首页 > 文献资料
-
上海胜邦:用实力赢得客户与客户共发展
上海胜邦质量检测有限公司是美国胜邦(Specialized Technology Resources,STR)在中国上海设立的实验室.在食品检测方面,上海胜邦具有明显的优势,在技术水平、专业素质和法规符合性三个方面的优势尤为突出.
-
胃癌患者淋巴细胞与15个STR位点的关联
目的 探讨基因组微卫星DNA与胃癌患者淋巴细胞之间的关联.方法:胃癌组选择胃癌住院患者,共31例,男18例,女13例,年龄在36岁到81岁之间.对照组随机选取体检的健康正常人,年龄从37岁到72岁之间,共20例,男10例,女10例.STR对照组是100位无关健康个体,男女各50例,年龄在20-45岁,静脉采血.血常规使用XE2100全自动血球分析仪进行检测;STR采用PCR和五色荧光自动检测技术进行检测,STR包括D8S1179、D21S11、D7S820、CSF1PO、D3S1358、D5S818、D13S317、D16S539、D2S1338、D19S433、VWA、D12S391、D18S51、D6S1043、FGA.结果:胃癌组LY#平均值为1.57;对照组平均值为2.27,该项目存在显著性差异(P<0.001).5个STR基因位点与淋巴细胞存在显著性差异,分别为D8S1179-12、D13S317-11、D12S391-22、D18S51-19、D6S1043-19.结论:肿瘤的发生来源于基因的突变,本文通过分析胃癌患者与正常对照人群淋巴细胞与STR位点之间的关系得出结论:5个STR基因位点与淋巴细胞存在显著性差异.
-
203例汉族人群9个STR基因座的遗传多态性分析
目的:分析中国汉族无关个体的9个STIR基因座的多态性,研究其在法医鉴定中的应用价值.方法:应用STR_Typer_10_vl荧光标记试剂盒,对203例中国汉族无关个体的9个基因座D18S1364、D12S391、D13S325、D6S1043、D2S1772、D11S2368、D22 - GATA198B05、D8S1132和D7S3048进行复合扩增,用310遗传分析仪和Gene Mapper IDv3.2对扩增产物进行分型,计算各个基因座的等位基因频率,统计其遗传学参数.结果:9个STR基因座共检出105个等位基因、367种基因型.各个基因座的等位基因数在9～ 17个之间,基因频率在0.003～0.277之间,杂合度在0.763 ～0.865之间,三联体非父排除率在0.533～0.726之间,个人识别率在0.910～ 0.965之间.9个STR基因座的累积个人识别率为0.999 999 999 998 122 1,三联体累积非父排除率为0.999 955 67.经H-W平衡检验,9个STR基因座的P值均＞0.05.结论:该9个STR基因座在中国汉族人群中均属于多态性程度高的遗传标记,可以用于法医亲权鉴定和个人识别,也可以用于人类学和遗传学研究.
-
STR应用的研究进展
短串联重复序列(Short tandem repeat,STR),以其数目多、分布广、突变率低、高度多态性、高信息含量、高杂合度和检测方便快捷广泛应用于基因作图、基因诊断、器官移植、人类学及群体遗传学法医学个体识别和亲权鉴定等.近年来,随着STR检测技术(毛细管电泳、激光荧光自动检测、DNA芯片等)的飞速发展,其应用领域也随之日益扩展.
-
CCC-HPF-2细胞基因组DNA可作为STR分型标准物质
目的 检测细胞培养传代过程中的基因稳定性,筛选符合中国人遗传特性的DNA标准物质,建立DNA标准细胞库.方法 通过显微镜下观察、免疫组织化学、核型分析检测细胞传代过程中形态、分子表达及核型是否稳定；应用PCR方法检测细胞的外源微生物及种属来源；STR检测验证细胞在传代过程中STR表达谱的平衡性及稳定性.结果 CCC-HPF-2细胞呈成纤维细胞样；波形蛋白表达阳性,CK阴性；无外源微生物污染；细胞来源于人；所有15个STR基因座都得到扩增,呈现较好的扩增平衡性,各代细胞STR表达谱一致,表现了高度稳定性.结论 CCC-HPF-2细胞来源于人,30代内的该细胞DNA可作为STR分型标准物质.
-
广西黑衣壮族17个Y-STR位点遗传多态性
目的 调查17个Y染色体短串联重复序列(Y-STR)基因座及其单倍型在广西黑衣壮族人群中的分布情况.方法 应用AmpFISTR[R]YfilerRM荧光标记复合扩增系统,对黑衣壮族184名无关男性个体血样进行17个Y-STR位点的复合扩增,用ABI PRISM 310遗传分析仪对扩增产物进行检测分析.结果 DYS456、DYS389 I、DYS390、DYS389 Ⅱ、DYS458、DYS19、DYS385a＼b、DYS393、DYS391、DYS439、DYS635、DYAS392、Y-GATA-H4、DYS437、DYS438、DYS448各位点遗传多样性(GD值)分布在0.4910～0.9727之间.17个Y-STR位点共同构成的单倍型180种,其单倍型多样性为0.99976.广西黑衣壮族与其他群体的Y-STR位点等位基因分布差异具有统计学意义.结论 广西黑衣壮族17个Y-STR位点具有丰富的遗传多样性,可为父权鉴定和父系进化研究提供有价值的遗传学资料.
-
广西3个少数民族17个Y-STR位点的遗传多态性
目的 研究广西侗、苗、壮3个少数民族17个Y-STR基因座的多态信息及其在法医学应用价值.方法 少数民族口腔拭子用磁珠法提取DNA后用Yfiler复合扩增试剂盒扩增,3100XL型遗传分析仪进行基因分型.计算基因频率,多样性和遗传距离.结果 获得3个少数民族309名男性17个Y-STR基因座的等位基因频率分布资料,3个少数民族单倍型共观察到275种.单倍型多样性:侗族为0.9972,苗族为0.9966,壮族为0.9964;遗传距离中苗族跟侗族的遗传距离近.结论 由17个Y-STR位点组成的单倍型多样性在种族鉴别,父权鉴定和群体遗传学等方面有很高的应用价值
-
一个复合短串联重复列的分离
Short Tandem Repeats(STR)即短串联重复序列,已广泛应用于连锁分析和致病基因的定位克隆等方面.近年来发现可表达的三核苷酸重复单位拷贝数的扩增在导致人类某些遗传病的可能作用,使重复序列的研究更受重视.本文采用自行设计的可筛选基因组中所有可能三核苷酸STR的"三联体"兼并寡核苷酸探针来筛查5号染色体短臂区域部分Cosmid克隆中可能存在的三核苷酸STR.经过多次Southern杂交、酶切、亚克隆的方法,得到一复合STR.结果表明应用"三联体"兼并寡核苷酸探针,以杂交法来进行"群体初筛,单个验证"的方案是可行的.
-
一个AB型开米拉家系遗传状态的研究
为了研究罕见开米拉血型家系的基因遗传状态,对先证者家系部分样本进行ABO基因序列测定,用流式反向序列特异性寡核苷酸探针方法测定HLA-A、B、DRB1基因位点,用PCR-序列特异性引物法测定HLA-A、B、DRB1基因位点,对16个短串联重复片段位点进行荧光标记复合扩增.结果发现:A3B3型家系的2个体中,ABO基因、HLA-B、DRB1基因、多个STR位点出现了2个以上的等位基因.结论:利用基因分型技术分析开米拉血型能清楚地提示此罕见血型的遗传状态,增进了对此遗传方式的认识.
-
人骨髓间充质干细胞体外扩增的生物学评估
本研究旨在对骨髓间充质干细胞(mesenchymal stem cells,MSC)进行移植前增殖分化能力测定,病毒学检查,核型分析,PCR-STR和HLA的检测,以便为临床应用提供安全、可靠的移植细胞.采用贴壁法分离骨髓MSC,在相同条件下分别考察各代细胞形态、生长、表面标记、成骨、成脂分化能力的变化情况,并进行不同生长时期的核型分析,利用HLA-SBT技术检测4个不同供者来源的MSC的HLA-Ⅰ和HLA-Ⅱ位点的高分辨分型;应用PCR-STR技术检测4个不同供者来源的MSC基因遗传标记.并且利用ELISA方法检测HIV,HBV,HCV和TP,使用PCR方法检测支原体污染.结果表明:随着传代次数增加,MSC的增殖能力、成骨能力均有所下降.在扩增过程中,MSC始终保持较高的纯度,CD29、CD44、CD105、CD166、CD73均表达阳性,CD14、CD34、CD45、CD80和CD86均表达阴性.在8代以前未发现核型变异.4个不同供者来源的MSC的HLA高分辨分型和STR基因分型结果为MSC3的TP表达阳性,MSC2在5代出现支原体污染.结论:在体外培养过程中MSC干细胞特性逐渐丢失,其中向成骨方向的分化潜能降低.MSC在8代以前可作为实验研究及临床应用的良好对象.
-
微卫星DNA标记对BABL/c突变卷毛小鼠遗传特性的分析
目的 利用微卫星DNA标记技术对BALB/c突变卷毛小鼠与正常BALB/c小鼠进行遗传检测,旨在分析BALB/c突变卷毛小鼠与正常小鼠之间存在的遗传差异.方法 选取38个微卫星DNA位点结合荧光PCR技术和STR扫描基因型来检测BALB/c突变卷毛小鼠、无毛小鼠与正常小鼠三个群体的遗传变异情况.结果 38个微卫星位点在BALB/c突变卷毛小鼠与正常小鼠之间有27个微卫星位点相同,有11个位点存在差异,其突变率为28.9%(11/38);BABL/c突变无毛小鼠与正常小鼠之间有30个位点完全相同,8个位点存在差异,其突变率为21.1%(8/38);而BABL/c突变卷毛小鼠与无毛小鼠间也有12个位点存在差异.结论 BALB/c突变卷毛小鼠的突变率较高,且明显高于无毛小鼠,证明了卷毛小鼠突变与无毛小鼠突变是两个完全不同的突变系,为今后研究和开发应用BALB/c突变卷毛小鼠提供可靠的理论数据.
关键词： BALB/c突变卷毛小鼠 STR 荧光PCR -
近交系剑尾鱼的STR遗传检测技术
目的 建立近交系实验用鱼DNA检测方法,用于遗传质量控制.方法 以RR-B、RW-H、BY-F三个近交系剑尾鱼的基因组DNA为主要研究对象,并以非选育剑尾鱼作对照,采用STR (short tandem repeat) 引物扩增方法检测不同品系在DNA上的异同.设计10对STR引物,优化PCR电泳条件,使用相同的实验条件进行重复,以得到可靠的扩增条带,筛选出特异性引物.结果 有4对引物可扩增出稳定条带,1对引物(AY204223)的PCR扩增条带在非选育群中表现多态性,在RR-B与BY-F系表型一致,与RW-H表型不同.这些STR位点能够区分剑尾鱼三个近交系品系.结论 STR检测技术可望用于近交系剑尾鱼的遗传质量监测.
-
封闭群斑马鱼的STR遗传检测技术
目的 以AB、LF、ST(本地短尾,short tail)三个封闭群斑马鱼的基因组DNA为主要研究对象,采用STR (short tandem repeat) 引物扩增方法分析不同种群在核酸水平的异同.方法 利用5对斑马鱼STR引物和3对剑尾鱼STR引物,优化PCR条件,对不同种群斑马鱼DNA进行扩增.结果 Z24、Z9384、Z10508、Z20046这4对引物可扩增出稳定条带.除Z24的3对STR引物在群内和群间均表现出多态性.对扩增不同带型进行统计分析,Z20046群间差异显著(P<0.01),Z9384有群间差异(P<0.05),Z10508扩增结果无统计学差异(P>0.05).结论 鉴于该方法操作简便,通过进一步研究,可为封闭群斑马鱼的遗传质量评价打下基础.
-
早发肺癌与15个STR位点的关联
目的 讨论早发肺癌与15个STR(短串联重复序列)位点的关联.方法 肺癌组为住院患者共10例,男5例,女5例;STR对照组是100位无关健康个体,男女各50例.STR采用PCR和五色荧光自动检测技术进行检测,STR包括D881179、D21S11、D7S820、CSF1PO、D3S1358、D5S818、D13S317、D16S539、D281338、D19S433、VWA、D12S391、D18S51、D6S1043、FGA.结果 STR中D12S391-23、FGA-24位点的频数分别为0.200、0.400,对照组频数分别为0.040、0.175,这两项存在显著性差异(P<0.05);其他位点没有显著性差异(P>0.05).结论 STR中D12S391-23、FGA-24位点的频率高于对照组,其附近可能有早发肺癌的易感基因.
-
宁夏人群MSX1基因CA重复序列多态性与非综合征型唇腭裂相关性的研究
目的 探讨宁夏人群同源异型盒1(MSX1)基因CA重复序列(STR)与非综合征型唇腭裂的相关性.方法 收集宁夏地区非综合征型唇腭裂三人核心家庭(患儿及其双亲)40例,采用聚合酶链反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)方法 检测MSX1基因CA 重复序列基因型,进行传递不平衡检验(TDT)和家系为基础的相关性分析(FBAT).结果 运用TDT发现,MSX1基因CA重复序列CA4等位基因在本研究人群非综合征型唇腭裂患儿中存在过传递(P=0.034).FBAT分析表明MSX1基因CA重复序列与本研究人群非综合征型唇腭裂具有相关性(P＜0.05).结论 MSX1基因CA重复序列与宁夏人群非综合征型唇腭裂存在相关性.
-
河北中南部地区汉族群体15个STR基因座遗传多态性研究
目的 研究PowerplexTM 16荧光标记复合扩增系统的15个STR基因座在河北中南部地区汉族个体的多态性分布,建立河北中南部地区汉族群体的遗传学基础数据.方法 采用Chelex-100法应用PowerplexTM 16荧光标记复合扩增系统和ABI 3130遗传分析仪对25295例河北中南部地区汉族个体血样DNA进行检测,统计15个STR基因座的基因型分布、基因频率、杂合度(heterozygosity,Ho)、多态信息量(polymorphism information contents,PIC)、个体识别率(discrimination power,DP)、非父排除率(probability of paternity exclusion,PE)等群体遗传学参数,并进行Hand-y-Weinberg平衡检验.结果 15个基因座在群体中具有较高多态性,基因型分布均符合Handy-Weinberg平衡定律(P>0.05).共检测出293个等位基因,1364种基因型,基因频率在0.002%~51.58%之间,Ho在0.6206~0.9146之间,PIC在0.5610~0.8967之间;累积个人识别率为0.999999999999999996156,累积非父排除率为0.999999663.结论 PowerplexTM 16荧光标记复合扩增系统的15个STR基因座适合作为河北中南部汉族群体的遗传标记.
-
21个非CODISSTR基因座的遗传多态性
目的:探讨研究江浙汉族人群 21 个非 CODIS STR 基因座的遗传多态性.方法:使用 AGCU 21 + 1 STR 荧光标记复合扩增系统对江浙地区汉族的250 个无关个体的 21 个非 CODIS STR 基因座进行扩增,统计 STR 基因座的遗传学参数.结果:扩增后取得了 21 个 STR 基因座的等位基因频率分布,检测出 6、5、8、11、9、10、15、7、13、9、6、11、13、8、7、9、6、16、8、15、9 个等位基因,也获得了 21 个 STR 基因座的 H,He,DP,PM 及 PE 等的法医遗传学资料.结论:21 个非 CODIS STR 基因座具有良好的遗传多态性,适用于法医学亲权鉴定和个体识别.
-
DNA遗传标记及其在亲子鉴定中的应用
亲子鉴定不但用于各种刑事案件,越来越多的民事案件也需要亲子鉴定技术来解决.现代的亲子鉴定主要经历了三个阶段:第一阶段是采用血型测试;第二阶段是20世纪80年代开创的染色体多态性鉴定技术;第三阶段则是目前利用DNA遗传标记来进行的DNA分型鉴定技术DNA分型技术作为亲子鉴定的主要方法,对鉴定工作具有重大意义[1].目前用于亲子鉴定的DNA遗传标记,主要包括常染色体STR、X染色体STR、Y染色体STR和线粒体STR等.本文主要讨论DNA遗传标记及其在亲子鉴定中的应用.
-
山西汉族人群DYS719基因座的遗传多态性研究
目的:调查基因座DYS719在山西汉族人群中的频率,并对其法医学意义进行探讨.方法:从山西汉族人群中随机抽取120例无关男性血样本,10例女性血样本,提取静脉血DNA,在Y染色体基因组DNA中查找候选的基因座,用GDB数据库中的引物进行PCR扩增,非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离以及硝酸银染色,然后将筛选的等位基因进行测序,构建等位基因分型标准物,按照ISFG原则命名各等位基因.结果:共检出5个等位基因,其基因多样性为0.738 4;法医学应用方面,其个人识别力和非父排除率均为0.738 4.结论:Y染色体基因座DYS719具有较高的遗传多态性,在法医学及人类遗传学方面具有较高的应用价值.
-
D3S1358两种引物比较研究
目的:研究D3S1358基因座两种引物在同一模板不同降解时间扩增效果,对其在法医学上的应用进行可行性探讨.方法:从商品化STR试剂盒中筛选出D3S1358,提取32例无关男性血液样本进行降解、扩增、琼脂糖电泳等.结果:通过琼脂糖电泳结果分析,D3S1358降解后由minisTR扩增效果明显优于常规STR扩增效果.结论:miniSTR在处理腐败降解检材的分型检出率较常规STR有一定的优势.
