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分子分型技术在结核病流行病学研究中的应用价值
结核病是严重威胁人类健康的传染病,近年来,由于结核菌耐药性增强,以及不少国家和地区忽视对结核病的控制,使全球结核病的流行非常严重,结核病再次成为一个严重的全球性公共卫生问题.流行病学研究是控制结核病的重要环节.监测感染的爆发以追踪某种特定结核菌菌株的传播是控制结核病的有效手段,受感染个体的菌株分型在追踪传染源方面起重要作用.
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MTD法和多位点PCR在肺外结核感染快速检测和菌株分型中的应用价值
目的:探讨MTD法和多位点PCR在肺外结核感染快速检测和菌株分型中的应用价值。方法:收治肺外结核感染患者120例,随机分为两组。对照组应用常规涂片检测方法,研究组采用MTD法和多位点PCR检测,比较两组临床快速检测效果。结果:研究组检测阳性率明显高于对照组(P<0.05)。研究组检测准确率明显高于对照组(P<0.05)。结论:MTD法和多位点PCR进行肺外结核感染快速检测,检测阳性率高,菌株分型准确率高。
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结核分支杆菌株水平鉴定技术及其研究进展
结核分支杆菌菌株分型对结核病流行病学调查和监测、传染源的发现、传播途径的阻断以及发病机制的研究都极为重要.结核分支杆菌的分型方法,主要分为非核酸法和核酸法.非核酸分型方法即传统分型方法,多是在细菌表型特征的基础上认识细菌的,包括生化分型法、血清分型法和噬菌体分型法.但由于结核分支杆菌分离株具有高度同源性,通过常规的生化试验和血清学方法是无法鉴别的,所以,对于结核分支杆菌,唯一可用的传统的菌株鉴定方法只有噬菌体分型法.随着分子生物学理论和技术的飞速发展,1980年以后,逐步建立了一些根据核酸序列进行菌株鉴定的高度特异的基因分型方法,即核酸法.主要包括:限制性片段长度多态性(RFLP)、DNA指纹图谱分析、脉冲场凝胶电泳(PFGE)、聚合酶链反应(PCR)酶切分型、随机扩增多态性(RAPD)DNA、DNA序列分析以及基因芯片技术等等.随着上述方法的应用,使结核分支杆菌的菌株分型进入了一个全新的领域,也进而使结核病流行病学的研究取得了很大的进展,现将对上述各分型方法综述如下.
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《美国药典》(35/NF30)附录微生物特征描述、鉴定和菌株分型
译者按:药典( Pharmacopoeia) 是一个国家记载药品规格、标准的法典.大多数由国家组织药典委员会编制,并由政府颁布,具有法律的约束力[1].药品是特殊商品,药品安全关系到广大群众身体健康和生命安全[2],因此必须对药品进行严格的监督管理,而药品检验则是监督管理的必要技术依托.随着当今科学技术的发展,对药品的检查技术也提出了更高的要求.为了提高药品检查水平,更好的满足我国与日俱增的进出口药品的检查,本文将<美国药典>(35/NF30)附录微生物特征描述、鉴定和菌株分型[3]章节译出,以期为药品的有效检验和我国药典标准修订提供参考.
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随机引物PCR基因分型方法及其在MRSA医院感染研究中的应用进展
目前MRSA、HBV、HIV三种病原所致疾病被认为是人类的三大流行传染病.自60年代发现MRSA以来,其导致医院感染所占的比例逐年上升,在革兰阳性菌中其发生率仅次于凝固酶阴性葡萄球菌[1].为了控制MRSA感染,首先要对其菌株分型,以便了解其传染源及传播途径,从而采取合理的措施防止流行和暴发感染.
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念珠菌菌株分型实验研究进展
菌株分型是通过分类,比较不同分离株之间的遗传相关性和差异性,并结合其流行病学特点,探讨菌株之间进化关系的一种研究手段.临床念珠菌分型在研究其物种相关性、评估流行病学、追溯流行源头、控制和预防临床感染以及抗真菌药物研发和抗真菌治疗等方面具有重要的指导意义.本文将从原理和优缺点等方面,介绍当前念珠菌属主要分型方法及新型分型方法,包括基于蛋白 / 酶的分型方法、基于精准 DNA 序列的分型方法、无需精准 DNA 序列的分型方法等.
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重视A族链球菌和相关儿科疾病的研究
A族链球菌(GAS)是儿童期感染的常见病原菌,可以造成严重侵袭性感染及感染后并发症.近年来,A族链球菌感染暴发报道增多,已引起人们关注,对A族链球菌基础和临床研究集中在:感染的实验室快速诊断技术、临床菌株分型、流行病学、严重感染及并发症发病机理等诸多方面.国内有关GAS研究报道尚不多,现将就其国外新近研究进展做一介绍.
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致病性真菌DNA提取方法的实验研究
聚合酶链反应(PCR)技术可用于真菌感染的早期诊断和菌株分型[1]为保证PCR技术及其相关技术的顺利开展,要求提取的真菌DNA完整,纯度高,不含TaqDNA聚合酶抑制剂,并且快速,简便,费用低.为探讨提取真菌DNA的佳方法,本研究对3种提取真菌DNA的方法进行了比较,结果显示用尿素裂解法提取的真菌DNA完整性好,纯度高,操作步骤简便,缩短了工作时间,所需费用低,适用于多种真菌DNA的提取,现报道如下.
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2%盐水灌肠治疗小儿急性菌痢临床观察
我院1996年7月~1999年9月应用2%盐水清洁灌肠治疗小儿急性菌痢68例,取得满意的临床疗效,报道如下。1 临床资料136例均为同期住院患儿,男92例,女44例,年龄7个月~13岁,病程2~43小时,体温>40.0℃ 47例,伴呕吐19例,血常规检查白细胞>20.0×109/L 58例,<10.0×109/L 23例,大便培养52例中阳性38例。菌株分型:福氏35例(92%),志贺氏2例(5%),宋内氏1例(3%)。随机分为治疗及对照两组,每组各68例。两组患者在年龄、性别、病程、临床症状及菌型方面无显著性差异,P>0.05,具有可比性。
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结核病菌株分子分型的技术进展
结核病(TB)是成人单一病原体所致死亡的主要原因,每年约引起300万人死亡.结核分枝杆菌(M.TB)是所谓"成功的病原体".据估计全球1/3的人口感染了M.TB.菌株分型是近年来TB领域研究的热点之一,基因分型方法可以研究M.TB菌株之间的遗传学关系,有助于探讨多种重要的流行病学问题,如家庭或社区中传染的来源、获得性耐药病原体的传播和早期发现等等.
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麻风在中国云南丘北县的传播:8年分子流行病学调查
目的:评价麻风在云南省文山州丘北县分子流行病学模式.方法:2002 - 2010年发现164例患者进入本研究,其中130份皮肤样本适用于可变数目串联重复序列(variable number of tandem repeat,VNTR)分型.收集患者人口统计资料,进行菌株VNTR分型和基因型的聚类分析.结果:分析显示该县某些少数民族人群的发现率明显高于全国水平.聚类分析表明家庭内和邻近乡镇的菌株型相似,8年间某些聚集株持续出现.菌株基因型相匹配的病例所占百分率随地理分布而变化.北部乡镇聚集株的比例相当高,菌株分类仍与以前确定的组群一致.南部菌株基因型与北部不同,但无法鉴别南部菌株间的亲缘关系.结论:社交活动,自然居住和职业环境等可能更利于北部菌株的传播.
关键词: 麻风 流行病学 菌株分型 可变数目串联重复序列 -
杭州市上城区与富阳市副溶血性弧菌食物中毒流行株的分型研究
目的:研究杭州市上城区与富阳市副溶血性弧菌食物中毒株与不同流行株进行耐热溶血素基因分析.方法:采集可疑食物标本等104株进行副溶血性弧菌血清分型,对45株流行株应用PCR技术对TDH和TRH检测.结果:富阳市1997年、1999年- 2001年、2003年- 2004年副溶血性弧菌以O1:K6、O3:K6、O4:K8三个血清型为食物中毒优势菌型;上城区2005年- 2007年以O1型23株;O2型1株;O3型37株;O4型25株;O5型1株;O10型1株为食物中毒优势菌.用PCR技术对45株TDH和TRH进行检测结果O1型16株,15株TDH阳性,1株TDH阴性;O3型9株TDH阳性;O4型20株,17株TDH阳性,3株TDH阴性.45株TRH1和TRH2全部阴性.结论:杭州市上城区与富阳市副溶血性弧菌所致食物中毒优势菌型以O1、O3、O4和O2、O5、O10血清璎为主,能够为食物中毒疾病预防和流行病学调查提供依据.
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RCR Ribotying在细菌分子流行病学研究中的应用
细菌流行病学鉴定的分子标记技术迅速发展,常以染色体或染色体外DNA为材料,产生特异的或随机的多态性.如DNA限制性片段长度多态性分析(RFLP)、脉冲凝胶电泳技术是非常有效的,但二者都受到耗时及需要昂贵设备等因素的限制,不适于临床实验;rRNA基因的DNA探针技术也适于流行病学研究,但操作较烦琐;Srull[4]等率先把rRNA基因的限制性片段长度多态性(RFLP)分析应用于实践,并称为ribotyping.利用rRNA为基础的广谱探针,分析Southern杂交后呈现的染色体探针指纹谱,已被众多研究者用作描述细菌特征和菌株分型(ribotypes)的一种方法.
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梅毒螺旋体分子流行病学研究进展
梅毒是由苍白螺旋体(treponema pallidum ,TP)引起的慢性传染病,主要通过性交传染。近年来,世界各地梅毒发病率呈上升趋势,我国梅毒发患者数也快速增长,据报道,2010年全国报告梅毒病例358534例,2010年发病率26.86/10万,比2009年增加17.02%,居全国乙类传染病的第3位。本病危害大,可侵犯皮肤黏膜、心血管、神经、骨骼等造成多系统损害,也可使妊娠期妇女发生流产、死胎和分娩先天梅毒儿。在性传播疾病中,梅毒致死性仅次于艾滋病,其与艾滋病的传播途径相似,同时,梅毒作为一种溃疡性性病,可大大增加感染 HIV的风险,有报道称生殖器溃疡患者较健康人感染 H IV的危险性增加4~5倍[1],因此,梅毒的流行在客观上促进了 HIV的传播,控制梅毒等相关的生殖器溃疡疾病,能有效控制 H IV的传播和艾滋病的发生。目前,国内外学者也越来越重视梅毒螺旋体的研究。梅毒螺旋体分子亚型研究不仅与梅毒流行病学紧密相关,也可用于识别和分析梅毒的再感染。 TP不能根据血清学方法进行区分,有学者曾通过DNA杂交及单核苷酸多态性等进行分型,未成功[2-3]。自从 Fraser等[4]揭示了 T P的基因序列后,有关TP的研究进入了分子生物学时代。
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牙龈卟啉单胞菌的分型及其致病作用
牙龈卟啉单胞菌被认为是牙周疾病重要的致病菌之一,与多种牙周疾病特别是成年人牙周炎关系密切。本文对其生物学特性、血清分型、遗传分型的临床流行病学特点及其致病性等进行了综述。