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干扰素诱导跨膜蛋白3 rs12252多态性与乙型流感病毒感染相关性研究
目的 了解干扰素诱导跨膜蛋白3(IFITM3) rs12252多态性与乙型流感感染之间的关联.方法 选择2014年1月-2015年4月北京地区流感样病例(ILI)监测乙型流感感染病例80例、严重急性呼吸道感染病例(SARI)监测乙型流感感染病例85例和健康对照人群65例.提取基因组DNA,使用高分辨率熔解曲线法和Sanger测序法检测IFITM3rs12252多态性..结果 ILI病例组IF-ITM3 rs12252基因型分布频率与对照组无显著性差异,但SARI病例组与对照组相比基因型分布频率具有显著差别.61.2％的SARI病例为IFITM3 rs12252 CC基因型,明显高于ILI病例和对照人群.隐性遗传模型显示CC基因型个体比TT基因型和CT基因型个体有更高的风险发展为乙型流感重症感染(OR =4.73,95％CI 2.42 ～9.22).结论 IFITM3 rs12252 CC基因型会导致较高的乙型流感重症感染风险.
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北京市门头沟区2015—2016年Victoria系乙型流感病毒HA1基因特征分析
目的 了解北京市门头沟区2015—2016年分离的Victoria系乙型流感病毒血凝素HA1基因变异特征,分析流行株与我国疫苗株的匹配情况,为乙型流感防控提供依据.方法 对狗肾传代细胞(MDCK)培养分离得到的14株Victoria系乙型流感病毒进行核酸提取,采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增病毒HA1基因后进行核苷酸序列测定,采用邻接法进行遗传进化树分析.结果 2015—2016年北京市门头沟区流行的乙型流感病毒以Victoria系为主.分离并测序的14株Victoria系乙型流感病毒HA1基因与WHO推荐的2016—2017年流感疫苗株B/Brisbane/60/2008(FJ766842)和国内代表株B/JilinNanguan/1223/2016(EPI768805)亲缘性更近.与B/Brisbane/60/2008和B/JilinNanguan/1223/2016(EPI768805)的HA1区的氨基酸相比,所有毒株都在2个位点发生氨基酸替换,个别毒株也会在其他个别位点发生点突变,变异涉及1个抗原决定簇.而与WHO推荐的2015—2016年Yamagata系疫苗株B/Phuket/3073/2013(EPI608074)亲缘关系稍远一些.结论 在2015—2016年流感监测季中,北京市门头沟区乙型流感病毒以Victoria系为优势流行株.而WHO推荐的乙型流感疫苗株为Yamagata系,可见疫苗株与本区流行株匹配性不佳.
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2015年北京市房山区乙型Yamagata系流感病毒HA基因特性分析
目的 了解北京市房山区2015年乙型Yamagata系流感病毒HA1基因变异情况.方法 选取2015年流感病原学监测中分离到的乙型Yamagata系毒株共13株,采用RT-PCR法扩增病毒HA基因片段后进行序列测定,与WHO推荐的疫苗株进行比对并构建进化树.采用MEGA6软件对测序结果进行分析.结果 2015年房山区乙型Yamagata系流感病毒HA1基因片段序列测定拼接后核苷酸长度为1059bp,编码氨基酸为353个,与2014-2015年的疫苗株B/Massachusetts/02/2012比较,13株毒株的氨基酸均在第123、131、165、180、187、196、211、217、244、313、327位点有变异;与2012-2013年的疫苗株B/Wisconsin/01/2010比较,13株毒株的氨基酸在第187、313、327均有变异.做进化树分析,房山区2015年分离到的乙型Yamagata系流感病毒与疫苗株B/Wisconsin/1/2010在同一个分支上,距离较近,与B/Massachusctts/2/2012不在一个分支上,距离较远.结论 2015年北京市房山区乙型Yamagata系流感病毒HA1基因在抗原决定簇区已发生变异,但疫苗株B/Wisconsin/01/2010有保护作用,应继续关注氨基酸的替换.
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2003-2014年浙江省宁波市乙型流行性感冒病毒血凝素和神经氨酸酶基因变化特征分析
目的 分析2003-2014年宁波市乙型流行性感冒(流感)病毒血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)的分子流行病学特征.方法 采集宁波市2003-2014年哨点监测医院的流感样病例标本进行流感病毒分离鉴定,选取不同时期的乙型流感毒株进行HA和NA基因序列测定,采用生物信息学软件分析变异和进化.结果 宁波市乙型流感病毒Victoria和Yamagata两大普系流行株的HA及NA基因在2003 2014年间每年均有不同程度的氨基酸序列变异,其中明显的为2005年与2009年的Victoria系毒株及2007年与2010年的Yamagata毒株变异.每当HA基因序列发生明显变异时NA基因也同时出现明显的变异,而且有时NA基因的变异比HA基因更明显.同时发现2013 2014年流行的乙型流感病毒为Yamagata系HA与Victoria系NA的重配株.结论 乙型流感两大谱系流行株的HA基因发生变异时NA基因也会出现变异,甚至较HA基因更快.2013-2014年宁波市乙型流感高发的流行株为Yamagata系HA与Victoria系NA基因的重配株.
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2009-2011年北京市西城区乙型流行性感冒病毒流行特征分析
目的 通过2009 -2011年的连续监测,了解北京市西城区乙型流行性感冒(流感)病毒的流行规律,为制定预防控制措施提供依据.方法 在北京市西城区两家流感哨点医院采集流感样病例的咽拭子3393份,用犬肾传代细胞进行病毒分离,分离阳性的病毒进一步用血凝抑制试验进行流感病毒株型别鉴定.结果 从2009年10月到2011年9月,西城区于2010年1、2月以及2011年3、4月分别出现了一次乙型流感的流行.共收集并检测流感样病例咽拭子样本3393份,其中分离并鉴定出乙型流感病毒阳性106例,总阳性率为3.12％；以2010年1月阳性率高,达到19.65％；病毒阳性者平均年龄为(25±20)岁,其中＞60岁组的阳性率高,达到5.70％.结论 2009-2011年北京市西城区乙型流感病毒2年的监测中,Victoria亚型为主要流行株.北京该地区乙型流感病毒主要累及青少年和老年人群.应该加强监测管理,并在流行季节尽快采取预防控制措施以保护公众的身体健康.
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2011年南昌市乙型流感病毒HA1基因特征分析
目的 了解南昌市2011年乙型流感病毒HA1基因的特征,探讨2011年流感监测季乙型流感病毒的分子流行病学特征.方法 按照采样时间,选取南昌市2011年从犬肾传代细胞(MDCK)培养分离到的乙型流感毒株共25株,提取病毒核糖核酸(ribonucleic acid,RNA),反转录-聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)扩增HA1基因片段,产物纯化测序,进行基因进化特性分析.结果 2011年南昌市流行的乙型流感病毒优势株为Victoria系病毒(84％).与北半球国际疫苗株B/Brisbane/60/2008相比,2011年南昌市流行的Victoria系乙型流感病毒HA1片段有8个氨基酸位点发生了变异,其中T197D氨基酸变异涉及抗原决定簇的B区.与北半球国际疫苗株B/Wisconsin/1/2010相比,Yamagata系流感病毒HA1片段有19个氨基酸位点发生了替换,其中R130K、T165N、Q195R、Q196T,氨基酸变异涉及A、C、D三个抗原决定簇.结论 2011年南昌市流行的乙型流感病毒优势株属Victoria系,分离到的Yamagata系毒株血凝素基因发生了明显变异,Victoria系毒株血凝素基因未发生明显的变异.
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2010-2015年湖北省乙型流感病毒流行和进化分析
目的 了解2010-2015年湖北省乙型流感病毒流行分布和基因进化情况.方法 通过测序和全球流感共享数据库(global initiative on sharing all influenza data,GISAID)获得2010-2015年湖北省乙型流感病毒血凝素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(neuramidinase,NA)氨基酸序列,分别对其进行系统进化树、氨基酸突变位点和三维建模分析,结合同期病毒分离株流行分布,分析重配株基因进化与病毒流行分布间的关系.结果 2010-2015年湖北省乙型流感病毒存在系内重配和系间重配,首例重配株出现后,该病毒都会形成较大流行.同期病毒在HA四个主要抗原表位上发现的突变位点有:Nll6K、N129S、A146T、K162R和N197S,在NA上发现了神经氨酸酶活性突变位点D197N,三维建模表明该位点并非直接与底物或抑制物接触.结论 2010-2015年湖北省乙型流感病毒的流行与该病毒的基因进化关系密切,监测该病毒抗原表位突变位点和耐药突变位点有助于深入分析其进化特性.
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2009-2010年浙江省宁波市乙型流行性感冒的流行与人群抗体水平变化
目的 了解2009-2010年宁波市乙型流行性感冒(流感)病毒的流行特征及人群对乙型流感的抗体水平变化.方法 从流感监测哨点医院采集患者标本进行流感病毒分离及疫情监测,于2009年7月和2010年3月底2次采集宁波市正常人群血清,用微量血凝抑制法进行乙型流感抗体检测.结果 在2009-2010年期间乙型流感的Victoria系毒株比较活跃,共出现2次流行的高峰期,且从2009年6月起血凝素基因出现了新变异株.人群血清抗体水平检测结果,2009年7月采集的标本阳性率为42.12％,而2010年3月底采集的标本为51.11％.结论 2009-2010年Victoria系乙型流感的流行与毒株的血凝素基因变异有关.从2009年7月至2010年3月底,人群对Victoria系乙型流感的抗体阳性率有明显的增高.
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2017-2018年流感季节美国流感活动以及2018-2019年流感季节流感疫苗的组成建议
美国2017-2018年流感季节(2017年10月1日至2018年5月19日)是一个流感活动高强度季节,流感样病例(ILI)的门诊/急诊就诊和流感相关入院治疗百分比高,美国全国范围内流感流行时间长、范围广.在全国范围内,ILI在2017年11月开始增加,2018年1-2月出现一个较长的发病高峰并且持续到3月.甲型流感病毒(H3N2)在2月占主导地位并在整个流感季节都占优势地位;乙型流感病毒从3月开始占据主导地位.该报告总结了美国从2017年10月1日至2018年5月19日的流感活动情况.
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乙型流感病毒致高龄患者重度粒细胞缺乏症1例
1临床资料患者,男,86岁,因"大面积脑梗死后遗症"于2013年2月25日在我科住院治疗.入院后查血常规、肝功能、血糖、血脂正常,肾功能BUN 11,8 mmol/L,Cr 98μmol/L,既往有冠心病房颤病史20年.住院后近1个月病情平稳.3月24日20时突然发热,高体温38.9℃,无寒战,轻微咳嗽、咳痰,时有恶心,无呕吐,无尿频、尿急、尿痛,无腹痛、腹泻.查体:精神萎靡,无呼吸急促,耳后、颌下淋巴结无肿大,口周无疱疹,咽略赤,双侧扁桃体无肿大,双肺底有细小湿啰音,心率66/min,节律不齐,腹软,无压痛.急查血象,白细胞计数0.9×109/L,中性粒细胞百分比6.4％,中性粒细胞绝对数0.1×109/L.
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北京市某区两起小学乙型流感暴发疫情调查
目的 分析北京市某区两起小学乙型流感暴发疫情的流行病学特征,为流感暴发疫情的防控提供参考.方法 对2010年1月北京市某区两起小学乙型流感暴发疫情进行临床诊断、流行病学分析及实验室病毒分离检测.并将分离结果与同期监测来源毒株、疫苗株序列进行比对分析.结果 这两起乙型流感疫情暴发分别在一个班级范围内.罹患率分别为42.2％(19/45)和42.9％(18/42).采集18件病人咽拭子样本,其中A校8件,B校10件.病毒分离得到5株乙型流感Victoria系毒株,其中A校2株,B校3株.与同期监测分离的4株乙型流感病毒以及乙型流感疫苗株进行序列比对,疫情与监测来源的毒株样本高度同源,与监测优势株型别一致,并与WHO推荐的2009 ～2010年乙型流感疫苗株同源性高达98.9％以上.结论 流感流行优势型别更替时间段内容易暴发流感疫情,两起疫情均由乙型Victoria系引起.北京市流感样病例病原学监测为预测流感流行趋势提供依据,同时可对疫情的发生提供预警.
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长沙市2009-2012年暴发性乙型流感病毒血凝素基因特征分析
目的:了解长沙市2009~2012年暴发性乙型流感病毒血凝素基因(HA1)的变异情况以及WHO推荐的流感疫苗株对人群的保护情况.方法:采集长沙市流感暴发点流感样病例咽拭子标本进行流感病毒的分离和鉴定,并对分离到的乙型流感病毒进行病毒核酸提取,一步法RT-PCR扩增HA1基因片段,双向测定核苷酸序列,对HA1序列进行分析处理,并与WHO推荐的疫苗株及代表性毒株进行比对分析.结果:2009~2012年分离的乙型流感毒株分属于Yamagata系和Victoria系两个谱系,谱系内毒株间距离很近.Yamagata系毒株与代表株B/Florida/4/2006同源性极高,在97%～98%之间;Victoria系毒株与代表株B/Brisbane/60/2008同源性亦很高,在97%～99.3%之间;本次分离的两个谱系的毒株均未发现核苷酸的缺失和插入,抗原决定簇分析发现主要是单个抗原位点的改变.所有Victoria系毒株与疫苗株相比潜在糖基化位点无差异,所有Yamagata系毒株均发生D211N位点的突变,从而导致增加了一个潜在的糖基化位点NKTQ.结论:2009~2012年长沙市暴发性乙型流感病毒Victoria系与Yamagata系交替流行,抗原性与WHO推荐的疫苗株存在一定的区别,因此不能对长沙市乙型流感的暴发流行提供佳的保护.
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吴起县学生群体性发热疫情的快速检测诊断
目的 搞清2006年吴起县学生群体性发热疫情的病原.方法 采集了20例发热学生的鼻咽拭子和血液标本,使用美国QUICKVUE流感A+B快检试剂进行现场检测;在国家级流感监测网络实验室(陕西省疾病预防控制中心),使用美国DHI公司呼吸道病毒抗原七项(甲、乙型流感病毒,副流感病毒1、2、3型,腺病毒,呼吸道合胞病毒)荧光检测试剂盒进行直接荧光抗原检测,用RT-PCR方法 进行乙型流感病毒核酸检测.结果 对13份鼻拭子标本进行了现场快速抗原检测,其中7份小学生标本显示乙型流感病毒抗原阳性,阳性率为53.85%;对12份鼻咽拭子进行了免疫荧光抗原检测,其中3份呈乙型流感病毒抗原阳性,阳性率为25.00%;对17份鼻咽拭子标本进行了RT-PCR检测,12份显示乙型流感病毒核酸阳性,阳性率为70.59%.结论 根据以上实验室快速检测结果 ,引起此次学生群体发热的病原为乙型流感病毒.
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陕西省高陵县乙型流感暴发疫情的病原学检测报告
目的 弄清陕西省高陵县某小学学生群体发热疫情的病因.方法 采集住院病例的鼻拭子标本 7 份和鼻咽拭子标本 13 份,用流感快速检测试剂检测流感病毒抗原;RT-PCR 法检测流感病毒核酸;接种 MDCK 细胞分离流感病毒.结果 鼻拭子标本有 4 份乙型流感病毒抗原阳性.阳性率为 57.14%(4/7).鼻咽拭子混合标本 12 份检出乙型流感病毒核酸,阳性率为 92.31%(12/13).鼻咽拭子标本经细胞培养,其中 10 份标本出现细胞病变.经鉴定为乙型流感病毒,病毒分离率为 76.92%(10/13).结论 这起暴发疫情是由乙型流感病毒引起.
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乙型流感病毒NS1基因的进化
NS1蛋白是由流感病毒第8个RNA片段(丙型流感病毒NS1由第7个片段)编码的RNA结合蛋白[1].研究表明,NS1蛋白与流感病毒宿主存在复杂的相互作用[2-5],是流感病毒主要的毒力因子[6].乙型流感病毒是导致流感暴发的主要病原之一,目前为止只发现一个亚型,宿主特异性较强[7].探讨乙型流感病毒NS1蛋白的变异规律,分析其起源和进化过程,对于监控流感病毒感染人群毒力的变化,预测流感病毒流行趋势以及流感减毒活疫苗株的筛选具有重要的参考意义.
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广州地区2009年乙型流感病毒血凝素基因特征分析
根据抗原性和基因特异性的差异,乙型流感病毒可分为B/Victoria/2/87系(Victoria系)和B/Yamagata/16/88系(Yamagata系)[1].血凝素(HA)基因与该病毒的进化趋势相关[2],HA的抗原变异主要发生在HA1区域[3],该区域4个主要的抗原表位[120-loop(HA1 116-137)、150-loop(HA1141-150)、160-loop(HA1 162～167)和190-helix(HA1194-202)]如发生变化,往往引起变异相关病毒株进化方向的改变[4].为了解2009年乙型流感病毒进化情况,本研究分析了HA1基因特点.
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浙江省2006年乙型流感病毒的分子变异和抗原特性研究
2006年浙江省乙型流感的流行强度明显较往年增强,为明确2006年浙江省乙型流感病毒流行株的分子进化特征,分析其发生暴发的原因,我们对当年从各地市分离的乙型流感病毒进行了抗原及基因特征分析,并与2005年分离毒株进行比较.
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浙江省1999-2010年乙型流感病毒血凝素和神经氨酸酶基因变化特征分析
目的 分析1999-2010年浙江省乙型流感病毒主要抗原基因血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)的分子变异特征.方法 采集浙江省流感暴发疫情和哨点监测医院的流感样患者呼吸道标本,荧光定量RT-PCR快速检测和病毒分离,选取乙型流感病毒分离代表株进行HA和NA基因测序,采用生物信息学软件分析变异和进化.结果 共分析浙江省乙型流感病毒分离株34株,其中Victoria系20株,Yamagata系14株;1999-2010年间Victoria系毒株的HA1基因变异率4.5%,Yamagata系毒株为3.4%;2004年后分离的Victoria系毒株均为基因重配株,HA属于Victoria 系,而NA属于Yamagata系;2010年新型甲型HINI流感流行高峰过后,浙江省仍以乙型流感病毒流行为主,分离株与2009-2010年流感疫苗株B/Brisbane/60/2008接近,与往年乙型流感毒株相比HA和NA发生多个氨基酸位点变异.结论 1999-2010年浙江省乙型流感病毒流行株发生明显变异,基因重配和抗原漂移是病毒发生变异的主要机制.
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乙型流感病毒Victoria系和Yamagata系HA1基因的分子进化研究
目的 探讨乙型流感病毒两大谱系的进化特征和进化规律.方法 从GenBank数据库下载1940-2012年乙型流感病毒流行株共126条,采用贝叶斯-马尔科夫链-蒙特卡洛(Bayesian-MCMC)和分子钟方法,对乙型流感病毒的HA1基因进行系统发育学分析,计算乙型流感病毒两大谱系可能的起源时间与分化时间.结果 1978-2010年乙型流感病毒Victoria系与Yamagata系的aa平均差异率为5.4％～ 10.2％,两谱系的aa差异和组间遗传距离随时间推移呈逐渐增大的趋势.与Victoria系毒株相比,Yamagata系全部毒株的163位aa及部分毒株的166位aa缺失,但是这些年来的乙型流感病毒HA1基因除个别位点外,尚未受到明显的正向选择压力.每年乙型流感病毒HA1基因的碱基替换速率为2.138×10-3(95％HPD:1.833×10-3～2.437×10-3)替代/位点,推算乙型流感病毒Victoria系和Yamagata系的近共同祖先出现在1971年(95％HPD:1969-1972年),两大谱系的分化时间点分别为1973年(95％HPD:1971-1974年)和1977年(95％HPD:1975-1978年).结论 乙型流感Victoria系和Yamagata系均较以往发生大的变异,且两大谱系的差异日趋增大,将来有可能分化为不同的亚型,在流感监测中应密切关注这一变化及其流行病学意义.
关键词： 乙型流感病毒 HA1基因 贝叶斯-马尔科夫链-蒙特卡洛方法 分子钟方法 进化 -
辟秽香囊抗流感病毒的实验研究
目的:观察辟秽香囊抗甲型、乙型流感病毒的作用.方法:将辟秽香囊与小鼠置于同一密闭容器,4d后使小鼠感染甲型和乙型流感病毒,比较小鼠肺指数和存活率.结果:辟秽香囊可减轻甲型、乙型流感病毒所致小鼠肺病变,降低肺指数值,且可明显降低甲型、乙型流感病毒感染小鼠的死亡数,延长小鼠存活天数.结论:辟秽香囊具有抗甲型、乙型流感病毒的作用.
