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北京市门头沟区2015—2016年Victoria系乙型流感病毒HA1基因特征分析
目的 了解北京市门头沟区2015—2016年分离的Victoria系乙型流感病毒血凝素HA1基因变异特征,分析流行株与我国疫苗株的匹配情况,为乙型流感防控提供依据.方法 对狗肾传代细胞(MDCK)培养分离得到的14株Victoria系乙型流感病毒进行核酸提取,采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增病毒HA1基因后进行核苷酸序列测定,采用邻接法进行遗传进化树分析.结果 2015—2016年北京市门头沟区流行的乙型流感病毒以Victoria系为主.分离并测序的14株Victoria系乙型流感病毒HA1基因与WHO推荐的2016—2017年流感疫苗株B/Brisbane/60/2008(FJ766842)和国内代表株B/JilinNanguan/1223/2016(EPI768805)亲缘性更近.与B/Brisbane/60/2008和B/JilinNanguan/1223/2016(EPI768805)的HA1区的氨基酸相比,所有毒株都在2个位点发生氨基酸替换,个别毒株也会在其他个别位点发生点突变,变异涉及1个抗原决定簇.而与WHO推荐的2015—2016年Yamagata系疫苗株B/Phuket/3073/2013(EPI608074)亲缘关系稍远一些.结论 在2015—2016年流感监测季中,北京市门头沟区乙型流感病毒以Victoria系为优势流行株.而WHO推荐的乙型流感疫苗株为Yamagata系,可见疫苗株与本区流行株匹配性不佳.
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2011年南昌市乙型流感病毒HA1基因特征分析
目的 了解南昌市2011年乙型流感病毒HA1基因的特征,探讨2011年流感监测季乙型流感病毒的分子流行病学特征.方法 按照采样时间,选取南昌市2011年从犬肾传代细胞(MDCK)培养分离到的乙型流感毒株共25株,提取病毒核糖核酸(ribonucleic acid,RNA),反转录-聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)扩增HA1基因片段,产物纯化测序,进行基因进化特性分析.结果 2011年南昌市流行的乙型流感病毒优势株为Victoria系病毒(84％).与北半球国际疫苗株B/Brisbane/60/2008相比,2011年南昌市流行的Victoria系乙型流感病毒HA1片段有8个氨基酸位点发生了变异,其中T197D氨基酸变异涉及抗原决定簇的B区.与北半球国际疫苗株B/Wisconsin/1/2010相比,Yamagata系流感病毒HA1片段有19个氨基酸位点发生了替换,其中R130K、T165N、Q195R、Q196T,氨基酸变异涉及A、C、D三个抗原决定簇.结论 2011年南昌市流行的乙型流感病毒优势株属Victoria系,分离到的Yamagata系毒株血凝素基因发生了明显变异,Victoria系毒株血凝素基因未发生明显的变异.
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Victoria系乙型流感病毒HA1基因变异特征分析
目的 阐明2012年邯郸市分离的Victoria系乙型流感毒株HA1抗原性和基因变异特征.方法 对2012-2013年分离的流感病毒采用RT-PCR方法特异性扩增HA1基因,扩增产物进行核苷酸序列测定,用DNAStar中Megalign软件进行比对分析,构建系统进化树.结果 邯郸市2012年分离的Victoria系乙型流感病毒与WHO推荐的2009-2012年北半球代表株相比,核苷酸同源性为98.1％ ～99.2％,氨基酸同源性为98.2％～ 99.4％.HA1区未发生氨基酸丢失和插入,与B/Brisbane/60/2008相比2个位点氨基酸替换具有共性(146I＞V和197D＞N),而这2个位点与2006-2008年疫苗株B/Malaysia/2506/04相同.与B/Brisbane/60/2008相比7个毒株中有2个毒株发生了另外4个位点(58L＞P、129N＞S、171N＞D和174G＞E)的替换.结论 2012年邯郸市分离的Victoria系乙型流感病毒血凝素蛋白未发生明显的抗原性改变,与WHO推荐的2011-2012年的流感疫苗株B/Brisbane/60/2008匹配,不属于Victoria系乙型流感病毒新变种.
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嘉兴市2011-2012年乙型流感监测与HA1序列分析
[目的] 了解2011-2012年嘉兴市乙型流感的流行状况及病毒序列特性、变异特点和WHO推荐流感疫苗株对人体的保护情况. [方法] 将采集的流感样病例的咽拭子标本用MDCK细胞培养分离流感病毒,用标准血清及荧光定量RT-PCR方法鉴定.随机选取6株乙型流感病毒株进行HA1基因核苷酸序列测定,并进行特性分析. [结果] 2011-2012年嘉兴市乙型流感病毒Victoria系和Yamagata系同时存在.随机抽取4株Victoria系和2株Yamagata系毒株,在糖基化位点上没有变化.4株Victoria系毒株核苷酸同源性为98.6％ ～99.7％,氨基酸同源性为98.8％～100.0％,其中2株与2009-2012年疫苗株相比,在L58P、N129S、I146V、N171D发生了氨基酸的替换.2株Yamagata系毒株核苷酸和氨基酸同源性为99.4％,与2012-2013年疫苗株极为接近. [结论] 嘉兴市流行的Victoria系乙型流感病毒与2009-2012年疫苗代表株同源性较高,当年度的流感疫苗株对本市Victoria系乙型流感病毒流行的防治有一定保护作用.但本地同时也还活跃着Yamagata系的乙型流感病毒,当年度的流感疫苗株对Yamagata系乙型流感病毒不能提供佳保护.
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湖州市乙型流感病毒HA1基因分析
目的:了解湖州市乙型流感病毒的基因变异情况和WHO推荐流感疫苗株对湖州市人体的保护情况.方法:采集类流感样本进行流感病毒的分离和鉴定,并对分离到的乙型流感病毒进行核酸的提取,采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增病毒基因后进行病毒血凝素HA1.基因核苷酸序列测定,用DNAMAN和MegAlign生物软件对测序结果进行分析处理,并与WHO推荐疫苗株基因进行比对.结果:分离到的毒株为Victoria系的乙型流感病毒,未发现核苷酸的丢失和插入,糖基化位点没有太大改变.毒株HAl区域的核苷酸序列长度为1015 bp,推导的氨基酸序列长度为339个,相比Yamagata系毒株在163位上都多1个天冬酰胺(N).结论:2010年WHO推荐乙型流感疫苗株与湖州市的流行株为同一谱系毒株,预防保护效果较好.
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浙江省乙型流感病毒HA1基因分析
目的:了解浙江省近几年乙型流感病毒的基因变异情况和WHO推荐流感疫苗株对浙江省人体的保护情况.方法:采集浙江省类流感样本进行流感病毒的分离和鉴定,并对分离到的乙型流感病毒进行核酸的提取,采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增病毒基因后进行病毒血凝素HA1基因核苷酸序列测定,用DNAMAN和BioEdit生物软件对测序结果进行分析处理,并与WHO推荐疫苗株基因进行比对.结果:分离到Yamagata系和Victoria系两个进化系的乙型流感病毒,两系毒株均未发现核苷酸的丢失和插入,糖基化位点没有太大改变.毒株之间核苷酸的同源性为95.25%,氨基酸的同源性为95.28%.Yamagata系毒株HA1区域核苷酸序列长度为1038 bp,推导的氨基酸序列长度为346个,氨基酸变异替换数在6～8之间;Victoria系毒株HA1区域的核苷酸序列长度为1041 bp,推导的氨基酸序列长度为347个,氨基酸变异替换数在2～8之间,相比Yamagata系毒株在163位上都多1个天冬酰胺(N).基因进化树上可见明显的Yamagata系和Victoria系两个分支.结论:浙江省人群交替流行着Yamagata系和Victoria系两个抗原性不同的进化系的乙型流感病毒,病毒的基因发生了变异,抗原已发生漂移.2001、2006两年WHO推荐乙型流感疫苗株与我省当年流行株为不同谱系毒株,预防保护效果不够理想,其余年份为同一谱系毒株,预防保护效果较好.
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2006～2007年深圳市Victoria系B型流感病毒HA1基因特性的分析
目的:了解2006～2007年深圳市Victoria系B型流感病毒流行情况及HA1基因特性.方法:用狗肾传代细胞(MDCK)和鸡胚进行流感病毒分离,将分离到的Victoria系B型流感毒株进行血凝素HA片段核苷酸序列测定并推导出其氨基酸序列,用SIMMONIC软件和Mega软件对其进行分析.结果:2006～2007年深圳分离培养到的Victoria系流感毒株与同时段的疫苗株B/Malaysia/2506/04、国内代表株B/Shenzhen/155/05的核苷酸同源性极高,没有发生较大的变异;2006～2007年深圳所有的Victoria系株均在134号位点上发生了Ser到Pro的替换.除此之外,还存在个别的氮基酸点变异,部分的变异位点处在HA1区的抗原表位,会导致病毒的抗原性改变.结论:本研究未发现2007年深圳流行的Victoria系B型流感毒株与2006年的流行株在HA1片段有明显的氨基酸变异.
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2011年-2016年唐山地区B型流感病毒血凝素基因特性分析
目的 分析2011年-2016年唐山地区B型流感血凝素基因特征.方法 对唐山市哨点医院流感样病例咽拭子标本进行核酸检测,阳性标本采用MDCK细胞分离培养,选取10株B型流感病毒进行HA1基因测序,分析其核苷酸序列特征及氨基酸变异情况.结果 进化分析显示,唐山地区B型流感病毒分为B/Victoria系和B/Yamagata系,其中4株B/Vic系毒株为1B分支(2011年-2012年)和1A分支(2015年-2016年),6株B/Yam系毒株均属于3分支.与疫苗株B/Brisbane/60/2008相比,B/Vic系毒株氨基酸替换发生在N129S和I146V(1B分支)、I117V和N129D(1A分支).与疫苗株B/Wisconsin/1/2010(B/Yam 3分支)相比,B/Yam毒株共有7个位点发生氨基酸替换;与疫苗株B/ Massachusetts/2/2012(B/Yam2分支)相比,有14个位点发生氨基酸替换,其中N116K、S150I、N165Y和D196N位于抗原表位上.结论 2011年-2016年唐山地区B型流感毒株发生明显变异,连续分子学监测对该地区的疫苗接种政策有重要意义.
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珠海市2011年连续发生5起乙型流感疫情的病毒HA1基因分析
目的 分析珠海市2011年多起连续发生的流感疫情中分离的乙型流感毒株HA1基因特性,阐述流感暴发的原因.方法 用MDCK细胞分离培养流感病毒,提取病毒核酸,采用RT-PCR扩增病毒HA基因并测定核苷酸序列,用ClustalX和MEGA4.1分析结果.结果 珠海市2011年多起连续发生的流感疫情中分离的乙型流感病毒属Victoria系,与2011年流感监测分离株2011C-IN-0056-7相比,没有核苷酸的丢失和插入,没有糖基化位点的改变,核苷酸同源性在97.3％以上,氨基酸有1～3个位点发生了变异,属于同一变异株.与2010-2011年北半球乙型流感疫苗株B/Brisbane/ 60/2008相比较,核苷酸同源性在98.5％以上,氨基酸有1～4个位点发生变异,也属于同一变异株.结论 引起本市流感连续暴发疫情的原因可能是本地流行株抗原漂移所致,与疫苗株B/Brisbane /60/2008核苷酸和氨基酸同源性都很高,吻合性较好,如果能够在儿童中普遍接种,应该能够起到很好的预防作用.
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2017年北京市丰台区6例乙型Victoria系流感病毒HA1基因特征分析
目的 了解2017年北京市丰台区流感暴发疫情中乙型Victoria系(BV)流感毒株血凝素(HA1)基因特征和变异情况.方法 对北京市丰台区2017年6起BV流感暴发疫情病例标本中分离得到的6株毒株的HA1基因进行提核酸、扩增和测序,通过DNAStar 7.1、Bioedit v7.0.9、Mega 6.0.6等生物信息学软件对序列进行分析.结果 6例样本中1号样本与2017年部分日本流行毒株亲缘关系较近(99.6％);另5例样本与2016年我国厦门、泰国和肯尼亚部分流行毒株的亲缘关系较紧密(99.1％～99.8％).6例样本与WHO推荐的疫苗株B/Brisbane/60/2008的同源性为98.6％.6例样本共有7个位点发生了变异,其中有5例样本发生了I132V、N144D和E200D的变异,分别涉及到抗原决定簇A、B、D3个区.结论 北京市丰台区2017年BV系流感株的HA1基因发生了个别位点的变异,但与WHO推荐的疫苗株B/Brisbane/60/2008的匹配度相对较高,继续使用疫苗对BV系病毒引起的流感能起到积极的预防作用.
