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肿瘤化疗与药物代谢酶遗传多态性的关系
遗传药理学(Pharmacogenetics)是研究机体遗传变异引起的药物反应异常的一门新兴学科.遗传药理学研究表明,遗传是药物在人体内的处置与机体对之产生反应的决定因素,是产生药物代谢与反应个体差异的重要原因[1].具体表现为药物代谢酶和(或)受体表达的改变,而药物代谢酶的多态性似乎比受体多态性更常见[2].
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BamH Ⅰ酶切位点变异区域性分布在HCV 1b型5'非编码区的研究
目的研究丙型肝炎病毒(HCV)1b型5'非编码区BamHⅠ酶切位点变异的区域性分布.方法对来自中国4个不同地区的64例HCV 1b基因型血清样品进行5'-NCR扩增后,分别用Mbo Ⅰ、BamH Ⅰ限制性内切酶酶切分析,比较不同地区变异株分布的差异.结果测序证实中国HCV 1b基因型在117位有BamH Ⅰ酶切位点.64例血清样品中,BamH Ⅰ单切点变异株,华南7例(28%),东北1例(10%),华北1例(11.1%),西南0例;Mbo Ⅰ及BamHⅠ切点均无的变异株,西南8例(40%),华南2例(4%),东北1例(10%),华北0例.结论证实HCV 1b型BamH Ⅰ变异具有区域性分布特点,华南地区和西南地区变异较多,华北和东北变异较少.而这一变异是否与干扰素治疗耐药有关,尚有待于进一步研究.
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乳本脱氢酶遗传变异的筛选方法
目的:建立人乳酸脱氢酶亚单位遗传变异的筛选方法.方法:在Paragon电泳仪上用涤纶膜作载体测定血清、红细胞中的乳酸脱氢酶同工酶,并计算亚单位比值H/M.结果:血清H/M比值受各种疾病影响,而红细胞H州比值主要与遗传有关.结论:红细胞H/M比值可作为乳酸脱氢酶遗传变异的初步筛选标准.
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分子遗传学数据分析和处理平台的设计与实现
目的 开发一个在高性能计算机的Linux环境下运行,基于B/S模式的分子遗传学数据分析与处理平台.方法 以Apache HTTP服务器为平台的WEB服务器,采用Perl语言整合许多遗传学数据分析软件和工具包,针对不同的SNPs变异数据,以提示方式简化数据输入格式和参数设置,经平台处理的结果以表格、文本或图像格式输出.结果 该平台实现了连锁不平衡的计算和绘制、挑选标签SNP和疾病对照设计或传递不平衡设计的关联分析,以及对一些群体遗传数据的估计等功能,操作简单,数据分析速度快.结论 该平台作为一个整合的遗传学研究辅助工具,克服了当前遗传分析软件或工具包在操作使用方面的不足,为遗传学研究者提供方便.目前该平台正处于测试阶级,运行状态良好.
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生物的生态幅波动与遗传变异规律分析
不同生物对一个环境因子有不同的生态幅,同一生物在不同生长期对同一环境因子有不同的生态幅.笔者基于相关研究,对生物的生态幅波动和遗传变异规律有一些新的看法.
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早发冠心病与载脂蛋白E基因多态性关联分析
目的载脂蛋白E(Apolipoprotoin E, apoE)作为脂蛋白的配体和结构与功能蛋白对血脂代谢起重要调节作用.不同载脂蛋白E基因型个体,其高脂血症与冠心病(CAD)等疾病的易患性存在明显差异.我们采用分子生物学方法,检测了一组正常人与早发CAD患者的apoE基因型,旨在探讨apoE基因遗传变异与CAD早期发生的关联作用.
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表面活性蛋白A基因单核苷酸多态性与成年女性尿路感染易感性的关系
在反复发作的尿路感染(UTI)患者中,只有部分患者存在明显的易感或诱发因素.目前尿路上皮细胞的天然免疫功能在UTI中的作用逐渐引起了关注[1].表面活性蛋白A(SP-A)是早发现于肺组织的一种天然免疫分子,在肺部的宿主免疫和炎性反应调节方面起着重要作用;其基因的遗传变异导致了人群对多种肺部疾病不同的易感性[2].
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应用比较基因组杂交技术研究外阴鳞癌组织的遗传变异
背景与目的:外阴鳞状细胞癌约占女性外阴恶性肿瘤的80%~90%.但有关其遗传学研究却不多,本研究采用比较基因组杂交(comparative genomichybridization,CGH)技术分析外阴鳞癌组织的遗传变异,了解其遗传改变的特征.以期发现外阴鳞癌相关基因.方法:应用CGH技术检测21例外阴鳞癌基因组的不平衡性即其DNA的扩增或丢失.结果:外阴鳞癌常见的扩增染色体是3q,8q,12q.常见的丢失染色体是4p和3p.结论:外阴鳞癌细胞中存在多条染色体拷贝数的改变,由此引起相应癌基因的扩增和抑癌基因的丢失可能参与了外阴鳞癌的发生、发展.
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鼻咽癌分子遗传学研究进展
探讨鼻咽癌(nasopharyngeal carcinoma,NPC)发生发展的分子遗传学事件及其变异对 NPC临床病理变化的影响.对原发性 NPC进行杂合性缺失(loss of heterozygosity, LOH)和比较基因组杂交(comparative genomic hybridization CGH)分析,观察到 NPC发生高频率 LOH的染色体主要位于 1p、 3p、 9p、 9q、 11q、 13q、 14q、 16q和 19p, 并定位了相应的 LOH小丢失区,并发现特定区域 LOH与鼻咽癌临床病理有密切关系 ; LOH量化值高(FAL值)并伴随病人血清高滴度 EBV/EA和 EBV/VCA抗体的 NPC, 多表现为 T3+ T4期、进展期 TNM/III+ IV期和远处淋巴结转移.NPC发生遗传物质扩增(gain)的染色体主要位于 1q、 2q、 3q、 6p、 6q、 7q11.2、 8q、 11q13、 12、 15q、 17q 和 20q, 表明在这些区域可能存在与 NPC发生发展相关的癌基因(oncogenes)活化,且 1q, 8q, 18q的扩增和 9p的丢失与晚期 NPC有密切关系.正常鼻咽上皮和鼻咽上皮不典型增生病变,3p区 LOH的检出率分别高达 74% 和 75%,表明 3p区缺失是 NPC发生过程中极早期分子事件.连锁分析表明 HLA基因和细胞色素 P4502E1酶基因可能是NPC的遗传易感基因,并定位了新的潜在 NPC易感基因位点.应用 cDNA微阵列技术,发现细胞周期蛋白、抗凋亡因子、某些癌基因 /肿瘤抑制基因、生长促进因子、肿瘤发生生长因子和肿瘤血管生长因子等在 NPC发生上调控表达 ; 不同临床分期的 NPC与正常鼻咽上皮间均存在差异表达.NPC发生遗传不稳定性(缺失和扩增)是常见的分子事件,遗传变异在 NPC的发生、发展过程中起重要作用.通过 LOH、 CGH、连锁分析和微阵列分析确定 NPC特异的分子标记物,能提供用于 NPC早期诊断和预后判断的分子标记物,并将使我们建立独立于传统临床分期和分型的新的 NPC分子分期和分子分型成为可能.
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基于多组学平台的帕金森遗传变异研究进展
“组学”是一种整体的研究思路,能提供一种非偏倚方法,鉴定涉及疾病的生物化学路径,终,旨在确定未来值得靶向研究的一系列标志物。它包括基因组学﹑转录组学﹑蛋白组学及代谢组学。本文就近年来多组学协同发展及其在帕金森病的遗传变异研究中的作用进行综述。
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遗传变异对氯吡咯雷疗效的影响
急性冠脉综合征的病理生理基础已经基本明确:血小板粘附活化,然后聚集形成血栓,从而导致血管闭塞.但是,在接受血小板抑制剂治疗的人群中,血管事件复发的绝对风险仍然很高.
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GRIK1 rs455804遗传变异与肝癌发病风险的关联性分析
目的 分析谷氨酸受体编码基因GRIK1的rs455804变异的单独作用和/或基因-环境交互作用是否影响肝癌发病风险.方法 在623例肝癌病例和623例对照中,应用多因素logistic回归模型分析rs455804与肝癌风险的关联性.应用交互作用超额相对危险度、交互作用归因比、交互作用指数评价rs455804与肝癌主要危险因素的交互作用.结果 rs455804各基因型在病例组和对照组的分布差异无统计学意义(P>0.05).经多因素logistic回归分析,在各遗传模型下,rs455804均未表现出与肝癌风险的统计学关联.研究亦未观察到有统计学意义的基因-环境交互作用.结论 rs455804与肝癌发病风险无关,GRIK1基因的肝癌致病遗传变异尚有待研究进一步阐明.
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基于细胞色素b序列的罗非鱼选育群体遗传变异分析
对吉富品系尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)不同世代选育群体细胞色素b序列进行测定和分析,45个样本经重排比较后获得1 064bp的同源序列.共检测到161个变异位点,占分析位点数的15.13%.同源序列中多态位点比例随着选育世代数的累进,呈现出降低的趋势,F0、F6、F7、F8、F9代分别为14.38%、13.47%、13.38%、10.24%、9.49%.核苷酸多样性指数也呈现出同样的降低趋势,Fo、F6、F7、F8、F9代分别为0.065 47、0.049 05、0.048 81、0.036 19、0.033 81.本研究结果表明,新吉富罗非鱼仍保持了一定程度的遗传变异水平,新吉富罗非鱼逐步趋于纯化.
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miR -146 a遗传变异与胃癌临床病理特征及预后的相关性
目的:探讨miR-146a遗传变异(rs2910164)与胃癌临床病理特征及预后的关系。方法选择98例接受奥沙利铂联合氟尿嘧啶类药物术后辅助化疗的Ⅰ~Ⅲ期胃癌患者,分析rs2910164遗传变异与患者临床病理特征及生存的相关性。结果全组患者2年无病生存率为63%,3年总生存率为73.4%。 GC+CC基因型患者淋巴结转移发生率低于GG基因型,但差异无统计学意义(P=0.059)。有或无淋巴结转移的患者3年总生存率分别为89.3%和63.7%(P=0.015),Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ期患者3年总生存率分别为100.0%、88.6%和56.9%(P=0.018)。脉管瘤栓(P=0.092)、神经受侵(P=0.071)与OS无明显相关性。 GC+CC基因型患者的3年总生存率显著高于GG基因型,分别为75.1%和66.7%( P=0.041)。预后多因素分析显示,分化程度( P=0.033,RR=5.116,95%CI 1.145~22.865)和淋巴结状态( P=0.031,RR=6.648,95%CI 1.191~37.118)为总生存的独立影响因素。结论 miR-146a遗传变异可能与胃癌患者淋巴结转移状态及预后相关。
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CYP2C9和VKORC1基因多态性与华法林个体化用药研究进展
华法林是临床上广泛应用的一种口服抗凝药,主要用于预防和治疗血栓性疾病.但其有效治疗范围较窄且不同个体之间维持剂量存在较大差异性,使其在临床应用比较棘手.尤其是在使用华法林抗凝治疗初期,极易导致严重的出血并发症.但近年来遗传药理学的发展,提高了基于遗传变异的个体化用药的可能性.
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心肌细胞RyR2和L型钙通道的基因变异与室性心律失常和心源性猝死的相关性
目的 探讨心肌细胞RyR2和L型钙通道的基因变异与室性心律失常和心源性猝死的相关性.方法 回顾分析2010年1月-2012年12月在我院就诊的慢性心力衰竭患者622例的临床资料,并选取同一时期体检中心体检的健康人群516例作为对照组,门诊或者电话随访记录慢性心力衰竭患者的死亡为终点,通过候选基因分析可能具有相关功能的4个基因变异,rs41315858 (G1885E)、rs3766871 (G1886S)、rs790896(G>A)和rs723672 (T>C),采用Logestic、Cox回归分析对4个候选基因变异进行相关性研究.结果 入选622例慢性心力衰竭患者和516例对照组,基因分析结果显示RyR2上的基因变异rs376687lA等位基因携带可以增加慢性心力衰竭患者发生室性心律失常的风险性;校正可能与该疾病相关的危险因素后,rs376687lA等位基因携带会增加心源性死亡和心源性猝死的风险,RyR2上的基因变异rs790896A等位基因携带可以降低心源性猝死风险.结论 RyR2上的基因变异rs376687lA是室性心律失常和心源性猝死的遗传学预测因子,而rs790896A等位基因是慢性心力衰竭患者的保护因子,可降低室性心律失常和心源性猝死的风险.
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心脏NOS1AP基因常见遗传变异与QTc间期及心源性猝死
心肌细胞复极化延长与普通人群中心血管疾病发病率与死亡率的增高密切相关[1].长QT综合征易感基因突变能显著增加患者心源性猝死(sudden cardiac death,SCD)的风险:[2].SCD是发达国家常见死因之一[3].体表心电图心率校正的QT间期(corrected QT interval,QTc间期)是心律失常发生与SCD研究中常用的指标之一[1].QTc 间期延长是SCD的危险因素之一[4].大约35%的QT间期变异具有遗传性[5].
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主要情绪性疾病与染色体3p21.1关系的研究进展
主要情绪性疾病.是指各种原因引起的以显著而持久的情感或心境改变为主要特征的一组疾病,是在众多因素共同作用下发生的复杂疾病,遗传模式复杂,因此也被称为"多因子疾病",包括双相情感障碍(bipolar disorder,BD)和重症抑郁症(major depressivedisorder,MDD).随着主要情绪性疾病遗传学研究的进展,遗传变异因素在疾病发生、发展中的作用逐渐被揭示出来,双相情感障碍性疾病中遗传因素占约60%~85%[1],MDD中遗传因素约占37%~40%[1-2].本文旨在对主要情绪性疾病与染色体3p21.1遗传变异关系的相关研究进行综述.
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吸虫种株基因差异的研究进展
吸虫分类是一个复杂而又有争议性的话题,长期以来,学者们对吸虫分类进行了各种各样的研究。传统的吸虫分类主要依据虫体形态、中间宿主地理分布、交叉繁殖及生理生化等参数,后来应用了蛋白质和酶学方法。随着分子生物学的技术发展,应用DNA技术研究种株的基因差异,分析种株的遗传变异及分类被认为是一种直接而可靠的方法。本文就近10年来吸虫种株在核糖体RNA、线粒体DNA、随机扩增的多态性DNA分析等方面的研究进展作一综述。
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云南寻甸山羊无形体感染及病原体16SrRNA基因变异分析
目的 分析云南寻甸县山羊无形体感染及病原体16SrRNA基因遗传变异.方法 随机采集农户家养山羊静脉血,提取DNA以巢氏PCR扩增无形体16SrRNA基因并遗传进化分析.结果 山羊无形体16SrRNA基因PCR检测阳性率为23.33%.248bp16SrRNA基因片段进化树分析结果显示当地无形体分为2类流行株,分别占检出菌株的42.86%和35.71%.2类菌株在国内外均有广泛分布.结论 云南寻甸山羊普遍存在无形体感染,进一步开展无形体人群感染调查及相应媒介、宿主十分必要.