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浅析固相萃取技术及其在体内药物分析中的应用
本文首先介绍了固相萃取技术的基本原理,接下来综述了固相萃取的三种类型、萃取的装置和萃取技术的进展,后分析SPE在体内药物分析中的应用.鉴于目前生物样本的分析需求和固相萃取的特点与优点,固相萃取的应用前景是非常光明的.
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职业暴露感染艾滋病病毒处理程序规定
第一章 总 则第一条为规范职业暴露感染艾滋病病毒处理程序,为艾滋病职业暴露感染提供诊断依据,制定本规定.第二条本规定适用于医疗卫生人员及人民警察等因职业活动发生以下导致感染或可能感染艾滋病病毒的情况:(一)被含有艾滋病病毒血液、体液污染的医疗器械及其他器具刺伤皮肤的;(二)被艾滋病病毒感染者或病人的血液、体液污染了皮肤或者黏膜的;(三)被携带艾滋病病毒的生物样本、废弃物污染了皮肤或者黏膜的;(四)其他因职业活动发生或可能感染艾滋病的.第三条职业暴露感染艾滋病病毒处理程序包括处置和调查工作,工作应当遵循科学、严谨、公正、及时的原则.
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高效液相串联质谱法检测人血清中总胆碱
胆碱的化学名为β-羟乙基三甲基氢氧化胺,分子式为HOCH2CH2 N+ (CH3)3,相对分子质量为126.16,属季胺碱类物质。胆碱主要通过参与细胞膜上磷脂的合成及机体内甲基代谢等形式来发挥其生理作用[1]。酯化形式的磷脂酰胆碱(phosphatidylcholine)是人体内胆碱主要的贮存形式,占总胆碱含量的95%以上[2]。对生物样本中总胆碱水平进行测定,综合游离胆碱水平[3-4],可以更全面地了解机体的胆碱水平。笔者在参考国外文献的基础上,采用磷脂酶-D(phospholipaseD,streptomyces chromofuscus)对酯化胆碱进行水解,建立了血清中总胆碱水平的高效液相串联质谱(LCMS/MS)测定方法。
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利用肿瘤医院资源优势开展临床流行病学研究
肿瘤医院具有独特的资源优势.利用临床流行病学方法,收集、利用肿瘤病例信息、肿瘤临床诊治、肿瘤生物标本等信息资源,可以促进新形势下肿瘤医院管理和科研的深入发展.南通市肿瘤医院是三甲肿瘤专科医院,也是国内早开展肿瘤诊治的地市级肿瘤专科医院之一,已具备了开展临床流行病学研究、医学随访研究及完善样本库并应用的工作基础.本文内容包括建立以医院为基础的肿瘤登记系统、为开展临床流行病学服务;建立临床肿瘤病例的随访与调查制度,评估肿瘤治疗影响因素并开展生存率分析;建立具有完善流行病学信息背景的肿瘤病例生物标本库,以适应转化医学发展之需.对工作中存在的瓶颈问题也进行了讨论.
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传染病样本资源库质量控制体系建设经验
生命科学领域中资源库的临床样本是不可再生的宝贵资源,而高质量的临床样本对科学研究具有极其重要的意义[1]。因此,如何科学、高效、标准化的采集、处理、储存高质量的生物样本资源,建立高质量的资源库,使之能更好地为转化医学服务就显得至关重要[2]。首都医科大学附属北京佑安医院自2009年起建立了传染病样本资源库[3-4],主要收集相关传染性疾病样本。该资源库分为临床数据样本资源库和样本数据样本资源库两部分。临床数据样本资源库包括患者的基本信息、疾病特征、检查结果等临床数据;样本数据样本资源库则是指人体的组织生物样本,包括患者的血液、病理、体液、DNA等标本。目前,国内外对资源库的质量控制都非常重视,但是由于资源库建设的复杂性和不统一性,尚无公认的资源库质量控制体系标准。我院在传染病样本资源库建设的基础上,建立了一套有效的传染病样本资源库质量控制体系,并已通过了ISO9001的质量认证。现将我院的这一做法做具体介绍。
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生物样本研究数据环境与受试者隐私保护伦理问题
传统生物医学研究中对受试者身份的保护,常通过一系列机制措施来实现,如仅以聚合形式发布数据、将可识别变量去除后再作信息公开等,其旨在对目标对象的健康信息进行保密性处理。此类隐私保护被视为医学研究伦理基本的原则之一,其确切执行则有利于维系研究受试者与社会公众的信任和支持。当前遗传学与基因组学研究广泛采用此类传统隐私保密模式,然而其在基因研究层面的普遍适用性不乏争议,且尚待考证。当前的隐私风险评估,亟需将整个“数据环境”纳入考虑,并不能仅孤立的局限于数据披露公开层面的质量管理。随着涉人研究数据资源的飙增,基因数据公开问题倍受关注,特别是涉及隐私保护的问题。本文围绕上述核心问题在数据环境、数据入侵者、数据主体隐私等方面展开论述,并就数据主体身份公开的控制、主体身份识别的风险及主体隐私的保护等层面进行相关性分析,以期为当前人体生物样本受试者的隐私保护及伦理审查实践提供参考。
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2445例感染性疾病患者生物样本基本特征分析
目的 探讨感染性疾病患者性别、年龄、地域、季节的基本特征及对免疫毒理学指标的影响.方法 采用前瞻性、多中心、大样本、注册登记式研究方法,收集使用喜炎平注射液、痰热清注射液、热毒宁注射液3种清热解毒类中药注射剂的2445例患者,制定《喜炎平/热毒宁/痰热清注射液基本信息表》,包括患者性别、年龄、地域、季节情况,并采集患者血液样本,检测血清环磷酸腺苷(cAMP)、白细胞介素1β (IL-1 β)、白细胞介素4(IL-4)、白细胞介素6(IL-6)、白细胞介素8(IL-8)、巨噬细胞炎性蛋白1β(MIPL-1β)、前列腺素E2(PGE2)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)水平. 结果 2445例患者中,男性占63.1%,以18岁以下儿童居多,北方地区人数略多,春季患者居多.女性患者IL-1 β、cAMP、MIPL-1 β、PGE2、TNF-α高于男性(P<0.05或P<0.01),儿童患者各项指标均高于其他年龄患者,北方患者IL-1β、IL-4、IL-6、IL-8、cAMP、TNF-α高于南方患者,夏季患者IL-1β、IL-8、cAMP、PGE2和TNF-α高于其他季节(P<0.01).结论 不同年龄、性别、地域与发病季节感染性疾病患者免疫毒理学指标有所不同,其可能成为影响临床诊疗决策的混杂因素.
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《第三届中国组织生物库标准化建立与应用研讨会暨第一届上海生物样本与转化医学论坛》会议纪要
由中国医药生物技术协会、上海市消化病学分会共同主办,中国医药生物技术协会组织生物样本库分会、上海市消化病学会生物样本库与转化医学学组、上海芯超生物科技有限公司联合承办的“第三届中国组织生物样本库标准化建立与应用研讨会暨第一届上海生物样本库与转化医学论坛”于2011年6月24日- 26日在生物芯片上海国家工程研究中心隆重召开.参加本次会议的医院、大学、科研院所及生物医药企业共计200余家,专家达300余人.
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二维码技术在生物样本库编码中的应用与评价
随着电子信息化的迅速普及,条形码发展十分迅速,它已广泛应用于商业贸易、生产制造、医疗卫生[1]、仓储物流[2]等领域.条码的应用大大提高了信息处理和数据采集的速度,提高了工作效率,促进商品贸易管理的现代化和科学化[3].但是传统的一维码信息量有限,纠错能力差,二维条码信息容量大,信息密度高,编码能力强,可以对文字、照片、指纹、掌纹、声音、签名等信息进行编码,并且它容易印制,成本低廉,纠错能力强,译码可靠性高[4-5],在国外已经得到应用[6-7],本文主要就生物样本库管理中二维码的应用进行介绍.
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儿童专科医院特色生物样本库的建立与应用
生物样本库是一种集中收集、处理、存储和应用各种生物材料及其相关信息用于疾病的临床诊疗研究的生物应用系统[1]。一般由两部分组成:一是样本实体库,即可以从中提取到 DNA、RNA、蛋白质等成分的组织或血液等生物样本;二是样本信息库,包括从生物样本中提取 DNA、RNA、蛋白质等成分所得到的个人独有的遗传信息数据及临床诊疗信息[2]。
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生物样本库的临床信息整合探讨
转化医学是近年来国际医学健康领域日渐崛起的一门新兴学科[1],倡导以患者为中心,强调基础研究人员与临床医生的密切合作,以提高医疗总体水平。来源于医院患者的生物样本库是开展转化医学研究的重要基础[2],其中生物样本的临床信息作为临床生物样本库的重要组成部分,更是为转化医学研究提供主要支撑。然而临床生物样本数据量庞大且非结构化,分布较为分散,如何从海量的临床数据中提取出可用信息,并与生物样本本身信息进行关联,形成临床数据与生物样本有效结合的样本库,是从事转化医学研究亟待解决的问题。生物样本库临床信息的有效整合,在提高样本信息使用率的同时也为临床数据分析提供便利。
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多中心间的协同性决定队列生物样本的一致性
作为转化医学、个体化医学和精准医学研究领域必不可少的宝贵资源,生物样本的价值在于其本身既有疾病相关个体特异的临床信息,又可以通过一系列生物技术手段获得实验室的实验信息。比如对肿瘤的遗传基因分型以及高风险的遗传标志(基因型体质、风险家族史等)多方位的分析,再结合相应患者的临床表现(基因型与表现型的符合性与特异性)和生活习惯(如环境暴露相关的致病风险因子)等信息可以对疾病发生的相关性做更加全面、可靠的分析,其结果可为临床治疗提供任何实验室研究或临床观察分析所不可能提供的依据[1]。
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自动化在生物样本库中的应用现状
为了将基础医学研究的成果充分应用到临床疾病诊治中,近年来,转化医学和精准医学的概念逐渐兴起,作为有望成为跨越这个鸿沟的桥梁,生物样本库如雨后春笋般地出现在全国各地,科研工作者也把目光投向生物样本库的标准化建设以及随之而来的价值发掘上[1]。然而,生物样本库普遍存在样本数量少、样本数据不完整、质量不达标等现象,严重地影响了相关研究结果的可靠性[2-3]。因此,高效地获取和存储质量合格、数据完整的生物样本,并更有效地为医学研究服务,便成为生物样本库行业发展的关键。随着技术的不断革新,解决上述问题的方法不断被探索出来,这其中重要之一就是“自动化”。“自动化”能大效率地提高样本制备质量,降低交叉污染,提高样本准备和处理速度,可追踪溯源从而降低出错风险[4]。“自动化”因其更统一、规范、高效的特点,成为了生物样本库的下一个发展方向。本文旨在介绍自动化在生物样本库中的应用现状,希望能为同行起到借鉴作用。
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人体生物样本跨境转移中的伦理和管理问题
2006年10月到2007年2月,一项由美国国立卫生研究院(NIH)主持的关于涉及到人体生物样本研究中"再次同意"问题和人体生物样本跨境转移中伦理与管理问题的问卷调查在中国、埃及、印度和日本同时展开.本次问卷由NIH的Reidar Lie教授和被调查国家的课题组成员共同设计.笔者参加了该课题组的工作,在北京、上海等地的医疗科研机构中开展了一项针对科学家、科研管理者的书面问卷调查.关于我国科学家对人体生物样本研究中"再次同意"问题的认知和态度调查结果已发表[1],本文将介绍我国生物医学科学家群体对人体生物样本跨境转移中伦理和管理问题的认知和态度,为我国相关的伦理准则和政策法规的酝酿和制定提供决策信息.
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涉及到人体生物样本研究中的"再次同意"问题
人类生物样本是一种重要的生物医学研究资源,但采集、处理、使用和储存样本及其数据时,应格外尊重样本提供者的基本权益[1].20世纪90年代以来,英国、冰岛等国在建设人类遗传数据库(genetic database)或生物信息库(bio-bank)的同时,也在积极探讨相关的伦理准则和管理法规.在众多伦理问题中,备受国际社会的关注是"再次同意"(re-consent)问题,即:当因特定目的采集的样本用于未来的其他研究时,是否需再次征求样本提供者的同意.
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河北省磁县食管癌高发现场生物样本库建立与管理
肿瘤组织生物样本在肿瘤的研究中扮演着重要的角色[1],生物样本库包括生物样本实体、生物分子及样本相关临床资料等综合资源,对于开展人类疾病预测、诊断、治疗研究具有重要的作用.转化医学的兴起和发展对生物样本资源的迫切需求与日俱增[2-3].在我国已有多家单位建立了不同规模、不同类型和不同管理与应用方式的组织和血液样本资源库[4-8].本文对磁县生物样本库的建设和管理进行介绍.
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生物样本的常用保存方式及效果
生物样本是医学研究的重要资源,病理学组织和细胞样本是临床常见的生物样本,主要来源于临床手术、活检、穿刺等操作,可通过制备切片、涂片以及提取生物大分子,用于病理诊断及医学研究。样本是医学研究的基础,其质量在很大程度上决定着研究结果的准确性和可靠性。随着基因组学、转录组学以及蛋白质组学等研究手段的飞速进步,各种分析技术对生物样本的质量也提出了更高的要求[1-2]。
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HIV和结核病:再论监测
Elizabeth Talbot及其同事在本刊本期发表的论文中,介绍了OraQuick(R)HIV-1/2测定法,这是一种旨在利用齿龈分泌物快速检测HIV的试剂盒,也能用于检测痰标本的HIV状况1.其敏感性和特异性均不及血液标本,但其特异性仍超过98%.作者建议可以利用痰标本监测结核病人的HIV流行情况.其主要优势为在资源匮乏的环境下,痰标本是结核病人唯一常规收集的生物样本,因而可以不必使用血液标本进行HIV的监测.
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如何利用BioLINCC申请临床研究数据和生物样本
BioLINCC是美国国家心脏,肺和血液研究所(NHLBI)于2008年建立的生物样本和数据存储信息协调中心,其中存储着NHLBI开发和维护的血液和心血管相关的临床研究数据和生物样本.BioLINCC的数据和生物样本通过申请均可以免费提供给研究者来进行更多的医学研究.本文详细介绍了如何通过BioLINCC检索和申请数据和生物样本.
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生物信息资源库建设的现状与未来
经济全球化格局下的社会发展,显现出资源资产化、资产市场化、市场国际化的自然资源开发利用趋势,中国未来应对全球生物资源竞争更具战略意义.临床生物样本作为基础研究与临床研究不可再生的宝贵资源,是转化医学研究的基石,生物信息资源库正日益受到各国高度重视.