首页 > 文献资料
-
AFLP技术在细菌学分型和流行病学调查中的应用
基于DNA水平的生物遗传多态性分析大大丰富了生物多样性的发现和分析.近年来,对于基因多态性的研究及基因标记技术迅速发展.目前用于多态性分析的方法主要有限制性片段长度多态性(RFLP)、随机引物PCR(RAPD)、脉冲场凝胶电泳(PFGE)、细菌的核糖体基因分型(Ribotyping)、多位点序列分析(MLST)以及扩增片段长度多态性(AFLP)等[1].这些方法所得到的多态性,都是运用染色体DNA通过限制性内切酶消化或/和PCR扩增的方法,根据带型中一些特征条带的存在或缺失来比较.带型的差异是实验菌株之间遗传距离的直接反映,因而认为这些带型是菌株的"基因组指纹",可以用于生物的鉴定和分型[2].
关键词: 片段长度多态性(RFLP) 细菌分型 流行病学 -
阴沟肠杆菌基因分型方法的比较研究
细菌分型的方法多、应用灵活、对不同的菌属分辨力不同,实验室之间缺乏统一的应用标准,造成不同实验室之间结果无法进行比较。
-
应用AFLP方法对我国土拉弗菌基因分型的研究
土拉菌病又称"野兔热",是由土拉弗菌经患病野生动物、吸血昆虫或遭受污染的水或食物传播的一种自然疫源性疾病,呈世界性分布.其致病菌是革兰阴性胞内寄生菌,包括4种基因型.由于不同基因型在地理分布、毒性等方面存在较大差异,基因分型研究一直是该领域的研究热点,而近年来随着16S rRNA的序列分析、随机引物扩增多态性(RAPD)、限制性片段长度多态性(RFLP)、扩增片段长度多态性(AFLP)等分子生物学方法在细菌分型中的应用,世界范围内许多地区的土拉弗菌株得到了很好的基因型鉴别,也对一些传统认识提出了新的质疑,如欧亚地区是否也存在致病性较强的A型菌株?事实上在1998年科学家们证实了这一疑问[1].
-
脉冲场凝胶电泳技术及其在细菌分型中的应用
随着对细菌感染研究的日益深入,传统的细菌鉴定技术已不能很好地满足医院感染的诊断和流行病学调查的需要,表型分型方法如药敏试验等可用于检测疫情的爆发流行,但不能确认菌株之间的相关性[1].如今,从型、亚型、株甚至分子水平上去认识细菌变得愈来愈重要,因此分子生物学在细菌分型上得到了广泛应用.
-
表皮葡萄球菌和结核杆菌对关节假体黏附机制的研究进展
关节置换术后感染一直是骨科医师面临的棘手问题,又被称为"关节置换术后的灾难性并发症",也是阻碍人工关节学科发展的主要障碍.近年来,随着无菌术严格化、操作技术规范化以及预防性运用抗生素等多种手段的应用,关节置换术后的感染率有所下降,但仍然保持在1%~5%[1,2].研究表明,患者术后发生感染的初始原因是细菌黏附在人工关节表面[3].目前,对假体周围感染的细菌分型、黏附因素及黏附机制进行了积极地探索和研究,本文对相关进展进行综述.
-
贵阳市甲型副伤寒沙门菌脉冲电场凝胶电泳分型分析
目的 了解贵阳市甲型副伤寒沙门菌的分子流行病学特征,分析菌株的相似性,为追踪传染来源、查找传播途径提供线索.方法 用脉冲电场凝胶电泳(pulsed field gel electrophoresis,PFGE)方法进行分型.结果 根据细菌染色体DNA的Spe I酶切图谱,将贵阳地区146株甲型副伤寒沙门菌分成10个PFGE带型,1型32株占21.9%,2型73株占50.0%,3型13株占8.9%,4型7株占4.8%,5型14株占9.6%,6型、7型、8型和9型各1株,各占0.7%,10型3株占2.7%,各型之间的相似性在98.1%~72.0%.暴发株24株被分为5个PFGE带型,1型占54.2%,带菌者1株为1型.各年菌株的PFGE带型不尽相同,1型和2型为常年流行带型.高流行区县的甲型副伤寒菌株被分为9个PFGE带型.结论 贵阳地区甲型副伤寒沙门菌流行复杂以2型和1型为优势流行带型,提示存在同一克隆群的菌株广泛传播.该研究进一步证实PFGE是一种发现或预警暴发的可行服务手段.
-
细菌分子分型方案的发展及其比较
细菌感染的爆发流行是当今社会的常见问题,对菌株的正确分型是进行细菌流行病学及抗菌药物研究的关键.现代分子生物学技术的发展为细菌分型提供了可靠的保证,在判定感染的爆发、确定感染的病原菌、寻找感染源以及识别一些特殊致病菌等方面发挥着重要作用.目前,正致力于研究速度更快、成本更低、通量更高、更适用于应对突发事件和临床检验的测序分型方案.
-
空肠弯曲菌的主要表面抗原成分在细菌分型及致病机制中的作用
空肠弯曲菌(Campylobacter jejuni,空弯菌)是全球性引起胃肠道感染细菌性肠炎常见的食源性病原体之一.该菌广泛存在于家禽类动物的肠道中,污染水源或食物后可引起腹泻的暴发流行,对成人、小儿可引起急性胃肠炎,也可导致心内腊炎、关节炎、败血症和血栓静脉等全身性疾病,还与人的急性感染性多发性神经根神经病,即格林巴利综合征(guillain-barre syndrome,GBS)的发生有密切关系[1].
-
感染创面细菌分型与治疗
创面细菌感染是临床上常见的并发症之一,而控制创面感染是临床治疗的重要部分,因此明确细菌种类及其药物敏感性是指导控制或消除创面感染的重要依据.本文对近10年的创面细菌培养及药物敏感试验予以调查,总结出创面感染的主要菌种及其药物敏感情况,以期为临床上感染创面的切实治疗提供一定的指导意义.
-
呼吸道感染患儿流感嗜血杆菌的生物分型与耐药性研究
目的 了解呼吸道感染患儿流感嗜血杆菌的生物分型及其对常用抗菌药的耐药情况.方法 对320例呼吸道感染患儿的鼻咽分泌物进行流感嗜血杆菌检测,采用流感嗜血杆菌选择性培养基进行分离培养,通过卫星试验进行菌株鉴定,采用吲哚试验、脲酶试验及鸟氨酸脱羧酶试验进行流感嗜血杆菌的生物分型,采用纸片扩散抗菌试验进行微生物敏感性试验,采用头孢硝噻吩纸片检测流感嗜血杆菌β-内酰胺酶.结果 呼吸道感染患儿鼻咽分泌物的流感嗜血杆菌检出率为47.50%(152/320),共检出Ⅰ、Ⅲ、Ⅳ、Ⅴ、Ⅵ 5型,分别占3.29%(5/152)、5.26%(8/152)、33.55%(51/152)、54.61%(83/152)、3.29%(5/152).产β-内酰胺酶的流感嗜血杆菌占42.76%(65/152).流感嗜血杆菌对四环素、利福平和美罗培南敏感;对阿奇霉素和左氟沙星的耐药率均小于10.00%;对氨苄西林、氯霉素和复方磺胺甲噁唑的耐药率为87.50%~100.0%.结论 该院流感嗜血杆菌Ⅳ、Ⅴ型是儿童呼吸道感染的主要生物型,产β内酰胺酶是其耐药的重要机制.
-
细菌的分子生物学分型及其临床意义
分子生物学技术已经成为细菌分型的有力工具.本文介绍了常用的细菌分子生物学分型方法.其中脉冲场电泳已成为多种细菌分型的金标准,而随机引物PCR、扩增片段长度多态性、多位点序列分型、质粒图谱分析、青霉素结合蛋白基因指纹图谱分析及核糖体分型也各有优缺点和适用范围.细菌的基因分型对流行病学监测有重要意义,有助于从基因水平了解细菌的致病机制及耐药机制,并为检测新抗生素的活性提供依据.
-
纳米基因芯片在微生物学分子诊断中的应用
开发纳米基因芯片的目的,就是将其用于微生物学分子诊断。纳米基因芯片技术具有广泛的用途,通过未知的带电生物分子特异性地与芯片上的已知分子结合,从而对其进行分析。采用电导分子杂交和基因控制技术在基因芯片上分析DNA多态性或基因突变,可在同一基板上精确、迅速地同时进行几种测试。本文叙述纳米基因芯片技术在分子诊断测试中的广泛应用,如鉴定病原菌、细菌耐药性和细菌分型等,以及在研究传染病病原菌的作用、人类染色体缺陷和研制疫苗等方面的巨大潜力。
-
288份分枝杆菌菌型鉴定及药敏试验结果监测分析
目的:通过分析石家庄市第五医院肺结核病人的分枝杆菌菌种鉴定及药敏试验结果,了解耐药情况,为临床治疗肺结核病人提供可靠的实验数据.方法:对2007~2010年就诊于我院的肺结核病人的1001份标本,用改良罗氏法培养,对288份分离培养阳性菌株进行菌型鉴定及药敏试验,试验结果进行统计分析.结果:①培养阳性率295/1001(29.5%),288例培养阳性标本,人型结核分枝杆菌263例,牛型分枝杆菌28例,乌型分支杆菌1例,其他非典型分枝杆菌3例.②耐药菌株98株,人型分支杆菌耐药比例低于牛型(30.4%Vs57.1%,P<0.01).耐药率从高到底依次为:乙胺丁醇18.4%、链霉素15.3%、利福平14.2%、异烟肼12.2%、氧氟沙星9.0%、左氧氟沙星8.3%、力克肺疾6.9%、阿米卡星5.8%、利福布丁4.5%.③单耐药菌株20例(7.6%)多耐药菌株25例(8.7%),耐多药菌株22例(7.6%),广泛耐药结核菌株6例(2.1%).结论:结核分支杆菌对抗结核药耐药率高,临床应根据结核杆菌药敏试验的结果,合理使用抗结核药物,减少耐药菌株的发生.