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SELDI-TOF MS技术及其在肝病研究中的应用
随着人类基因组计划的完成,生命科学进入了功能基因组学时代,蛋白质组学研究成为其中的重点.蛋白质组学的含义是:一个基因组、一种生物或一种细胞/组织所表达的全套蛋白质[1].由于蛋白质是生命活动和生物结构主要的实际承担者,从整体水平出发的蛋白质组学研究可在更贴近生命本质的层次上去发现和理解生命活动的规律.
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重要绦虫功能基因组学研究进展
绦虫病是一类严重危害人类健康以及畜牧业生产的寄生虫病,其防治措施目前尚不完善.近年来,分子生物学技术发展迅速,已成为遏制绦虫病的有效手段.因此,研究绦虫基因的功能对于防治绦虫病意义重大.本文介绍了功能基因组学研究常用的几种技术,并对近年来一些重要绦虫的功能基因组学研究进展作一综述.
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重要人兽共患寄生虫功能基因组学研究进展
随着分子生物学技术的迅速发展,基因组学的研究已从结构基因组学转向功能基因组学,对于基因功能的研究也由单一基因转向大规模、批量分析.为促进我国寄生虫功能基因组学的研究,本文介绍几种重要的功能基因组学研究技术方法,并对近几年来一些重要寄生虫功能基因组学的新研究进展作一综述.
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血吸虫反向疫苗学理论与技术的研究现状与展望
近年发展起来的反向疫苗学,以"序列-结构-功能"思想为依据,以免疫信息学、计算机预测设计以及高通量的各种组学(包括基因组学、转录本组学、蛋白质组学等)综合集成技术为核心,可能为血吸虫疫苗候选分子的发现提供一条新途径.本文简要介绍了反向疫苗学常用的理论预测和实验方法;概述了应用反向疫苗学理论与技术筛选和鉴定血吸虫候选疫苗分子(保护性抗原或表位)的进展情况;后,讨论了通过模拟辐照致弱血吸虫疫苗或人群获得性免疫的效应机制等来发展血吸虫反向疫苗学的可能的研究方向.
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丙型肝炎基因治疗的现状与前景
背景丙型肝炎病毒(HCV)是导致慢性肝炎、肝硬化和肝细胞肝癌的主要原因之一.近年来对HCV分子生物学属性的研究集中在对病毒复制、HCV基因及病毒蛋白结构和功能方面.HCV基因治疗的发展是基于HCV功能基因组学的发展,HCV为单链RNA病毒,包括5′非编码区(NCR)、核心区(C)及非结构区(NS),其中5′-NCR中内核糖体进入基序(IRES)启动病毒基因翻译,NS3具有丝氨酸蛋白酶和解旋酶的功能,NS5B具有聚合酶的功能,在HCV复制中起重要作用,也是HCV基因治疗的重要靶位点.
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生物信息学(5):药物设计与生物信息学
药物基因组学药物基因组学(pharmacogcnomics)是20世纪90年代末发展起来的基于功能基因组学(functional genomics)与分子药理学的一门科学.它从基因水平研究基因序列的多态性与药物效应多样性之间的关系,即研究基因本身及其突变体对不同个体药物作用效应差异的影响,并以此为平台开发药物,指导合理用药,提高用药的安全性和有效性,避免不良反应,减少药物治疗的费用和风险.
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功能基因组学和蛋白质组学在生殖医学研究中的应用
后基因组时代,或者称为功能基因时代,是基因组研究的收获时代,研究重点已经从揭示生命的所有遗传信息转向整体水平上对生物功能的研究.第一个转向标志就是产生了"功能基因组学"学科,它采用了生物芯片(Biochip)、微阵列制样(Microarry)等新技术,对成千上万的基因表达进行分析和比较,力图从基因组整体水平上对基因的活动规律进行阐述.但是由于生物功能的体现者是蛋白质,仅仅从基因的角度来研究是远远不够的,因此在人类基因组计划和功能基因组学研究基础上,产生了一门在整体水平上研究细胞内蛋白质的组成及其活动规律的新兴学科--蛋白质组学(Proteomocs).
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分子生物学在医学检验中的应用(文献综述)
分子生物学是一门正在蓬勃发展的学科,新技术和应用条件的不断出现,为检验医学的发展提供了崭新的时代并提供新的机遇和挑战.分子生物学是以核酸、蛋白质等生物大分子为研究对象的学科,分子生物学技术即建立在核酸生化基础上的一类研究手段,现已广泛应用于医学检验中,同时也逐渐渗入数理科学、结构基因组学、功能基因组学和环境基因组学,研究内容也从DNA鉴定、扩展到核酸及表达产物分析,技术不断进步为微生物检验、肿瘤诊断及评估、遗传病诊断、免疫系统疾病诊断提供重要依据和创新思路.
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功能基因组学和组合化学在抗结核新药开发中的应用
结核病耐药性是导致结核病难以治愈的重要原因.为根除结核病,必须开发针对耐药菌和休眠菌的新型抗结核病药物.组合化学和功能基因组学的结合将有助于加快新药开发速度.本文综述了功能基因组学和组合化学在开发抗结核新药中的应用.
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PPP4R1基因与肿瘤相关性的生物信息学预测及在胃癌组织中的初步验证
目的:应用生物信息学分析方法预测基因PPP4R1与胃癌发生和转移的关系,并采用RT-PCR进行验证.方法:利用基因功能模块原理,通过IntNetDB找到基因PPP4R1的伙伴基因,应用CFinder工具找其社团基因,Chilibot在线工具分析社团基因与肿瘤的关系,继而推测PPP4R1与胃癌的联系.采用RT-PCR法检测18对分别来自同一患者的转移和原位肿瘤组织、12对分别来自同一患者的原位肿瘤和癌旁正常组织PPP4R1基因表达,对上述生物信息学分析的结果进行验证.结果:生物学分析结果表明,PPP4R1的社团基因有CTDSP2、PPP2R5E、CTDP1、CTDSP1、FLJ22405、MTMR4、PPP1CA、PPP1CB、PPP1CC、PPP2R2A、PPP2R5A、PPP2R5C、PPP3CC,其中与癌相关的基因有9个,与癌及转移相关的基因有2个.PCR验证结果表明:18例原位胃癌组织中有15例基因PPP4R1表达高于其对应的转移组织(P<0.01);12例正常组织有9例高于其对应的癌组织(P<0.01).结论:基因PPP4R1可能与胃癌的发生和转移相关;生物信息学可能成为研究基因功能快速而有效的新方法.
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遗传工程小鼠的饲养管理和品系建立
随着人类结构基因组序列的阐明,生命科学研究重点从结构基因组学转向了功能基因组学.要研究一个基因的功能及其调控,好的方法是在活体内增加或敲除、突变一个或几个基因,在整体上观察研究该基因在生命活动中的作用.这种研究在人体不能进行.
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格列奈类药物基因组学研究进展
药物基因组学足在药物遗传学基础上发展起来的新兴学科,是分子药理学与功能基因组学结合的产物.通过研究药物代谢、转运及药物作用受体相关基因单核苷酸多态性(SNP)对药物疗效的影响,开发新药、指导临床合理用药,从而提高药物的疗效及安全性[1].
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长链非编码RNA与前列腺癌
功能基因组学的飞速发展将越来越多的目光引向了对非编码转录产物功能的研究.在某些情况下或者是至少在一种特定的细胞类型中,人类的常染色体中几乎每一对核苷酸对都会发生转录现象[1].转录产物中能够稳定存在的信使RNA(messenger RNA,mRNA)不超过2%,其余绝大部分为非编码 RNA(noncoding RNA,ncRNA)[2].关于ncRNA的分类,目前有两种较常用的方法,一种是依据ncRNA的表达特点及功能,将其划分为组成型ncRNA( constitutive ncRNA)和调节型ncRNA( regulatory ncRNA);另一种是依据ncRNA的分子大小也就是所含碱基数量的多少,划分为长链ncRNA(long non-coding RNA,IncRNA;碱基数>200)和小分子ncRNA(碱基数≤200).
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功能医学:推动建立医学领域新思维
只要做一次功能基因组学检测就能帮助你保持健康,并降低患病风险.这样的好事儿听起来很美,细细一品味却又像是天方夜谭.然而,随着近年来功能医学的介入,人类所期待的这等好事儿正在由美梦逐渐演变成现实.那么,什么是功能医学?它的出现将为人类的健康带来怎样的影响?它是否真如传闻中所说的那样神奇?
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药物基因组学及其在合理用药中的应用
药物基因组学(pharmacogcnomics)是20世纪90年代末发展起来的基于功能基因组学(functional genomics)与分子药理学的一门科学.它从基因水平研究基因序列的多态性与药物效应多样性之间的关系,即:研究基因本身及其突变体对不同个体药物作用效应差异的影响,以此为平台开发药物,指导合理用药,提高用药的安全性和有效性,避免不良反应,减少药物治疗的费用和风险[1,2].
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蛋白指纹技术在诊断胃肠道癌中的应用进展
随着人类基因组计划的实现,生命科学研究的战略重点从结构基因组学转向功能基因组学.研究目标从单个基因转向一群基因(基因组)和功能基因,从遗传信息转向生物功能,开始从整体组织和细胞内的蛋白质角度研究生命活动的基本规律.
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基因芯片技术在鼻咽癌研究中的应用进展
人类基因组测序工作的完成,标志着基因组学的研究已由结构基因组学迈向功能基因组学,即后基因时代[1-2].如何从海量的基因信息中挖掘基因功能,如何大规模研究人类约3万条基因的功能[3],尤其是基因的相互作用和调控关系,将成为研究现代生物学面临的大挑战.
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代谢组学在强直性脊柱炎研究中的应用
代谢组学[1]是继基因组学、转录组学和蛋白质组学之后兴起的系统生物学的一个新的分支,它是通过考察生物体系(细胞、组织或生物体)受刺激或扰动后(如将某个特定的基因变异或环境变化后)代谢产物图谱及其动态变化,研究生物体系的代谢网络的一种技术。与其他三种组学研究的 DNA、RNA和蛋白质等生物大分子不同,代谢组学是对生物体系中的小分子化合物进行定性定量研究。近年来,代谢组学相关技术发展迅速,已广泛应用到毒理学[2]、营养学[3]、植物学[4]、微生物学[5]、药物研发[6]、疾病研究[7]、功能基因组学[8]等领域。强直性脊柱炎( AS )是以中轴关节慢性炎症为主的原因不明的全身性免疫性疾病,其特点为病变累及骶髂关节,常发生椎间盘纤维环及其附近韧带钙化和骨性强直,晚期可发生脊柱强直和关节畸形[9]。国内髋关节受累率达60%左右,严重者髋关节畸形强直而造成终身残废,丧失劳动力[10]。 AS病因复杂,其发病机制至今仍然不明。近年来,一些学者[11]对AS的生物学指标进行了研究,希望能够找到早期诊断AS的标志物并探明其发病机制。代谢组学运用高通量、高敏感的分析技术,结合化学计量学方法,分析体液中的代谢产物,可以将所有代谢物的信息整合到一起,通过比较其代谢特性,寻找出早期敏感的生物标志物,能够帮助分析病变过程和辅助临床诊断。本文就代谢组学及其在AS生物标志物研究中的现状做一综述。
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蛋白质组学在临床医学中的应用
简述生命科学研究中的两项重要内容:基因组学和蛋白质组学研究的历史现状:虽然基因组学的上游学科为蛋白质组学的发展奠定了基础,但蛋白质组学作为一门独立的学科,其方法学及相关技术在临床应用中有其独特的优势,同时也面临着很大的挑战.
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RNA干涉文库的设计与应用
人类基因组计划的巨大发展提供了大量原始生物学信息,但对其功能信息的了解还相当有限.RNA干涉技术为研究基因功能提供了一种快速而经济的方法.构建靶向大量基因的RNA干涉文库在基因组范围内实现基因的沉默,已成为研究细胞生物学行为的一种新的功能基因组学研究方法.近年来相继出现许多针对RNA干涉文库的设计策略,并在一定规模内成功实现遗传学筛选,为将RNA干涉文库用于功能基因组学的研究进行了意义深远地探索与尝试.