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三邻甲苯磷酸酯暴露对鸡脊髓组织基因谱的影响
目的 从三邻甲苯磷酸酯(tri-orhto-cresyl phosphate,TOCP)暴露鸡的脊髓组织中筛选有机磷致迟发性神经病(organophosphorus ester induced delayed neuropathy,OPIDN)的相关基因,为进一步探讨OPIDN的发病机制提供目的基因谱.方法 罗曼鹤母鸡(Roman hens)随机分为TOCP组、先给苯甲基磺酰氟(phenylmethanesul fonyl fluoride,PMSF)再给TOCP的PMSF前干预组、生理盐水对照组,每组4只.染毒5d处死实验鸡,低温取脊髓,依次提取总RNA、纯化、转录合成cRNA探针、标记生物素、基因芯片杂交、扫描杂交信号、后进行基因芯片处理和分析.结果 TOCP组与对照组相比有显著差异,并与PMSF前干预组无显著差异的基因有520个,其中表达差异在3倍以上基因有36个.结论 从TOCP暴露鸡脊髓组织中筛选出520个OPIDN相关基因,其中36个基因可能为OPIDN密切相关基因.
关键词： 有机磷致迟发性神经病 基因谱 三磷甲苯磷酸酯 苯甲基磺酰氟 脊髓 -
冠心病中医证候与基因相关性研究
随着后基因组时代的到来及对中医证本质认识的深入,冠心病中医证候研究已经从症状、体征为主体,发展到了目前的分子基因水平.众多中医药工作者在基因层面上对冠心病中医证候本质进行了探讨,主要包括证候相关基因及其多态性研究、证候相关基因差异表达谱研究等,涉及冠心痛血瘀证、痰浊证、痰瘀互阻证、心阳虚证等方面.本文对近年来冠心痛中医证候与基因相关性研究进行了总结,并提出了存在的问题及下一步的研究思路.
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SARS-CoV N蛋白对真核细胞基因谱的影响
N蛋白位于SARS冠状病毒(SARS-CoV)颗粒的核心,是SARS-CoV的主要结构蛋白之一,它可以与病毒基因组RNA结合.目前研究表明N蛋白可以选择性激活AP-1(activator protein 1)信号转导途径;并发现在压力条件下(即缺乏生长因子时),N蛋白可以诱导COS-1细胞凋亡和肌动蛋白重组.本文研究了体外转染N蛋白真核表达载体后细胞基因转录水平的变化.通过长寡核苷酸芯片和SAM统计学处理,得到了瞬时表达N蛋白的真核细胞转录谱.N蛋白对哺乳动物细胞转录的影响可能与SARS-CoV的致病机理相关.
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胃癌中医证型相关基因的表达谱
目的:寻找不同胃癌证型组织中的相关基因表达谱差异表达,对研究胃癌证型实质进行探讨、胃癌的中医证的基因诊断及指导临床用药有重大的意义.方法:我们运用含有4 096条人类全长基因的cDNA表达芯片技术,对胃癌中医证型邪热内蕴证和气滞血瘀证共4例,胃癌组织及胎胃正常组织基因表达进行了分析.结果:两证型都有免疫相关基因的下降,也有癌基因的上调,但热毒内蕴亚型基因表达提示了正气未虚,尚有防御能力,如nm23基因增高,p18基因表达增高;而气虚夹瘀亚型中则无此改变.结论:胃癌患者的基因表达既有相同表达改变,也有不同中医证型的基因谱表达改变也不相同,基因表达谱可为中医的证型提供科学依据.
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与基因再一次亲密接触
随着人类基因谱大规模测试工作的顺利完成,基因技术给予我们更多梦想和希望,我们每个人都期待着在不远的将来,长期威胁人类健康的心脑血管病、癌症、糖尿病、自身免疫疾患等痼疾能就此终结.尽管在美国权威期刊<科学>杂志"十大科学成就"的排位中,基因技术曾一度逊位于近几年风头正劲的干细胞研究,但无论如何基因工程依然是生物技术中耀眼的明星.
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试论中西医结合对家族性疾病的治疗原则
目的探讨中西医结合对家族性疾病的治疗原则.方法从NCBI(OMIM)库中检索出家族性疾病与遗传性相关的主效基因,按控制该疾病的基因效应,讨论中西医结合对家族性疾病的治疗原则.结果①如控制该疾病的主效基因相同,但形成(气化为)不同的基因谱导致所控制的表型(证候、症状)差异较大者,应同病异治.②如控制该疾病的主效基因不同而其基因的功能相同,而且所控制的表型(证候、症状)差异较小而病程相近者,可异病同治.③痼疾宜治本,定期发作周期性疾病宜治标,普遍的宜标本兼治.讨论:中西医结合是针对同一病种由于个体内控制该疾病的基因谱的不同,或基因谱相同而其境遇不同,从而导致所诱导的该基因谱的表达,或其体质也有差异等情况而对证治疗的,故用它治疗家族性疾病较为有效.结论由于控制家族性疾病多数是多基因(基因谱),故治疗家族性疾病应以调节基因的表达的阴(下或抑制)阳(上或促进)调节的治标为主,即传统的中西医结合治疗为主;靶基因治疗,即基因工程治疗的治本为辅.又,此类病不但应进行综合治疗,并应坚持较长期的治疗.
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遗传病与相关表达条件——经络与遗传的关系
随着人类DNA基因谱的逐步被破译,发现很多疾病与遗传有关.甚至一些传染病象AIDS病都与遗传有关,现已发现有些人有抗AIDS病基因.
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川芎嗪预处理急性缺血性肾衰竭基因谱研究
目的:探讨川芎嗪对大鼠缺血再灌注损伤基因表达谱的影响,筛选出肾损伤的相关基因.方法:将大鼠随机分为实验组与对照组.实验组以川芎嗪经大鼠尾静脉注射6周后,建立缺血性肾衰竭模型,运用基因总结技术检测川芎嗪对肾损伤相关基因表达的影响.结果:川芎嗪能使大鼠缺血再灌注损伤肾相关基因表达上调和下调,其中川芎嗪下调已命名的大鼠肾基因(Ratio＜0.5)67个;川芎嗪上调已命名的大鼠肾基因(Ratio＜0.5)26个.结论:川芎嗪通过下调或上调缺血再灌注损伤肾相关基因表达的活性对急性缺血再灌注损伤肾发生药理作用.
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基因与疾病研究的样本量计算方法
随着基因谱的建立,遗传因素与疾病发生关系的研究已经进入了广泛探索的阶段.其中仅有约5%的疾病属于基因缺陷性遗传所致,绝大部分疾病的发生与基因的易感性有关.如肿瘤、心脑血管疾病属于多因素所致的疾病,已有的研究资料表明,多个(种)易感基因参与发病.充分利用临床病例进行相关研究,发现有关的易感基因,将会把疾病的防治引入新的领域.但基因研究的资金投入大,因此确定研究设计和样本量非常重要.本文就设计类型和样本量的计算方法作简要介绍.
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老龄肾阳虚证的差异表达基因谱研究的意义探讨
肾阳虚作为中医脏腑辨证的一个重要的基础证型,一直是中医界研究的重点,也取得了一定的成绩.在前期研究的基础上,运用宏观证候与微观基因表达谱的结合的方法,开展特定老龄人群生理性肾阳虚证的差异基因表达谱的差异特征研究,可以尽可能排除干扰,揭示老龄肾阳虚基因表达变化的规律,探讨亚健康状态(生理性肾阳虚证)与衰老的关系.从而可以使肾阳虚证的基因研究更加细致深入.
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基因表达谱差异分析丹黄散对糖尿病足创面修复的作用
背景:丹黄散能刺激肉芽组织增生,减少溃疡创面分泌物,促进溃疡创面修复.目的:从基因组层面评估丹黄散在糖尿病足治疗中的作用.方法:纳入2007-10/2008-09于贵阳中医学院第二附属医院代谢与内分泌科就诊的糖尿病足患者9例,分别给予常规治疗(糖尿病足组)及丹黄散外敷治疗(丹黄散治疗组);同时选取同时期的外伤患者作为对照组.取以上3组患者足组织标本,应用Oligo GEArray(r)芯片检测各组基因表达谱,比较分析基因表达谱差异.结果与结论:和对照组比较,糖尿病足组有28个基因表达上调,6个基因表达下调;与糖尿病足组比较,丹黄散治疗组有30个基因表达上调,4个基因表达下调.说明糖尿病足溃疡局部涉及多基因差异表达,丹黄散可调控部分差异基因表达.
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基因芯片研究艾灸大鼠命门穴延缓衰老的抗氧化机制
目的 探讨艾灸大鼠命门穴延缓衰老的分子机制.方法 老年大鼠分为老年组和灸疗组,另设年轻组,用Illumina大鼠全基因组芯片研究其分子机制.结果 老年组与年轻组中涉及氧和活性氧中间产物参与新陈代谢的过程的9条基因下调,经过灸命门穴位治疗后,有8条基因在灸疗组与年轻组中正常表达.结论 抗氧化可能是灸命门穴延缓老年大鼠衰老的机制之一.
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生肌玉红膏对大鼠糖尿病足溃疡RNA基因表达的影响
目的:观察生肌玉红膏对大鼠糖尿病足溃疡RNA基因表达的影响.方法:选用Wistar大鼠60只,制备糖尿病足(Wagner溃疡2级)动物模型,按随机数字表法分为中药组和模型组,每组30只.两组大鼠足部溃疡处分别予生肌玉红膏和生理盐水局部外用,每2天换药1次;治疗30 d后,取大鼠足组织标本,应用miRCURYTM芯片检测各组标本基因表达谱,比较分析基因表达谱差异.结果:与模型组比较,中药组有20个基因表达上调,4个基因表达下调.结论:生肌玉红膏可调控糖尿病足大鼠的部分差异基因表达.
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后基因组时代病理样品库的建立及其意义
后基因组时代基因谱研究的重要技术与设备有DNA和cDNA微阵、蛋白质组、基因表达系列分析、逆转录酶多聚酶链反应、激光显微切割、组织微阵、生物样品库和生物信息系统等.
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EGCG诱导人肝癌SMMC-7721细胞早期凋亡及基因和蛋白谱的变化研究
目的 探讨表没食子儿茶素没食子酸酯(EGCG)诱导人肝癌SMMC-7721细胞早期凋亡的变化规律,以及EGCG作用后SMMC-7721细胞基因及蛋白谱的变化.方法 通过MTT法初步筛选EGCG诱导SMMC-7721细胞凋亡的作用浓度,流式细胞Annexin V-FITC/PI法检测EGCG对SMMC-7721细胞增殖的抑制作用和早期凋亡的诱导效应;运用Affymetrix U133A 2.0人基因组表达谱芯片检测EGCG作用后SMMC-7721细胞基因表达谱的变化,以及SELDI检测EGCG作用后SMMC-7721细胞蛋白图谱的变化, Real-time PCR验证3个表达差异显著基因.结果 EGCG诱导SMMC-7721细胞早期凋亡的佳作用剂量是218.2 μmol·L-1,早期凋亡的作用呈剂量依赖性;SMMC-7721细胞经EGCG作用后,表达差异两倍以上的基因共196个,包括上调基因132个和下调基因64个;EGCG作用后表达差异两倍以上的蛋白共43个,包括23个表达上调蛋白,20个表达下调蛋白.Real-time PCR验证DIO2、Id3基因表达与芯片结果一致.结论 EGCG有明显的诱导肝癌SMMC-7721细胞早期凋亡的作用,其诱导凋亡作用涉及多基因和多蛋白变化.
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支气管哮喘相关基因研究现状
支气管哮喘(asthma)简称哮喘,是一种具有遗传倾向的变态反应性疾病,目前认为,该病遗传受多基因调控,不同基因可导致相同表型(基因异质性),相同基因也可导致不同表型(基因多效性),有些个体携带突变基因而无相应表型(不完全外显),而另一些个体没有哮喘但有不同的基因突变(多基因遗传).由此推断,不同的基因与基因、基因与环境相互作用导致了哮喘的发生.近年来,国际上通过基因谱扫描、侯选基因技术和连锁分析等研究方法,已发现数个基因与哮喘相关.下面就哮喘相关基因的研究现状作一综述.
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女性生殖道人乳头瘤病毒多重感染基因谱的研究
目的:探讨生殖道人乳头瘤病毒(HPV)基因型在女性多重感染者中的分布.方法:采用核酸分子快速导流杂交基因芯片分型技术(HybriMax)对大连地区5599例女性进行HPV多重感染检测.结果:5599例女性中检出354例(6.32％) HPV多重感染患者,21个亚型中检出20个基因型.高危-高危基因型、高危-低危基因型、低危-低危基因型多重感染者分别为155例(43.8％)、18例(5.1％)、181例(51.1％).354例多重阳性感染者中二重感染多,占77.68％ (275/354),常见感染模式为HPV16+58、HPV 16 +52;其次为三重感染,占15.25％ (54/354),常见感染模式为HPV31 +58 +CP8304,占5.56％ (3/54).合并基因型数多的为七重感染,四重及四重以上多重感染基因型构成复杂多变,尚未发现常见感染模式.各年龄组HPV多重感染率差异显著(x2=88.91,P＜0.005).≤20岁女性的HPV多重感染率高(15.6％)；随年龄增加,HPV多重感染率逐渐下降,而＞50岁女性的HPV多重感染率有增加趋势.结论:大连地区HPV多重感染率较低,但以高危混合型为主.用HybriMax法对HPV DNA进行多重感染基因谱检测,对宫颈病变的防治具有重要意义.
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急性ST段抬高型心肌梗死患者外周血环状RNA的表达变化
目的:筛选急性ST段抬高型心肌梗死患者外周血差异表达的环状RNA,探讨环状RNA在急性心肌梗死中的作用.方法:采用环状RNA芯片检测3例急性前壁心肌梗死和3例冠状动脉(冠脉)正常的健康对照者外周血中环状RNA的表达谱,根据变化倍数和P值筛选差异表达的环状RNA,通过生物信息学分析预测靶miRNA;对筛选出来的6个环状RNA,采用荧光定量PCR方法检测其在急性ST段抬高型心肌梗死患者(22例)和正常对照患者(21例)外周血中的水平.结果:在882个环状RNA中,急性前壁心肌梗死患者外周血中有460个(52.2％)表达上调,422个(47.8％)表达下降;在上调的环状RNA中,15个变化倍数＞10.0;在下调的环状RNA中,14个变化倍数＞7.0.在急性ST段抬高型心肌梗死患者中对筛选出来的6个环状RNA进行检测,环状RNA30741的外周血表达水平显著高于正常的健康对照者(P＜0.01),生物信息学分析显示环状RNA30741的靶miRNA是小分子RNA-21.结论:急性ST段抬高型心肌梗死患者外周血环状RNA的表达存在差异,其中环状RNA30741可能参与了急性ST段抬高型心肌梗死的病理过程.
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不同化疗敏感性下咽鳞癌差异基因表达谱的筛选
目的 筛选化疗敏感性不同的下咽鳞癌差异基因表达谱,探讨基因表达谱预测下咽鳞癌化疗敏感性的可能性.方法 选取诱导化疗敏感和不敏感的下咽鳞癌各4例,分别提取mRNA,体外反转录为cDNA和cRNA,不同生物素标记和片断化后制成cRNA探针,与人类基因组芯片杂交,对杂交信号扫描并归一化处理,使用GCOS 4.0统计软件分析.以Signal Log Ratio≥1和change P-value≤0.05为标准筛选差异表达基因并根据生物学过程和功能分类.结果 筛选差异表达基因119条,其中上调基因65条,下调基因54条.差异表达基因包括信号传导(STAT3),细胞周期(CCND1、TCF7L1),细胞凋亡(FADD),黏附分子(MUC4、cadherin 11、ICAM2)以及酶类等.化疗敏感组中EGFR、TGF-β和TNFR等细胞信号通路异常.结论 不同化疗敏感性的下咽鳞癌基因表达谱不同,根据基因表达谱的变化评估化疗敏感性是可能的.
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肝癌基因治疗研究进展与介入医学
目前研究表明肝癌的发生是一个多步骤的复杂过程,在这个过程中,有多种癌基因和抑癌基因的改变,肝癌的癌基因谱已逐渐明朗.肝癌的基因治疗是目前学术界研究的热点,已取得了很大的进展.本文综述肝癌基因治疗的研究进展并对介入医学在肝癌基因治疗中的地位和作用作一展望.
