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宿主残体文献资料
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DNA条形码技术在鼠疫疫区啮齿动物残体鉴定中的应用
目的 应用DNA条形码技术对陕西省鼠疫疫区啮齿动物残体进行宿主分类鉴定,分析DNA条形码技术鉴定方法的可行性.方法 收集外形经形态学鉴定的7个鼠种8个不同部位62份残体样本,提取组织中DNA,经PCR、电泳、测序及结果比对等步骤,分析线粒体细胞色素C氧化酶Ⅰ亚基(COI)基因序列.将COI基因序列利用美国国家生物技术信息中心(NCBI)运行BLAST程序进行序列同源性比较;利用邻接(NJ)法构建COI基因序列的NJ系统树.结果 除3份毛发外,足部、尾巴、皮毛、肌肉、肋骨、耳朵、眼球均扩增出COI基因,扩增产物片段的大小与预期片段的大小相近(700 bp),且条带单一.DNA测序获得了59份残体标本的COI基因,其中长爪沙鼠、黑线仓鼠、子午沙鼠、三趾跳鼠、小毛足鼠、褐家鼠、五趾跳鼠序列同源性比较显示,COI基因与对应宿主所对应的基因均具有高度的同源性(99.0％,98.1％,99.8％,98.9％,99.5％,99.1％,98.3％).NJ法显示,59份残体标本的COI基因构建出7个序列的NJ系统树,同鼠种不同标本聚为一类.结论 DNA条形码技术能够对鼠疫疫区啮齿动物残体进行物种分类鉴定,鉴定结果可靠.
关键词： DNA条形码 细胞色素c氧化酶Ⅰ基因 宿主残体 鉴定
