳阳的钉螺同属一个支系,云南洱源钉螺单独形成另一支系.结论 广西、湖南和云南的钉螺CO1和Cytb基因总体上具有相对丰富的多态性.
关键词： 钉螺 细胞色素c氧化酶Ⅰ基因 细胞色素氧化酶b基因 遗传变异
