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非小细胞肺癌中PUMA基因外显子突变和mRNA表达的分析
肺癌是全球死亡第一位的恶性肿瘤[1,其发生是多步骤、多阶段的病理过程,与调控细胞生存、凋亡、细胞间通信、细胞微环境的改变等相前的基因和基因表型改变有关[2]……
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非小细胞肺癌EGFR基因第19外显子突变的特征分析
吉非替尼(gefitinib)是针对肺癌表皮生长因子受体(epiddermal growth factor receptor,EGFR)设计的肿瘤靶向药物,已使众多的非小细胞肺癌(NSCLC)患者获益,但其疗效与EGFR基因突变相关[1-3].通过EGFR基因第19外显子可筛选gefitinib药物的适合患者进行个体化治疗,提高疗效,减少盲目用药.我们检测了62例NSCLC患者的EGFR基因第19外显子突变,并分析突变DNA特征及氨基酸变化规律.
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分子病理在肿瘤个体化医疗发展中的地位和作用
随着人类基因组研究的进展,人们对疾病的认识也从形态学表象深入到其发生发展的分子水平。同一肿瘤,发生于不同人体,由于受遗传背景和诸多复杂环境因素的影响,尽管终均呈现出恶性的病理学表型及相应的临床表型,但其致病相关的分子机制(基因型)并非完全相同,进而疾病进程也必然不同。临床实践中,这一肿瘤的异质性特征,已逐步得到了广泛证实,而且针对其不同分子分型的临床处理,也已几乎使每位患者受益。例如, HER2基因扩增和蛋白过表达的乳腺癌患者,使用抑制HER2的单克隆抗体--曲妥珠单抗(赫赛汀)治疗,其总生存期明显延长;表皮生长因子受体( EGFR )基因第19或21号外显子突变的肺癌患者,采用酪氨酸激酶抑制剂--吉非替尼(易瑞沙)治疗,效果显著优于化疗。以分子特征制定相应的个体化治疗方案,目前已成为临床常规。
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BAT-26预测散发性大肠癌的复制错误
目的:微卫星不稳定(microsatellite instability MSI)是DNA 复制错误(replication error RER+)的标记,BAT-26系位于错配修复基因hMSH2中的单腺苷酸重复序列位点,曾被报道无需正常对照就可用于预测散发性大肠癌RER状况,我们选择BAT-26并与其他双核苷酸重复序列位点进行比较加以验证与评价.方法:经病理确诊的散发性大肠癌肿瘤组织60例,常规抽提DNA,采用PCR-银染法分析6个(CA)n双碱基重复微卫星序列和BAT-26位点,并用自动荧光DNA序列分析法检测BAT-26;同时以PCR-SSCP法检测RER+病例hMSH2基因5,7,8,1 2,13,15外显子突变;RER+判断依6个(CA)n位点中出现2个或以上MSI为标准.结果:RER+散发性大肠癌占18%(11/60),6例RER+肿瘤检出hMSH2基因突变.含hMSH2基因突变的6例RER+病例中有3例BAT-26不稳定(BAT-26+),44例RER-散发性大肠癌均为BAT-26-.与(CA)n位点结果比较,BAT-26预测RER的阳性符合率为50%,阴性符合率为100%,BAT26+在预测散发性大肠癌RER+特异性为100%,敏感性为50%.PCR-银染和自动荧光DNA序列分析两种方法检测BAT-26 MSI结果一致.结论:单用BAT-26作为预测RER状况的指标尚有缺陷,需结合其他微卫星位点进行综合分析.
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食管癌p53基因第5外显子突变影响因素的病例对照研究
目的:探讨p53基因第5外显子基因突变的影响因素.方法:应用DNA序列分析技术和病例对照研究方法,分析西安和林州食管癌p53基因第5外显子的突变情况及其影响因素.结果:西安和林州p53基因第5外显子突变率分别为14.3%(6/42)和18.6%(8/43),两地突变率比较差异无显著性.西安不经常食用新鲜蔬菜者突变率(37.5%)显著高于经常食用新鲜蔬菜者(8.8%,P<0.05),P=6.20(0.97-39.7).林州食用酸菜者突变率(38.5%)显著高于不食用酸菜者(17.1%,P<0.05),P=5.63(1.10-28.84).其余因素与p53基因第5外显子突变未见显著生差异.结论:在西安经常食用新鲜蔬菜可减少p53基因第5外显子突变发生,在林州经常食用酸菜可增加p53基因第5外显子突变的机率.
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结直肠癌组织中DPC4基因的分子生物学研究
目的:检测DPC4基因在结直肠癌及其癌旁组织中的失活.方法:采用聚合酶链反应(PCR)、单链构象多态性分析(sSCP)检测30例结直肠癌及其癌旁组织的DPC4基因失活情况.结果:30例结直肠癌组织标本中3例出现DPC4基因缺失,4例出现DPC4基因第11位外显子突变;而其癌旁组织则无DPC4基因突变或缺失,有显著性差异.结论:DPC4基因作为一个抑癌基因,参与了结直肠癌的发生.
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霍奇金淋巴瘤IκBα基因第四外显子突变初步分析
霍奇金淋巴瘤(HL)临床治疗进展很快,但其发病机制仍不清楚.已知HL的发生、发展和核因子-κB(NF-κB)活性异常增高有关[1].IκBα是NF-κB主要的抑制因子,IκBα基因异常可能参与HL的发生、发展[2].经典型HL细胞(HRS细胞)中IκBα第四外显子突变文献报道较少,本组以初发未经治疗的HL为研究对象,分析HL中IκBα第4外显子突变的特点、可能造成的蛋白结构异常及其病理意义.
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应用第2代测序技术检测遗传性乳腺癌-卵巢上皮性癌综合征再发子宫浆液性腺癌患者的BRCA1、BRCA2基因突变
卵巢上皮性癌(卵巢癌)是严重危害妇女健康的主要恶性肿瘤之一,病死率高居妇科恶性肿瘤之首。在所有的卵巢癌患者中,高达10%~15%者为遗传性乳腺癌-卵巢癌综合征(hereditary breast/ovarian cancer syndrome ,HBOC)患者[1]。目前已知,HBOC与BRCA1或BRCA2基因的种系突变有关。子宫乳头状浆液性癌(uterine papillary serous carcinoma,UPSC)是1种独特的子宫内膜癌,恶性程度高,生物学行为与卵巢浆液性癌较为相似。UPSC在所有子宫内膜癌中所占比例不到10%,但超过50%的复发及死亡的子宫内膜癌患者为UPSC[2]。已有研究表明,UPSC患者中BRCA1、2基因突变携带率极高[3-4]。本研究中的2例患者为同胞姐妹,姐姐患卵巢浆液性囊腺癌,妹妹先后患乳腺癌、UPSC;本研究应用第2代测序(next generation sequencing, NGS)技术检测患者BRCA1、2基因全外显子突变情况,姐妹的BRCA1基因第20外显子均携带HBOC高风险错义突变p.A1752P;此外,采用常规Sanger测序技术检测到乳腺癌+UPSC患者之女也携带该突变。现将结果报道如下。
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子宫内膜癌组织与张力蛋白同源第10q染色体丢失的磷酸酶基因第5和第7外显子突变的测定
与张力蛋白同源第10q染色体丢失的磷酸酶基因(phosphatase and tensin homology deleted on chromosome ten,PTEN)是近年来被证实的一种抑癌基因,其突变在多种肿瘤的形成和发展中起着重要作用[1],而与子宫内膜癌关系的研究,国外资料尚少.我们采用聚合酶链反应-单链构象多态分析(PCR-SSCP)和序列分析,对34例原发性子宫内膜癌PTEN基因第5和第7外显子的突变进行检测,旨在探讨PTEN基因突变与子宫内膜癌发生的关系.
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角膜格子状营养不良
角膜格子状营养不良(LCD)为常染色体遗传病,目前发现的基因突变除伴有全身病变的LCDⅡ型为第9号染色体-gelsolin基因突变外,余均为第5号染色体长臂3区1带BIGH3基因不同外显子突变所致,包括外显子4、11、12、14等多个不同基因位点的突变.过去LCD通常分为4个不同类型-Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、ⅢA型,目前随着对本病的分子遗传学的深入研究,不断有新的BIGH3基因突变位点被发现,一些突变类型不论在临床特点、组织病理学特征、超微结构上均与传统分型有所不同,有时表现界于两种类型之间,不能归属于任何一型,即中间型,因而向传统分类方法提出了挑战.
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梅尼埃病患者COCH基因第4和5外显子突变研究
COCH(coagulation factor C homology) 基因是在耳蜗、前庭均有表达的基因,位于常染色体14q12-13,含有12个外显子[1].目前发现COCH基因突变均位于第4、5外显子,引起一系列耳蜗、前庭功能障碍症状[2-6].本研究通过DNA直接测序法对梅尼埃病(MD)患者COCH基因第4、5外显子进行检测,探讨该基因第4、5外显子突变与MD的相关性.
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EML4-ALK融合基因与非小细胞肺癌分子靶向治疗的研究现况
肺癌是当今世界常见的恶性肿瘤之一.据统计,每年新发肺癌患者中有大约85%为非小细胞肺癌,而其中又有70%的患者在确诊时已存在局部晚期或远处转移[1].近年来随着对癌症发病机制的深入研究和分子生物学的发展,出现了以特定分子为靶点的抗肿瘤药物.针对EGFR19或21号外显子突变而开发的酪氨酸激酶抑制剂,如吉非替尼、厄洛替尼等已经被广泛应用于临床治疗,且给部分NSCLC患者带来了明显的疗效,患者病情可以得到缓解甚至长期带瘤生存.