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中蜂囊状幼虫病毒LN-QY株VP2结构蛋白的基因分析及B细胞抗原表位预测

张琳;钱爱东;毛靖宇

摘要: 目的 预测中蜂囊状幼虫病毒(Chinese sacbrood virus,CSBV)LN-QY 株 VP2 蛋白的空间结构及其B细胞抗原表位.方法 将已感染CSBV LN-QY 株的RNA作为模板,进行RT-PCR扩增该毒株结构蛋白 VP2 基因,再与pMD18-T载体连接,之后转化大肠杆菌DH5α感受态,对经EcoRⅠ和BamH I双酶切鉴定为阳性的重组质粒进行测序,通过序列比对,获得LN-QY株VP2的核苷酸序列和推导的氨基酸序列,建立VP2结构蛋白的3D模型,在此基础上,应用DNAStar软件中的Protean模块综合分析结构蛋白的柔性区域、亲水性、表面可能性以及抗原指数等参数.结果 VP2结构蛋白的空间构象比较规则,其可能的B细胞抗原表位区域位于178-184,144-199,211-217氨基酸区段.结论 本研究为CSBV LN-QY 株VP2蛋白表位疫苗的设计以及血清诊断试剂盒的研制奠定了理论基础.

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