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非编码RNAs对骨骼肌发育及疾病的调控作用
非编码RNAs(noncoding RNAs,ncRNAs)包括长链非编码RNAs (long noncoding RNAs,lncRNAs)和小RNAs(microRNAs,miRNAs),与成肌分化、肌纤维类型的调控和骨骼肌疾病关系密切;近期循环ncRNAs成为研究热点,可用作某些疾病的潜在血浆分子标志物,对疾病早期进行筛选.通过研究ncRNAs在骨骼肌发育中的作用及机制将会为骨骼肌疾病的治疗提供潜在靶点.
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lncRNAs与心血管疾病的关系研究概述
心血管疾病严重威胁人类健康.有关心血管疾病的研究一直是基础医学的一个重点研究方向.随着遗传学研究的发展,曾被认为无用的非编码基因序列越来越受到广大研究者们的关注.占非编码RNA(ncRNA)大多数的长非编码RNA (lncRNA)的相关研究正在兴起.虽然目前对lncRNA的研究尚处于起步阶段,但已有不少证据表明lncRNA与心血管疾病有着密切关系.本文重点介绍lncRNA的功能和特点,并在现有研究的基础上对lncRNA与心血管疾病的关系作进一步阐述.
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竞争性内源RNA在胰腺癌中的作用
胰腺癌是消化系统恶性程度较高的肿瘤之一,如何早期发现、诊断及提高疗效是目前临床迫切需要解决的问题.近年来竞争性内源RNA假说的提出为阐明包括胰腺癌在内的多种肿瘤的发生发展机制提供了重要线索及新的研究方向.微小RNAs (miRNAs)和长链非编码RNAs (lncRNAs)均为竞争性内源RNA假说的重要组成部分,研究发现,miRNAs的过度表达和沉默,以及部分lncRNAs的异常表达均与胰腺癌的发生发展有密切关系.本文分别从竞争性内源RNA假说的内容及机制,竞争性内源RNA成员在胰腺癌等肿瘤中的作用作系统综述.
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lncRNAs在淋巴造血系统肿瘤中的研究进展
长链非编码RNAs（long noncoding RNAs，lncRNAs）是长度≥200个核苷酸的非蛋白编码转录子。多数lncRNAs在肿瘤组织中显示致癌基因的作用，通过影响肿瘤细胞的增生、迁移、浸润和转移促进肿瘤的发生发展；部分lncRNAs已成为特定肿瘤的诊断及预后标志物。对其表达、功能及机制的研究成为当前肿瘤研究的热点，但多集中于上皮源性肿瘤。本文旨在对lncRNAs在淋巴造血系统肿瘤中的研究进展进行综述。
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CRISPR/Cas9基因编辑技术在精神分裂症研究和治疗中的应用前景综述
精神分裂症是多发于青壮年的精神障碍性疾病之一,至今病因未明.遗传学研究结果显示遗传因素在精神分裂症发病过程中起着重要作用,它是一种具有遗传性的脑基因异常表达疾病.近年来大量的和分裂症有关的基因被鉴定和标记,治疗上依赖于新型的基因编辑工具进行基因的再编辑,从而治疗精神分裂症.本文综述了CRISPR/Cas9基因编辑技术的应用.
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人脂肪干细胞脂向分化中长非编码RNA的差异表达
背景：肥胖导致了包括高血压、冠心病、脂肪肝、高脂血症、2型糖尿病在内的诸多疾病，因此深入理解脂肪细胞分化机制对于肥胖的防治具有深远意义。目前对于脂向分化机制的研究多集中在微小RNA上，对于长非编码RNA在脂向分化过程中的作用尚且知之甚少。目的：获得脂向分化过程中差异倍数明显的长非编码RNA，并进一步筛选在脂向分化过程中可能发挥重要作用的长非编码RNA进行验证。方法：取人腹部皮下脂肪，采用组织块培养法获取脂肪干细胞，传至第3代后进行成脂诱导分化，通过微阵列技术对脂向分化过程中0，5，12 d长非编码RNA及mRNA差异性表达量进行统计，并结合生物信息学报告筛选出呈现明显差异性表达的长非编码RNA，通过qRT-PCR进行验证。结果与结论：脂向分化过程中以差异倍数1.5(P <0.05)为标准，上调长非编码RNA的数量5 d vs.0 d 748个，12 d vs.0 d 847个，12 d vs.5 d 593个；下调长非编码RNA的数量5 d vs.0 d 828个，12 d vs.0 d 1113个，12 d vs.5 d 750个；结合生物信息学分析结果，在与脂类代谢有关的28个长非编码RNA中根据诱导0，5，12 d 差异表达倍数较高且其靶基因可能是已知的与成脂相关的基因中，筛选出3个长非编码 RNA：AK304548、BP216319、DA852857。通过PCR验证结果显示AK304548、BP216319及其靶基因表达量呈现先下调后上调的趋势，与微阵列测序结果相符，预示其在脂向分化过程中起到调控作用。
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LncRNAs参与免疫调节及自身免疫性疾病的研究进展
在基因组非编码基因特异性的RNA分子表达产物中,长链非编码RNA(lncRNAs)在许多生物学过程中发挥了重要的调节作用,越来越多的研究发现,lncRNAs还参与了一些疾病的发生发展过程.目前较多的研究热点集中于lncRNAs和肿瘤的关系上,但是近年来人们发现lncRNAs还可能在免疫调节的不同时期发挥调控作用:在固有免疫应答中调节了免疫细胞的发生发展;在适应性免疫应答中调节效应免疫细胞的应答敏感性.这说明lncRNAs可能参与一些自身免疫性疾病的发病过程,了解近年来lncRNAs与免疫调节及自身免疫性疾病相关的研究成果很有意义.
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LncRNAs在肾癌中的作用机制及免疫治疗发展趋势
随着生物信息学技术的进步、高通量测序的应用,发现了大量的功能性的lncRNAs.它可以表现为抑癌基因、致癌基因甚至是同一LncRNAs在不同的环境及组织中表现出抑癌、致癌双重功能,并参与肿瘤的发生发展.研究表明,LncRNAs在肿瘤细胞的增殖、凋亡、侵袭、迁移以及肿瘤的转移及耐药等多种生物学进程中起着关键性的作用,因而有望成为肿瘤生物标记物以及药物治疗新靶点用于肿瘤诊断、治疗、预后预测.
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组蛋白甲基化与lncRNAs的表达调控
LncRNAs是长度超过200 nt非编码蛋白质的RNA分子,并参与细胞内多种调控过程.LncRNA在发育和基因表达中发挥着复杂精确的调控功能,补充解释了基因组复杂性的生物意义,同时也使人们重新认识了生命过程中基因表达调控网络的复杂性.LncRNA参与了X染色体沉默、基因组印记、染色质修饰、转录激活、转录干扰以及核内运输等多种重要的调控过程.组蛋白修饰是基因表达调控的重要形式,尤其是组蛋白甲基化的调控作用.研究发现组蛋白甲基化对基因异常表达的调控参与多种肿瘤的发生.组蛋白去甲基化酶的发现又提出了一种新的理念,即组蛋白甲基化对lncRNA表达调控作用,这将是基因表达调控研究的新领域.
关键词： 组蛋白甲基化 组蛋白去甲基化转移酶 lncRNAs -
LncRNA在神经发育及神经性疾病中作用的研究进展
长链非编码RNA (long non-coding RNA,lncRNA)是指不具有编码蛋白能力且长度大于200nt的RNA,近年来,越来越多的lncRNAs在多种生命活动中发挥着重要的作用.已有研究发现lncRNAs在神经发育过程中起着重要的作用,lncRNAs可以调控神经干细胞定向分化为神经元、胶质细胞、星状细胞,lncRNAs,还参与调控神经千细胞的分化进程;lncRNAs表达异常与神经疾病也有密切关系.本文就lncRNAs在调控神经细胞分化进程和在神经性疾病作用的研究新进展进行综述.
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lncRNAs的分子功能及其在干细胞多能性中的研究进展
长链非编码RNAs(long noncoding RNAs,lncRNAs)是调控基因表达的新重点,其本身的脱帽和降解可能会是它功能的一个极其重要的方面,尤其是在可诱导基因的转录调控中起到重要作用.lncRNAs具有作为信号、诱饵、向导和支架等多种分子功能.干细胞的研究证实lncRNAs在维持干细胞多能状态中起作用,是干细胞多能性及神经生成等的关键调节器,而且主要通过反式作用影响全体基因表达.随着研究的深入,越来越多的具有重要调控功能的lncRNAs被发现,但是要阐明其调控生物学进程的具体的分子机制及信号通路还需要更多更深入的研究.
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乳腺癌lncRNAs表达谱的检测
目的 初步探讨人乳腺癌lncRNAs基因表达谱的筛选.方法 在EBI数据库中的Array Express子数据库选取两组代表乳腺癌基因表达的基因芯片数据,从一组数据下载原始CEL数据文件,运用RMA(RobustMultichip Average)方法对原始CEL文件进行标准化及背景校正.得到乳腺癌与癌旁组织中的探针表达谱矩阵,将其与NetAffx注释文件结合.提取出RefSeq转录本ID和(或)Ensembl基因ID的探针集.对于Refseq ID的探针集,只保留那些NR者(代表非编码RNA).对于Ensembl基因ID的探针集,只保留注释为LncRNA,加工过的转录本或“misc_RNA”.对上述步骤得到的数据进行过滤,得到存在差异表达的lncRNA数量,将这一结果在另一组乳腺癌芯片数据中进行验证.结果 共筛选出表达差异显著且方向一致的18个LncRNA,其中2种LncRNAs表达明显上调,16种LncRNAs表达明显下调.结论 筛选出与乳腺癌相关的差异表达lncRNAs,为进一步研究其在乳腺癌中的作用奠定基础.
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LncRNAs在糖尿病神经血管病变中的研究进展
长非编码核糖核酸(long noncoding RNAs,lncRNAs)是不参与翻译蛋白质的功能性RNA片段.已有不少研究证据表明lncRNAs与糖尿病有着密切联系.该文就lncRNAs在糖尿病神经病变和血管病变中的作用及其机制进行综述,为糖尿病的预防与治疗提供相关的研究依据.
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lncRNAs参与基因表达调控机制的研究进展
长链非编码RNAs (long non-coding RNAs,lncRNAs)是一组内源性、长度超过200 nt、缺少特异完整的开放阅读框(open reading frame,ORF)、无或很少有蛋白编码功能的RNAs分子.近年来的研究发现,IncRNAs与许多重要的生物学过程相关,如基因组印记、细胞分化、免疫反应等.lncRNAs在表观遗传水平、转录水平和转录后水平等多个层面调节基因的表达,通过介导染色质重塑和组蛋白修饰、干扰转录、调节选择性剪接模式、生成小RNAs、调节蛋白质活性、改变蛋白质定位等方式,参与机体生长、发育、衰老及死亡等重要生命活动的调控.关于lncRNAs参与基因表达调控的机制有待进一步研究,这将有助于深入理解疾病的发病机制,为寻找疾病分子标记物、药物靶点提供新的方向.
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长链非编码RNA LINC00467促进非小细胞肺癌细胞的增殖
目的 研究长链非编码RNAs(Long non-coding RNAs,LncRNAs) LINC00467在非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)组织及细胞系中的表达及其对NSCLC细胞系功能的影响.方法 利用高通量基因表达[Gene Expression Omnibus (GEO)]数据库提取GSE19804和GSE18842数据集的生物信息学资料,分析LINC00467在NSCLC组织和正常肺组织中的表达差异;采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测收集的25对NSCLC癌组织及其癌旁组织以及NSCLC细胞系(A549、NCI-H266、NCI-H1299)和人正常支气管上皮细胞系HBE中LINC00467的表达;然后将NSCLC细胞系A549分别转染LINC00467 siRNA(si-LINC00467组)和对照序列(si-NC组),分别采用流式细胞技术、CCK8和细胞克隆形成实验检测两组细胞的增殖情况,qRT-PCR和Western blot实验检测两组细胞细胞周期相关分子G1/S-特异性周期蛋白-D1 (CyclinD1)和细胞周期分子细胞周期素蛋白依赖性激酶6(CDK6)的表达.结果 GEO公共数据库分析显示,LINC00467在NSCLC组织中的表达高于正常肺组织(P＜0.05),与癌旁组织和上皮正常细胞相比较,NSCLC癌组织和细胞系中LINC00467的表达水平升高(P＜0.05);A549细胞中si-LINC00467组中LINC00467表达水平明显低于si-NC组(P＜0.01),且细胞活力和细胞克隆数均低于si-NC组,差异均有统计学意义(P＜0.05);相较于si-NC组,si-LINC00467组CyclinD1和CDK6的表达受到明显抑制(P＜0.05).结论 NSCLC组织及细胞系中LINC00467呈高表达,沉默LINC00467表达可明显抑制NSCLC恶性增殖的表型,可为NSCLC的靶向治疗提供潜在策略.
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LncRNA在泌尿系肿瘤中的研究进展
LncRNAs是基因表达过程中重要的调控因子，并与细胞生长、增殖、分化及生存等重要通路相互作用。回顾当前lncRNAs的生物学进展，揭示其与前列腺癌、膀胱癌及肾癌的联系，我们将对肿瘤的生物学机制有更深的了解并为泌尿系肿瘤的治疗提供了新的治疗靶点。
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胃癌中lncRNAs的研究进展
胃癌是一种我国常见的消化道恶性肿瘤,严重威胁人们健康与生命.阐明胃癌发病的分子机制及获得新的分子靶点对胃癌防治尤为重要.长链非编码RNAs的发现对深入阐明胃癌发病的分子机制及发现新的分子标志物提供了可能.本文对lncRNAs在胃癌中的表达以及对胃癌的生长增殖、转移、耐药与预后等研究进行综述.
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胰腺癌中mRNAs、ncRNAs研究进展
胰腺癌恶性程度高,胰腺癌的发生与基因的基因突变、缺失、表达障碍有关.对miRNAs、mRNAs、lncRNAs、circleRNAs胰腺癌相关的研究进行总结,研究表明miRNAs调控mRNAs实现对癌症的生长、浸袭、凋亡,而lncRNAs与CirRNAs则与miRNAs结合,形成ceRNA机制,这些总结对将来胰腺癌的研究发现新的分子机制具有重要作用,对寻找有更好诊断意义的胰腺癌临床指标具有积极的意义.
关键词： 胰腺癌miRNAs mRNAs lncRNAs circleRNAs -
心肌梗死中lncRNAs、mRNAs基因表达谱分析
急性心肌梗塞(acute myocardial infarction,AMI)是全球范围内致死和致残的主要疾病之一.基于生物信息学方法,通过对获得的心肌梗死lncRNA和mRNA表达谱数据进行分析,建立lncRNA-mRNA网络,通过模块挖掘获得5个功能显著性模块,研究在心肌梗死中lncRNAs-mRNAs的调控机制.其中lncRNA H19在所构建的lncRNA-mRNA网络中度数较大,并且有研究证实H19可以作为治疗心肌梗死的新靶点.本文对心肌梗死基因表达谱进行分析,旨在探索心肌梗死发生发展过程中lncRNA与其靶基因的关系和调控作用机制.
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脑卒中lncRNA与mRNA表达谱分析
本文研究差异表达的lncRNAs、mRNAs在脑卒中疾病中的调控机理.对脑卒中表达谱进行分析,建立了lncRNA-mRNA疾病网络,利用cytoscape发现了五个与疾病相关的重要模块.对五个模块进行功能注释,发现多个模块中出现重复的功能注释,其中代谢相关功能在多个模块重复出现,与脑卒代谢中密切相关;多个模块注释到转录调控功能,表明基因通过协同作用行使功能调控脑卒中,通过本文的研究得到lncRNAs与mRNAs协同作用的一些结果,为临床治疗研究提供科学的理论依据.
