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基于生物信息学方法探析补肺益肾方的分子网络及生物功能
目的:通过生物信息学方法探析治疗慢性阻塞性肺疾病(COPD)有效方剂补肺益肾方的分子网络及生物功能,为中药复方药理机制研究提供新思路.方法:通过在线数据库查找补肺益肾方中药成分的化合物,在PubChem数据库中检索这些化合物的靶蛋白,运用Ingenuity Pathway Analysis(IPA)软件对二者进行分子网络、生物功能及相关生物学通路的构图和解析.结果:查找到补肺益肾方的靶蛋白共239个,可构建成9个分子网络,其中相关的前3个分子网络功能为:Cellular Development、Energy Production和Cancer.与补肺益肾方相关的前3个生物功能为:Cellular Growth and Proliferation、Cell Death and Survival和Inflammatory Response.与补肺益肾方相关的前3个生物学通路为:Cell Cycle:G1/S Checkpoint Regulation、Chronic Myeloid Leukemia Signaling、Cyclins and Cell Cycle Regulation.结论:通过查找中药化合物靶标并通过IPA软件进行分析的生物信息学方法可以用于解析补肺益肾方的分子网络及生物功能.
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麻杏石甘汤防治甲型H1N1流感分子机制的生物信息学分析
目的:通过构建分子网络及解析生物学通路,探讨麻杏石甘汤防治甲型H1N1流感的分子机制.方法:查找麻杏石甘汤中药成分的有效化合物,在PubChem数据库中检索有效成分的靶蛋白,在Gene数据库中查找甲型H1N1流感的相关基因,运用Ingenuity Pathway Analysis (IPA)软件对二者进行构图和解析.结果:查找到麻杏石甘汤的靶蛋白186个,甲型H1N1流感相关基因7个.二者的分子网络复杂,生物功能多样,在共同作用的8条生物通路中,有4条通路为细胞免疫相关通路:病毒模式识别受体信号通路、巨噬细胞白介素12(IL-12)信号和生产通路、蛋白激酶(PKR)在干扰素诱导的抗病毒反应中作用通路、肿瘤坏死因子受体Ⅰ(TNFR1)信号通路.麻杏石甘汤可以调节细胞免疫相关通路中的Toll样受体9(TLR9)、磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)、核苷酸结合的寡聚结构域2受体(NOD2)等多个位点.结论:麻杏石甘汤可以通过干预细胞免疫相关通路中的多个位点起到防治甲型H1N1流感的作用.
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一贯煎治疗肝癌的分子机制生物信息学分析
目的:通过生物信息学技术研究滋阴疏肝药一贯煎治疗肝癌的分子机制.方法:在PubChem数据库中查找一贯煎组成药物的活性靶蛋白,在Gene数据库中查找肝癌相关人类基因,运用生物软件Ingenuity Pathway Analysis(IPA),构建二者分子网络并解析生物学通路.结果:查到一贯煎靶蛋白分别76个,肝癌相关基因300个,二者分子网络复杂,生物功能多样,共同作用生物通路281条,主要涉及凋亡和肿瘤等相关生物学通路,且一贯煎可作用肝癌相关通路的TP53、NF-κB、STAT1、ERK1/2、MMP2等78个位点.结论:一贯煎可通过干预肝癌相关的凋亡和癌症通路中多个位点发挥治疗的作用.
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雷公藤甲素治疗胰腺癌分子机制的生物信息学分析
目的:通过生物信息学方法探讨雷公藤甲素(TP)治疗胰腺癌分子机制.方法:在PubChem数据库中查找TP活性靶蛋白,在Gene数据库中查找胰腺癌相关基因,运用Ingenuity Pathway Analysis (IPA)软件,构建二者分子网络和生物学通路并解析.结果:二者涉及的生物学通路中有5个共有生物学通路,2条为癌症相关通路,TP可作用癌症相关通路的溶血磷脂酸受体(EDG)、JAK等.结论:TP可通过干预胰腺癌相关的凋亡通路和癌症信号通路上多个位点发挥治疗胰腺癌的作用.
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喜炎平注射液防治甲型H1N1流感分子机制的生物信息学分析
目的 通过生物信息学方法,探讨喜炎平注射液防治甲型H1N1流感(简称甲流)的分子机制.方法 以“Andrographolide”(穿心莲内酯)为检索词,在PubChem数据库中查找其相关生物学结果,根据结果确定穿心莲内酯的活性靶蛋白.以“H1N1 influenza A”(甲流)为检索词,在Gene数据库中查找甲流的相关基因.利用IPA生物信息学软件分别构建穿心莲内酯的活性靶蛋白及甲流相关基因的分子网络,并进行生物学作用通路及分子作用机制的解析.结果 查找到穿心莲内酯的活性靶蛋白9个,甲流相关基因22个.二者构成的网络中共同分子为:Akt、Hsp90、Hsp27、PI3K、ERK1/2、NFkB、Proteasome、caspase、Jnk、P38MAPK、Pka、Pkc (s)、Ras、RNA polymeraseⅡ、Vegf,其中穿心莲内酯靶蛋白网络的分子大多与细胞周期、胚胎发育及细胞间信号传导有关;甲流相关基因网络中的分子大多与传染性疾病、炎症反应及免疫性疾病有关.二者共同作用的通路以细胞免疫通路为主,穿心莲内酯主要作用于该类通路中的AKT和NF-κB分子.结论 喜炎平注射液可能通过调解细胞免疫通路中的AKT和NF-κB分子干预甲流.
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MPO及TNF-α在小鼠侵袭性肺曲霉病中的作用
烟曲霉菌是自然界广泛存在的腐生致病菌,易导致免疫力低下患者发生严重且致死性的侵袭性肺曲霉病(IPA).通过建立小鼠侵袭IPA模型,探讨髓过氧化物酶(MPO)及TNF-α在侵袭IPA中的作用,为阐明IPA的发病机制提供资料.
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侵袭性肺曲菌病的CT表现
侵袭性肺曲菌病(invasive pulmonary aspergillosis,IPA)是肺曲菌病中严重的类型,是免疫功能受损、危重或衰弱患者较常见的肺部并发症,死亡率高达30%~40%,不同于肺曲霉球和过敏性肺曲霉菌所致病者.该病诊断较困难,确诊常依赖于肺活检.近年来国外有较多文献探讨CT扫描对IPA的诊断价值,国内学者对此病的认识也有所提高,报道逐渐增多.
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慢性阻塞性肺疾病合并侵袭性肺曲霉病的研究进展
侵袭性肺曲霉病(invasive pulmonary aspergillosis,IPA)常常继发于免疫受损和器官移植患者,病死率较高.近年来,COPD患者继发IPA国内外均有报道,其病死率在80%以上[1],亦有文献报道[2]COPD是IPA的危险凶素.临床上治疗时机的延误是主要的死亡原因,呼吸道标本中发现其他致病微牛物是延误治疗的原因之一.COPD患者IPA的发生率较高,长时间肺部浸润影和临床病情的短时间恶化需警惕IPA发生的可能性[3].现将COPD合并IPA的进展综述如下.
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两种抗原联合检测对诊断侵袭性肺曲霉病的诊断价值
真菌血清抗原检测在侵袭性肺曲霉病(invasive pulmonary aspergillosis,IPA)中的诊断价值越来越受到重视.目前开展较为广泛的血清学检查方法包括1,3-β-D葡聚糖抗原检测(G试验)和曲霉半乳甘露聚糖检测(GM试验).
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连续血清半乳甘露聚糖检测在重症慢性阻塞性肺疾病合并侵袭性肺曲霉病诊断和预后评价中的价值
侵袭性肺曲霉病(IPA)为血液系统恶性肿瘤或严重免疫抑制患者常见的机会性感染,连续血清半乳甘露聚糖(GM)检测可用于该人群IPA的早期诊断.近来研究结果提示入住ICU的重症COPD患者是IPA的高危人群,在这一人群中,IPA往往难以与普通细菌感染相鉴别,诊断困难,病死率极高.早期诊断和及时开始治疗对改善重症COPD合并IPA患者的预后极为重要.GM检测亦可作为评价血液系统恶性肿瘤患者预后的指标之一.本研究采用单中心前瞻队列研究的方法,评价了连续血清GM检测对入住ICU的重症COPD合并IPA患者的诊断和预后评估价值.
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药物预防慢性阻塞性肺疾病患者真菌感染的探讨
慢性阻塞性肺疾病((COPD)是呼吸内科的主要疾病,呼吸道感染是造成COPD患者急性加重的重要因素,在COPD急性加重期(AECOPD)的治疗中,抗生素是不可缺少的,同时根据病情可能还要使用激素,这样就容易引起侵袭性真菌感染(IFI),加重病情,增加了治疗的难度,甚至导致患者死亡.目前报道多的是侵入性肺曲霉菌病(IPA).
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影响公立医院员工对绩效方案满意度的因素研究
本研究于2014年4月8日对上海市浦东医院全院进行问卷调查,问卷发放200份,回收后有效问卷114份.问卷分为五大维度,绩效考核方案的落实程度、绩效考核方案的优势、绩效考核的公平性、绩效考核后整体质量的影响、医院绩效考核的结果及分配.本文通过重要性/绩效分析(IPA),提出以下建议:第一、利用绩效管理系统实施绩效评价体系的动态监测;第二、重视医疗服务特殊性对医院绩效管理水平影响;第三、加强医院文化建设从而提升对绩效管理水平.希望医院建立以科学评价为关键的新型绩效管理模式,提高员工对绩效的满意度和对绩效的支持及对医院的归属感,从而有效推动医院绩效改革,促进医院经营发展,提高医院生产效益.
关键词: IPA 重要性/绩效矩阵分析 绩效满意度 -
EM:Drug & Pharmacology与IPA的比较研究
从数据库概况、来源期刊情况、主题词、副主题词及文献的主题侧重等方面对比分析了EM:D&P和IPA的特性,旨在为广大药学科研和情报人员在选择数据库时提供参考.
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支气管肺泡灌洗液半乳甘露聚糖检测在诊断恶性血液病患者肺部真菌感染中的价值
近年来,接受大剂量化疗和干细胞移植治疗的血液系统恶性疾病患者数量逐年增加,成为侵袭性真菌感染(Ifi),尤其是肺部侵袭性曲霉菌感染(IPA)的高危人群[1].
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基于生物信息学方法探析川芎嗪对类风湿性关节炎作用机制
目的:通过生物信息学方法探析川芎嗪对类风湿性关节炎作用机制,为其后续的实验验证及应用拓展提供预测性科学依据.方法:将Pubchem数据库中查找到的川芎嗪人类靶蛋白和类风湿性关节炎Gene数据库中获得的人类靶基因导入IPA分析平台,把两者相关的网络、信号通路进行比较分析,进而得出川芎嗪作用于类风湿性关节炎的可能机制.结果:通过本研究,发现川芎嗪主要通过第二信使信号通路参与类风湿性关节炎发生发展中细胞的生长、增殖和发育、生存与死亡等功能.川芎嗪通过三条路径影响了类风湿性关节炎中细胞的转录功能,分别是Gaq-PI3K-AKT-NF-κ B路径、Gas-cAMP-RAF-ERK1/2-CREB路径和Gai-STAT3路径.川芎嗪可能通过RGS蛋白对G蛋白偶联受体信号进行了负调控.结论:通过查找川芎嗪靶蛋白、类风湿性关节炎基因并通过IPA软件进行分析可以得出川芎嗪作用于RA的可能机制.
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基于重要性-绩效性分析的开封市中老年人休闲满意度
目的:丰富老年人的休闲生活,提高老年人休闲质量和满意度。方法在深度访谈和问卷调查的基础上,运用IPA分析法对影响老年人休闲满意度各因子的重要性和实际感受进行对比分析。结果老年人有选择地进行休闲活动对身心健康起到了良好的效果,但是老年人休闲设施的供给、休闲技能、丰富兴趣爱好和获得新知识四方面亟待改善。结论加强老年人休闲设施建设,注重老年人休闲教育。
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慢性阻塞性肺疾病合并侵袭性肺曲菌病3例分析
侵袭性肺曲菌病(IPA)多发生在血液系统肿瘤及器官移植等免疫功能受损患者,发病率及病死率较高[1],近年来慢性阻塞性肺疾病(COPD)患者合并肺曲霉感染特别是IPA的报道越来越多,其临床表现缺乏特异性,预后差,早期文献报道的病死率几乎100%[2],国内近年报道的也在70%[3],而其确诊在临床上非常困难.鉴于此,现将我院近两年来确诊的COPD合并IPA 3例分析报道如下.
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重度哮喘发作为主要症状的侵袭性肺曲霉菌病2例及文献复习
侵袭性肺曲霉菌病(IPA)常发生于重度免疫损害患者中,如恶性肿瘤和血液病化疗患者.发生在免疫功能正常宿主中较少见.一旦发生患者病情重,进展迅速,死亡率高,因患者无常见的高危因素,临床上常被误诊[1].近年来,慢性肺部疾病合并侵袭性肺曲霉菌病的报道增多,认为慢性肺部疾病尤其COPD是IPA发病的高危因素[2].现报道我院治疗的有慢性肺部疾病的2例原发性IPA,以提高临床警惕性.
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侵袭性肺曲霉菌病5例临床分析
侵袭性肺曲霉菌病(IPA)主要见于免疫受损患者[1-2].目前IPA在早期诊断和治疗上均存在较大的困难,病死率仍较高[3].本研究通过回顾分析5例较为典型的IPA患者的临床诊治经过,以期提高对该病的认识.
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重症慢性呼吸道疾病合并侵袭性肺曲霉病的临床特点
目的:对重症慢性呼吸道疾病合并侵袭性肺曲霉病(CRD & IPA)的临床特点进行总结和探究,为该病的早期诊断与治疗提供依据.方法:将入住我院的96例重症慢性呼吸道疾病患者的资料进行回顾性分析,并对侵袭性肺曲霉进行分离.结果:在上述CRD患者之中,确定有IPA的患者有22例,占整个CRD患者的22.9%.在22名CRD&IPA患者中,已经确诊5例,临床诊断为13例,4例拟诊,分别占CRD&IPA患者的22.7%、59.1%、18.2%.结论:CRD&1PA并非为少见症状,预后差,因此需要加强对CRD&IPA的诊断,以尽快使医生确定治疗方案.
关键词: 重症慢性呼吸道疾病合并侵袭性肺曲霉病 CRD IPA X线 曲霉