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《第三届中国组织生物库标准化建立与应用研讨会暨第一届上海生物样本与转化医学论坛》会议纪要
由中国医药生物技术协会、上海市消化病学分会共同主办,中国医药生物技术协会组织生物样本库分会、上海市消化病学会生物样本库与转化医学学组、上海芯超生物科技有限公司联合承办的“第三届中国组织生物样本库标准化建立与应用研讨会暨第一届上海生物样本库与转化医学论坛”于2011年6月24日- 26日在生物芯片上海国家工程研究中心隆重召开.参加本次会议的医院、大学、科研院所及生物医药企业共计200余家,专家达300余人.
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《第六届中国生物样本库标准化建设与应用研讨会暨首届中国生物样本库院长高峰论坛》会议纪要
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上海安集协康生物技术股份有限公司通过生物样本库达标检查
根据上海安集协康生物技术股份有限公司生物样本库质量达标检查申请,协会组织有关专家对该单位进行了组织样本库现场检查,经专家现场打分,该单位样本库基本符合《生物样本库质量达标检查手册》规定的要求。现场抽取的样品经上海芯超生物科技有限公司按照《生物样本库质量达标检查手册》检验,符合质量标准。按协会相关规定,该单位已通过生物样本库质量达标检查,并取得生物样本库质量检查合格证书,证书编号2016S001,有效期自2016年7月至2019年6月止。
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中国医药生物技术协会组织生物样本库分会筹备会在上海召开
中国医药生物技术协会组织生物样本库分会筹备会于2009年8月29日在生物芯片上海国家工程研究中心召开.著名分子肿瘤学家顾健人院士、生物芯片国家工程研究中心主任赵国屏院士、中国医药生物技术协会彭玉理事长、卫生部科技司技术处吴沛新处长、生物芯片国家工程研究中心董事长华裕达先生、上海市科委副巡视员施强华先生、浦东新区科委副主任张爱平教授受邀出席了本次会议.
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第七届中国生物样本库标准化建设与应用研讨会暨第二届中国生物样本库院长高峰论坛?首届中美临床转化医学论坛会议纪要
由中国医学科学院、中国医药生物技术协会共同主办,中国医药生物技术协会组织生物样本库分会(BBCMBA)、全国生物样本标准化技术委员会(筹)、生物芯片上海国家工程研究中心、复旦大学附属中山医院、复旦大学附属肿瘤医院、同济大学附属同济医院、上海芯超生物科技有限公司等联合承办,上海分子医学工程技术研究中心、中华医学会消化病学分会生物样本库与转化医学协作组、中国医药城生物样本库与转化医学研究院共同协办,中国工程院、复旦大学、同济大学、上海交通大学医学院、美中转化医学协会(UCATM)、美中转化医学杂志(AJTR)、美国消化病杂志(AJDD)、《中国医药生物技术》杂志联合支持的“第七届中国生物样本库标准化建设与应用研讨会暨第二届中国生物样本库院长高峰论坛?首届中美临床转化医学论坛”于3月26–28日在上海光大会展中心国际大酒店隆重召开。参加本次会议的医院、大学、科研院所及生物医药企业共计500余家,报告及主持专家100余人,参会代表近1000人,国内外参会展商40余家。
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浙江省台州医院获得我会生物样本库质量检查合格证书
为了促进我国生物样本库的规范化建立,我会生物样本库分会制定了《生物样本库质量达标检查手册》,经过常务理事会审议和批准,开展生物样本库行业自律工作。2014 年下半年,浙江省台州医院向我会递交相关申请材料,我会组织专家赴现场进行检查,并且抽取样品送检。经查,该院符合《生物样本库质量达标检查手册》质量标准,现已获得我会生物样本库检查合格证书,同时,专家也对其标本库给予了进一步完善建议。生物样本库检查是我会继牛血清生产质量检查和细胞培养基生产质量检查之后的又一项行业自律工作。
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天津市第一中心医院通过生物样本库质量达标检查
根据天津市第一中心医院生物样本库质量达标检查申请,协会组织有关专家对该单位进行了组织样本库现场检查,经专家现场打分,该单位样本库基本符合《生物样本库质量达标检查手册》规定的要求。现场抽取的样品经上海芯超生物科技有限公司按照《生物样本库质量达标检查手册》检验,符合质量标准。按协会相关规定,该单位已通过生物样本库质量达标检查,并取得生物样本库质量检查合格证书,证书编号2015S002,有效期自2015年9月至2018年8月止。
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中国医药生物技术协会组织生物样本库分会成立大会会议纪要
中国医药生物技术协会组织生物样本库分会于2009年6月4日经国家卫生部审核、民政部批准正式成立(社证字第3023-17号).成立大会于2009年11月27日-28日在上海张江高科技园区的生物芯片上海国家工程研究中心隆重召开.参加本次会议的三甲医院、院校及科研院所达百余家,医疗、生物医学领域专家200余人.
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生物样本库岗前培训及生物样本库质量达标检查培训在津举办
中国医药生物技术协会组织生物样本库分会于6月26-28日,在天津市第一中心医院举办了第四期生物样本库岗前培训以及生物样本库质量达标检查培训.协会行业发展与自律工作部李振峰主任出席会议.本次培训得到了业内专家的高度重视,并在培训中为学员们言传身教.参加本次培训的专家有:生物芯片上海国家工程研究中心主任郜恒骏教授、国家卫生计生委科学技术研究所人类遗传资源中心主任高华方、上海交通大学医学院附属新华医院王伟业教授、生物芯片上海国家工程研究中心生物样本库主任周红梅、中国医药生物技术协会组织生物样本库分会周学迅老师、复旦大学附属肿瘤医院孙孟红教授、复旦大学杨亚军教授、天津医科大学附属肿瘤医院陈海欣教授、中国医药城生物样本库与转化医学研究院张可浩主任、中国医药生物技术协会组织生物样本库分会总干事张小燕.
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二维码技术在生物样本库编码中的应用与评价
随着电子信息化的迅速普及,条形码发展十分迅速,它已广泛应用于商业贸易、生产制造、医疗卫生[1]、仓储物流[2]等领域.条码的应用大大提高了信息处理和数据采集的速度,提高了工作效率,促进商品贸易管理的现代化和科学化[3].但是传统的一维码信息量有限,纠错能力差,二维条码信息容量大,信息密度高,编码能力强,可以对文字、照片、指纹、掌纹、声音、签名等信息进行编码,并且它容易印制,成本低廉,纠错能力强,译码可靠性高[4-5],在国外已经得到应用[6-7],本文主要就生物样本库管理中二维码的应用进行介绍.
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基于ISO27001体系的生物样本库信息风险评价
ISO27001标准前身为英国的 BS7799标准,该标准由英国标准协会(BSI)于1995年2月提出,并于1995年5月修订而成。2005年国际标准化组织(简称:ISO)将BS7799转化为 ISO27001:2005发布,后由国际标准化组织及国际电工委员会(IEC)修订认可。我国2008年将ISO27001:2005转化为国家标准 GB/T 22080:2008。该标准指出“像其他重要业务资产一样,信息也是一种资产。它对一个组织具有价值,因此需要加以合适地保护”[1]。信息安全防止信息受到各种威胁,以确保业务连续性,使业务受到损害的风险降至低,使投资回报和业务机会大。该标准包括对于信息安全管理的建议、信息安全管理系统领域中的风险及相关管控。本文将基于 ISO27001标准中的信息安全风险评价方法,通过研究医院生物样本库的共性,开展信息风险评价工作。
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儿童专科医院特色生物样本库的建立与应用
生物样本库是一种集中收集、处理、存储和应用各种生物材料及其相关信息用于疾病的临床诊疗研究的生物应用系统[1]。一般由两部分组成:一是样本实体库,即可以从中提取到 DNA、RNA、蛋白质等成分的组织或血液等生物样本;二是样本信息库,包括从生物样本中提取 DNA、RNA、蛋白质等成分所得到的个人独有的遗传信息数据及临床诊疗信息[2]。
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生物样本库的临床信息整合探讨
转化医学是近年来国际医学健康领域日渐崛起的一门新兴学科[1],倡导以患者为中心,强调基础研究人员与临床医生的密切合作,以提高医疗总体水平。来源于医院患者的生物样本库是开展转化医学研究的重要基础[2],其中生物样本的临床信息作为临床生物样本库的重要组成部分,更是为转化医学研究提供主要支撑。然而临床生物样本数据量庞大且非结构化,分布较为分散,如何从海量的临床数据中提取出可用信息,并与生物样本本身信息进行关联,形成临床数据与生物样本有效结合的样本库,是从事转化医学研究亟待解决的问题。生物样本库临床信息的有效整合,在提高样本信息使用率的同时也为临床数据分析提供便利。
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潮汕沿海地区食管癌样本库的建立及其应用
食管癌(esophageal cancer,EC)是全球常见八大恶性肿瘤之一,位居恶性肿瘤死亡率第六位[1-2]。依据组织病理类型分类,食管癌主要包括食管鳞癌和食管腺癌。食管鳞癌主要集中在亚洲的中东部和非洲等地区,而食管腺癌则在欧美等国家地区多发[3]。我国是世界上主要的食管鳞癌高发国,食管鳞癌病例占全部食管癌病例的90%以上,并呈现明显的地理性分布差异,主要分布在河北、河南和山西三省交界的太行山地区,闽粤交界的潮汕沿海地区,鄂皖交界的大别山地区,四川北部地区,新疆哈萨克族居民居住地区和苏北地区等[4-5]。肿瘤流行病学调查结果表明,潮汕地区是我国唯一的沿海食管癌高发区,与我国其他内陆型食管癌高发区相比,其地理位置与气候条件,以及当地居民饮食生活习俗等均明显不同。1995–2004年的流行病学调查结果显示,该地区食管癌的标化发病率为74.47/105[6-7]。在潮汕当地,食管鳞癌的发病率一直高居各类恶性肿瘤之首。在此背景之下,毋庸置疑,建立潮汕沿海地区食管癌样本库是十分重要的工作,对揭示食管癌,尤其是食管鳞癌的病因,阐明这种特殊恶性肿瘤发病的分子机制,寻找其早期癌变特异性分子标志物,以利于早期发现、早期诊断和早期治疗,以及监测治疗后患者病情发展转归、预警预后等均有着十分重要的意义。
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自动化在生物样本库中的应用现状
为了将基础医学研究的成果充分应用到临床疾病诊治中,近年来,转化医学和精准医学的概念逐渐兴起,作为有望成为跨越这个鸿沟的桥梁,生物样本库如雨后春笋般地出现在全国各地,科研工作者也把目光投向生物样本库的标准化建设以及随之而来的价值发掘上[1]。然而,生物样本库普遍存在样本数量少、样本数据不完整、质量不达标等现象,严重地影响了相关研究结果的可靠性[2-3]。因此,高效地获取和存储质量合格、数据完整的生物样本,并更有效地为医学研究服务,便成为生物样本库行业发展的关键。随着技术的不断革新,解决上述问题的方法不断被探索出来,这其中重要之一就是“自动化”。“自动化”能大效率地提高样本制备质量,降低交叉污染,提高样本准备和处理速度,可追踪溯源从而降低出错风险[4]。“自动化”因其更统一、规范、高效的特点,成为了生物样本库的下一个发展方向。本文旨在介绍自动化在生物样本库中的应用现状,希望能为同行起到借鉴作用。
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中国生物样本库向标准化迈进
过去一百多年,各国对肿瘤浩浩荡荡的研究并没有取得突破性进展,就如 Leaf[1]在2004年Fortune所提到:“Why We’re Losing the War on Cancer -- and How to Win it?”。近10多年来,基因组学、功能基因组学、高通量生物芯片、新一代测序及生物信息学、高通量 RNAi等前沿技术的迅猛发展,国际癌症基因组(ICGC)项目的启动[2],使得我们将有机会看清肿瘤的全貌,一直在不断重演的“盲人摸象”式研究的历史有望结束。现在,肿瘤已被认为是一个系统性疾病,是全身代谢障碍的局部表现,研究者必须注重应用系统生物学的原理指导肿瘤诊治的研究。系统生物学的发展使得3P医学[预测(Prediction)、预防(Prevention或干预 Preemptive)、个性化治疗(Personalized therapy)]应运而生,分子水平的早期诊断、药物靶点的发现面临前所未有的机遇。今年初,奥巴马提出精准医学,即基于基因组学的个性化医学,受到各国政府、科学界、医学界与产业界的高度关注,我国政府到2030年预计总投入600亿人民币开展精准医学研究与实践。其实,我国在这一领域经过10余年的拼搏已进入世界先进行列,中国癌症基因组(CCGC)项目于2010年1月也正式启动,我们都身临其境,深深地感受着这个时代的巨大变革并见证这个“不朽的传奇(An enduring legacy)”。
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生物样本质量的影响因素与评估
样本质量是整个样本库的核心,样本应该在尽可能严格的条件下进行采集、处理、保存、运输以及后期加工.样本库的工作就是尽可能地将对样本质量的影响降低到小,除了严格质量管理的制度外,新技术的不断研发、理论研究的不断丰富将有助于评估影响样本质量的因素,从而制定或改进有关样本的标准流程以尽量减少样本质量的变化,保持样本的原有性质.
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河北省磁县食管癌高发现场生物样本库建立与管理
肿瘤组织生物样本在肿瘤的研究中扮演着重要的角色[1],生物样本库包括生物样本实体、生物分子及样本相关临床资料等综合资源,对于开展人类疾病预测、诊断、治疗研究具有重要的作用.转化医学的兴起和发展对生物样本资源的迫切需求与日俱增[2-3].在我国已有多家单位建立了不同规模、不同类型和不同管理与应用方式的组织和血液样本资源库[4-8].本文对磁县生物样本库的建设和管理进行介绍.
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上海市第一人民医院中心生物样本库负责人招聘通知
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样本库中临床剩余生物样本的伦理问题
生物样本库中纳入的临床生物样本中,既往留存的临床剩余样本是其中很重要的组成部分。对于这类样本的入库及管理面临一系列伦理问题,主要包括:剩余生物样本纳入样本库是否需要伦理审查;是否需要取得捐献者签署的知情同意书;以及样本采集、保存、管理的标准化和信息保密问题。文章对这些问题进行分析整理,阐述伦理要点及关注点,为生物样本库建设及运作过程的伦理问题提供解答及指导。