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应用ROC曲线分析降钙素原在细菌性肺炎中的诊断价值
目的 探讨降钙素原在细菌性肺炎中的诊断价值.方法 分别测定89例细菌性肺炎患者和53例健康志愿者的降钙素原、C反应蛋白及WBC水平,应用ROC曲线分析降钙素原诊断细菌性肺炎的佳阈值、灵敏度、特异度、准确度、阳性预测值和阴性预测值.结果 病例组降钙素原水平明显高于对照组,差异有统计学意义(P ＜0.05);ROC曲线分析降钙素原诊断细菌性肺炎的曲线下面积为0.968,灵敏度95.0％,特异度85.7％,准确度为87.7％,阳性预测值为89.4％,阴性预测值为93.1％.结论 降钙素原在细菌性肺炎的诊断中具有较高的灵敏度和特异度,是细菌性肺炎较特异的血清学标志物.
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麻疹、手足口病和猩红热患儿的CRP和PCT水平分析及临床价值
目的 分析麻疹、手足口病和猩红热患儿的C-反应蛋白(CRP)和降钙素原(PCT)水平及临床价值.方法 随机筛选2013年6月至2015年6月检测在我院就诊的60例麻疹患儿(麻疹组)、50例手足口病患儿(手足口病组)、40例猩红热患儿(猩红热组)和30例正常体检儿童(对照组),检测血清C-反应蛋白(CRP)、降钙素原(PCT),比较麻疹、手足口病和猩红热的PCT和CRP的检测结果.采用Logistic回归分析获得新的统计量,计算各曲线下面积(AUC),探讨二者在麻疹、手足口病和猩红热的临床价值.结果 (1)PCT和CRP在麻疹、手足口病和猩红热组均高于对照组(P＜0.05).猩红热组中PCT水平高,依次为手足口病组、麻疹组,差异明显有统计学意义(P＜0.05).CRP在手足口病组中高,依次为猩红热组和麻疹组,差异明显有统计学意义(P＜0.05).(2)根据ROC曲线以及“灵敏度+特异性”取大值的原则,确立麻疹、手足口病和猩红热患儿的PCT和CRP的佳截断点分别为0.35ng/mL、0.45ng/mL和0.525ng/mL;11.1mg/L、8.55mg/L和7.35mg/L.(3)CRP +PCT的ROC曲线的AUC明显大于PCT和CRP任一指标的AUC.结论 PCT和CRP分别在麻疹、手足口病和猩红热的诊断中具有高的临床价值.但不能用唯一的PCT和CRP的参考值去衡量麻疹、手足口病和猩红热的感染及炎症程度.
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利用ROC曲线确定PSA诊断女性乳腺癌佳临界值
目的 利用ROC曲线确定PSA(前列腺特异性抗原)诊断女性乳腺癌的佳临界点.方法 女性乳腺癌组61例,女性乳腺良性疾病组108例,女性正常对照组30例,均在西门子全自动化学发光仪上测定静脉血清PSA浓度.结果 曲线下面积为0.932(P ＜0.001),根据ROC确定诊断临界值为0.030,该点处灵敏度为82.0％,特异性为87.7％.结论 血清PSA浓度检测可以作为女性乳腺癌一个有用辅助检测指标.
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应用Logistic回归和ROC曲线综合分析PSA、fPSA、fPSA/PSA和EPCA对前列腺癌的诊断价值
目的 探讨Logistic回归和ROC曲线综合分析PSA、fPSA、fPSA/PSA和EPCA对前列腺癌的诊断价值.方法 检测107例前列腺癌(prostate cancer,PCa)患者、84例良性前列腺增生(benign prostatic hyperplasia,BPH)患者和50例健康对照者的血清PSA、fPSA和EPCA水平,计算fPSA/PSA,建立Logistic回归模型,绘制ROC曲线并计算曲线下面积来评价各肿瘤标志物对PCa的诊断价值.结果 PCa组血清PSA、fPSA和EPCA水平较BPH组和健康对照组明显升高(P<0.01),PCa组和BPH组fPSA/PSA水平低于健康对照组(P<0.01);单项指标中,EPCA的灵敏度和特异性高(78.5%、96.0%),约登指数大(0.777);建立回归模型Y=logit(P)=-6.906+0.843XPSA-1.402XfPSA+0.271XEPCA,新变量P的AUC为0.935,灵敏度和特异性分别为87.9%和96.0%.结论 PSA、EPCA检测在PCa诊断中具有一定的临床意义,与fPSA联合检测与单项检测相比可以显著提高诊断能力,综合应用Logistic回归和ROC曲线分析有助于提高PCa的诊断效能.
关键词： 前列腺癌 前列腺增生 早期前列腺癌抗原 Logistic回归 ROC曲线 -
PCT和CRP联合检测在儿童流感、水痘和腮腺炎的临床价值
目的 探讨PCT和CRP联合检测对儿童流感、水痘和腮腺炎的临床价值.方法 筛选2013年6月至2015年6月在本院就诊的60例流行性感冒患儿(流感组)、50例水痘患儿(水痘组)、40例腮腺炎患儿(腮腺炎组)和30例正常体检儿童(对照组),检测血清C-反应蛋白(Creactive protein,CRP)、降钙素原(procalcitonin,PCT),比较流感组、水痘组和腮腺炎组的PCT和CRP的检测结果.采用Logistic回归分析获得新的统计量,计算各曲线下面积(AUC),探讨二者在流感、水痘和腮腺炎的诊断价值.结果 (1)水痘组和腮腺炎组的PCT、CRP高于流感组(P＜0.05),且三组中的PCT、CRP均高于对照组(P＜0.05).(2)以对照组儿童为诊断依据,根据ROC曲线“灵敏度+特异性”取大值的原则,确定流行性感冒、水痘、腮腺炎患儿的PCT和CRP的佳截点分别为0.25ng/mL、0.45 ng/mL和0.35ng/mL;6.85mg/L、8.05mg/L和4.7mg/L.(3)CRP+ PCT的ROC曲线下的面积(AUC)明显大于PCT和CRP任一的AUC.结论PCT和CRP在流感、水痘和腮腺炎的诊断中有一定的临床价值,二者联合检测诊断效价更佳.
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用ROC曲线比较TRFIA和RIA检测AFP在HCC诊断中的价值
分别用时间分辨荧光免疫分析(TRFIA)和RIA法检测血清AFP浓度,比较两种检测方法对原发性肝细胞癌(HCC)诊断的临床应用价值.选择门诊和住院期间得到确诊的原发性肝癌患者118例和肝良性病变患者123例,分别用TRFIA和RIA法检测受试者血清AFP浓度,并行工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线分析.以正常对照组95%区间为医学正常值范围,TRFIA法和RIA法诊断肝癌的临床界限值分别为7.2ng/mL和23.2ng/mL.TRFIA诊断肝癌的灵敏度为45.8%,特异性为92.4%,诊断准确率为75.9%.RIA法的灵敏度为40.7%,特异性为91.4%,诊断准确率为67.6%.两种检测方法ROC曲线下面积分别为0.759(TRFIA)和0.676(RIA).TRFIA和RIA法都可以满足临床AFP检测需要,但TRFIA法明显优于RIA法.
关键词： ROC曲线 时间分辨荧光免疫分析 放射免疫分析 肝癌 -
应用ROC曲线确定D-二聚体诊断深静脉血栓临界值
血浆D-二聚体是交联纤维蛋白经纤溶酶水解后的一种特异性降解产物,是体内纤维蛋白溶解亢进的分子标志物,可以作为体内血栓形成的指标之一.血浆D-二聚体浓度升高提示体内纤维蛋白溶解活性增强,其测定已经广泛用于诊断静脉血栓形成(VTE).深静脉血栓(deep venous thrombosis,DVT)是血管外科的常见病,临床医生认为D-二聚体的定量水平偏高,对深静脉血栓诊断的效率不高.
关键词： D-二聚体 深静脉血栓(DVT) 临界值 ROC曲线 -
化学发光检测人血清HBsAg正常参考值的确定方法
乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)感染是一个全球性公共卫生问题,目前全世界约有3.5亿慢性乙型肝炎病毒携带者,占人口总数的5％,在我国HBV携带率为10％左右.乙型肝炎病毒表面抗原(HBsAg)是HBV的外膜蛋白.HBsAg有4种主要的亚型:adw、ayw、adr和ayr,我国主要为adr和adw[1].HBsAg是乙肝患者血清中首先出现的病毒标志物,HBsAg的检测可作为乙型肝炎的早期诊断和普查项目.一直以来,临床上广泛使用的HBsAg检测法是酶免疫分析方法(EIA),且多为定性检测.
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ROC曲线确定佳临界点的方法探讨
ROC曲线称受试者工作特征曲线,又称相对工作曲线,目前在临床诊断性试验中,用于正常值临界点的合理选择.在工作应用中,笔者发现一种确定ROC曲线佳临界点的快速方法,试与传统方法比较,报道如下.1 传统方法在绘制ROC曲线时,传统方法以某试验的SEN为纵坐标,以1-SPE(假阳性率,FPR)为横坐标,依照连续分组测定的数据,分别计算出SEN和FPR,将给出的各点连成曲线即为ROC曲线,距左上角近一点为正常值的佳临界点,这一点下的曲线面积大.用该点数值区分正常和异常,其敏感度和特异性都比较高,而误诊和漏诊例数之和小[1].
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COX多因素分析和ROC曲线综合评价DNA修复基因对鼻咽癌的预后价值
目的 应用COX多因素分析和ROC曲线探讨DNA修复基因对鼻咽癌的预后价值.方法 收集2007年5月至2012年2月经广西壮族自治区人民医院病理科确诊为鼻咽癌且选择调强放射治疗的患者100例.筛选随访时间超过1年的患者共71例,用免疫组化SP法检测鼻咽癌组织中DNA修复基因DNA-PKcs及BRCA1的表达.用Spearman分析DNA-PKcs和BRCA1的表达水平与临床特征的相关性;ROC曲线法建立预后分组,用Kaplan-Meier生存曲线对DNA-PKcs、BRCA1的表达与预后关系进行单因素分析;Cox比例风险回归对预后进行多因素生存分析.结果 1)DNA-PKcs的表达水平和患者的生存时间呈正相关(P＜0.05).2)DNA-PKcs高表达患者的生存时间长于低表达的患者(P＜0.01).3)多因素生存分析,DNA-PKcs表达水平是影响预后的独立因素(P＜0.01),而BRCA1表达水平未能得出类似结果.结论 DNA-PKcs表达状态是影响预后的独立因素.DNA-PKcs高表达可能作为预测鼻咽癌患者预后较好的一个指标.
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应用化学发光免疫分析法测定血清抗TgAb和抗TPOAb的临床诊断价值
为探讨化学发光免疫分析法(CLIA)测定血清抗甲状腺球蛋白抗体(抗TgAb)和抗甲状腺过氧化物酶抗体(抗TPOAb)的临床诊断价值,以病理诊断作为主要依据,289例各种甲状腺疾病患者为研究对象,采用CLIA法测定血清抗TgAb、抗TPOAb水平,应用ROC曲线分析法评价CLIA法的诊断价值并确定诊断临界值.结果发现对自身免疫性甲状腺疾病(AITD)的诊断,血清抗TgAb和抗TPOAb水平的ROC曲线下面积分别为0.792±0.029 和0.892±0.022,其诊断临界值分别为90 U/mL(准确度75.1%,敏感度63.3%,特异度82.2%)和300 U/mL(准确度85.5%,敏感度78.9%,特异度89.4%).特别针对桥本病的诊断,血清抗TgAb和抗TPOAb曲线下面积分别为0.769±0.044和0.737±0.049,诊断临界值分别为300 U/mL(准确度69.7%,敏感度54.9%,特异度82.8%)和3 000 U/mL(准确度74.3%,敏感度70.6%,特异度77.6%),总预测正确率为71.6%,总判别功效为69.7%,增加血清TSH水平变量后,总预测正确率和总判别效力均提高至89.9%. 表明CLIA法测定血清抗TgAb和抗TPOAb水平对AITD诊断具有较高的诊断价值;对桥本病和Graves病的诊断,如同时参考血清促甲状腺激素(TSH)水平,可明显提高诊断的准确度.
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几种户尘螨过敏原点刺液的临床评价
目的 评价户尘螨过敏原点刺皮试液用于诊断和筛查尘螨过敏的意义.方法 对219例患者进行户尘螨过敏原点刺试验和户尘螨sIgE检测.点刺试验所用点刺液为本课题组研制的点刺液(A组)、ALK公司的户尘螨点刺液(B组)和ALK公司的混合螨(户尘螨和粉尘螨)点刺液(C组),以sIgE为诊断标准.统计分析采用SPSS 11.0软件,对3组户尘螨过敏原点刺试验进行ROC曲线评价.结果 A、B和C组风团平均直径中位数分别为0.43 cm、0.35 cm和0.28 cm.所有入选者点刺试验后1 h,A组有5例点刺试验后出现局部反应,2 h左右自行缓解;有2例出现迟发反应,需12 d左右才消退;B组和C组各有3例点刺试验后出现局部反应,B组和C组各有2例有迟发反应.所有患者均无局部皮疹、全身性不良反应.3组户尘螨过敏原点刺试验的ROC曲线下面积分别为0.765、0.801和0.782,说明户尘螨过敏原点刺皮试液对诊断户尘螨过敏具有较高准确性.以户尘螨sIgE为标准的点刺试验灵敏度和特异度:A、B和C组点刺液的灵敏度分别为92.4%、87.0%和81.5%,特异度分别为60.6%、73.2%和74.8%.结论 户尘螨点刺液可作为尘螨过敏的诊断试剂,有良好的灵敏度和特异度,具有临床筛查和诊断意义.
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桡骨远端骨折术后早期影像学表现与远期功能的ROC曲线法相关性分析
目的:应用ROC曲线法研究桡骨远端骨折术后早期影像学评分与远期功能的关系.方法:回顾性研究内固定术治疗的桡骨远端骨折的成年患者术后早期Batra改良的Jakim影像学评分及远期腕关节功能的改良Garland and Werley评分的关系,用SPSS 15.0软件进行统计学分析,采取ROC曲线法,以P＜0.05为有统计学意义.结果:共109例患者,平均年龄59.1岁(18～87岁),改良的Garland and Werley评分平均1.6分(0～12分),其中优82例,良25例,可2例,Batra改良的Jakim影像学评分平均92分(30～100分).ROC曲线分析整组资料,60岁以下年龄组和内固定取出组患者影像与功能相关性有统计学意义(AUC分别为0.652,0.785,0.762).结论:桡骨远端骨折患者内固定术后早期影像学评分与远期功能间存在相关性,对整体而言相关性不高,但对60岁以下患者和内固定取出的患者,两者具有较高的相关性,其术后早期影像学评分对于患者远期功能有一定的预测意义.
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血清和尿半胱氨酸蛋白酶抑制剂C对糖尿病患者早期肾损伤的诊断价值
目的 观察糖尿病患者血清和尿半胱氨酸蛋白酶抑制剂C(cystatin C)的浓度变化并与临床常用反映肾功能改变的指标进行比较,探讨其对糖尿病早期肾损伤的临床评估价值.方法 选择本院首次确诊为糖尿病患者82例,按24 h尿白蛋白定量程度分成3组,以健康志愿者为对照,分别观察血清cystatin C、血清肌酐(Scr)、尿cystatin C、N-乙酰-β-葡萄糖苷酶(NAG)、α1微球蛋白(MG),99mTc肾小球滤过率(GFR),内生肌酐清除率(Ccr)-GFR等临床指标并行统计分析.结果 尿cystatin C浓度及其异常率的升高早于血清cystatin C.血清cystatin C与99mTc-GFR的相关性较Ccr-GFR与99mTc-GFR的相关性好(r=-0.88和r=0.84,P<0.01).尿cystatin C与NAG的相关性和尿cystatin C与α1-MG的相关性之间差异无统计学意义(r=0.89和r=0.90,P>0.05).血清cystatin C的工作特征曲线下面积(AUCROC)大于Ccr-GFR的AUCROC(0.897±0.094和0.757±0.228,P<0.01);尿cystatin C的AUCROC大于NAG的AUCROC(P<0.05),与α1-MG的AUCROC差异无统计学意义(P>0.05).尿cystatin C的似然比(LR)大于血清cystatin C的LR.结论 血清和尿cystatin C水平可较早期地反映糖尿病患者肾功能的损伤,其反映肾小管功能的损伤早于肾小球功能的损伤.
关键词： 半胱氨酸蛋白酶抑制剂 糖尿病 肾功能试验 ROC曲线 肾小管 -
血肌酐水平预测脑干出血预后的价值
目的 确定判断脑干出血患者预后的血肌酐临界值,分析血肌酐与格拉斯哥昏迷评分(GCS)相关性,探讨血肌酐对评估脑干出血预后的价值.方法 回顾性分析2010年6月至2012年6月期间本院收治的77例自发性脑干出血患者的临床资料,根据预后将患者分为生存组(n=51)和病死组(n=26).对两组患者行GCS评分和血肌酐检测,根据血肌酐水平绘制血肌酐预测脑干出血患者病死情况的受试者工作曲线(ROC)并评估血肌酐的优截断点cut-off值.以cut-off值为界将患者分为血肌酐＜96.000 μmol/L组(n=39)和≥96.000μmol/L组(n=38),对比两组患者的GCS评分和实际病死率.结果 病死组GCS评分低于生存组,而血肌酐水平高于生存组(均P＜0.05).根据ROC曲线,以血肌酐水平来预测患者死亡事件,其cut-off值为96.000 μmol/L,其诊断灵敏度为80.77％,特异度为66.67％.血肌酐＜96.000μmol/L组和≥96.000 μmol/L组患者的GCS评分及实际病死率差异均有统计学意义(均P＜0.05).结论 血肌酐水平可应用于脑干出血患者病情严重程度的评估以及预测死亡危险度.
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人附睾上皮分泌蛋白4在卵巢癌检测中的作用评估
目的 探讨人附睾上皮分泌蛋白4(HE4)在卵巢癌检测中的作用.方法 选取2012年7月至2015年1月期间本院收治的卵巢癌患者120例和卵巢良性肿瘤患者30例为研究对象,根据卵巢癌分期将卵巢癌组分为卵巢癌早期组(Ⅰ、Ⅱ期)及卵巢癌晚期组(Ⅲ、Ⅳ期).采用酶联免疫吸附法检测血清HE4水平,采用电化学发光法检测血清糖类抗原125(CA125)水平.比较各组患者术前血清HE4、CA125阳性表达率,术前、术后不同时间点卵巢癌各亚组患者血清HE4、CA125变化,以及卵巢癌各亚组复发患者复发前不同时间点和复发时血清HE4、CA125变化.结果 术前,卵巢癌早期组和晚期组HE4阳性率、CA125阳性率均明显高于卵巢良性肿瘤组(均P<0.05);卵巢癌早期组和晚期组之间比较差异无统计学意义(均P>0.05);与术前比较,术后不同时间点卵巢癌早期组和晚期组血清HE4、CA125水平均降低(均P<0.05),术后3个月、6个月、12个月,血清HE4、CA125水平呈逐渐下降趋势,至术后12个月降至低,术后18个月又开始上升,术后18个月、24个月、36个月,血清HE4、CA125水平呈逐渐上升趋势,但仍较术前降低;组间比较,卵巢癌早期组各时间点HE4、CA125水平均低于卵巢癌晚期组;术后36个月内,卵巢癌组共有37例患者复发,与复发前9个月比较,复发前6个月、3个月、复发时复发患者血清HE4水平显著升高(均P<0.05),血清CA125水平在复发前9个月、6个月、3个月无明显变化(均P>0.05),复发时明显升高(均P<0.05).经受试者工作特征(ROC)曲线分析,血清HE4诊断卵巢癌的曲线下面积(AUC)为0.927,诊断卵巢癌复发的AUC为0.904,均优于血清CA125诊断.结论 HE4对于卵巢癌发病及复发诊断效能高,可用于卵巢癌病程的监测.
关键词： 人附睾上皮分泌蛋白4 CA-125抗原 卵巢肿瘤 复发 ROC曲线 -
移行带前列腺特异性抗原密度在前列腺特异性抗原4.0～10.0和10.1～20.0μg/L时诊断前列腺癌的作用
目的 探讨移行带前列腺特异性抗原密度(TZPSAD)在前列腺特异性抗原(PSA)4.0～10.0 μg/L 和 10.1～20.0 μg/L时诊断前列腺癌的意义.方法 回顾性分析1999年11月至2009年8月在本院行前列腺穿刺活检的患者资料,以PSA 4.0～20.0 μg/L且有经直肠B超测量前列腺移行带资料的1 89例患者为研究对象,用接受者操作特性(ROC)曲线计算评估PSA和TZPSAD诊断前列腺癌的意义.分析PSA和TZ PSAD不同临界点在PSA 4.0～10.0 μg/L和10.1～20.0 μg/L范围内对前列腺癌的诊断效力.结果 40例(21.2％)诊断为前列腺癌,PSA 4.0～10.0μ/L时前列腺癌的阳性率为20.5％(16/78),PSA 10.1～20.0 μg/L时前列腺癌的阳性率为21.6％(24/111),两者差异无统计学意义(P=0.854).PSA4.0～10.0 μg/L时,PSA和TZPSAD预测前列腺癌ROC曲线下面积(AUC)分别为0.569和0.702;PSA10.1～20.0 μgL时,PSA和TZ PSAD预测前列腺癌AUC分别为0.463和0.730.TZPSAD 0.370和0.500 ng·ml-1·ml-1分别在PSA4.0～10.0和10.1～20.0 μg/L的诊断效力大,其敏感性分别为68.8％和70.8％,特异性分别为72.6％和70.1％,结论 TZPSAD在PSA 4.0～ 10.0和10.1～20.0μg/L时诊断前列腺癌的效力均明显优于PSA,可明显提高PSA诊断前列腺癌的阳性率,减少不必要的前列腺穿刺活检.
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炭疽杆菌PA63蛋白原核表达及抗体检测间接ELISA方法的建立
目的 原核表达炭疽杆菌PA63蛋白,以此为包被抗原建立检测相应抗体的间接ELSIA方法,用于炭疽血清免疫学诊断. 方法 选择炭疽杆菌PA63为目的基因,合成全长序列,构建pCzn1-PA63质粒,克隆至E.coli ArcticExpress表达菌株,优化IPTG表达条件,通过包涵体变性复性,Ni柱纯化获得可溶性PA63蛋白.利用棋盘滴定法确定包被PA63蛋白的佳浓度及血清佳稀释度建立间接ELISA方法,对炭疽阳性血清和阴性血清进行检测,计算ROC曲线下面积,确定Cut-off值,灵敏度与特异度. 结果 成功构建了pCzn1-PA63质粒,IPTG 37℃诱导表达蛋白主要以包涵体形式存在.包涵体经变性、复性,纯化后获得PA63蛋白.用5 μg/ml PA63包被酶标板,血清稀释度为1∶50建立的ELISA方法;ROC 曲线下面积为0.969(P＜0.01),Cut-off值为0.2865时的灵敏度为91.18％(95％可信区间为76.32％-98.14％),特异度为94.64％(95％可信区间为85.13％-98.88％). 结论 成功表达具有生物活性的重组炭疽杆菌PA63抗原蛋白,以此为包被抗原建立的间接ELISA检测炭疽PA抗体,具有较高的灵敏度与特异度,可用于炭疽的血清学诊断.
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一种基于LBP特征提取和稀疏表示的肝病识别算法
由于肝脏超声图像具有回声不均匀、边缘模糊等缺点,肝脏疾病的无创诊断易受影响,而且目前临床基于肝脏超声图像的肝病诊断主要依靠医生的主观判断,其缺点为依赖医生主观经验且耗时,因此提出一种基于局部二值模式(LBP)特征提取和稀疏表示的肝病识别算法.从肝脏超声图像中提取感兴趣区域,使用LBP特征提取方法对感兴趣区域提取图像特征,将得到的特征进行字典训练,得到稀疏矩阵,终采取支持向量机对其进行分类.实验样本均取自青岛大学附属医院肝胆科.实验1使用该方法对100个正常肝脏样本和100个肝硬化样本进行分类,准确率达到99.50％,实验2使用该方法对肝硬化、脂肪肝、肝血管瘤和肝癌4类样本共200个进行分类,AUC值分别为67.2％、65.1％、55.0％和62.6％.ROC曲线表明,提出的分类方法在准确率和泛化能力上均优于传统方法,有助于肝病的临床诊断.
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基于多特征融合的线性内核SVM法挖掘生物实体关联
提高挖掘生物医学文献中的实体关联算法的性能,对开拓研究新思路有重要启示作用.提出一种改进特征的新线性内核SVM关联挖掘方法,以糖尿病相关文献摘要为研究内容,总结归纳出5种实体关联挖掘特征:实体特征、实体对特征、依赖图特征、解析树特征和名词短语约束特征,其中实体对和名词短语约束是所提出的新特征,并使用Huber损失函数作为SVM分类器的线性内核进行计算,挖掘预测疾病、基因和药物实体之间的关联.计算得到10种糖尿病相关病症和23种基因有173种关联,13种糖尿病相关病症和26种药物存在79种关联,18种基因与17种药物组成了159种关联,构建出疾病-基因、疾病-药物、基因-药物和8种糖尿病相关疾病基因药物的关联网络,共计619种实体关联,同时预测出27种新实体关联对,后使用ROC曲线验证3种关联(0.804、0.847和0.742).结果表明,所提出算法与CoPub(0.710)、PubGene(0.609)、FBK-irst(0.547,0.800)和WBI(0.510,0.759)所用算法相比,高精确度提升超过约5％(0.847与0.800),低提升超过约20％(0.742与0.510),性能更优,为下一步在生物医学大数据中的应用打下良好基础.
关键词： 特征 支持向量机(SVM) 关联挖掘 糖尿病 ROC曲线
