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利用共词聚类分析探讨胃癌前病变研究现状
利用MEDLNE检索胃癌前病变专题文献，对文献中高频主要主题词进行共词聚类分析，研究各类主题词之间的内在关系，探讨胃癌前病变的研究现状和热点。
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利用引文时序和同被引聚类分析探索抗原CD44研究历史及现状
利用SCI检索抗原CD44相关文献,并对其高被引论文进行时序和同被引聚类分析,探索抗原CD44研究历史及现状.
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国外脊索瘤研究热点的同被引聚类分析
从文献计量学角度分析国外脊索瘤研究热点.对脊索瘤这一专题的高频引文进行同被引聚类分析,将高频引文归类,得出聚类树图,总结出该领域的研究热点.脊索瘤的研究热点主要集中在脊索瘤的临床病理学研究、该病的治疗,包括手术治疗和放疗以及治疗以后的预后和随访调查等5个方面.高频引文的同被引聚类分析对于研究学科或某一专题的研究热点是一种比较有效的方法,为专业人员深入开展本学科的研究提供参考.
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基于共词分析的我国医学信息学国际发文热点研究
以Web of Science为数据源,检索我国医学信息学领域国际发文量,利用SPSS 20.0软件对文献关键词进行因子聚类分析,总结出6大研究主题:核医学图像数据库存储研究;计算机自然语言处理和文本挖掘在中国传统医学诊断中的运用;统计方法和计算机处理对临床医学和研究型数据的分析和系统构建;计算机和网络在医院信息系统、临床管理系统、护理系统研发与管理中的运用;统计方法和计算机技术在临床辅助检查心电图和临床疾病的治疗与诊断、临床决策中的运用;电子医学记录和健康记录的安全管理.
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国际医学信息学领域大数据研究热点分析
基于Web of Science从发文年代、国家/地区和机构、核心作者及主要期刊分布几方面分析医学信息学学科大数据研究的现状和进展,借助软件对关键词进行聚类分析,发现研究热点主题主要集中在临床决策支持系统、临床研究数据管理、电子健康档案、转化生物信息学和遗传流行病学等方面.
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生物信息学中模式识别技术应用与发展
评述生物信息学研究中常见的模式识别技术,主要包括人工神经网络(ANN)、聚类分析法(CA)、主元分析法(PCA)和隐马尔可夫模型(HMM)等,并分析生物信息科学研究中模式识别技术的发展与要求.
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基于数据挖掘的刘健教授治疗强直性脊柱炎用药规律研究
目的:应用数据挖掘技术和关联规则分析刘健教授治疗强直性脊柱炎中药配伍及组方规律.方法:基于数据挖掘技术,对2016年3月至2017年3月刘健教授治疗强直性脊柱炎门诊患者病例进行回顾性研究,采用SPSS 22.0与SPSS Modeler 14.2进行药物及其性味归经频数分析、聚类分析及关联规则.结果:①药物性味归经前三位:寒性、温性和平性,甘味、苦味和辛味以及归肝、脾、胃经药物使用频繁.②刘健教授常用药物一般分为4类:健脾祛湿药、清热药、活血化瘀药、祛风湿药,多数药物使用在50%以上.③关联规则分析提取出健脾化湿药茯苓及活血化瘀药红花与清热药、活血化瘀药、祛风湿药、补益药是相互关联的.④聚类分析得出桃仁、红花、鸡血藤、路路通、威灵仙,黄芩、白花蛇舌草、蒲公英、杜仲、丹参、厚朴、豨莶草,姜半夏、山药,炒谷芽、炒麦芽、陈皮,黄芪、当归、茯苓,薏苡仁等6组.结论:刘健教授治疗强直性脊柱炎以从脾论治为主,配伍清热解毒、祛风除湿、活血化瘀中药,寒温并用,甘苦同施,肝脾肾同调,祛邪不忘扶正,标本兼治.
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基于关联规则挖掘健脾化湿、清热通络中药对骨关节炎患者血小板参数的影响
目的:采用关联规则技术挖掘分析刘健教授运用健脾化湿、清热通络中药治疗骨关节炎的用药规律,为临床辨证论治骨关节炎提供依据.方法:整理安徽中医药大学第一附属医院风湿免疫科2012年6月至2016年12月电子病历录入的诊断为骨关节炎患者的资料,采用SPSS 21.0、SPSS Clementine 11.1软件Aprior模块和统计学方法分析中药、中成药及外用药对患者实验室指标的影响.结果:①共纳入骨关节炎患者1970例,经健脾化湿、清热通络中药治疗后,患者血小板参数、炎症指标及免疫指标等均有所改善.②本院风湿免疫科治疗骨关节炎常用药物有5大类:健脾化湿药、祛风除湿药、活血化瘀药、清热解毒药和补益肝肾药.根据每类药物使用频次前5位提取,健脾化湿药为茯苓、陈皮、泽泻、薏苡仁、山药,祛风除湿药为威灵仙、烫狗脊、豨莶草、伸筋草、独活,活血化瘀药为丹参、桃仁、红花、鸡血藤、牛膝,清热解毒药为蒲公英、白花蛇舌草、黄芩、黄柏、知母,补益肝肾药为杜仲、桑寄生、熟地黄、枸杞子、千年健.③设关联规则支持度为20%,置信度为70%,口服中药及中成药分别与实验室指标关联,关联度高的前5位,蒲公英、丹参、薏苡仁关联于血小板计数(PLT)指标下降,薏苡仁、泽泻、独活关联于免疫球蛋白IgG指标下降,丹参、鸡血藤、黄芩关联于超敏C-反应蛋白指标下降,蒲公英、威灵仙关联于 α1-酸性蛋白指标下降,黄芩、丹参、鸡血藤关联于三酰甘油指标下降,新风胶囊关联于PLT指标下降,新风胶囊、芙蓉膏关联于红细胞沉降率、IgG、补体C3、补体C4指标下降.④由聚类分析得出,聚1类丹参、狗脊、桃仁、红花,聚2类茯苓、陈皮、山药、薏苡仁,聚3类蒲公英、白花蛇舌草、豨莶草、威灵仙、泽泻,聚4类知母、黄柏、熟地黄、枸杞子,聚5类桑寄生、牛膝、伸筋草、黄芩,聚6类杜仲、独活,聚7类鸡血藤.结论:骨关节炎活动期患者实验室指标及血小板参数处于异常活跃状态,中药治疗可以改善患者实验室指标,减轻免疫炎症反应,其中尤以健脾化湿、清热通络中药为主.
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曼陀罗和毛曼陀罗花的佳采收期评价
目的 探索评价曼陀罗和毛曼陀罗花的佳采收期的方法.方法 将两种曼陀罗花的生长发育过程进行量化,与Logistic生长曲线方程拟合,建立数学模型,运用有序聚类分析法将其生长过程划分不同采收期,以活性成分为指标,对两者佳采收期进行界定.结果 两种曼陀罗花的生长过程与Logisitic生长曲线方程拟合良好,有序聚类分析后将其花的生长发育过程划分为5个阶段,依此确定的佳采收期与以往研究中药材佳采收期方法不同.结论 该研究中药材佳采收期的方法值得进一步研究并推广.
关键词： 曼陀罗 毛曼陀罗 最佳采收期 Logisitic生长曲线 聚类分析 -
橘叶UPLC指纹图谱和化学模式识别研究
目的 建立橘叶UPLC指纹图谱,对不同产地药材进行质量评价,为科学评价各批次橘叶质量提供依据.方法 采用Acquty UPLC BEHC18(100 mm×2.1 mm,1.7μm)色谱柱,以0.2％甲酸水溶液-甲醇为流动相进行梯度洗脱,体积流量为0.3 mL/min,柱温为26℃,检测波长为330 nm.结合聚类分析和主成分分析对20批不同产地橘叶药材的整体质量进行评价.结果 建立20批橘叶的UPLC对照指纹图谱,标定27个共有峰,聚类分析分成4类,利用主成分分析进行验证且确定6个决定峰.结论 结合化学计量学和UPLC指纹图谱为建立全面有效的橘叶药材质量控制模式提供参考.
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不同产地土贝母中皂苷类成分的HPLC特征图谱及3种主要皂苷的含量测定
目的 建立不同产地土贝母药材中皂苷类成分的特征图谱,并测定其中3种主要皂苷的含量,为该药材质量控制提供参考依据.方法 采用Thermo Hypersil GOLD aQ C18色谱柱(250 mm×4.6 mm,5 μm),乙腈-水为流动相进行梯度洗脱,体积流量1.0 mL/min,进样量10 μL,柱温30℃,检测波长214nm,建立15批土贝母HPLC特征图谱,并进行相似度评价、主成分分析及聚类分析;采用Diamonsil C18色谱柱(250 mm×4.6 mm,5μm),以乙腈-水为流动相进行等度洗脱测定药材中3种皂苷类成分的含量.结果 建立的15批土贝母特征图谱共标定6个共有峰,相似度为0.845～0.98;主成分分析及聚类分析均将15批药材分为两类,与相似度评价结果一致;得到影响药材质量的3个皂苷成分(土贝母苷甲、乙、丙)并对其进行了含量测定,结果15批药材都符合药典含量限度的要求.结论 本研究所建立的HPLC特征图谱结合含量测定以及相似度评价,主成分分析,聚类分析等评价方法,可以全面、准确和有效地用于土贝母药材的质量评价.
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烧伤患者铜绿假单胞菌获得性耐药基因和菌株亲缘性研究
目的 调查分离白烧伤患者的40株铜绿假单胞菌获得性耐药基因和菌株间的亲缘性. 方法 选择笔者单位烧伤科2014年1月-2015年12月自烧伤患者分离出的40株铜绿假单胞菌,每年20株.采用K-B纸片扩散法检测分离出的菌株对头孢噻肟、头孢他啶、头孢吡肟、亚胺培南、美罗培南、庆大霉素、阿米卡星、环丙沙星、左氧氟沙星等9种抗菌药物的敏感性.采用PCR法检测9种β内酰胺类抗菌药物获得性耐药基因、外膜孔蛋白oprD2基因、12种氨基糖苷类抗菌药物获得性耐药基因、6种消毒剂获得性耐药基因与可移动遗传元件遗传标记基因,选取阳性表达基因进行DNA测序及比对.对40株铜绿假单胞菌的28种获得性耐药基因序列进行非加权组平均法聚类分析. 结果 40株铜绿假单胞菌对上述9种抗菌药物均耐药.40株铜绿假单胞菌共检出blaTEM、blaCARB2种β内酰胺类抗菌药物获得性耐药基因,aac (6')-Ⅰb、aac(6')-Ⅱ、ant(2")-Ⅰ、ant(3")-Ⅰ、rmtB 5种氨基糖苷类抗菌药物获得性耐药基因,qacE△1-sul1、merA、intⅠ13种消毒剂获得性耐药基因及可移动遗传元件遗传标记基因,并均存在外膜孔蛋白oprD2基因缺失.40株铜绿假单胞菌聚集特征明显,共有7种基因模式和3个克隆株.2～4、6～9、11、14、17 ～39号菌株携带的耐药基因序列相似,亲缘性高;12、13号菌株携带的耐药基因序列相似,亲缘性高;10、16号菌株携带的耐药基因序列相似,亲缘性高. 结论 blaTEM、bla CARB、aac(6')-Ⅰb、aac(6')-Ⅱ、ant(2")-Ⅰ、rmtB、qacE△1-sul1、merA、intⅠ1在烧伤患者铜绿假单胞菌菌株中流行且均存在oprD2基因缺失,可能是导致铜绿假单胞菌对β内酰胺类、氨基糖苷类、喹诺酮类抗菌药物均耐药的重要原因,耐药表型与基因型相符率高.烧伤患者检出铜绿假单胞菌耐药基因相似,菌株间亲缘性高.
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基于ICP-MS对不同产地小根蒜无机元素的主成分分析和聚类分析
目的:研究小根蒜中无机元素的含量及其分布特征,为中药材薤白的品质评价和质量控制提供实验依据.方法:采用电感耦合等离子体质谱( ICP - MS)法,对10个小根蒜样品中14个无机元素的含量进行全定量分析,从元素组学的角度建立其无机元素特征谱,并采用SPSS聚类分析和主成分分析对其特征元素进行评价.结果:主成分分析选出6个主因子,得出小根蒜的特征元素为Cu、Zn、Fe、Mn、Ni、Cr、Se;聚类分析将10个小根蒜样品聚为2大类,不同产地小根蒜体内无机元素的含量与气温、地理位置等生态环境存在着一定的相关性.结论:全定量分析法可用于小根蒜无机元素的含量测定;主成分分析法和聚类分析法是小根蒜无机元素含量分析的有效方法.
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不同地理居群大蒜药材高效薄层色谱指纹图谱研究
目的:建立大蒜药材高效薄层色谱指纹图谱,并对不同地理居群大蒜药材的指纹图谱进行比较分析.方法:采用高效薄层硅胶G板,以正丁醇-正丙醇-冰醋酸-水(3∶1∶1∶1)为展开剂,以0.2％茚三酮溶液显色后,在日光灯下检视并照相,并在500 nm处对各轨道扫描吸收光谱后获得薄层色谱指纹图谱,经指纹图谱系统解决方案软件生成共有模式,进行相似度分析.结果:筛选和优化了高效薄层色谱条件,斑点清晰,分离度好;相似度分析表明,不同地理居群的大蒜药材在药用活性成分相对含量上有不同程度的差异,大致可分为5类.结论:建立的高效薄层色谱指纹图谱,为大蒜药材指纹图谱的研究奠定了方法学基础,可以作为不同来源大蒜药材质量控制的重要依据.
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模式识别技术在不同来源甘草药材分类中的应用
目的:建立不同来源甘草药材的模式识别分类方法.方法:通过HPLC快速获得19个不同来源甘草药材样品的色谱指纹图谱,色谱条件固定相为Kromasil KR100-5 C18(150 mm×4.6 mm),流动相为乙腈-0.05%三氟乙酸溶液,梯度洗脱为乙腈20%(0 min)→40%(5 min)→50%(10 min),流速为0.8 mL·min-1,检测波长为254 nm,从每个色谱指纹图中提取出325个特征变量,采用聚类分析对甘草药材样品进行相似性评价,并应用PLS方法建立起不同植物种、不同种植方式甘草的2个分类回归模型.结果:采用分类模型对不同植物种、不同种植方式甘草进行判别,2个分类回归模型的分类准确率均为100%.结论:此方法可用于不同来源甘草药材的分类研究,本文以HPLC指纹图谱结合化学计量学知识,为不同中药样品的质量评价提供了一种分类方法.
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延胡索药材HPLC指纹图谱的化学模式识别研究
目的:以21种不同产地的延胡索中药色谱指纹图谱为基础,采用化学计量学方法对其进行化学模式识别,并对不同的化学模式识别方法进行比较.方法:将指纹图谱信息进行预处理,经过峰对齐及标准化后,用MATLAB数据处理软件进行模式识别分析.结果:对21种样品进行了分类和鉴别,采用此方法所得结果与实际相符合.结论:本文方法结果可靠,可用于不同产地的中药延胡索的分类和鉴别.
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独活的HPLC指纹图谱及4个香豆素类成分的测定
目的:建立独活HPLC指纹图谱并测定独活中二氢欧山芹醇、蛇床子素、异欧前胡素、二氢欧山芹醇当归酸酯的含量,为独活的质量控制提供参考.方法:采用SWELL ChromplusTM C18色谱柱(250 mm×4.6 mm,5μm),以乙腈(A)-0.2％醋酸水溶液(B)为流动相,梯度洗脱(0～5 min,15％→20％A;5～20 min,20％→27％A;20～45 min,27％A;45～55 min,27％→30％A;55～56 min,30％→41％A;56～60min,41％A;60～70 min,41％→50％A;70～90 min,50％→55％A;90～95 min,55％→15％A;95～100 min,15％A),流速1.0 mL·min-1,检测波长325 nm,柱温25℃.采用“中药色谱指纹图谱相似度评价系统”建立指纹图谱并进行相似度评价,利用SPSS 20.0软件进行聚类分析.对二氢欧山芹醇、蛇床子素、异欧前胡素和二氢欧山芹醇当归酸酯的含量测定进行方法学考察.结果:建立了独活的指纹图谱,标定了21个共有峰,18批独活药材与对照图谱的相似度均≥0.85,聚类分析将其分为3类.二氢欧山芹醇、蛇床子素、异欧前胡素和二氢欧山芹醇当归酸酯线性范围分别为2.250～36.000、34.500～552.000、1.375～22.000和9.375～150.000 μg·mL-1,线性关系良好(r≥0.999 7);重复性试验RSD＜2％,平均加样回收率在94.1％～100.6％之间.18批样品中二氢欧山芹醇、蛇床子素、异欧前胡素和二氢欧山芹醇当归酸酯的含量分别为0.009 3％～0.110 1％,0.498 9％～1.664 1％,0.007 1％～0.045 0％和0.065 4％～0.569 0％.结论:独活指纹图谱专属性强,结合4个香豆素类成分的含量测定可较全面控制独活的质量.
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HPLC-CAD法测定白茅根中果糖、葡萄糖和蔗糖的含量
目的:建立高效液相色谱串联电喷雾检测器(HPLC-CAD)同时测定30批白茅根样品中果糖、葡萄糖和蔗糖的方法,并对不同来源白茅根所测糖类成分的含量进行比较,为其质量标准提高提供依据.方法:采用Xbridge Amide色谱柱(4.6 mm×250 mm,3.5 μm),以乙腈-0.2％三乙胺水(75∶25)为流动相,流速1 mL· min-1,柱温30℃.结果:在建立的液相色谱条件下,上述3个糖类成分分离完全,果糖、葡萄糖、蔗糖进样量分别在2.125～12.749、2.017～12.101、5.274～31.646μg范围内线性良好;精密度、重复性、稳定性及回收率实验结果均符合含量测定要求,果糖、葡萄糖和蔗糖进样量的平均回收率(n=6)分别为99.8％、99.8％、100.7％.30批白茅根样品中果糖、葡萄糖和蔗糖的含量分别为2.019～63.319、2.835～64.797、1.289～175.816mg·g-1.以3个糖为指标,经过系统聚类分析,性状有问题的样本被聚成一类,该类样品中3个糖的含量均比较低,果糖小于17.500 mg· g-1,葡萄糖低于12.800 mg·g-1,蔗糖多小于51.900 mg·g-1;符合《中华人民共和国药典》规定的样本为一类,此类样品中3种糖含量较高,果糖与葡萄糖的含量大于性状有问题的样本.结论:该方法适用于白茅根中果糖、葡萄糖和蔗糖的含量测定,3个糖的测定对白茅根具有一定的鉴别意义.
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顶空固相微萃取-气相色谱质谱联用分析比较鲜/干高良姜挥发性成分
目的:比较鲜品和干品高良姜挥发性成分的异同,为其质量评价提供依据.方法:顶空固相微萃取(HS-SPME)结合气相色谱联用质谱法(GC-MS法)分析不同高良姜样品的挥发性成分.具体条件:SPME萃取头于样品瓶中80℃平衡10 min,再吸附20 min,250℃解吸5 min进样;GC分离采用HP-5MS毛细管柱(30 m×0.25 mm×0.25μm),载气为He气,柱流量1.0 mL·min-1,柱温为程序升温(初始温度60℃,以4 ℃·min-1的速率程序升温至116℃,保持20 min,以5℃·min-1的速率程序升温至160℃,以20℃·min-1速率提升至280℃,保持2 min);质谱检测为EI离子源,电子能量70 eV,四极杆温度150℃,接口温度250℃,质量范围为m/z 50～500.结果:依据MS数据库及文献检索,共鉴定出主要化合物30个,主要为烯、醇类成分,其中桉油精、α-松油醇、石竹烯、α-香柑油烯及α-金合欢烯含量较高.新鲜和干燥高良姜挥发性成分的种类差异不大,但含量差异较为明显.干品高良姜中依然含有较高含量的桉油精,与高良姜干品浓烈的辛香味有关.结论:本法能够快速比较鲜/干高良姜中挥发性成分,为高良姜挥发性成分质控指标选择提供依据.
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HPLC法同时测定钩吻茎中胡蔓藤碱丙等6个生物碱的含量
目的:建立HPLC法同时测定钩吻茎中胡蔓藤碱丙、钩吻素甲、钩吻素子、钩吻素己、钩吻绿碱和胡蔓藤碱乙的含量,并比较评价各产地钩吻生物碱含量的差异.方法:采用外标法进行测定,色谱柱为ZORBAXBonus-RP Analytical(4.6 mm×250 mm,5μm),流动相为甲醇-0.1％甲酸水梯度洗脱,流速1.0 mL· min-1,检测波长254 nm,柱温30℃.分别测定32批钩吻茎,并进行聚类分析.结果:胡蔓藤碱丙、钩吻素甲、钩吻素子、钩吻素己、钩吻绿碱、胡蔓藤碱乙6个成分的线性范围分别为1.00～50.06μg·mL-1(仁1.000 0)、1.13～50.85 μg· mL-1(r=0.999 8)、1.16～52.20 μg· mL-1(r=1.000 0)、1.16～52.20 μg· mL-1(r=0.999 7)、1.06～50.88 μg· mL-1(r=0.999 7)和1.01～50.50 g· mL-1(r=1.000 0),平均加样回收率为93.1％～103.8％(RSD为2.0％～2.9％).不同产地样品中钩吻茎中胡蔓藤碱丙、钩吻素甲、钩吻素子、钩吻素已、钩吻绿碱和胡蔓藤碱乙含量范围分别为0.136～2.202、0.564～2.686、0.718～3.553、0.160～2.025、0.151～3.493、0.288～4.700mg·g-1.结果显示不同产地的钩吻6个成分含量均有差异,32批不同产地钩吻药材可聚为6大类.结论:该法可为钩吻多指标成分的质量评价提供参考.不同产地钩吻的各个化学成分的含量呈现明显分类特点,为钩吻地区鉴定提供依据.
