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2003-2014年浙江省宁波市乙型流行性感冒病毒血凝素和神经氨酸酶基因变化特征分析
目的 分析2003-2014年宁波市乙型流行性感冒(流感)病毒血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)的分子流行病学特征.方法 采集宁波市2003-2014年哨点监测医院的流感样病例标本进行流感病毒分离鉴定,选取不同时期的乙型流感毒株进行HA和NA基因序列测定,采用生物信息学软件分析变异和进化.结果 宁波市乙型流感病毒Victoria和Yamagata两大普系流行株的HA及NA基因在2003 2014年间每年均有不同程度的氨基酸序列变异,其中明显的为2005年与2009年的Victoria系毒株及2007年与2010年的Yamagata毒株变异.每当HA基因序列发生明显变异时NA基因也同时出现明显的变异,而且有时NA基因的变异比HA基因更明显.同时发现2013 2014年流行的乙型流感病毒为Yamagata系HA与Victoria系NA的重配株.结论 乙型流感两大谱系流行株的HA基因发生变异时NA基因也会出现变异,甚至较HA基因更快.2013-2014年宁波市乙型流感高发的流行株为Yamagata系HA与Victoria系NA基因的重配株.
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2010-2011年广东省东莞市甲型H1N1流行性感冒病毒血凝素基因变异特征研究
目的 了解2010-2011年广东省东莞市甲型H1N1流行性感冒(流感)病毒血凝素(HA)基因的特征及变化.方法 反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)、基因扩增、测序得到标本HA基因的核酸序列,利用生物信息软件对序列的特征及变化情况进行分析.结果 通过测序得到各标本HA基因1701bp长度的核苷酸序列,566个氨基酸.2年间有24个氨基酸位点发生变异,但其中有12个位点的改变只出现在单个毒株上.发生明显变化趋势的位点只有145、202、391、468,其中202位点属于Sb抗原决定簇区.受体结合位点、潜在糖基化位点及二硫键比较稳定,2年间没有发生变化.结论 主要功能区域比较保守,无变化.序列中发生明显变化趋势的位点只有4个,其中1个位于抗原决定簇区,属于流感病毒抗原漂移过程中突变的累积.
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2009-2015年福建省福州市急性腹泻儿童中诺如病毒基因多样性及动态变化研究
目的 通过定点监测了解2009-2015年福建省福州市急性腹泻儿童中诺如病毒基因多样性及动态变化趋势.方法 采集2009-2015年福州市儿童医院因急性腹泻入院的5岁以下儿童的粪便标本,应用实时荧光定量聚合酶链反应(Real-time PCR)筛查诺如病毒阳性标本.应用反转录聚合酶链反应(RT-PCR)方法扩增完整的VP1区和部分RdRp区并测序,应用在线基因分型工具和种系进化分析方法了解福州市5岁以下儿童中诺如病毒基因型/亚型的分布.结果 在随机抽取的93份标本中,Real-time PCR法检测阳性有91份;共获得其中73份完整VP1区和72份部分RdRp区基因序列.在完整的VP1分型中,GⅡ.4_2006b型43份,GⅡ.4 Syndeny_2012型16份,GⅡ.3型10份,GⅡ.4 NewOrleans_2009型2份,GⅡ.12型l份,GⅡ.7型l份.在部分RdRp区分型中,共发现GⅡ.P4_2006b型43份,GⅡ.Pe型16份,GⅡ.P12型10份,GⅠ.P4型1份,GⅠ.Pa型1份,GⅡ.P21型1份.结论 应用双命名系统分型的方法,发现2009-2015年福州市急性腹泻儿童中诺如病毒具有遗传多样性,其中2009-2012年流行的优势毒株为GⅡ.P4_2006b/GⅡ.4_2006b型,2013-2015年流行的优势毒株为GⅡ.Pe/GⅡ.4 Sydney_2012型.此外,GⅡ.P12/GⅡ.3为福州市持续流行的型别.
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2007-2009年广西壮族自治区甲3亚型流感病毒HA1基因变异的特征研究
目的 从HA1基因层面探讨2007-2009年广西壮族自治区(广西)甲3流感病毒的变异、进化发展规律,探寻与WHO疫苗推荐株以及上海市、北京市和浙江省等地当年流行株之间的差异.方法 提取广西22株2007-2009年甲3流感毒株RNA,并测定其血凝素重链(HA1)区域的核苷酸序列,采用生物信息软件,分析与当年疫苗推荐株及上海、北京和浙江等地在HA1以及HAI抗原决定簇区域的差异,分析进化关系.结果 22株广西甲3流感病毒2007年与2008年比较接近,HA1区核苷酸和氨基酸的同源性均值分别为99.39%和99.08%;而与2009年变异较大,同源性均值分别为99.04%和97.78%.而对比世界卫生组织(WHO)推荐的2008-2009年甲3流感疫苗株A/Brisbane/10/2007,广西3年分离株HA1区氨基酸酸同源性均值分别为99.81%、99.25%和97.94%.2009年广西甲3流感病毒与当年疫苗株比较,HA1抗原决定簇发生了6个氨基酸的替换,且发生在A、D、E三区.各年度散发株和暴发株同源性较均在99.00%以上.2007年广西甲3毒株与上海及北京比,HA1区氨基酸同源性均值分别为99.83%和99.12%,2008年比较结果分别为98.93%和99.25%.基因进化树分析显示2009年分离株与2007年、2008年及当年疫苗株距离较远,单独分支.结论 广西2007年与2008年甲3流感病毒HA1基因特性较为接近,2009年毒株发生了较大变异.广西与上海、浙江等地分离株更为接近,而与北京分离株差异较大.WHO推荐的当年疫苗株均滞后广西流行株.
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1999-2008年广东省韶关市H3亚型流行性感冒病毒的变迁
目的 通过A型流行性感冒(流感)病毒H3亚型血凝素HA1基因的变异,探讨韶关市1999-2008年H3亚型流感病毒的变迁.方法 复苏韶关市疾病预防控制中心保存的历年H3亚型流感毒株,提取病毒RNA,RT-PCR扩增病毒HA1基因,纯化产物进行核苷酸序列测定,使用DNA Start MegAlign等生物软件包对序列进行分析.结果研究测定了4个年份的流感毒株,与代表株A/Panama/2007/1999相比,同源性为91.3%～93.8%,在5个抗原决定簇共14个氨基酸发生变异,RBS上有6个位点发生变异,各毒株均在不同的位点上增加了一个糖基化位点;与代表株A/Flujian/411/2002比较,同源性为90.2%～97.7%,18个氨基酸变异发生在5个抗原决定簇,10个氨基酸变异发生在RBS,A/SG/199/1999,A/SG/y009/2008分别增加了一个糖基化位点;与代表株A/Wisconsin/67/2005比较,同源性从88.3%～98.4%,共有14个氨基酸变异发生在5个抗原决定簇,RBS上有9个氨基酸发生变异,各毒株均在不同的位点上增加了一个糖基化位点;本次研究的毒株变异率逐渐下降,变异活跃的两个氨基酸第158和173位点分别位于B和D抗原决定簇.结论 韶关市H3亚型流感病毒在1999-2008年间发牛了3次抗原性变异,每一次变异大约间隔3～4年.从2008年的氨基酸变异情况得知,H3亚型流感病毒的抗原性漂移有增强的趋势.
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2003-2009年宁波市乙型流感病毒监测与HA1序列分析
目的 分析近年来宁波市乙型流行性感冒(流感),两大谱系毒株流行情况和病毒血凝素基因特性.方法 用犬肾传代细胞(MDCK)分离流感病毒,对2003-2009年分离的乙型流感病毒按不同的谱系选择每年的代表株,经聚合酶链反应扩增目的 基因后进行乙型流感病毒的血凝索基因HA1区域(HA1)核苷酸序列测定.结果 乙型流感两大谱系的病毒在宁波市几乎每年均有出现,相互交祷成为优势株.其中Yamagata系在2004及2007年相对占优势,而Victoria系在2006年3月及2009年6月2次出现了流行高峰.HA,序列测定结果Yamagata系毒株在2003、2007年HA1区出现2次出现明显的氨基酸替换,Victoria系在2005年底及2009年初发生2次明显氨基酸替换.结论 2003-2009年乙型流感的两大谱系病毒的HA1序列均存在较大差异,本市2004及2007年Yamagata系2次在乙型流感中相对占优势和2006及2009年Victoria系出现的2次乙型流感流行高峰均与病毒HA1区的氨基酸替换有关.
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狂犬病毒毒株及抗原性研究进展
狂犬病是一种严重危害人类健康的人畜共患病,病死率极高,且目前尚无有效的治疗方法而只能着重于预防,故疫苗的有效保护极为重要,对毒株的研究分析可以了解其来源及变异,以确定疫苗株的筛选和使用.
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霍乱弧菌中VSP-Ⅰ岛的分布和变异特征研究
目的 探讨霍乱第7次大流行基因岛1 (VSP-Ⅰ)在霍乱弧菌中的分布和变异特征.方法 从美国国立生物技术信息中心的GenBank数据库中下载所有霍乱弧菌基因组数据,以霍乱第7次大流行代表菌株N16961的VSP-Ⅰ作为参考序列,筛查所下载霍乱弧菌基因组中的VSP-Ⅰ.使用MUMmer软件进行单核苷酸多态性(SNP)分析,OrthMCL软件进行同源基因分析,BLAST软件进行序列结构变异分析和功能注释.结果 VSP-Ⅰ广泛存在于霍乱弧菌中,其中霍乱第7次大流行的105株菌株中均携带VSP-Ⅰ,且其序列高度保守;其中94株菌的VSP-Ⅰ完全一致,仅在11株菌中分别存在1 ～14个SNP位点.而2株非O1非O139群菌株携带VSP-Ⅰ,但和大流行菌株相比,存在插入缺失等序列变异.同时,VSP-Ⅰ有9个共有保守基因,VC0183虽在所有菌株中均存在,但在2株非O1非O139菌株中长度发生改变.此外,VSP-Ⅰ携带5个与该岛的转移和整合相关的基因(VC0181 ～ VC0185),VC0178编码马铃薯糖蛋白类似物,VC0180编码蛋白水解酶,二者可能与毒力相关.结论 作为霍乱第7次大流行菌株中的特异性基因簇,VSP-Ⅰ已转移至非O1非O139群菌株中,并发生序列的变异.
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莪术油治疗小儿呼吸道感染101例临床分析
小儿呼吸道感染是小儿常见疾病,但是由于病毒不断发生变异,耐药增强,使上呼吸道感染不能得到有效控制,导致下呼吸道感染.笔者采用莪术油葡萄糖注射液治疗小儿急性呼吸道感染,取得显著疗效,现报告如下.
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左氧氟沙星序贯疗法治疗社区获得性肺炎疗效评价
社区获得性肺炎为常见感染性疾病,随着抗菌药物的广泛使用,社区获得性肺炎的致病菌株发生变异,对常用抗菌药物的耐药菌株不断出现,为评价新一代喹诺酮类抗菌药左氧氟沙星序贯疗法治疗社区获得性肺炎的可行性和实用意义,现将结果报告如下.
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多层螺旋CT检查在窦口鼻道复合体变异与鼻窦炎性疾病相关性研究中的价值
目的:探讨多层螺旋CT检查在窦口鼻道复合体(OMC)变异与鼻窦炎性疾病相关性研究中的价值.方法:对65例经鼻内镜及多层螺旋CT检查验证副鼻窦炎患者的影像图像进行回顾性分析.结果:65例OMC变异患者经鼻窦冠状位或横断位扫描及高空间分辨率算法成像分析,OMC变异所致的各种鼻窦炎均能清晰显示.其中,鼻中隔偏曲46例,占70.77％；中鼻甲气化4例,占6.15％；中鼻甲反向弯曲5例,占7.69％；Hall气房6例,占9.23％；钩突偏曲、气化或肥大4例,占6.15％.各种变异所致的间隙狭窄61例,占93.85％.各组鼻窦炎性表现分布:额窦粘膜增厚7例,积液2例,上颌窦积液和(或)粘膜增厚55例；筛窦积液33例,积液31例；其中,36例患者为多个窦腔受侵,占55.38％.结论:各种形式的OMC变异均能导致程度不同的副鼻窦炎性改变,多层螺旋CT检查能清晰显示各种变异的形态和特征,为功能性鼻内镜手术治疗具有积极的指导价值.
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超声波辅助提取红心萝卜花色苷的研究
花色苷是自然界中庞大的一类水溶性色素,日常生活中人们食用的被子植物和开花植物中,有很多种都含有花色苷类物质.它具有消除自由基、降血脂、抗变异、延缓衰老、提高视力等生理活性.是替代合成色素的一类重要食品添加剂.
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染色体变异与生殖异常的关系
目的 探讨染色体变异与生殖异常的关系.方法 对1,856例来诊的生殖异常患者的行染色体检查,其中对D/G组染色体着丝粒区(cen)和随体区增加(ps+)、副缢痕区增加(qh+)、9号染色体的臂间倒位(inv9)、Y长臂的增加(大Y或Yqh+)和减少(小Y或Yqh-)等染色体变异进行回顾性分析.结果 1,856例患者检出染色体变异96例,检出率为5.2%;其中具有临床表现的共66例,占68.8%.各种类型染色体变异检出例数和检出率、具有临床表现的例数和构成比分别为:大Y32例、检出率1.7%,具有临床表现22例、构成比33.8%;小Y12例、检出率0.6%,具有临床表现10例、构成比15.4%;inv(9)17例、检出率0.92%,具有临床表现12例、构成比18.5%;ps+19例、检出率1.0%,具有临床表现13例、构成比20.0%;qh+增加16例、检出率0. 9%,具有临床表现9例、构成比13.8%.结论 染色体变异与生殖异常的关系密切.
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双染法在大鼠骨骼发育毒性研究中的应用
在发育毒性研究中,骨骼畸形和内脏畸形是评价外界化合物对机体影响的主要内容.传统的发育毒性研究均采用骨骼单染法来评价骨骼是否异常.然而,第20天胎龄仔鼠的骨骼只有部分被骨化,另一部分骨骼仅以软骨的形式存在.单染后仅使骨化部分染色,软骨部分无法被染色.因此,只有采用骨骼双染法,才能较全面准确地评价骨骼畸形的发生.我们综合国内外相关资料及自己的实验结果,具体介绍骨骼双染的步骤、正常第20天胎龄仔鼠的骨骼发育情况及常见的骨骼畸形和变异,为国内发育毒性研究提供参考.
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食物成分研究的发展与未来方向
食物成分的研究在食品科学和人类营养学研究中既是应用基础、又是研究工具.本文综述了食物成分研究的几次大发展、食物成分数据的应用、提高食物成分数据的报告、减少实际食物和测量食物间含量的变异和食物成分研究的未来方向.为食物成分和其他相关学科的研究和应用提供参考.
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左侧椎动脉起源及走行异常伴椎动脉多发分支状变异一例
椎动脉起源及走行异常临床上比较少见,明确血管变异对于患者颈部及颈椎手术意义重大.本文报道1例主诉左上肢乏力,转头后猝倒,在行颈部CT血管造影检查后证实为特殊类型的椎动脉起源及走行异常病例.
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试剂更换引起标本血脂结果变异
随着生活素质的提高,人们的健康意识越来越强,定期进行血脂测定已成为人们作为监测健康状态的一项指标.经过长期的实验室工作,我们发现在血脂测定中存在着分析中变异,这种变异主要来自仪器与试剂的不同.
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右上颌第一磨牙5根管一例
上颌第一磨牙通常有3~4个根管，随着现代口腔治疗技术的发展和应用，近中颊根第二根管（M B2）的发现率越来越高，从而避免根管遗漏，提高根管治疗的成功率，显微镜的使用同时也帮助我们发现根管的变异情况。我科在临床工作中遇到的右上颌第一磨牙5个根管的病例一例，报告如下。
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肺移植围手术期的麻醉护理配合
肺移植手术是终末期肺部疾病的较好选择,此类病人的病情比较严重,有的甚至已经用呼吸机支持,在进入手术室后要做各种各样的监测项目,作为手术室护士要娴熟的配合麻醉进行麻醉和各种穿刺操作,现总结如下.由于肺移植手术复杂、创伤大,病情严重,术中容易影响呼吸和循环等系统的变化,因此术中麻醉监测项目多才能及时发现异常及时作出调整.比如:连续监测ECG、PET CO2、SpO2、鼻咽温及有创动脉压,经漂浮导管监测中心静脉压(CVP)、肺动脉压(PAP)、肺动脉闭合压(PAOP)、间断心排血量(CO)、混合静脉血氧饱和度(SVO2),Picco经左股动脉穿刺置入,连续监测心排血量(PCCO)、每搏心排血量(SV)、每搏量变异(SVV)、外周血管阻力(SVR)、MAP及脉压变异(PPV)等.
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临床路径信息系统开发研究与应用
我院自主开发的临床路径信息系统经过多年优化完善已经形成从入院评估、诊疗监控、预警防呆、变异干预、分析评价等完善体系,结合HIS系统、电子病历、路径知识库等系统,为提高医疗质量、降低病人费用、节约医疗资源、规范诊疗流程等方面起到了积极的促进作用.
