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人白细胞抗原(HLA)-DRB1 *0901、1501和HLA-DQB1 *0301、0602与新疆哈萨克族食管鳞状细胞癌相关性
目的 从基因水平探讨新疆哈萨克族食管鳞状细胞癌HLA-DRB1和DQB1等位基因的遗传易感性,为寻找哈萨克族食管鳞状细胞癌的易感基因提供线索.方法 运用序列特异性引物聚合酶链反应(PCR-SSP)技术,检测新疆哈萨克族食管鳞状细胞癌200例、正常食管黏膜177例HLA-DRB1 *0901、1501和DQB1 *0301、0602等位基因的分布.结果 新疆哈萨克族食管鳞状细胞癌患者HLA-DRB1 *1501、DQB1 *0301和DQB1 *0602基因分布频率(0.455,0.760和0.690)明显高于177例正常食管黏膜上述等位基因分布频率(0.232,0.520,0.554),差异具有统计学意义(OR=2.78,2.93,1.80;P值均<0.05);新疆哈萨克族食管鳞状细胞癌HLA-DRB1 *0901等位基因分布频率(0.105)与哈萨克族正常食管黏膜(0.102)对比,差异无统计学意义(OR=11036,P>0.05);HLA-DQB1 *0602等位基因的分布频率在哈萨克族中低分化鳞状细胞癌组中的分布频率(0.742)高于高分化鳞状细胞癌组(0.597),差异具有统计学意义(P<0.05).结论 HLA-DRB1 *1501、DQB1 *0301和DQB1 *0602可能是哈萨克族食管鳞状细胞癌的易感基因,HLA-DQB1 *0602与哈萨克族食管鳞状细胞癌的分化程度有关.
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PLCE1基因rs2274223和rs3765524位点多态性与新疆哈萨克族人群食管癌的易感性
目的 探讨中国新疆地区哈萨克族人群PLCE1基因rs2274223和rs3765524位点单核苷酸多态性与食管癌遗传易感性的关系.方法 采用病例-对照研究的方法,选择牧区哈萨克族食管癌患者(病例组)200例和正常者(对照组)300名,运用基质辅助激光解析电离时间飞行质谱(MALDI-TOF MS)的方法检测PLCE1基因rs2274223位点和rs3765524位点的单核苷酸多态性,应用非条件Logistic分析方法计算优势比(OR)及其95％可信区间(CI),评估不同基因型与食管癌发病风险及临床病理特征的关系.结果 rs2274223和rs3765524位点基因型的分布均符合Hardy-Weinberg平衡;rs2274223位点基因型及等位基因型在新疆哈萨克族食管癌病例组中的分布与对照组比较差异有统计学意义(P=0.006,P=0.003);Logistic回归分析表明,携带突变纯合型GG或只要携带突变位点G的个体(AG/GG)即可增加食管癌的罹患风险(GG比AA:OR =3.17,95％ CI=1.45 ～6.93;AG/GG比AA:OR=1.55,95％ CI=1.08 ～2.22);同时,凡是携带有rs2274223位点突变位点的个体罹患低分化食管癌(OR=2.48,95％ CI=1.10 ～5.60)且临床分期Ⅲ/Ⅳ期(OR=1.85,95％ CI=1.05 ～ 3.25)的风险大大增加.然而rs3765524位点基因型及等位基因在新疆哈萨克族食管癌病例组中的分布与对照组差异无统计学意义,且其与临床病理特征均未见相关性.结论携带PLCE1基因rs2274223位点可增加哈萨克族低分化食管癌的患病风险,且可以增加TNMⅢ/Ⅳ期食管癌的风险.
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Vav3基因位点多态性与中国汉族人群前列腺癌发病风险的关联性
目的：筛查及分析Vav3基因位点多态性与前列腺癌发生、发展的相关性及其临床意义。方法收集并建立2008至2012年间1015例前列腺癌患者及1068例无瘤健康对照，通过NCBI dbSNP （ http：／／www.ncbi.nlm.nih.gov／projects／SNP ）以及 SNPinfo （ http：／／snpinfo.niehs.nih.gov／snpfunc.htm）数据库，分析并筛选Vav3单核苷酸多态位点，运用Logistic回归分析所选位点与前列腺癌发病的相关性，并进行位点多态性与前列腺癌不同临床病理参数、生化复发相关性分析。结果Vav3 rs12410676 G＞A与前列腺癌的发生呈负相关[相加模型OR＝0.80（0.69～0.93）， P＝0.003；显性模型OR＝0.81（0.68～0.97）， P＝0.022；隐性模型OR＝0.54（0.36～0.82）， P＝0.004]。同时Vav3 rs8676 G＞A与rs12410676 G＞A的联合效应与前列腺癌的发生存在负相关，随着变异位点数量的增加患前列腺癌的风险越小（ P＜0.05）。在分层分析中，相对于Vav3 rs12410676 GG组，携带AA／AG的人群在体质量指数≤25 kg／m2组，或吸烟组，或Gleason 评分≥7分（4＋3），或高侵袭性前列腺癌中都具有保护作用。运用假阳性报告概率法对获得的结果进行了假阳性分析，结果发现在不同的先验概率（0.25，0.1，0.01）的情况下，上述结果具备不同的统计学效能。结论 Vav3基因位点多态性与中国前列腺癌的发生具有一定的相关性，但相关效应较低，尚需在大样本量、多中心、不同种族的前列腺癌研究中加以验证。
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mTORC1基因多态性位点与中国新疆散发性结直肠癌发病风险的关联性
目的 筛查及分析PI3K/AKT/mTOR信号转导通路中mTORC1基因多态性位点与结直肠癌发病风险的相关性及其临床意义.方法 收集2000年至2013年间新疆医科大学第一附属医院665例原发性结直肠癌患者和 695 名健康对照,通过病例-对照研究,运用 Logistic 回归分析mTORC1相关基因中 10 个多态位点( mTOR: rs1034528, rs2295080; Raptor: rs1062935, rs3751934;mLST8:rs3160,rs26865;DEPTOR:rs2271900,rs4871827;AKT1S1:rs2290774,rs2353005)与结直肠癌易感性的关系.结果 mTORC1相关基因与结直肠癌发病风险相关,并与人群的年龄、性别、吸烟状态及体重指数相关.其中,mLST8 rs26865 AA基因型在≤68 岁(OR＝0.64,95%CI＝0.43～0.96,P＝0.031)、女性(OR＝0.61,95%CI＝0.38～0.99,P＝0.046)、无吸烟人群(OR＝0.55,95%CI＝0.35～0.87,P＝0.010)中均能降低结直肠癌的发病风险;mTOR rs1034528 CC基因型在＞68岁的人群中提高了结直肠癌的发病风险(OR＝3.34,95%CI＝1.12～9.91,P＝0.030)、Raptor rs3751934 CA/AA基因型在体重指数＞25 kg/m2的人群中能降低结直肠癌的发病风险(OR＝0.68,95%CI＝0.47～0.98,P＝0.038)、AKT1S1 rs2290774 CC基因型在不吸烟的人群中能降低结直肠癌的发病风险( OR＝0.67, 95%CI＝0.45～0.99,P＝0.048). mTORC1低风险基因型叠加与结直肠癌发病风险相关性分析结果显示,同时携带两个以上低风险基因型的人群要比没有或只携带1个低风险基因型的人群患结直肠癌的风险要低(OR＝0.74,95%CI＝0.58～0.95,P＝0.017),这在≤68岁、男性、体重指数＞25 kg/m2及不吸烟人群中尤其明显. mLST8 rs26865基因型与mLST8及下游蛋白4EBP1和p70S6K的表达无相关性.结论 mTORC1相关基因多态位点与中国新疆散发性结直肠癌的发生具有一定的相关性,但相关效应较低,尚需在大样本量的、多中心、不同种族的结直肠癌研究中加以验证.
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MicroRNA靶位点单核苷酸多态性在肿瘤中的研究进展
miRNA（microRNA）是一类长度约19～23个核苷酸的内源性非编码小分子RNA。通过与靶mRNA 3'端非编码区的碱基配对，引起靶mRNA降解或翻译抑制来调控基因表达。研究表明miRNA靶基因位点单核苷酸多态性可能会通过影响miRNA与靶基因mRNA配对的有效性及结合数量，使其丧失原有的调控功能，改变相关基因表达，进而影响肿瘤的易感性、进展及预后。
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ARTS1多态性与广东汉族人群类风湿关节炎相关性的初步研究
目的 探讨肿瘤坏死因子受体1(tumor necrosis factor receptor 1,TNFR1)脱落调节氨肽酶1(aminopeptidase regulator of TNFR1 shedding 1,ARTS1)基因多态性与广东汉族人群类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)遗传易感性的关系.方法 采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism,PCR-RFLP)的方法 检测广东汉族人群RA患者(RA组)和健康志愿者(对照组)ARTS1基因6个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点的等位基因以及基因型频率,分析6个多态性位点与RA遗传易感性的关系.采用多重线性回归分析6个SNP与RA的临床指标(包括年龄、性别、发病年龄、肿胀关节数目、压痛关节数目、红细胞沉降率、C反应蛋白、晨僵时间、类风湿因子和抗环瓜氨酸肽抗体)的相关性.结果 110例RA患者中,携带ARTS1 rs26653 GG基因型频率(26%)和G等位基因频率(52%)显著高于正常对照组(319例)GG基因型频率(18%)和G等位基因频率(48%),差异有统计学意义(P<0.05,OR=2.332,95% CI 1.244～4.371).ARTS1 rs26618、rs27434、rs27640、rs27529、rs27044 5个位点基因型以及等位基因频率与对照组比较差异无统计学意义(P>0.05).使用多重线性回归分析,6个SNP位点中rs26653与RA患者肿胀关节数目呈显著正相关(r=0.477,P<0.05),其余5个SNP与肿胀关节数目无显著相关性.6个SNP位点与其余临床指标(年龄、性别、发病年龄、压痛关节数目、红细胞沉降率、C反应蛋白、晨僵时间、类风湿因子和抗环瓜氨酸肽抗体)无显著相关性.结论 广东地区汉族人群中,与ARTS1 rs26653 CC基因型相比,携带rs26653 GG基因型可增加RA的发病风险.
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保定市中老年人群载脂蛋白E基因多态性与脑梗死遗传易感性关系的研究
目的 检测并分析保定市中老年人群中载脂蛋白E(apoE)基因多态性,探讨apoE基因多态性与脑梗死遗传易感性的关系.方法 采用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术,分析92例脑梗死患者和86例健康对照者apoE的3种等位基因ε2、ε3、ε4,做基因频率和基因型多态性分析.结果 健康人群组apoE基因呈多态性,有6种基因型,即3种纯合子(ε2/2、ε3/3、ε4/4)和3种杂合子(ε2/3、ε3/4、ε2/4).健康人群组apoE 3种等位基因的基因频率分别为:ε2 5.8%、ε3 87.2%、ε4 7.0%;apoE基因型频率数为ε2/2 0、ε3/3 75.5%、ε4/4 1.2%、ε2/3 10.5%、ε2/4 2.3%、ε3/4 10.5%.脑梗死组apoE等位基因频率:ε2 4.3%、ε3 69.6%、ε4 26.1%;基因型频数:ε2/2 3%、ε3/3 42.3%、ε4/4 10.8%、ε2/3 11.9%、ε2/4 2%、ε3/4 30%.与健康人群组比较,脑梗死组ε3/3基因型频率较健康组明显降低,差异有统计学意义(P<0.05),ε4/4、ε3/4基因型频率较健康组明显升高,差异有统计学意义(P<0.05),ε2/2、ε2/3、ε2/4基因型频率较健康组差异无统计学意义(P>0.05).与健康组比较,脑梗死组ε3等位基因频率明显降低,差异有统计学意义(P<0.05),ε4等位基因频率明显升高,差异有统计学意义(P<0.05),ε2等位基因频率较健康组差异无统计学意义(P>0.05).结论 保定市健康人群组apoE ε3基因出现率高,ε2和ε4频率较低,以ε3/3基因型多,而ε2/2、ε4/4相对较少,脑梗死患者中ε3/3、ε2/3基因型频率较低,ε3对脑梗死可能具有保护作用.ε4等位基因频率在脑梗死患者中增高,ε4可能是脑梗死的易感因素和风险因素.
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中国广东地区汉族人群HLA-B基因多态性与IgA肾病易感性关联研究
目的 研究人类白细胞相关抗原(HLA)Ⅰ类B亚型基因多态性与我国广东地区汉族人群IgA肾病易感性的相关性.方法 使用基因克隆及聚合酶链反应.测序分型方法(PCR-SBT)对中国广东地区145例IgA肾病患者(IgA肾病组)和137例健康人(对照组)进行HLA-B基因多态性研究,并比较两组的基因型和等位基因的频率,分析HLA-B基因多态性与IgA肾病的相关性.结果 (1)IgA肾病组和健康对照组共检测到103种HLA-B等位基因,其中以HLA-B*400101、HLAB*4601、HLA-B*1502、HLA-B*1301、HLA-B*5801等位基因频率较高,符合中国广州地区汉族HLA-B等位基因分布特征.(2)HLA-B*5601在IgA肾病组的基因频率明显高于健康对照组(P<0.05),可能与IgA肾病发病相关.结论 HLA-B基因多态性可能与我国南方汉族人群IgA肾病的发病相关,HLA-B*5601可能是IgA肾病的易感基因.
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新疆阿克苏地区维族人1p13.3 rs12740374、rs646776和rs599839与心肌梗死的关系
目的 探讨1p13.3 rs12740374,rs646776和rs599839单核苷酸多态性与心肌梗死发生及患者血脂水平的关系.方法 本研究属于病例对照研究.选取新疆阿克苏地区维族心肌梗死患者150例和健康维族人123名,通过高温连接酶检测法(PCR-LDR)检测rs12740374,rs646776和rs599839位点基因型.同时,检测病例组样本血脂水平,分析其与患者基因型的关联.采用x2检验及Fisher确切概率法分析.结果 病例与对照组间rs12740374 (x2=5.65,P＜0.05)、rs646776(x2=4.88,P ＜0.05)和rs599839(x2=5.1,P＜0.05)的等位基因频率差异均有统计学意义,在显性突变模式下rs12740374 GG与GT+ TF(x2 =5.01,P ＜0.05),rs646776AA与AG+ GG(x2 =4.50,P＜0.05)和rs599839AA与AG+ GG(x2 =4.00,P＜0.05)基因型频率差异均有统计学意义,采用Logistic回归矫正性别及血脂等因素后差异仍有统计学意义(P＜0.05),携带rs599839位点不同基因型的患者总胆固醇水平间差异有统计学意义(x2=6.25,P＜0.05).结论 rs12740374,rs646776和rs599839位点可能与维族人群心肌梗死发病有关,rs599839位点基因型可能与总胆固醇水平有关.
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父母来源验证对全基因芯片扫描结果临床致病性判定的影响研究
目的通过经全基因芯片扫描分析(CMA)诊断的46例患儿总计携带54个不同临床意义的拷贝数变异(CNV)进行父母来源验证,旨在研究验证结果对不同全基因芯片扫描临床致病性判定的影响.方法回顾性研究.收集2014年8月至2015年12月就诊于新华医院儿童内分泌及遗传科门诊的患儿共46例,经全基因芯片扫描分析产生54个CNV,使用CMA或荧光定量PCR的方法对其进行父母来源验证.结果46例全基因芯片扫描患者总计携带54个拷贝数变异.其中17个为致病性变异,经父母验证后有14个是新发突变,3个遗传自母亲,其中1个是1q21.1缺失综合征,另2个来自母亲的X染色体,分别为Xq27.3q28重复和Xq22.1q22.3重复.1q21.1缺失综合征大多遗传自父母,X染色体上的重复可能因为失活机制而不在母亲身上显现出表型.17个临床判定为致病性的CNV,经过父母验证后仍判定为临床致病性变异.10个临床意义不确定-倾向可能致病的CNV,经验证后3个是新发突变,认为是可能致病性变异,7个分别遗传自父母,判定为临床未知致病性;27个临床意义不确定的变异,经验证后仅1个是新发突变,认为是可能致病性,其他均有父母来源,判定为倾向良性变异.结论对于临床报告为CNV可能致病性应该验证父母来源以进一步研究其致病性,对于临床未知意义的CNV经过父母验证可以初步明确其性质.
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高分辨熔解曲线技术检测血液 BRCA1／2基因突变在乳腺癌高危人群中的应用
目的：通过高分辨熔解曲线技术（ HRM）分析乳腺癌患者及高危人群BRCA1／2基因的突变特征，探讨HRM技术在乳腺癌高危人群中BRCA1／2基因突变检测的应用价值。方法采用临床对照研究方法，收集2015年3月至2016年6月间在安徽省肿瘤医院和亳州市人民医院就诊的乳腺癌患者及其一级亲属（高危人群）各52例，无乳腺癌家族史的健康人40名，年龄性别无统计学差异，通过外周静脉血提取基因组DNA，应用HRM法检测血液中乳腺癌易感基因BRCA1／2突变情况，并对突变阳性结果进行DNA测序验证；采用logistic回归方法分析BRCA1／2基因突变与易感因素之间的相关性。结果52例乳腺癌患者发现9例BRCA1／2基因突变，突变率为17．3％，52例乳腺癌高危人群中发现5例BRCA1／2基因突变，突变率为9．6％，在40名健康人群中发现1例BRCA1／2基因突变。采用HRM法检测的9例BRCA1／2基因突变阳性结果与基因测序结果全部相符。 BRCA1／2基因突变与初产年龄、慢性乳腺疾病的易感因素有一定的相关性。9例BRCA1／2基因突变阳性的乳腺癌患者一级亲属中发现有5例BRCA1／2基因突变，一致性达到44．4％（4／9）。结论 BRCA1／2基因突变阳性的乳腺癌患者一级直系亲属存在较高的BRCA1／2突变率，因此HRM技术可用于乳腺癌高危人群的健康筛查和风险评估。（中华检验医学杂志，2017，40：105－108）
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应用二代测序技术检测乳腺癌易感基因BRCA1/2和TP53及PTEN胚系突变
目的 研究乳腺癌易感基因BRCA1、BRCA2、TP53、PTEN在中国乳腺癌患者中发生胚系突变的情况.方法 本研究为探索性研究,选择2016年1月至2018年8月就诊于北京大学人民医院乳腺外科的女性乳腺癌患者128例.其中散发乳腺癌患者44例,具有遗传性乳腺癌高危因素的乳腺癌患者84例.应用二代测序技术对患者进行BRCA1、BRCA2、TP53及PTEN 4个基因的胚系突变情况进行检测.χ2检验分析4种基因突变携带率在散发病例及具有遗传性高危因素的乳腺癌患者之间的分布.按照患者临床特点(有无家族史、是否为三阴型乳腺癌、年龄及是否为双侧乳腺癌)进行分组,其中有明确乳腺癌家族史42例,三阴型乳腺癌34例,早发性乳腺癌33例,双侧乳腺癌7例,Fisher确切概率检验比较BRCA1/2基因致病突变与遗传性高危因素乳腺癌患者临床特征之间的关系.结果 128例乳腺癌患者中,检测到BRCA1/2胚系突变30例,其中致病突变13例,3例新发突变,BRCA1:c.4760C>G、BRCA2:c.44134414del和BRCA2:c.64826485del可能为中国人群特有突变.TP53突变3例,其中1例致病突变.3例突变均为早发乳腺癌.5例PTEN突变,其中3例致病突变.在84例具有遗传性高危因素的乳腺癌患者中4种易感基因突变的患者携带率40.5％(34/84),致病突变率15.4(13/84).44例散发病例中,携带突变率为9％(4/44).致病突变率为6.8％(3/44).乳腺癌易感基因在具有遗传性高风险因素的乳腺癌患者携带率更高,与散发病例人群差异存在统计学意义(P<0.001).BRCA1/2突变在具有遗传性高风险因素的乳腺癌患者各分组中差异均无统计学意义.结论 乳腺癌易感基因胚系突变检测在乳腺癌风险预测、预后评价等方面具有重要意义.
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杀伤细胞免疫球蛋白样受体及HLA-Cw基因多态性与强直性脊柱炎遗传易感性研究
目的 探讨杀伤细胞免疫球蛋白样受体(KIRs)2D基因及其配体HLA-Cw等位基因与强直性脊柱炎的遗传易感性是否相关.方法 以PCR-SSP基因分型技术检测105例强直性脊柱炎患者KIR2D基因(KIR2DL1、2DS1、2DL2、2DL3、2DS2)和HLA-Cw01～08等位基因,并将HLA-Cw01～08分成HLA-Cwlys和HLA-Cwan两组,分别计算KIR2D基因、HLA-Cw等位基因及活化性KIR/HLA-Cw组合基因型频率,并与51例骨关节炎患者和120名健康人群比较.结果 强直性脊柱炎组患者HLA-Cwlys基因频率为0.269 7,高于骨关节炎组患者的0.148 2(P=0.024)和健康对照者的0.138 8(P=0.001).强直性脊柱炎组患者KIR2DS1/HLA-Cwlys组合基因型阳性率为26.67%,明显高于骨关节炎组的11.76%(P=0.039)和健康对照组的13.33%(P=0.018).结论 HLA-Cwlys可能与强直性脊柱炎遗传易感性相关;当抑制性受体KIR2DL1的特异性配体HLA-Cwlys存在时,KIR2DS1基因携带者可能是强直性脊柱炎的高危人群.
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Janus激酶246/1单倍型与中国上海地区汉族PV和ET患者的相关性
目的 研究中国汉族人群中JAK2 46/1单倍型的tSNP rs12343867基因型与PV和ET患病易感性以及与JAK2 V617F突变的关系.方法 收集125例PV患者和87例ET患者及213名健康人全血DNA,用PCR结合高分辨熔解曲线法检测JAK2 rs12343867位点的基因型,并用简单随机抽样法从425份经熔解曲线法分析的标本中选取20份标本进行基因测序验证,x2分析PV和ET患者JAK2 46/1单倍型与MPNs患病风险的关系.结果 125例PV患者中C等位基因占62.8%,T等位基因占37.2%;87例ET患者C等位基因占45.4%,T等位基因占54.6%.20例随机选取的标本经基因测序法验证与高分辨熔解曲线法分析结果一致.JAK2 rs12343867 3种基因型分布差异有统计学意义(x2=78.69,P＜0.01).CC和CT基因型携带者均较TT型携带者发生MPNs的风险显著增加[比值比(OR)分别为18.56、3.60,95%可信限(CI)分别为8.70～39.58、2.28～5.69,P均＜0.01).PV组的等位基因频率在V617F阳性与阴性组之间的分布差异无统计学意义(x2=2.47,P=0.12);而在ET组中V617F阳性患者的等位基因C的检出率与V617F阴性组之间的分布差异有统计学意义(x2=7.75,P＜0.01).结论 JAK2 46/1单倍型是中国汉族PV和ET患者的易感基因.在ET患者中,个体携带的JAK2 46/1单倍型与后天获得JAK2 V617F突变相关.
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2型糖尿病相关线粒体ND1基因的荟萃分析
目的 利用荟萃分析评价线粒体ND1基因点突变与2型糖尿病发病的相关性.方法 通过文献检索收集1999年1月至2008年9月在中英文公共数据库检索或已经发表的线粒体ND1基因点突变与2型糖尿病相关的病例对照研究.按照本研究纳入和排除标准,筛选线粒体ND1基因G3316A、T3394C 2个点突变作为研究对象.应用STATA 9.0 SE软件对各研究进行综合分析.结果 在病例对照研究中,线粒体G3316A、T3394C相对危险度合并OR值和95%CI分别为:2.70(1.39～5.24)、3.44(1.41～8.40).结论 线粒体G3316A、T3394C点突变可能与中国人2型糖尿病遗传易感性相关.
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白细胞介素-22基因单核苷酸多态性与肺结核易感性的相关性研究
目的 探讨IL-22基因单核苷酸多态性(SNP)与肺结核易感性的关系.方法 选取2009年1月至2010年12月深圳市第三人民医院收治并确诊的肺结核患者479例为病例组,其中男212例,女267例；年龄18～ 69岁,平均(36±17)岁；对照组为同期在该医院体检者358名,其中男162名,女196名,年龄18～60岁,平均(34±13)岁.应用MassARRAY时间飞行质谱生物芯片技术,检测IL-22基因6个SNP位点(rs1182844、rs2227473、rs2227476、rs2227480、rs2227485和rs2227508)基因型,对SNP位点进行Hardy-Weiberg平衡检验,并计算各SNP位点等位基因频率及比值比.选取rs2227473不同基因型肺结核患者外周血单个核细胞(PBMC),使用抗人CD3和CD28抗体联合刺激后,采用ELISA法测定不同基因型患者细胞上清液中IL-22浓度.分别采用x2检验和t检验对两组SNP等位基因频率和IL-22浓度进行统计学分析.结果 病例组和对照组6个IL-22基因SNP位点的基因型分布均处于遗传平衡状态.其中rs2227473位点存在GG、GA和AA基因型,病例组仅有等位基因G频率(90.0％,862/958)显著高于对照组(85.6％,613/716),差异有统计学意义(x2=7.448,P ＜0.01,OR=1.509,95％CI-1.121～2.030).rs2227473位点GG基因型的PBMC培养上清液中IL-22浓度为(19 ±5) ng/L,显著低于AA/GA基因型的(39±6)ng/L,差异有统计学意义(t=2.686,P＜0.01).结论 IL22基因rs2227473多态性与肺结核易感性有显著相关性,其等位基因G是肺结核的易感基因.rs2227473多态性影响宿主PBMC的IL-22表达水平,在调节肺结核保护性免疫过程起重要作用.
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HLA-Cw基因多态性与肺结核易感性关系的初步研究
目的 分析人白细胞抗原(HLA) -Cw基因多态性与肺结核遗传易感性的关系,探究肺结核的易感基因和抵抗基因.方法 选取2010年5月至2011年5月山东省胸科医院确诊的继发性肺结核患者112例为肺结核组,其中男62例,女50例；年龄19 ～ 69岁,平均41.7岁；根据痰涂片抗酸染色结果分为涂阴组77例和涂阳组35例.对照组为同期在该院健康体检的110名,其中男59名,女51名；年龄21 ～ 67岁,平均38.3岁.提取基因组DNA,扩增HLA-Cw等位基因,进行Hardy-Weinberg吻合度检验,估算基因频率(％)=1 -(1-表型频率)1/2.两组间比较采用x2检验,检验水准α/8=0.00625,P＜0.00625为差异有统计学意义.结果 肺结核组HLA-Cw08等位基因的基因频率(43.6％,75/112)显著高于对照组(27.4％,52/110),差异有统计学意义(x2=8.790,P＜0.00625)；肺结核涂阳组HLA-Cw04等位基因的基因频率(20.7％,13/35)显著高于涂阴组(4.7％,7/77),HLA-Cw08等位基因的基因频率(22.5％,14/35)显著低于涂阴组(54.4％,61/77),差异均有统计学意义(x2值分别为12.909和16.732,均P＜0.00625).结论 HLA-Cw基因多态性与肺结核有一定相关性,HLA-Cw08可能是肺结核的易感基因,HLA-Cw04和08等位基因可能与MTB的感染状态和结局有关.
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DNA修复基因XRCC3多态性与肺癌易感性的关系
目的 研究DNA修复基因XRCC3多态性与肺癌易感性的关系.方法 采用病例-对照研究,于2006年9月至2007年1月收集上海肺科医院原发性肺癌患者291例及同期住院的非肿瘤患者273例,应用Taqman探针结合实时荧光PCR方法分析病例组和对照组XRCC3基因Thr241Met的多态性分布,比较不同基因型与肺癌易感性的关系以及基因多态性与吸烟对肺癌的交互作用.对照组与病例组的比较用x2检验,以调整比值比及95%可信区间表示相对危险度,所有统计检验均为双侧概率检验,所有资料均用SPSS软件进行统计.结果 与携带XRCC3密码子241野生纯合基因型(Thr/Thr)且不吸烟者相比,携带同样基因型且吸烟者患肺癌的风险会增加,其调整比值比(OR值)为2.47[95%可信区间(CI)为1.49～4.08,P＜0.01];携带有杂合基因型(Thr/Met)且吸烟者患肺癌的风险也会增加,其调整OR值为2.28(95%CI为1.21～6.60,P=0.017).野生纯合基因型(Thr/Thr)且吸烟量少于30包年可能对肺腺癌有较弱的保护作用(OR=0.49,95%CI为0.26～0.93,P=0.03).携带有XRCC3密码子241Met等位基因且吸烟者患肺鳞癌的风险明显增加(调整OR=9.69,95%CI为3.27～28.72,P＜0.01).携带241Met等位基因且吸烟剂量＜30包年和≥30包年的患者患肺鳞癌的风险也不同,OR值分别为8.00(95%CI为1.97～32.52,P＜0.01)和11.67(95%CI为2.98～45.73,P＜0.01).结论 DNA修复基因XRCC3多态性可能对肺癌易感性产生影响,并可能与吸烟有一定的协同作用.
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转化生长因子β1-509C/T基因多态性与冠心病遗传易感的相关性分析
目的 探讨中国汉族人群转化生长因子(TGF)-β1-509C/T基因多态性与冠心病遗传易感的关系.方法 选择冠心病患者340例为冠心病组,非冠心病患者271例为对照组,利用聚合酶链反应连接酶检测反应分析技术对TGF-β1-509C/T(rs1800469)多态位点进行分型,采用非条件logistic回归分析统计该多态位点与冠心病易感的相关性.结果 冠心病组与对照组CC、CT和TT基因分布比较,差异无统计学意义,-509C/T多态位点与冠心病无易感相关性(x2 =2.813,P=0.245).在不吸烟患者中,CT和TT基因型均显著增加个体患冠心病的风险(OR=1.98,95 ％CI:0.98～4.02,P=0.059、OR=2.49,95％CI:1.20～5.17,P=0.014),T等位基因明显增加个体患冠心病的发病风险(OR=1.49,95％CI:1.07～2.08,P=0.019).结论 TGF-β1-509C/T(rs1800469)多态位点在不吸烟人群中与冠心病的遗传易感有关,并且T等位基因是个体患冠心病的危险因素.
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整合素α2基因C807T多态性与脑梗死的相关性研究
目的 探讨整合素α2(ITGA2)基因C807T多态性与脑梗死的关系及其对血脂、栽脂蛋白水平的影响.方法 选择住院的脑梗死患者150例为脑梗死组,另选健康体检者170例为对照组.应用PCR-RFLP方法检测两组ITGA2的基因型;同时按常规方法测定血脂和栽脂蛋白水平.结果 与对照组比较,脑梗死组患者TC,TG、LDL-C水平明显升高(P<0.05),ITGA2基因C807T多态性在两组人群中的分布差异有统计学意义(P<0.05),T等位基因携带者患脑梗死的风险是C等位基因的1.690倍(OR=1.690,95%CI:1.219～2.341),携带T等位基因的脑梗死个体TC水平明显高于不携带者(P<0.05).结论 ITGA2基因C807T多态性与脑梗死发病有相关性,其中T等位基因可能是脑梗死的遗传易感基因,ITGA2基因C807T多态性可能通过影响血脂水平而影响脑梗死的发生.
