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CETP TaqIB、KCNE1 S38G和eNOS T-786C基因多态性与非瓣膜性心房颤动的关联研究
目的 研究浙江省汉族人群胆固醇酯转运蛋白基因TaqIB(CETP TaqIB)、心肌缓慢延迟整流钾离子通道(Iks)β亚单位基因S38G(KCNE1 S38G)和内皮型一氧化氮合酶基NT-786C(eNOS T-786C)遗传多态性与非瓣膜性心房颤动(房颤)易感性的关联.方法 选取非瓣膜性房颤患者147例,病区对照147例,采用聚合酶链反应.限制性内切酶片段长度多态性(PCR-RFLP)鉴定CETP TaqIB、KCNE1 S38G和eNOS T-786C遗传多态性的基因型和等位基因分布.结果 (1)CETP B1等位基因频率在非瓣膜性房颤组明显高于对照组,差异有统计学意义(OR=1.763,95%CI:1.247~2.492,P=0.002);(2)logistic回归分析:校正性别、年龄、高血压、吸烟、BMI等混杂因素之后,CETP TaqIB基因多态性在病例组和对照组之间差异具有统计学意义;(3)多因子降维法分析表明,CETP TaqIB、KCNE1 S38G和eNOS T-786C存在交互作用,3个基因多态性同时存在危险度优势比为CETP TaqIB单独存在时的1.849倍.结论 CETP B1等位基因是非瓣膜性房颤遗传易感性的独立危险因子.CETP B1等位基因、KCNE1 S38G等位基因和eNOS T-786C等位基因同时存在可能增加非瓣膜性房颤遗传易感性.
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基因多态性与疾病易感性的分子流行病学研究:问题与对策
传统流行病学研究表明,在相同的环境暴露下,不同个体对疾病的易感性存在差异.研究表明,单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)在阐明疾病的发生发展过程,个体对环境危险因素的易感性与耐受性等方面都起着重要的作用.与基因多态性相关的分子流行病学研究将促进在分子水平上探讨环境-基因交互作用在疾病发生发展中的影响.有关基因多态性与疾病易感性的分子流行病学研究近年来在我国也已逐步展开并渐深入,虽然在数量和质量上均无法与国外相比,但也有自己的特色和优势,即中国人群不同的环境暴露特点和中华民族有别于其他种族的遗传背景特征.本文主要讨论和分析目前基因多态性在疾病分子流行病学研究中存在的主要问题,并希望能对将来的研究有所裨益.
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配对病例对照研究基因与基因交互作用样本量的确定
目的采用配对病例对照研究探讨基因与基因交互作用所需的样本量.方法 logistic 回归分析原理建立两基因与一种疾病相关性模型,以模拟参数值回代计算样本量,计算过程以QUANTO软件完成.结果 (1)基因交互作用越大,所需样本量越少;基因型分布频率Pr为35%(相当于显性遗传模型易感基因频率等于 0.20、阴性遗传模型易感基因频率等于 0.60)时,基因交互作用的样本量少:如两基因主作用均为2,基因交互作用为2时样本量为700例;基因交互作用为5时样本量为200例.(2)探讨基因主作用与探讨基因交互作用所需的样本量不同.结论提供了可供查阅的两基因交互作用样本含量值.
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单纯病例研究方法在流行病学研究中的应用
流行病学在公共卫生决策与计划、预防疾病和促进健康方面正在发挥着愈来愈重要的作用.分子流行病学研究的兴起为揭开疾病的"黑匣子"之谜创造了条件,为阐明致病因素与发病机制提供了有利的工具,与此同时也促进了该领域方法学的研究,并取得了令人瞩目的进展.其中,单纯病例研究(case-only study)方法在探索环境-基因交互作用、评价环境暴露和生物效应以及寻找突发病因的研究中已崭露头角,并在不断发展和完善之中.单纯病例研究的基本特征是研究对象仅用病例而不用对照.按其应用范围可分为四类:病例分布研究(case-distribution study)、病例-病例研究(case-case study)、病例-系列研究(case-series study)和病例-交叉研究(case-crossover study),现分别介绍如下.
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线粒体与核基因交互作用的研究进展
线粒体是真核生物细胞中特别重要的细胞器,对其研究已有一个多世纪的研究历史[1],是机体通过氧化磷酸化生成高能磷酸化合物ATP的加工厂,也是细胞凋亡调控和活性氧产生的重要部位.线粒体DNA(mitochondrion DNA,mtDNA)由于自身比较独特的遗传特性(母系遗传、缺乏重组和进化速率高)而被广泛地应用于人类群体的研究.
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复杂基因-基因交互作用与中国人群贲门癌发病风险的关系
肿瘤的发生发展受多个基因和多种环境因素的共同影响,并普遍存在复杂基因-基因、基因-环境交互作用.对于复杂交互作用的探索一直是肿瘤分子流行病学研究的热点及难点.统计学交互作用在一定程度上可反映生物学交互,因而对交互作用的探讨通常首先是基于统计层面的分析,但目前尚缺乏对多个因子交互作用进行分析的有效统计方法.
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环境因素与基因交互作用和非综合征性唇腭裂关系研究进展
非综合征性唇腭裂( nonsyndromic cleft of lip with or without palate,NSCL/P)是一种病因十分复杂的先天性缺陷。尽管对于综合征性唇腭裂的病因已经有明显的进展,但是对于更加常见的NSCL/P病因的研究仍然十分匮乏。目前已经明确了许多基因和环境因素对NSCL/P有影响,并且还有一些报道基因和环境因素的交互作用对NSCL/P发生的影响,但是对于NSCL/P的病因,仍然有很大的争议。本文主要对基因和环境的交互作用对NSCL/P的影响进行综述。
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三种遗传性耳聋基因交互作用与高频听力损失易感性的关系
目的 探讨EYA4基因、粒状头样2(grainyhead-like-2,GRHL2)基因和原钙黏蛋白15 (protocadherin 15,PCDH15)基因的交互作用与噪声性高频听力损失(noise-induced high-frequency heating loss,NIHL)之间的关系.方法 将双耳高频平均听阈≥40 dB (A)的343名噪声作业工人作为观察组;按匹配标准,选择双耳高频平均听阈及平均语频均<25 dB (A)的343名噪声作业工人作为对照组.应用条件Logistic回归方法探讨基因单个位点与NIHL易感性之间的关系,应用广义多因子降维法(generalized muhiple dimensionality reduction,GMDR)分析基因一基因之间交互作用对NIHL易感性的作用.结果 在校正吸烟、饮酒、高血压和身高因素后,EYA4基因rs3813346位点在共显性、显性和隐性遗传模型下与NIHL关联(P值分别为0.012、0.024和0.043);GRHL2基因rs3735715位点在共显性和显性遗传模型下与NIHL关联(P值分别为0.047和0.046).PCDH 15基因rs11004085 CT基因型与TT基因型相比,发生NIHL的风险增加.EYA4基因的rs3813346、rs9321402和GRHL2基因rs3735715间的交互作用可能与NIHL之间存在关联(P=0.012),交叉验证一致性和预测准确率均为高,分别为10/10和54.47%.结论 EYA4基因和GRHL2基因可能通过独立和/或交互作用与NIHL易感性之间发生关联.
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神经网络模型在分析复杂性疾病多基因交互作用中的应用
复杂性疾病的发病机制复杂,受多个微效基因及环境因素的影响,并且普遍存在基因-环境、基因-基因的交互作用.选择何种方法对多基因之间的交互作用进行分析以评价其在疾病发生过程中的作用,是当今面临的大挑战.传统的统计分析方法存在多重检验、维度困扰、模型依赖等许多问题,其中维度困扰是指每增加一个基因位点,所需的样本量将呈指数倍增加,即使样本量较大,很可能出现某些基因型组合观察值太少甚至缺失的情况,这将导致交互作用效应参数估计的不准确[1].
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肺癌开胸手术患者血清糖类抗原及相关生长因子水平
肺癌的发生是一个多基因参与,多阶段发展的复杂过程.是环境因素与基因交互作用的结果.目前国内除应用影像学检查外,血清糖类抗原的检测也被广泛用于肺癌诊断.同时发现糖类抗原血清水平的变化多见于上皮类恶性肿瘤患者[1].而且还发现许多非肿瘤患者或良性肿瘤患者也不同程度升高.在良、恶性肿瘤及其它肺良性疾病存在一定的交叉.另外,近年来在肿瘤临床许多细胞生长因子也倍受关注.本文对32例肺癌手术患者的血清CA-125、CA-153、血管内皮生长因子(VEGF)及胰岛素样生长因子Ⅱ(IGF-Ⅱ)水平进行了测定分析,现报道如下.
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ESR1基因与5-HTT基因多态性的交互作用对女性围绝经期抑郁障碍的影响
目的 通过多因子降维法(MDR)模型探讨雌激素α受体(ESRl)基因与5-羟色胺转运体(5-HTT)基因多态位点的交互作用对围绝经期首发抑郁障碍的影响.方法 采用病例-对照研究,通过对在妇科门诊就诊的围绝经期汉族女性人群进行抑郁障碍筛查及诊断,终共纳入围绝经期抑郁障碍患者63例(病例组),围绝经期健康女性131例(对照组).采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性( PCR-RFLP)法对5-HTT基因启动子区域多态(5-HTTLPR)位点、第2内含子上可变数目串联重复序列多态位点(Stin2)及ESR1基因第1内含子上限制性内切酶PvuⅡ(rs11155815)和Xba Ⅰ (rs11155816)多态位点进行基因分型.应用MDR软件对两基因交互作用与围绝经期首发抑郁障碍的关联进行分析.结果 病例组与对照组5-HTTLPR位点各基因型分布频率差异具有统计学意义(P=0.032),患病与L/L基因型呈正相关(OR=3.52,95%CI为1.36~9.09);而两组间Stin2位点、PvuⅡ位点及XbaⅠ位点各基因型分布频率比较,差异无统计学意义(P>0.05).基因交互作用分析结果显示,5.HTT基因及ESR1基因上的4个多态位点的交互作用与抑郁障碍存在关联(P<0.05),其中优模型为5-HTTLPR与Xba Ⅰ多态位点交互作用与疾病的关联模型(x2 =9.24,p =0.010).结论 5-HTT基因与ESR1基因多态交互作用可能增加女性围绝经期抑郁障碍患病的风险.
关键词: 抑郁障碍 围绝经期 基因交互作用 雌激素α受体基因 5-羟色胺转运体基因 -
基因交互作用预测高原红细胞增多症的遗传易感性研究
目的:本研究拟探讨SENP1、VEGF以及CARD14交互作用在预测移居汉族男性高原红细胞增多症遗传易感性的作用。方法:纳入234例移居汉族男性高原红细胞增多症( HAPC)患者与250例移居汉族男性正常对照, PCR-高分辨率熔解曲线法判定SENP1基因rs726354、VEGF基因rs3025033及CARD14基因rs8065364等多态性位点的基因型,多因子降维软件分析基因之间的交互作用。结果:rs726354多态性位点以及rs3025033多态性位点基因型与等位基因频率在HAPC组与正常对照组的分布无差异;CARD14基因rs8065364的3种基因型在HAPC组与正常对照组的频率分布存在差异,HAPC组与正常对照组C等位基因与T等位基因频率存在差异。基因交互作用提示上述3个多态性位点的不同组合可影响移居汉族男性HAPC的易感性。结论:CARD14基因rs8065364多态性与移居汉族男性HAPC的发生存在相关性,C等位基因是汉族男性HAPC的危险因素,SENP1基因、VEGF基因以及CARD14基因的交互作用可能参与了移居汉族男性HAPC的发生。
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影响肺癌发生的环境因素与基因的交互作用
肺癌是当今常见的恶性肿瘤之一,其发生是一个多基因参与、多阶段发展的复杂过程.一方面机体暴露于环境危险因素而导致DNA损伤,促使癌基因激活和/或抑癌基因失活而形成恶性肿瘤;另一方面基因多态性的存在使携带易感基因型的个体较少量地暴露于环境危险因素即可发病.因此,肺癌的发生是环境因素与基因交互作用的结果,现将国内外这方面的研究进展综述如下.
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膳食-基因交互作用与维吾尔族人群维医体液类型关联性研究
维医体液论是研究人类各种体液特征、体液类型的生理病理特点,并以此分析疾病的反应状态、病变的性质及发展趋向,从而指导疾病预防、治疗以及养生保健的辩证理论体系。课题针对维医体液论需要解决的基础理论问题,研究各种体液类型在维吾尔族自然人群中的分布规律,分析Ace、ApoE基因多态性与维吾尔族自然人群中体液类型关联,分析膳食模式与维吾尔族自然人群体液类型关联,进一步研究膳食-基因交互作用与维吾尔族体液类型的内在关联。研究成果将进一步阐释维医体液论的本质及推动其现代化,也为体液论的进一步研究提供理论平台,为更好地发挥其疾病预防、治疗以及养生保健作用提供基础理论依据。
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阿司匹林代谢基因在心脑血管疾病治疗中的价值
收集阅读近年来国内外相关文献,归纳和总结.阐述阿司匹林代谢基因在心脑血管疾病治疗中的价值,为个体化治疗提供理论依据.阿司匹林抵抗与心脑血管事件之间有着必然的联系,基因多态性可显著影响血小板活性、阿司匹林抵抗程度以及药物不良反应,基因突变以及基因交互作用可使阿司匹林抵抗产生的比例和缺血性心脑血管事件发生率均有显著差异.依据药物代谢相关基因检测结果合理调整给药方案实行个体化治疗,可以降低阿司匹林抵抗、缺血性心脑血管事件的发生率、阿司匹林副作用发生率.