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碱基序列HLA基因分型基础上的非血缘骨髓移植治疗白血病一例
患者,女,26岁.1998年12月在本院经骨髓细胞学及染色体检查,确诊为慢性粒细胞白血病(CML)慢性期,Ph染色体阳性.当时外周血白细胞153.0×109/L.服用羟基脲后外周血白细胞降至正常范围,并一直服用羟基脲维持治疗.白细胞计数降至正常范围时进行了HLA检查,在亲缘关系中未找到供者,随后在广州市器官移植配型中心查找到1名HLA抗原型全相合无关供者进行骨髓移植(U-BMT),经采用直接碱基序列HLA-DRB1、B4、B5基因分型,证实供受者基因B1、DRB4*DRB5*基因序列完全相同.无关供者系1名20岁青年,组织配型见表1 ,HLA-DRB碱基序列分型见表2.
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苏云金芽孢杆菌与蜡状芽孢杆菌亲缘关系研究
目的 探讨苏云金芽孢杆菌(Bt)与蜡状芽孢杆菌(Bc)的亲缘关系,为Bt鉴定、安全性评价及降低其致病风险等提供科学依据.方法 采用肠杆菌基因间重复一致序列-PCR(ERIC-PCR)技术,对6株苏云金芽孢杆菌和3株蜡状芽孢杆菌及对照菌株的基因组DNA进行扩增,对其指纹图谱进行分析;回收并克隆重复性好的苏云金芽孢杆菌基因组DNA扩增片段,以其为探针,分别与供试菌株基因组DNA进行杂交.结果 与蜡状芽孢杆菌相比,苏云金芽孢杆菌菌株间基因组DNA指纹图谱较一致;所有供试苏云金芽孢杆菌菌株均扩增产生一条250 bp左右的片段;苏云金芽孢杆菌与蜡状芽孢杆菌均可扩增产生600 bp左右的共有DNA片段.此外,以苏云金芽孢杆菌500 bp片段为探针与苏云金芽孢杆菌基因组DNA杂交有很好的特异性.结论 肠杆菌基因间重复一致序列-PCR指纹图谱可以正确反映苏云金芽孢杆菌与蜡状芽孢杆菌亲缘关系;500 bp片段可以作为苏云金芽孢杆菌鉴定探针.
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几种不同种源远志等位酶与可溶性蛋白鉴别研究
目的:利用等位酶与可溶性蛋白凝胶电泳技术探讨远志不同种源的鉴别与亲缘关系.方法:采用聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)技术分析不同种源远志苹果酸酶、过氧化物酶、酯酶与可溶性蛋白谱带,采用NASYS软件对电泳谱带进行聚类分析.结果:远志可溶性蛋白与等位酶聚丙烯酰胺凝胶电泳图谱能够鉴别不同种源的远志,9份不同种源远志可被聚为三种类型,遗传距离0.1054～1.2040,除卵叶远志外,其余8份远志遗传距离0.1054～0.6931,卵叶远志与远志间的遗传距离明显高于远志间的遗传距离,地理位置相近的远志遗传距离较小,亲缘关系较近.结论:利用等位酶与可溶性蛋白凝胶电泳技术可为不同种源远志的鉴定与划分提供参考.
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副溶血性弧菌重复序列-PCR分型研究
目的 利用REP-PCR技术对副溶血性弧菌进行分子分型研究和亲缘关系的探讨.方法 以基因外重复回文序列(REP)为引物,对20株副溶血性弧菌基因组DNA进行扩增,得到DNA指纹图谱,并利用SPSS 11.5统计软件对DNA扩增图谱进行分析,做出聚类图,并与血清型进行比较分析.结果 REP-PCR可以把20株菌分为7个型,优势菌型为A型和B型,分辨力指数为0.932.结论 REP-PCR方法可以用于副溶血性弧菌分型分析,具有较好的分型能力,如果能将分子分型和血清分型两种方法联用,分辨率会更高.研究推断血清型O1群与O3群菌株之间亲缘关系密切.
关键词： 副溶血性弧菌 分子分型 亲缘关系 基因外重复回文序列-PCR -
五个决定人类相貌基因被确认
[美国每日科学网站9月13日报道]题:确定5个决定人相貌的基因荷兰、德国、加拿大、英国和澳大利亚的研究人员在《科学公共图书馆遗传卷》月刊上发表研究报告称,确定了5个决定人相貌的基因.同卵双胞胎的长相几乎一模一样,兄弟姐妹的长相一般也比没有亲缘关系的人像.这暗示,基因在决定人的相貌上具有重要作用.可是,科学家对决定人类面部形态的基因几乎一无所知.
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《出生医学证明》管理模式初探
<出生医学证明>是一个新生命出生时的健康状况、与其父母的亲缘关系、与出生地的地缘关系的法定证件.在我国,<出生医学证明>还是孩子申报户口的凭证.深圳市从1996年6月1日起使用卫生部统一印制的<出生医学证明>,并同时起用了计算机打印、管理系统,现将我们的管理方法介绍如下.
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微生物基因分类鉴定的方法学进展
分子生物学理论与技术的迅速发展给传统微生物分类鉴定带来了巨大的革新.当代微生物分类学利用遗传学原理和方法分析微生物种、属间的亲缘关系.遗传分类法是根据核酸分析得到的遗传相关性(genectic relatedness)所做的分类.因为这种分类方法是以决定生物表型特征的遗传物质-核酸作为比较的准绳,所以它是一种客观和可信度较高的分类方法[1].
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HBV P基因特征及与乙型肝炎关系现状
人的乙型肝炎病毒(HBV)和一些动物肝炎病毒同属嗜肝DNA病毒科,HBV是此科的原型.嗜肝DNA病毒经反转录复制,与逆转录病毒科有亲缘关系.这类病毒颗粒中含内源性DNA聚合酶(DNAp)活性.
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吉林省2001～2014年麻疹病毒血凝素蛋白基因亲缘关系分析
目的 分析吉林省2001～2014年间麻疹病毒血凝素(hemagglutinin,H)蛋白基因的亲缘关系.方法 选取35株吉林省麻疹病毒株作为代表株,采用RT-PCR法获得麻疹病毒H蛋白核酸分段扩增产物,将测得的序列用DNASTAR软件进行拼接,并用Mega 4.0和Bioedit软件对序列进行亲缘关系和同源性分析.结果 35株麻疹病毒代表株均属于H1基因型H1a基因亚型,且明显处于两个小分支上.35株麻疹病毒株H蛋白基因同源性变化为:株间核苷酸同源性为98.2％ ～ 99.8％,株间氨基酸同源性为95.2％～ 99.8％;与H1a中国代表株(China93-4/H1a)相比,核苷酸同源性为98.8％～99.6％,氨基酸同源性为96.7％ ～ 98.8％;与中国疫苗株(Shanghai-191)相比,核苷酸同源性为94.5％～95.2％,氨基酸同源性为84.7％～86.7％.结论 吉林省2001～2014年间,麻疹病毒H蛋白与中国代表株(China93-4/H1a)的亲缘关系呈逐年渐远的态势发展,与中国H1a代表株和中国疫苗株相比,核苷酸和氨基酸同源性均呈逐年下降的趋势,提示应对吉林省麻疹病毒H蛋白进行持续监测和分析.
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山东菟丝子类药材及与伪品的凝胶电泳鉴别
目的:准确、有效、快速地鉴别山东菟丝子类中药及其伪品.方法:采用聚丙烯酰胺凝胶电泳法.结果:山东四种菟丝子均具有4条相同的谱带,与伪品有较大差异.同一亚属菟丝子各有6条相同的谱带,表明同亚属的菟丝子具有较近的亲缘关系.结论:种子蛋白凝胶电泳的结果可作为菟丝子药材与混伪品之间以及同属菟丝子植物之间的鉴别依据.
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古尼虫草与亚香棒虫草亲缘关系初探
目的:用分子生物学方法,对古尼虫草和亚香棒虫草进行研究,对其寄主昆虫COI( cytochrome oxidase subunitⅠ,细胞色素氧化酶亚基Ⅰ)和真菌ITS(Internal Transcribed Sequence,内转录间隔区)区的基因序列进行比较,以确定两者亲缘关系.方法:在古尼虫草和亚香棒虫草性状研究的基础上,对两者来源真菌ITS区和寄主昆虫COI基因进行了PCR扩增和序列测定,对序列进行比对分析,并与GenBank核酸序列数据库中的序列进行BLAST检索比对.结果:发现古尼虫草和亚香棒虫草的来源真菌ITS区和寄主昆虫COI基因序列均有较高相似度.结论:古尼虫草和亚香棒虫草有较近的亲缘关系.
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鼠疫耶尔森菌亲缘性分型方法研究进展
狭义的亲缘性是指具有一定的血缘或者婚姻的社会关系,现在亲缘关系的范围正在扩火,而本文中亲缘性是指具有相同的遗传背景,相似的进化分支,结构或功能.现将研究鼠疫耶尔森菌亲缘性的方法综述如下.
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浅谈中药材有效利用与开发
为了进一步深入开发中药资源,发掘新药源,研究新用途,拓宽应用领域,使其在卫生保健事业和人民生活中发挥更大的作用,必须树立广义的中药资源理念.多层次、多部门、多方位地进行中药资源的开发研究,以获得更高的经济效益和社会效益.在中药资源中,亲缘关系相近,资源比较丰富的可开发种类较多,因此在实践中可以某种中药材的有效成份作为指标,研究和发掘新药源.
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义乌市33株副溶血性弧菌脉冲场凝胶电泳分子分型结果
副溶血性弧菌（ Vibrio parahaemolyticus ，VP）是一种分布极广的海洋细菌，夏季海水及海产品中常带有此菌。近年来，VP成为我国首要的食源性致病菌，特别是在一些沿海城市，由该菌引起的食物中毒占细菌性食物中毒总数的比例高达60％以上［1－2］。义乌市海产品资源丰富，VP也是主要的食源性致病菌［3］。脉冲场凝胶电泳（ PFGE ）技术因其分辨力高、结果重现性好，而被认为是细菌分子分型的“金标准”［4］。我们对2013年义乌市不同来源的33株VP进行了血清分型和PFGE分子分型研究，旨在初步分析相关菌株间的亲缘关系，了解其内在联系和流行规律，为本市VP食物中毒的防制提供参考。
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ICP-MS法分析不同批次气滞胃痛颗粒中无机元素的差异
目的 建立电感耦合等离子体质谱(ICP-MS)法对10批气滞胃痛颗粒中无机元素的含有量进行测定,并分析其差异.方法 ICP-MS法对10批气滞胃痛颗粒进行半定量检测,建立无机元素轮廓谱.然后,对数据进行聚类分析及主成分分析,并进行全定量检测,验证亲缘关系及差异元素.结果 10批气滞胃痛颗粒分成3组,其中2013年12月至2014年1月2批次的亲缘关系较近,2013年5、6月2批次的亲缘关系较近,其他6批关系较近.从中发现6个差异元素,分别为A1、Ca、Fe、Cu、Zn、As.结论 不同批次气滞胃痛颗粒中无机元素的差异可能来源于原料药材.
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蛋白质电泳指纹图谱在各产地贝母亲缘关系研究中的应用
目的 研究浙贝母和其他产地贝母品种的亲缘关系.方法 采用蛋白质聚丙烯酰胺凝胶电泳指纹技术,对具有代表性的7个品种(系)浙贝及东贝、皖贝、川贝这3种近缘药用贝母(共30份个体)进行分析.结果 10种贝母的基因多样性指数为0.333 4,Shannon信息指数为0.490 2,多态位点百分率(PPB)为85.71％.结论 浙贝母的宽叶、轮叶、狭叶、梅园和新梅园品种间的相似性系数在0.772 2 ～0.933 2之间,其中宽叶种与轮叶贝母遗传距离小,三籽和多籽与其他浙贝品种(系)亲缘关系较远,而与东贝母的遗传相似性高于上述5个浙贝母品种(系),并且皖贝与川贝之间亲缘关系较近,聚为另一类.
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基于ITS序列分析铁皮石斛与近缘类群的亲缘关系
目的:采用分子系统学方法分析铁皮石斛及其近缘种的遗传多样性,为准确进行基源鉴定、阐明属内的种问关系提供分子证据.方法:采集25种40个石斛样品分离提取DNA,PCR扩增ITS区及5.8S rDNA完整序列并测序,用Mega 3.1软件进行分子遗传进化分析.采用邻接法和大简约法分析铁皮石斛亲缘关系构造系统树.结果:对25种石斛类植物的ITS区序列进行分析,两种方法得到的系统树基本一致.ITS序列在石斛种间存在极其显著的差异,铁皮石斛与其它各种石斛均有各自特异性的序列位点.结论:ITS序列作为石斛属植物种间的分子鉴定标记是可行的.
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广西三地广州管圆线虫亲缘关系研究
目的 分析和判定广西钦州、靖西、藤县三地广州管圆线虫(A ngiostrongylus cantonensis)分离株的基因差异和系统发生关系. 方法 从广西钦州、靖西、藤县采集野生蛞蝓,分离广州管圆线虫三期幼虫.提取广州管圆线虫三期幼虫的基因组DNA,特异性扩增内转录间隔区2(internal transcribed spacer 2,ITS2)基因并测序,与GenBank中的广州管圆线虫序列进行比对,分析基因变异.应用Mega5.05软件构建系统发生树,分析系统发生关系. 结果 从三地共采集623条蛞蝓,其中阳性蛞蝓共283条,平均感染率为45.4％.其中靖西感染率高,为52.4％;藤县和钦州感染率分别为49.1％和19.3％.特异性扩增的ITS2长度为700 bp.GenBank检索获广州管圆线虫(A.cantone ns is)、A.dujardini以及脉居管圆线虫(A.vasorum)的相应序列为对照序列,枯病菌(Rhizoctonia solani)的相应序列为构建系统发生树的根(root)序列.广州管圆线虫钦州分离株、靖西分离株、藤县分离株与GenBank中的广州管圆线虫序列的同源性分别为99.5％、99.5％和99.7％;靖西分离株与藤县分离株、GenBank中广州管圆线虫序列的同源性分别为100％和99.5％;藤县分离株与及GenBank中广州管圆线虫序列的同源性为99.5％.三个分离株与A.dujardini、脉居管圆线虫(A.vasorum)的同源性低.以广州管圆线虫为标准株,靖西分离株有11处碱基变异,变异率为1.93％;钦州分离株有6处,变异率为1.05％;藤县分离株有15处,变异率为2.63％,TG短序列重复插入突变明显.在大似然法(maximum likelihood method)和邻接法(neighbor-joining method)构建的系统发生树上,靖西、钦州及藤县的分离株与广州管圆线虫同属一个分枝,系统发生关系较近,A.dujardini、脉居管圆线虫居于另一分枝. 结论 广西三地的广州管圆线虫分离株存在较高的遗传多态性,与GenBank中的广州管圆线虫同源性高,亲缘关系近,初步判断三个分离株与GenBank中广州管圆线虫为同一虫种.
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广东省南澳岛广州管圆线虫遗传多样性调查
目的 研究广东省南澳岛广州管圆线虫(Angiostronglus cantonensis)遗传多样性,分析其与中国不同地区分离株间的系统发生关系. 方法 2015-2016年采用分层随机抽样法在南澳岛抽取3个行政村(宫前村、金山村和六都村),选取55个采样点.用鼠笼捕鼠,解剖鼠类收集广州管圆线虫成虫.现场采集福寿螺(Pomacea canaliculata)和玛瑙螺(Achatina fulica),从螺类收集Ⅲ期幼虫,实验室感染SD大鼠后收集成虫.提取成虫基因组DNA,PCR扩增核糖体DNA内转录间隔区2(internal transcribed spacer 2,ITS2)和线粒体DNA细胞色素氧化酶Ⅰ亚基(cytochrome c oxidase subunit Ⅰ,CO Ⅰ)并测序,运用ClustalX 1.83比对序列,DnaSP5.10分析其序列组成及遗传多样性.从GenBank上获取浙江温州(登录号HQ540551.1)、广东深圳(登录号HQ540546.1)、台湾花莲(登录号KF591125.1)等中国不同地区分离株的ITS2序列,运用Mega6.06基于Kumara 双参数模型计算遗传距离,用邻接法(NJ)和大简约法(MP)构建系统进化树,分析各地区分离株的亲缘关系. 结果 从南澳岛共捕获鼠类110只,广州管圆线虫感染阳性率为29.1％ (32/110);分别检测福寿螺和玛瑙螺1 190只和24只,广州管圆线虫感染阳性率分别为6.1％ (72/1 190)和83.3％ (20/24).PCR结果显示,广州管圆线虫ITS2和CO Ⅰ片段长度分别为693和1 174 bp,位点变异率分别为4.7％和1.0％.南澳岛广州管圆线虫ITS2基因单倍型多样性指数为0.927,核苷酸多样性指数为0.007,平均核苷酸差异指数为4.549.CO Ⅰ基因单倍型多样性指数为0.440,核苷酸多样性指数为0.004,平均核苷酸差异指数为3.743.基于ITS2的分析结果显示,南澳岛与国内其他地区分离株遗传距离为0.181 ～～0.775,NJ法MP法构建的系统进化树基本一致,南澳岛大部分虫体序列与广东深圳、福建福清、云南普洱、广西南宁的分离株同属一大分支,小部分则单独聚成一支. 结论 南澳岛广州管圆线虫种群内存在一定程度的遗传分化和遗传多样性,其虫体可能存在多种类型和来源,但尚需进一步研究.
关键词： 广州管圆线虫 内转录间隔区2 细胞色素氧化酶Ⅰ亚基 遗传多样性 亲缘关系 -
线粒体DNA ND1基因突变与家族性糖尿病
糖尿病(DM)是常见的代谢性疾病之一,遗传因素在该病的发生中起重要作用.线粒体DNA(mtDNA)突变是导致家族性糖尿病的病因之一[1].mtDNA tRNALeu(UUR)基因nt 3243A→G点突变是迄今唯一明确的致糖尿病点突变,其发生率在家族性DM群体中占1%～3%.然而,该突变的发生率不能单独解释母系遗传DM现象,可能还有更广泛围的突变存在于mtDNA中.为此本研究选择有DM家族史的DM患者及正常人进行mtDNA分析.一、对象和方法1.对象:选择无亲缘关系、家族中有母亲和(或)兄弟姐妹患病史的DM患者128人(第1组);有父亲患病史的DM患者32人(第2组),无家族史的DM患者50人(第3组)及100例无DM家族史的正常人作为对照组(第4组).每一组研究对象的性别、年龄及DM类型等情况(表1).所有患者均按照1985年WHO的糖尿病标准进行诊断.
