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MicroRNA在胃癌研究中的应用前景
微小RNA(microRNA,miRNA)是一类广泛存在于多种生物体内、序列长度约19~25个核苷酸、不编码蛋白质的单链小RNA.成熟的miRNA能够识别特定的靶mRNA 3'非编码区,并与之结合,如果两者碱基序列完全互补,则可使靶mRNA降解,如不完全互补,则抑制靶mRNA 翻译,影响蛋白质表达水平,但不影响靶mRNA的稳定性;另外,它可以指导其靶向基因的mRNA快速脱腺苷化,进而导致mRNA的快速衰减和表达水平的降低等.
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表观遗传学与自身免疫病
表观遗传学是一门研究生命有机体发育与分化过程中导致基因发生表观遗传改变的新兴学科.它的主要论点是生命有机体的大部分性状是由DNA序列中编码蛋白质的基因传递的,但是DNA序列以外的化学标记编码的表观遗传密码对于生命有机体的健康及其表型特征同样也有深刻的影响.本文就近几年来主要表观遗传机制及其与自身免疫病关系的研究综述如下.
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蛋白质组学发展的思考
1 蛋白质组研究的必要性与艰难性首先,目前基因组研究的策略虽然能从基因转录的水平,即mRNA水平来说明一种蛋白质表达所须启动的基因状况,从而在程度上反映蛋白质水平.但事实上,一种基因并不仅仅对应于一种蛋白质,而可为几个,甚至几十个,因为大多数mRNA只能编码蛋白质的前体蛋白,后者在不同的时间、空间,经过特定地剪切、加工、修饰、折叠、转运、定位等,才能成为一个有正常功能的蛋白质.这些过程中的任何一个步骤发生微细的差错即可导致异常蛋白质的产生和疾病.而基因是不能完全决定这样复杂的蛋白质后期活动的.
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表面等离子共振技术在蛋白质组学中的应用
被誉为"生命登月计划"的人类基因组计划于2001年2月迎来了它的一个重要里程碑--人类基因组工作框架图完成[1]!它公布了覆盖人类基因组97%的基因序列,并提示仅有3-4万个基因编码蛋白质.面对这些浩如烟海的碱基序列,如何破译全部遗传信息、解码生命的奥秘成为"后基因组时代"的重要任务.结构基因组学正向功能基因组学、蛋白质组学过渡,研究重点变为从整体水平上探讨基因组动态的生物学功能,研究蛋白质结构与功能的关系及蛋白质间的相互作用,解释人类生命现象何以如此复杂多变.
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肿瘤表遗传学(五)
第五讲非编码RNA编码蛋白质的基因组占基因组的不足2%,其余基因组的大部分是编码不同长度的非蛋白质编码RNA或非编码RNA(non-coding RNAs,ncRNAs),这些ncRNA具有重要而多样的生理功能,如在转录和转录后基因沉默、转录物的剪切、加工和修饰以及在构建染色质修饰复合物中起关键作用;进而调控正常发育和各种生理过程,一旦发生异常就可能引发疾病.
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EB病毒编码的蛋白质在癌变过程中的作用
EB病毒是一种与人类肿瘤有密切关系的DNA病毒.在病毒感染的不同时期有不同病毒编码蛋白质的表达,因此研究所表达不同抗原的致瘤作用将有助于研究EB病毒的致瘤机制.本文仅就EB病毒编码蛋白LMP1、EBNA1、EBNA2、BARF0和BARF1在癌变中作用的研究进展作一综述.
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长链非编码RNA在消化道肿瘤中的研究进展
长链非编码RNA (long noncoding RNA,lncRNA)是指长度超过200个核苷酸、具有调控基因表达作用的非编码RNA.lncRNA通过多种调控方式影响肿瘤细胞的生长,参与细胞凋亡调控、肿瘤浸润与转移等过程,有希望成为新型肿瘤标志物和肿瘤治疗的靶点,它在肿瘤诊断和治疗方面已显示出良好的临床应用前景.本文就lncRNA在消化道常见的恶性上皮源性肿瘤中的研究进展做一综述.1 lncRNA概述一般认为,RNA是介于DNA和蛋白之间的信息物质,但人类基因组计划的完成和哺乳类转录组数据的不断积累揭示,人类和其他高级真核生物的遗传物质只有极小一部分编码蛋白质,而超过97%的转录产物是功能多样的RNA分子,即非码 RNA(noncoding RNA,ncRNA)[1-2].
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非编码RN A与肝细胞癌的研究进展
肝细胞癌(hepatocellular carcinoma ,HCC )是临床上的常见恶性肿瘤之一,也是第三大导致癌症病死的原因[1]。由于缺少有效的治疗措施,晚期 HCC常常导致患者快速死亡。与其它多种恶性肿瘤相似,HCC的发生中存在着多种基因网络及信号通路的调控异常。这些改变的基因包括可编码蛋白质的基因及非编码RNA (noncoding RNA ,ncRNA )。近年来,随着对微小RNA(micro‐RNA ,miRNA)研究的深入,逐渐认识到包括miRNA在内的ncRNA在HCC的发生、发展及转移中扮演着十分重要的角色。ncRN A是一种不翻译为蛋白质的功能性RNA ,人类的基因组中只有不足2%的基因序列终翻译为功能性蛋白质,其他很大比例是转录为ncRNA ,并通过多种途径直接发挥生物学作用[2]。ncRNA 具有多种类型,且不同类型的转录谱是存在着巨大差异的。同时,人基因组编码的ncRNA数量仍属未知,也不断有研究发现全新的功能性ncRNA[3]。长链非编码RNA (long noncoding RNA ,lncRNA)是大小超过200个核苷酸长度的ncRNA。虽然与microRNA相比其生物学功能尚不明确,但是越来越多的研究显示lncRNA可通过多种机制来干预相关基因的表达。在 HCC中,ncRNA作为致病、诊断、预后及治疗相关的研究靶点也逐渐引起学者的关注。在此,我们对ncRNA与HCC的关系进行简要的综述。
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MicroRNA-203及其与胶质瘤的关系研究进展
神经胶质瘤是常见的颅内原发性肿瘤,且其发病率随年龄增大有增高的趋势[1-2],也几乎是死亡率高的脑内肿瘤。microRNA-203(miRNA-203)是新近发现的与胶质瘤密切相关的一类表达于真核生物的非编码蛋白质的短链RNA,近年来的研究发现 miRNA-203在胶质瘤中的异常表达与胶质瘤发病的关系密切。其通过与靶基因的完全或不完全配对,调节 mRNA 的降解和翻译,负向调节基因的表达,参与抑制胶质瘤细胞的作用。现对 microRNA-203的特性及其与神经胶质瘤的关系研究进展综述如下。
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ras癌基因与膀胱癌
肿瘤的发生、发展及转移均与基因异常有密切关系,在以往被肯定的膀胱癌致癌因素中,ras癌基因与膀胱癌的关系已被有关的基因学研究证实.现结合文献将二者的关系综述如下.1 ras癌基因与膀胱癌的关系1982年,Weinberg和Barbacid从人膀胱癌细胞株中克隆到第1个人类癌基因,即ras基因.ras基因家族包括K-ras、H-ras和N-ras,是人类肿瘤中常见的癌基因.其编码蛋白质分子量为21KD,称为P21,能与细胞膜结合,具有GPT酶的活性.
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鼻咽癌端粒长度缩短的研究
目的:染色体端粒在维持染色体稳定性和完整性方面起重要作用, 它们富含G重复序列,因而称为末端重复排列.人和其它哺乳动物的端粒 DNA 序列由 5'-3'方向的(TTAGGG)n重复串联组成,在人类大约2-15kb,是非结构基因,不具有编码蛋白质的功能.随着细胞分裂的不断进行,端粒长度逐渐缩短,减少到一定程度,细胞就趋向衰亡,故被认为是细胞有丝分裂的"生物钟".
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心血管疾病相关 microRNA 的研究进展
MicroRNA( miRNA)是一类内源性的、长度约为20~24个核苷酸的非编码单链RNA,由发夹结构的单链RNA前体(约70~90个碱基大小)经过Dicer酶加工后生成。主要通过与靶mRNA的3′端非翻译序列结合,导致靶mRNA降解或转录后翻译抑制,从而调控靶基因的表达。据推测,miR-NA调节着人类三分之一的基因,由于miRNA存在的广泛性和多样性,提示miRNA可能有非常广泛多样的生物学功能, miRNA调节人体多种生理病理活动,如生长发育、细胞增殖和凋亡分化等。 miRNA与心血管疾病密切相关,心肌及相关组织中的miRNA参与心血管疾病的多种病理过程。 miR-NA是多细胞生物中众多基因调控分子中的一种,越来越多的miRNA及其功能被发现,使得miRNA指导基因调控的重要性备受关注[1]。1993年,由Lee等研究人员利用遗传分析的方法在秀丽新小杆线虫( C.elegans)中发现了能时序调控胚胎后期发育的lin-4,lin-4不编码蛋白质,而是编码一种小片段的RNA。然而,当时并未引起研究者太大的注意,因为没有发现其他类似于lin-4的基因,也没有发现类似的不编码蛋白的RNA。直到7年之后,Reinhart等在2000年发现了另一个非编码RNA-let-7,它在调控线虫由幼虫L3期向成虫发育的过程中起重要的调控作用。随后的一年里,随着生物基因学的迅速发展,许多科研人员又相继在线虫、果蝇、斑马鱼和水稻等真核生物和细胞中找到这类的小分子RNA,并将这些具有时空表达特异性的非编码小分子RNA命名为miRNA。至此, miRNA迅速成为生命科学界研究的焦点,对其形成、作用机制和功能的研究很快全面开展起来。
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鼻咽癌EMT相关lncRNA的研究进展
目前,长链非编码 RNA (long non-coding RNA, lncRNA )已经成为人们研究的热点并在越来越多的肿瘤中得到证实。尽管lncRNA不参与编码蛋白质,但参与调控基因的表达。研究者们在多种恶性肿瘤中检测出 lncRNA 异常表达,这些重要的发现对肿瘤的预后及诊断具有重大的意义。上皮间充质转化(epithelialmesenchymal transition, EMT )是上皮细胞转化为间充质细胞,在肿瘤的发生发展、侵袭及转移过程中发挥着重要的作用。随着研究的深入,研究者们发现lncRNA参与肿瘤EMT的调节,但其具体调控机制仍缺乏有力的证据。不可否认,lncRNA参与EMT的调控机制已在多种肿瘤得到证实,而 lncRNA 在鼻咽癌EMT中的作用尚未有报道。鼻咽癌是我国东南部地区高发的肿瘤,恶性程度高,极易转移,因此,探讨lncRNA 调控鼻咽癌EMT的机制将对鼻咽癌的临床诊断、预后判断及新的治疗靶点提供理论和实验依据。本文就 lncRNA 的生物学特性、lncRNA在肿瘤中的作用及lncRNA 与肿瘤 EMT 的相关联系作一全面阐述。
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P16基因的研究进展
恶性肿瘤的发生,目前认为是细胞内癌基因的激活与抑癌基因的缺失和(或)失活所致,其中已发现的癌基因有100多利,而抑癌基因的发现很少,目前已肯定的抑癌基因包括Rb、P53、nm23、P16等,其中P16基因是近研究的热点(1).p16基因,又称MTS1(Multiple Tumor Suppressor 1)或CDKN2基因,是人们发现的第一个直接参与细胞周期调控的抑癌基因,位于染色体9P21(2),其编码蛋白质是周期素依赖激酶4(CDK4,Cyclin Dependent Kinase 4)的抑制剂,周期素与CDK结合,能使Rb1蛋白磷酸化,解除其对DNA合成必需的-酶表达的抑制作用.这一过程是起动细胞由G1其进入S期的核心步骤,因此,P16能控制细胞由G1期进入S期,对细胞的生长周期起负调控作用(3).本文将结合近的新进展,对P16基因与肿瘤的发生、发展及应用的关系,作一简述.
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抗凋亡因子survivin与结肠癌关系的研究进展
Survivin先于1997年由Altier[1]利用效应蛋白酶-Ⅰ从人类基因库中筛选克隆出来.该基因位于染色体17q25,长约75~130 kb[1],含有3个内含子和4个外显子,编码蛋白质属1种哺乳类凋亡抑蛋白家族(inhibitor of apoptosis protein IAP)成员,分子量为16.4ku,含1个独立的BIR结构(可与Caspase-3、7结合而抑制凋亡)和1个螺旋扩展C端的二聚体结构.
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胃癌免疫组化表达54例的分析
近年来研究表明,nm23的表达与癌细胞转移的相关抑制有关.ras基因是较早被确定的由点突变方式被激活而导致组织细胞癌变的基因,而基因编码蛋白质为p21ras.nm23低表达和p21过表达在肿瘤发生发展中的作用越来越引起人们重视.本文应用免疫组化方法探讨nm23、p21的表达和PCNA标记变化与胃癌的一些关系.
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从中医角度探讨微小RNA调控造血机制
微小RNA(microRNA,miRNA)的研究已成为当前生物学、医学领域的一大热点。自从Lee等[1]首次发现miRNA后,各国学者不断对其深入研究,发现miRNA在发育调控、细胞增殖和死亡、造血过程以及肿瘤的发生等方面发挥着重要作用。
1生物特性
miRNA是一种大小约19-25个碱基的单链非编码小分子RNA,通过其"种子序列"与靶mRNA 3'端非翻译区(UTR)的序列完全互补或不完全互补结合,导致靶mRNA降解或翻译抑制,从而在转录后水平负调控靶基因的表达。研究表明miRNA调控了体内超过1/3的蛋白编码序列表达,几乎参与了所有的生物学过程。由于miRNA属于非编码因子,非编码RNA自身不能编码蛋白质,但它可调控下游靶基因mRNA的表达,进而影响蛋白的表达情况。 -
食管癌与微小 RNA 关系研究进展
食管癌(EC)是世界恶性肿瘤和癌症死亡的常见原因[1]。尽管 EC 的诊断和治疗已得到快速发展,但其平均5年生存率仅保持在10%~20%[2]。评估 EC 预后和建立合理的治疗方案显得十分重要。因此,有必要找到食管癌的肿瘤分子标志物。人类基因组计划结束后,人们发现编码蛋白质的基因只占总基因组的2%。而占人类基因组95%的非编码 RNA 在调控细胞分化、凋亡、生物发育、疾病发生等方面均起重要作用。微小 RNA 即microRNA 在不同水平上发挥着基因调控、RNA 切割和基因重组等方面的功能。本文对食管癌与miRNA 的关系作一综述。