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应用Empower Stats软件估计基因环境交互作用研究中的样本含量
在基因环境交互作用的研究中,传统的样本含量估计公式和设置的参数只考虑一种暴露,未考虑两个以上因素的交互作用,依此样本含量而进行的研究,其检验效能往往很低(文中以例1和例2说明).在基因-环境交互作用研究的设计阶段,可采用随机模拟法估计样本含量及检验效能.Empower Stats软件可以方便地实现上述分析,同时输出R统计模拟程序,并输出对每个模拟数据所做的回归方程参数.
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弹性匹配策略在分析基因与环境交互作用中的应用
以HER-2原癌基因Ile655Val多态性、吸烟与乳腺癌之间的关联研究为例,运用大样本近似原理计算检验效能,并通过逐步提高对照组中匹配因素的比例,探索弹性匹配策略在环境与基因交互作用分析中的应用价值及其效能计算方法 .HER-2基因多态和吸烟交互作用的检验效能在非匹配的病例对照研究中为30%,应用传统的频数匹配则提高为56%,进一步增加对照组的吸烟率,则能获得更高的效能值(power=74%).结论 :与非匹配或频数匹配的病例对照研究相比,应用弹性匹配的病例对照研究,能够显著增加环境与基因交互作用的检验效能和研究效率,此匹配策略尤其适用于人群中环境暴露率较低、环境暴露与基因易感性呈负向关联或匹配对照例数较少等情况.在研究设计时可充分权衡检验效能的提高与匹配成本的增加,从而选择佳的匹配策略.
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小化随机分组使用常规统计检验方法的Ⅰ型错误和检验效能
目的:采用觉规统计分析方法,分析小化随机分组资料后的Ⅰ型错误和检验效能.方法:采用Monte Carlo模拟的方法,计算小化随机分组的资料使用常规协方差分析的Ⅰ型错误和检验效能,并与简单随机化、中心分层区组随机化分析的结果进行比较.结果:简单随机化、中心分层区组随机化和小化随机分组的资料采用协方差分析后,Ⅰ型错误均保持在0.05左右.3种分组方法的检验效能接近,无明显差异.结论:小化随机分组的资料可采用常规的协方差分析方法,并能将Ⅰ型错误保持在0.05左右且不降低检验效能.
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生长抑素治疗重症急性胰腺炎临床疗效的荟萃分析
SAP是消化科常见的急症,病死率高达20%左右[1].生长抑素(somatostatin,SS)是胰腺分泌的强力抑制剂,国内外许多临床试验研究显示,生长抑素治疗SAP的临床疗效较好,但研究结果并不一致.因此,我们对国内外近10年公开发表的生长抑素治疗SAP的研究资料进行荟萃分析,以提高统计检验效能,评价结果的一致性.
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在不同怀孕年龄组中头3个月的唐氏综合征联合检验效能:筛查方针调整吗?
本文发表在2011年第31期的《Prenatal Diagnosis》上.对唐氏综合征( DS)头3个月的联合检测(FCT)性能在不同怀孕年龄组之间的表现是否一致?在筛查方针方面是否需要做出调整?
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样本含量估计与检验效能分析(一)
在2010年第6期的讲座中,我们介绍了试验设计的重复和均衡原则.重复原则关键在于正确估计样本含量,即指实验中拟包括的各组内重复实验次数之和.说到样本含量,我们不得不提到检验效能,正确估计样本含量的目的在于花费较少的人力、物力的同时,提高检验效能(即假设检验能发现客观上存在的差别的能力);反之,若检验效能偏低,说明样本含量不足.本期我们将详细阐述样本含量估计和检验效能分析两方面的问题.
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单组设计、配对设计、交叉设计定量与定性资料差异性检验时样本含量与检验效能估计
本期讲座中,我们将向读者介绍单组设计、配对设计、交叉设计定量与定性资料差异性检验时的样本含量与检验效能估计.一、单组设计定量与定性资料差异性检验时样本含量与检验效能估计单组设计是指对来自某个总体的一个随机样本在一个特定条件下观测其定量或定性指标的取值.其特点是仅涉及一个试验因素的一个特定水平,受试对象未按任何其他试验因素或区组因素分组.
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两因素析因设计定量资料样本含量与检验效能估计
如果试验涉及两个试验因素,当各因素在试验中同时实施且所处的地位基本平等,两个因素之间存在一级交互作用,且需要加以考察时,所采用的一种试验设计类型就是两因素析因设计[1].若观察指标只有一个且是定量的,相应的资料类型即为两因素设计一元定量资料,这时我们可以采用两因素设计一元定量资料方差分析处理该资料.本期讲座,我们向读者介绍两因素析因设计一元定量资料方差分析时样本含量与检验效能估计.
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样本含量与检验效能估计(三)——结果为二值变量的单因素两水平设计三种特殊试验的样本含量估计
我们通常采用卡方检验或Fisher精确检验处理结果为二值变量的单因素两水平设计定性资料(也称为四格表资料),这些方法属于差异性检验.在新药或医疗器械临床试验研究中,还可能需要采用非劣效性检验、等效性检验、优效性检验这3种特殊的假设检验方法中的某一种来处理此类资料.上期讲座中,我们介绍了结果为定量变量的单因素两水平设计三种特殊检验的样本含量估计,本期向读者介绍结果为二值变量的单因素两水平设计三种特殊检验的样本含量估计.
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样本含量与检验效能估计(四)——拟作成组设计定量与定性资料差异性检验时的样本含量估计特殊试验的样本含量估计
在2011年第4期和第5期的讲座中,我们介绍了成组设计三种特殊检验的样本含量估计问题,本期讲座中将为读者介绍成组设计定量资料和定性资料差异性检验的样本含量估计.所谓差异性检验,研究目的是分析两组样本所代表的两个总体均数(或总体率)是否相等.对于定量资料,若资料满足参数检验的前提条件(独立性、正态性和方差齐性),可采用成组设计定量资料检验进行分析;否则,需要采用秩和检验.对于定性资料,可采用卡方检验或Fisher精确检验进行分析.
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非劣效性/等效性试验中的统计学分析
随着医药事业的发展进步,许多疾病的治疗已有现成的有效药物,以阳性标准治疗而不是安慰剂作为对照的临床试验愈来愈多,导致了许多新药临床研究的目的发生转变,更多遇到的情形是要确认新药的临床疗效是否不差于或者相当于标准的有效药物,因而非劣效性/等效性试验在新药临床试验中占有较大的比例。为此,本文主要根据国际上实施非劣效性/等效性试验的原则和要求,对相应的一些统计学事项进行论述。结合有关的事例,作者较为系统地介绍了临床非劣效性/等效性界值的确定、统计学推断的假设检验和可信区间方法、样本含量及检验效能的计算等。就实际应用中的有关问题,作者还提出进一步的建议和讨论。相信这对于加强生物统计学在我国临床试验中的正确应用,推动我国临床试验与国际的接轨具有重要的现实意义。
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鱼腥草注射液治疗呼吸系统感染的Meta分析
呼吸系统感染是内科常见病,通常是由病毒和细菌引起的,在病毒感染的同时,合并细菌感染的占大多数.几千年来,中医药学在防治呼吸系统感染方面积累了有效的疗法和方药.近年来,应用中医药治疗呼吸系统感染的临床研究越来越多,也取得了不少成绩,但应该指出的是:中医药学的临床研究对方法学的应用仍不够重视,临床试验的规范性亦较差,研究结果难以得到国际医学界的承认.循证医学(evi-dence-based medicine)提倡在搜集所有有关临床试验(证据)的基础上,对证据进行科学的质量评价,然后综合各高质量的临床试验数据,进行综合的系统分析.Meta分析是对以往具有相同研究目的的多个研究结果进行加权合并和综合评价的一种方法.它能够提高统计检验效能,解决研究结果间的不一致性,使研究结论更适合于人群总体.
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提高药品检验效能对提升技术监管水平的重要意义
药品检验按照检验的性质及检验结果的效力可分两类:一类是药品生产者、经营者、医疗机构等因自身需要对药品进行的检验.对于这类药品的检验,法律没有必要强制规定检验机构.另一类药品检验为药品监督管理部门依法履行药品监督管理职能所需要进行的检验.承担上述工作的药品检验机构,其检验结果将作为药品监督管理部门作出具体行政行为的依据.
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应用假设检验需特别注意的几个问题
对假设检验选择单侧检验还是双侧检验、如何建立原假设和备择假设、如何提高检验效能等问题进行了讨论、辨析,并结合实例指出了科研论文中假设检验应用的常见问题.
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安慰剂和阳性药对照的三臂非劣效临床试验的样本含量估计和统计推断
目的 介绍一种基于非劣效界值为标准对照药效应一部分的三臂非劣效临床试验的样本含量估计和统计检验的方法.方法 在介绍Pigeot法的基础上,实例探讨了如何计算样本含量及确定非劣效界值,并用模拟的方法比较了Pigeot法与传统检验方法的检验效能.结果 相同样本含量时Pigeot法的检验效能更高.结论 Pigeot法充分利用了所有样本量的信息,提高了检验效率,降低了临床试验的成本.
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实验组与对照组比较的样本率多重比较方法的模拟研究
目的 研究5种实验组与对照组比较的样本率多重比较方法之特性.方法 用SAS软件编制计算机模拟抽样程序,模拟估算各种参数条件下5种方法的总Ⅰ型错误率、检验效能和判对率.结果 5种方法各具特色:Brunden法保守,杜养志法灵敏,Durmett-SNK法和Bootstrap法较稳健,Dunnett-Levy法逊于Dunnert-SNK法.结论 5种方法中没有一种方法能在各种条件下都将总I型错误率控制在α水平内.相对而言,Dunnett-SNK法稳健,较其他方法更值得推荐.如需严格控制总Ⅰ型错误率且组数不超过5,可选择BrurIden法.如希望结果灵敏,可考虑杜养志法和BootstraD法.
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无删失生存数据Wilcoxon秩和检验与logrank检验的比较
目的 比较Wilcoxon秩和检验与logrank检验处理无删失生存数据的统计性能.方法 采用MonteCarlo模拟方法,应用SAS9.1.3软件编程,比较两种检验方法的Ⅰ型错误率和检验效能.结果 小样本情形(n≤50)下,Wilcoxon秩和检验的Ⅰ型错误率较logrank检验更接近检验水准0.05,而检验效能与logrank检验相差不大,后者检验效能的提高是以扩大Ⅰ型错误率为代价的.结论 对于无删失生存数据的比较,尤其是小样本情形(n≤50)下,建议采用Wilcoxon秩和检验.
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假设检验中计算观察检验效能的意义的探讨
目的探讨假设检验后计算观察检验效能的意义.方法理论上推导观察检验效能与P值的函数关系.应用Monte Carlo方法,模拟产生不同参数条件下三种常用假设检验方法的观察检验效能与P值,建立两者的回归方程,计算两者的决定系数R2.根据模拟结果进一步揭示观察检验效能与P值的关系.结果定义上,观察检验效能并不等同于理论检验效能.理论上,观察检验效能是P值的单调减函数.模拟上,检验观察检验效能与P值呈负相关关系,两者存在对数二次曲线回归关系,且决定系数大于0.9.结论依据样本信息计算观察检验效能并不能提供比P值更多的信息,不能作为理论检验效能的估计值或替代值,因此,根据观察检验效能的大小判断样本量是否足够的观点不应该提倡,即使检验结果P>0.05.
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协变量的不均衡对协方差分析的影响
目的 探讨协变量的不均衡对协方差分析的影响.方法 通过Monte Carlo模拟并结合临床试验实例对作协方差分析时引入不均衡的协变量来校正的前后变化作比较.结果 协变量的不均衡对协方差分析的检验效能是存在一定影响的,无论协变量不均衡程度有多大,在作协方差分析时引入不均衡的协变量来校正总是有一定代价的.结论 新药临床试验中常常存在病人的基线特征在处理组间不均衡从而影响对试验结果的正确评价.可以在作协方差分析时引入该不均衡的协变量去处理,但要根据协变量的不均衡程度及试验目的等实际情况加以权衡.
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生存曲线交叉时统计推断方法的比较和选择
目的 针对两条生存曲线出现交叉的情况,探讨其组间生存率比较的检验方法,并分析Log-rank、Breslow、Tarone-Ware、Renyi、Lin-Wang、Two-stage六种检验方法的适用情形.方法 采用Monte Carlo方法模拟不同参数分布情形下,无删失和平均删失比例为10%、20%、30%时,六种方法的检验效能和Ⅰ类错误.结果 Log-rank检验在两组危险率成比例时具有优的检验效能,Breslow与Tarone-Ware检验对后期的差异不敏感,Two-stage、Lin-Wang、Renyi检验在生存曲线交叉时具有较好的检验效能,其中Renyi检验较为保守.当两组危险率满足比例风险假定或两条生存曲线后期差异大时,六种方法的检验效能随删失比例的增加而减小.结论 不论生存曲线是否出现交叉,综合检验效能和Ⅰ类错误两方面,Two-stage方法在两组生存率比较的问题上较其他五种方法具有更广的适用性,而当两条生存曲线交叉时,用Log-rank等常规方法可能会得到不合理的结论.
关键词: 生存曲线交叉 两组生存率的比较 Monte Carlo模拟 检验效能 Ⅰ类错误