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基于“强”规则匹配技术的临床数据处理方法探讨
临床数据处理的关键是如何定义清晰的数据处理边界，建立“强”规则匹配方法，以保证数据提取的准确性及具有极少的“冗余”度，完成“数据”向“信息”的转换，形成应用价值。本文作者及合作团队，通过对国内6所大型三级甲等医院，不同疾病类型临床数据处理方法的研究，解决了信息模型构建、临床专业词库形成、临床信息提取等技术难题，形成了具有较强应用价值的基于大数据的临床质量管理和科研数据支撑系统。比较结果证明，针对信息模型中数据项，原始病历的人工阅读结果与专用信息提取工具结果间的误差能够控制在2%以内。
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病案管理人员在职教育的探讨
随着医学科学的发展,病案管理在医学科教研乃至医护人员不断走向成熟的过程中起着越来越重要的作用,而这就要求病案管理能与医学进步协调同步发展.针对目前病案管理人员普遍专业素质偏低,设备落后,病案资料的信息提供满足不了临床各专业要求的情况,首要任务就是提高病案专业人员的业务素质,使之能使用现代化的信息工具和方法,尽可能把病案中有用的信息提取出来.而提高病案专业人员的业务素质首先从在职人员人手,搞好在职教育,再逐步过渡到学校的正规教教育,进而提高整个病案管理队伍素质.
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浅谈药物不良反应
使临床医务人员对药物不良反应事件、概念有所了解,以便工作中即时记录上报,达到指导临床合理用药,及时预防和控制严重不良反应的发生.
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正则表达式在上市中药文献信息提取中的应用
上市中药文献分析任务繁重,利用计算机自动提取目标信息之后再进行人工检查,可以简化工作、提高效率.该文分析了上市中药文献信息提取的难点,认为非术语信息的匹配和不同分组的同类信息的区分是影响常用信息提取技术在上市中药文献信息提取中应用的两大关键问题.该文分析了正则表达式的模式匹配对于解决上述两大问题的价值,并选取“病例数”(非术语信息)和“有效率”(不同分组同类信息区分)2种信息,以此为例探讨了基于正则表达式的信息提取方法,初步实践了这一思路.
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基于文本挖掘的流行病学致病因素的提取
目的 基于文本挖掘技术,设计出能够自动提取流行病学致病因素的系统.方法 该自动信息提取系统由一个文本挖掘引擎子系统和一个基于规则的信息提取子系统构成.首先使用文本挖掘引擎标记出所有的名词短语,并收集该名词短语的语义等信息.然后利用基于规则的文本分类器,标记出流行病学致病因素.结果 为评估本系统,将由流行病学专家人工注解的文本输入该系统,评估发现好的结果F-measure为64.6％,其精确率和召回率分别为61.0％和68.8％,该结果优于其它相关研究,且其中有些错误仍可避免.结论 基于文本挖掘的方法对从流行病学研究文献中自动提取致病因素信息有很大帮助.
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基于界面信息提取的IHE XDS-LAB检验报告创建者的设计与实现
目的 使本身不具备检验报告共享能力的大量在用LIS系统,也能实现检验报告的跨机构跨区域共享.方法运用Windows消息机制获取既有LIS的报告单界面信息,将其整合成符合HL7 CDA文档,基于IHE XDS-LAB技术框架的检验报告共享架构实现.结果 设计并实现了基于IHE XDS-LAB检验报告创建者角色的应用程序,并通过了IHE 测试工具的测试.结论 本研究在不改变既有LIS系统的前提下,使其能够拥有基于标准的检验报告共享能力,促进检验报告跨机构跨区域的共享.
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蛋白质序列信息的提取与蛋白质结构预测
蛋白质结构预测是生物信息学的一项重要任务.本文介绍了目前在蛋白质结构预测中,基于人工神经网络和小波分析蛋白质序列信息的提取方法.从蛋白质序列提取更多的生物学特征和机器学习相结合的方法将有效提高蛋白质结构预测的精度.
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复杂性疾病生物信息学研究的策略与方法
本文简述近年来复杂性疾病生物信息学研究的策略与方法,并介绍清华大学生物信息学教育部重点实验室的有关工作.由于遗传、环境的相互作用及基因型-表型复杂的内部结构,常用的家系研究、基于遗传图谱的连锁分析、基于物理图谱的定位克隆以及关联分析等单基因病策略与方法,在复杂性疾病的分子机制研究上存在局限.在后基因组时代,生物信息学的发展,为从分子水平和系统观念研究复杂性疾病,以及研究模式从"序列→结构→功能"向"相互作用→网络→功能"的转变提供了契机.从多因素分析、基因的相互作用着手研究复杂性疾病成为热点.我们以信息、系统的观点,从功能基因组系统学出发研究复杂性疾病的机制,并在复杂性疾病的基因组合及相互作用信息提取、复杂性疾病基因转录水平和表达水平的芯片分析、多层次生物信息整合、分子调控网络建模、中医药生物信息学等方面进行了有益的尝试.
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心电图学信息提取呼吸波
目的：传统系统心血管生理学及其衍生出的心血管病学认为心电图学信息是一个反映人体心血管系统心脏功能的指标，与其他系统器官的功能没有关系，至少关系不大，心电图与呼吸相关研究不多。但是，整体整合生理学医学新理论体系创立以来，认为有机整体的人体心肺为核心的功能调控与维持涉及全身多系统共同相互作用，所以人体血液循环调控与呼吸调控是密不可分的。特别是进一步认识到心衰患者发生异常呼吸的机制以及正常人随吸呼节律而改变的每搏量、收缩压、心率及自主神经张力的变异性均是由于呼吸产生的动脉波浪式信号对外周化学感受器刺激经神经直接或者间接所造成。所以人体心电图学信息包含的呼吸相关信息应该可以有效地提取出呼吸波来。
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多参数监护中睡眠呼吸事件信息的提取
目的:对多参数监护中保存的病人数据进行挖掘分析,获得病人的睡眠呼吸事件信息.方法:利用多参数监护中保存的心电、血氧、呼吸等生理信号,结合多信息融合分析技术和专家知识获取病人的睡眠分期和呼吸事件信息.结果:成功从监护数据中提取出关键生理信号,分析出睡眠分期和呼吸事件,并初步应用于临床.结论:利用多参数监护数据,可以提取出睡眠相关信息,该功能对全面了解和掌握病人健康状况具有重要意义,可以成为多参数监护的一项重要的扩展功能.
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衍射增强成像的生物医学应用研究进展
X射线相衬成像技术是近年来研究开发的高衬度和高空间分辨率的新型成像技术,和传统X射线成像技术相比,它可满足生物软组织微观成像条件,获得软组织的丰富内部微观结构细节.衍射增强成像(DEI)是相衬成像技术的研究热点.利用基于DEI的信息提取和CT重建等图像处理技术,能够获得生物样品高质量图像及三维精细微观结构,更好地显示样品内部的结构和细节.结合DEI的理论和图像处理方法介绍了DEI技术的生物医学应用进展.
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老年发热病例的临床教学方法
临床思维能力和获取医学信息能力的培养是中医临床教学的重要内容.以老年人发热为例,列举了衰弱体质感冒、可疑噬血细胞综合征、帕金森综合征合并复杂感染和不明原因发热,尽可能复原临床场景,依据"先弄清疾病诊断,再筛选高效处方"的原则,采用逐步深入的步骤,依次呈现明确疾病诊断、细化类证鉴别、确立佳方剂的过程;以思辨过程为主线,以临床效果为证据,藉此论述养成良好的思维习惯的重要性和可学习性,并建立中医临床诊疗信心.古代和现代医学文献信息量浩繁,如何尽快掌握获得有效信息的能力,亦在文章中尝试给予介绍和指导.
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WONCA研究论文摘要汇编--抑郁症初级保健心理治疗效果：系统回顾和Meta分析
目的系统回顾抑郁症患者初级保健心理治疗有效性的现有可查证据，与一般护理或控制组进行对比，并对疗法类型和实施模式进行研究。方法通过检索MEDLINE、Embase、CENTRAL和PsycINFO数据库，搜集对比成人抑郁症患者初级保健心理治疗与常规治疗或控制组的随机对照试验，检索时间设定为2013年12月之前。至少两人从纳入研究中进行信息提取，并进行误差风险评估。以治疗后抑郁得分作为指标进行随机效果Meta分析。结果总共30项研究符合纳入标准，涉及5159例患者。与控制组相比，治疗结束时效果（标准平均差异）得分如下：面对面认知行为疗法（CBT）得分为-0.30〔95％CI（-0.48，-0.13）〕，面对面问题解决疗法得分为-0.14〔95％CI （-0.40，0.12）〕，面对面人际心理疗法得分为-0.24〔95％CI（-0.47，-0.02）〕，其他面对面心理干预得分为-0.28〔95％CI（-0.44，-0.12）〕，远程治疗师引导CBT得分为-0.43〔95％CI（-0.62，-0.24）〕，远程治疗师引导问题解决疗法得分为-0.56〔95％CI（-1.57，0.45）〕，自助引导 CBT 得分为-0.40〔95％CI（-0.69，-0.11）〕，无接触或低限度接触CBT得分为-0.27〔95％CI（-0.44，-0.10）〕。结论心理疗法在抑郁症患者初级保健中起到有效作用。与需要大量资源的疗法相比，面对面认知行为疗法能够以更少的资源获得相似效果。
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022 高血压病各期微循环观测结果的主成分分析
目的: 描述甲襞微循环的指标有16个, 不同指标之间往往有一定的相关性, 因此有可能用较少的起主要支配作用的综合指标把存在于各原始指标中的重要信息提取出来. 这些综合指标既能反映原始指标所包含的主要信息, 它们彼此之间又是无关的. 方法: 用主成分分析方法对高血压一期、二期、三期的甲襞微循环观测指标进行了初步分析. 一般主成分分析时以主成分的累积贡献率为标准, 通常累积贡献率达到70%以上即认为分析结果比较满意, 以此时的主成分数目为终分析结果. 结果: 高血压病各期的微循环改变特征并不相同, 在高血压一期, 主要以血管清晰度和血液流态的改变为主, 如血管清晰度、流速、红细胞聚集、白细胞数、乳头下静脉丛等. 在高血压二期, 大部分指标均有明显改变, 如管袢数、管袢型态、流速、细胞聚集、白细胞数、白微栓血色、渗出、乳头下静脉丛、乳头、汗腺导管. 在高血压三期则主要以微血管形态和血管运动性为主, 如清晰度、流速、血管运动性、红细胞聚集、乳头. 其中流速、红细胞聚集的影响在高血压不同分期时均出现, 说明它们的改变始终伴随着高血压病的发展. 结论: 通过主成分分析, 所以从高血压病临床微循环观测的大量数据中提取了非常有用的信息, 将高血压各期的微循环特征用较少的指标表示出来, 同时也认识到在疾病的不同病程阶段微循环的各项指标的贡献不同, 同一指标在疾病的不同阶段其贡献率也不同. 在上述的高血压三个不同病程分期的主成分分析中, 累积贡献率均达到或是接近了70%.
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正常和听障儿童口语叙事中的停顿研究
停顿是指语句或词语之间声音上的间歇，是每一种交流语言都具有的普遍现象。许毅［1］指出，停顿是语流中的间歇，与话语的连续性相辅相成。一方面它们把连续的话语切断，另一方面它们又为话语的连续提供了三方面的条件：即补充气流动力、为说话者组织连续话语提供思考的时间、把连续的话语切割为有某些结构作用或表达作用的片断［2］。在言语产生过程中，说话者会对将要说出的言语中介形式及终的输出结果进行主动的自我监控，在监控到言语错误或者信息提取困难时，说话者一般会暂停语流，依靠停顿来重新进行言语计划、确定修补策略、实施修补等。因此，对言语产生过程中停顿的研究成为一个非常好的、研究人的言语组织及其认知过程的窗口。
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基于"种子概念"的中医医案症状信息提取方法
目的:基于种子概念提取方法,建立中医医案症状信息提取方法.方法:对中医医案进行分词,通过设立种子概念,统计互信息量,选择大于阈值者为复合种子概念;结合萤火虫算法,统计相邻词语间关联性,获取扩展种子概念.结果:获取复合种子概念217个,扩展种子概念68个.结论:该方法实现了中医医案症状信息的自动化提取,为中医医案的数据挖掘提供了便利.
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基于XML的文章信息摘录系统的设计和开发
"基于XML(eXtensible Markup Language)的文章信息摘录系统"主要实现将学术论文的文章信息批量写入到XML格式的文件,现简单介绍该系统,给出系统的功能及部分功能模块的实现.
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医学资源异构跨库检索技术理论和实践
阐述异构跨库检索技术理论,探讨如何运用iRMS技术进行资源整合,通过实践看出该技术在数字图书馆资源建设中的广阔前景和巨大的应用价值.
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电子病历辅助临床决策
简要介绍电子病历的概念及其发展历程，阐述电子病历信息提取及辅助临床决策的方法，包括机器学习、统计学习、规则归纳法等，描述电子病历辅助临床决策在诊断标准识别和临床诊疗活动中的应用，体现电子病历辅助临床决策之循证意义。
