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  • 糖尿病肾病的生物标志物

    作者:安玉

    糖尿病肾病是一种常见的糖尿病微血管并发症.尽管在疾病的预防和治疗方面已取得很大进步,但仍有不少患者进展至终末期肾病.糖尿病肾病的诊断主要依赖蛋白尿和微量白蛋白尿,但这些指标对糖尿病肾病的诊断又缺乏敏感性和特异性.因此,寻找能早期诊断并判断预后的生物标志物是当今医学面临的难题.近年来,针对糖尿病肾病发病各个环节的生物标志物的研究均取得了一定进展,然而更多基于系统生物学方法的研究结果还有待进一步临床验证.

  • 统生物学--推动肾脏病临床研究的新动力

    作者:刘志红;黎磊石

    在科学实践中,客观事物的复杂性与主观认识的局限性之间的矛盾始终是推动科学发展的基本动力.当肾脏病肾活检诊断开始从初的组织形态学向分子诊断深入发展的时候,目前临床上一些用于作疾病诊断、观察病情变化的生理、生化和免疫学指标的局限性也显得越来越突出.这些指标更多地反映的是机体病理生理过程中的一些共性特征,缺乏组织结构与功能变化之间的内在联系,更无法展现疾病特定条件下的一些特征性改变.因此,如何从肾活检组织和血清及尿液标本中寻找到有助于肾脏病早期诊断,反映病情性质、程度和判断疗效更有针对性的生物标记物(Biomarkers)已成为肾脏病临床研究的当务之急[1,2].要解决好这个问题需要对疾病发展过程有一个系统的认识,这其中当然离不开与此相适应技术方法的改进.这些都促使我们重新思考以往经典实验生物学研究中存在的问题,并将探索的眼光投向当今医学研究富挑战的新领域--后基因组和系统生物学的研究.

  • 通量平衡分析的进展与应用

    作者:颜思奇;李娟;方慧生

    代谢网络是系统生物学的一个热门话题,代谢网络包含生物体内编码酶的基因以及所有已知的代谢反应.通量平衡分析是分析代谢网络中代谢物通量的数学方法,通过计算代谢网络中代谢物的通量,可以预测生物体的生长速度或某个特定代谢物的生成速率.文章综述了通量平衡分析算法的原理、建模步骤,分枝菌酸通路的通量平衡分析实例,常用的通量平衡分析软件,并从安装要求、可用性、功能、模型交换、网络可视化5个方面比较了应用通量平衡分析算法工具的特性,以指导用户选择合适的软件工具.

  • 系统生物学与药物发现研究

    作者:吴梧桐

    系统生物学是假说驱动的科学,是21世纪医学与生物学的核心驱动力.近代药物发现研究主要基于药物新靶点的发现,但是在疾病生物学模型中,化合物的有效性与安全性并不全决定于靶点的选择,系统生物学为药物发现提供了一个全新的研究模式,能明显降低新药研究开发的时间与费用.

  • 基于机制的生理药动-药效学模型研究进展

    作者:徐瑞娟;杨进波;杨劲

    生理药动-药效学模型通过对生物学过程的描述,可预测体内药物的吸收、分布、代谢、排泄以及进一步的生理生化反应.这类模型是通过已知的生化/生理基础来构建,采用了一种“自下而上”的建模方法,并利用数学方法对生理过程及药物的作用机制作出准确的描述.其中药效学部分,根据预测目的和药物作用的复杂性,可进一步分为基于经验的和基于机制的效应模型,这两种模型均可与基于机制的生理药动学模型相连接,终预测药物的体内处置和效应.基于机制的生理药动-药效学模型的优势在于:可外推性、新的影响因素的可纳入性以及可用于未知领域的预测等.随着实验技术的不断革新,药物作用机制的逐渐明确,这类模型越来越多的被成功应用于药物研发及风险评估中.综述生理药动-药效学模型的构建策略与分类以及在药物研发和风险评估中的应用研究.

  • 药物代谢组学与个体化用药的精准医疗

    作者:王广基

    系统生物学是当今世界上生命科学研究为活跃的领域之一,其包括基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学.在系统生物学背景下,以内源性小分子为基础,代谢组学创始人帝国理工学院的NicholsonJK教授领导的团队于2006年在Nature杂志上发表文章,正式提出“Pharmaco-metabonomic”即“药物代谢组学”的概念,定义为“基于数学模型通过对干预前的内源性物质定量数据预测药物或外源性物质给药后的体内结果”[1].

  • 药物代谢组学研究进展

    作者:黄寅;许风国;张伟;王俊南;张尊建

    药物代谢组学是在系统生物学背景下,代谢组学与药学紧密交叉、有机结合促生的一门新兴学科.它依托现代分析技术、化学计量学和生物信息学技术,通过分析比较给药前后生物体液中小分子代谢物轮廓的改变来进行药物疗效和毒性的评价、预测.本文对药物代谢组学的研究流程和应用等方面的新进展进行了系统概括,并对相关技术要点和存在的问题进行了讨论.

  • 代谢组学——肿瘤个体化治疗研究的有力工具

    作者:柴延兰;王娟;刘孜

    代谢组学是后基因组时代飞速发展起来的新学科,是目前组学研究领域的热点之一.其核心内容在于运用核磁共振、色谱、质谱等分析技术,对某一生物体或细胞内所有相对低分子量的代谢物进行系统检测,将获得的代谢图谱数据借助化学计量工具和模式识别软件转换成相应的信息,从而揭示机体生命活动的本质.在生命科学迅速发展的今天,肿瘤个体化治疗的研究逐步受到广泛重视,尤其是代谢组学以其高通量、高灵敏度、高精确度的优势,在肿瘤个体化治疗的研究中显示出了巨大的潜力和价值.文中主要就代谢组学的概念、研究内容、研究方法及其在肿瘤个体化治疗中的应用做一综述.

  • 代谢组学在强直性脊柱炎研究中的应用

    作者:齐亚军;刘健;曹云祥;孙玥;王芳;叶文芳

    代谢组学[1]是继基因组学、转录组学和蛋白质组学之后兴起的系统生物学的一个新的分支,它是通过考察生物体系(细胞、组织或生物体)受刺激或扰动后(如将某个特定的基因变异或环境变化后)代谢产物图谱及其动态变化,研究生物体系的代谢网络的一种技术。与其他三种组学研究的 DNA、RNA和蛋白质等生物大分子不同,代谢组学是对生物体系中的小分子化合物进行定性定量研究。近年来,代谢组学相关技术发展迅速,已广泛应用到毒理学[2]、营养学[3]、植物学[4]、微生物学[5]、药物研发[6]、疾病研究[7]、功能基因组学[8]等领域。强直性脊柱炎( AS )是以中轴关节慢性炎症为主的原因不明的全身性免疫性疾病,其特点为病变累及骶髂关节,常发生椎间盘纤维环及其附近韧带钙化和骨性强直,晚期可发生脊柱强直和关节畸形[9]。国内髋关节受累率达60%左右,严重者髋关节畸形强直而造成终身残废,丧失劳动力[10]。 AS病因复杂,其发病机制至今仍然不明。近年来,一些学者[11]对AS的生物学指标进行了研究,希望能够找到早期诊断AS的标志物并探明其发病机制。代谢组学运用高通量、高敏感的分析技术,结合化学计量学方法,分析体液中的代谢产物,可以将所有代谢物的信息整合到一起,通过比较其代谢特性,寻找出早期敏感的生物标志物,能够帮助分析病变过程和辅助临床诊断。本文就代谢组学及其在AS生物标志物研究中的现状做一综述。

  • 肝豆状核变性中医辨证分型与客观化指标的相关性

    作者:杨秋水;程楠;王训;李健;韩咏竹

    肝豆状核变性(HLD)又称作Wilson病,是一种常染色体隐性遗传病,基因定位于13q14.3,由于铜代谢障碍沉积于肝脏、肾脏和大脑,导致急慢性肝病、肾病和(或)神经系统疾病[1].目前,现代医学主要是运用金属络合剂及阻止肠道对铜的吸收与促进排铜的药物,虽可以改善神经系统体征或使其他临床症状缓解,但此类药物毒副作用较大,如胃肠道反应、过敏、自发性出血、肝肾损害、过度络合综合征等[2],且需终生服药,价格昂贵,限制了临床的使用范围.杨任民等[3]应用中药治疗HLD患者107例,显效9例,有效率为81.4%.

  • 中医系统生物学研究几个关键问题

    作者:李富仁;赵宏杰;雷钧涛;张笑波

    今天的系统生物学是在细胞、组织、器官和生物体整体水平上研究结构和功能各异的各种分子及其相互作用,并通过计算生物学来定量描述和预测生物功能、表型和行为.

  • 藏药二十五味珊瑚丸治疗阿尔茨海默病的网络药理学研究

    作者:胡贤达

    目的 通过网络药理学方法,探讨藏药二十五味珊瑚丸治疗阿尔茨海默病的药理作用机制.方法 采用反向药效团匹配法,对二十五味珊瑚丸主要入血成分的潜在靶点进行预测,并结合生物信息学手段,对主要生物学功能及细胞信号通路进行系统分析.结果 二十五味珊瑚丸作为一种多组分药物,具有多个潜在靶点.可能参与以丝裂原活化蛋白激酶、胰岛素、哺乳动物雷帕霉素靶蛋白为主的细胞信号传导通路,涉及以炎症、凋亡、β淀粉样蛋白的表达及清除为主的生物学功能.结论 二十五味珊瑚丸能够通过多组分和多靶点的协同作用,共同干预阿尔茨海默病的进程.

  • 基于病证结合肠易激综合征动物模型构建方法及研究思路

    作者:旺建伟;张秋樾;胥风华;叶虹玉;赵文静

    构建病证结合动物模型是进行中医药研究比较理想的技术平台。目前,诸多学者在现代医学疾病动物模型基础上结合病因制作病证动物模型,制备了适宜的相应的肠易激综合征病证结合模型,体现中医对肠易激综合征辩证优势,促进了病证结合动物模型研究的发展,但仍存在着对证候评价主观性、重病轻证等问题。因此在病证结合模型复制、筛选、评价方面,在不断深入疾病发病机制及中医证候研究基础上,通过方证相关结合系统生物学研究方法,进行深入中医证候内涵相关研究,改进病证模型的研究、构建方法,病证结合动物模型制备思路更成熟,以阐明中医药的科学内涵。

  • 阳虚质和阴虚质特征比较研究

    作者:李英帅;王济;李玲孺;袁卓?;俞若熙;王琦

    阳虚质、阴虚质是相互联系又相互对立的两种基本体质类型,两者在形态结构、生理功能、心理特点和反应状态4个方面具有差异性.这两种体质类型以"虚"为共同特点,表现为生理功能的低下、适应能力的减弱等,在此基础上,又表现出寒与热、静与动的对立特征.

  • 衰老的基础研究现状与干预策略

    作者:陈厚早;刘德培

    我国已进入老龄化社会,老年伴随着疾病增加严重威胁人们的健康,但是目前对于衰老的认识还处于初步阶段.衰老过程中,机体系统层面的紊乱与细胞和分子层面的失真互为因果,使得衰老的机制具有明显的复杂性.本文从系统、细胞和分子三个角度阐述衰老的基础研究的现状,进一步阐述衰老导致疾病过程中的内在联系以及提出潜在干预策略.因此,倡导通过健康的生活方式来控制衰老相关疾病的发生发展,探索从“分病而治”向“异病同防/治”的战略转变.

  • 浅谈系统生物学与中药药理研究

    作者:钱善军

    本文介绍了系统生物学的概念和特点,概括了系统生物学在中药有效成分或有效部位、单味中药以及中药复方研究中的应用优势,对系统生物学在中药现代药理研究中的应用前景进行了展望.

  • 试论药物的组合应用是未来药物发展的重要方向

    作者:郭慧

    许多疾病都是由多个原因综合作用产生的,其发病机制体现了多途径、多靶点的网络变化。因此,仅仅依靠以往单一靶点的药物治疗模式已不能满足复杂疾理论支持和技术支撑。为此,本文分析了中西药物的发展趋势,指出药物的组合应用是融合了中西药物的优势特征,是未来药物发展的必然趋势,具有广阔的开发和应用前景。

  • IL-18在心血管疾病中的研究进展

    作者:姚平波;文红艳

    心血管疾病是现代社会严重威胁人类健康,引起死亡的主要疾病之一.近年来,随着基因组学、蛋白组学和系统生物学的研究迅猛发展,生物信息的不断发现,确定心血管疾病的生物标志物已经成为一种迫切需要.

  • 乳腺癌的分子分型

    作者:张百红;岳红云

    乳腺癌是一种分子水平异质性很高的疾病,分子分型可为乳腺癌的个体化治疗提供一个新视野.在分子病理学、分子生物学和系统生物学指导下,乳腺癌经历了4类分型、70种和21种基因蛋白谱以及基因组整合分类等不同分型.这些分型将为乳腺癌的精确治疗提供指导.

  • "体质"是系统生物学与中医学的佳结合点

    作者:田栓磊;王琦

    系统生物学是生命科学中的一个新兴领域,它的崛起给中医药的研究带来新的机遇.中医学与系统生物学在许多方面有近似的属性,中医药的研究若能与系统生物学相结合,势必会促进中医药学的发展."体质"是将系统生物学引入中医学研究的佳结合点,在中医体质学的研究中引入系统生物学方法具有重要意义.

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