首页 > 文献资料
-
代谢组学研究进展
代谢组学是功能基因组学和系统生物学研究不可或缺的重要组成部分,是通过考察生物体系受刺激或扰动前后(如将某个特定的基因变异或环境变化后)代谢产物的动态变化,研究生物体系的代谢网络的一种技术.近年来,在药物研发、疾病研究、植物和微生物等领域发展迅速,但在分析技术、方法学和应用等方面急需突破.
-
2011年原发性肾小球疾病研究进展
肾脏病学科是一个相对年轻的学科,近年来随着肾活检病理诊断、分子生物学、细胞遗传学、基因组学、蛋白组学、代谢组学以及系统生物学等技术广泛应用于肾脏病学领域;多学科、多中心以及国际学术的交流与合作,在2011年肾脏病学科取得了突飞猛进的成果,为肾脏病的临床工作提供了许多新的理念与思路,尤其是原发性肾小球疾病的研究.本文将对原发性肾小球疾病在2011年取得的部分研究进展进行综述分析.
-
医学中的系统生物学
对生命体抽象之后就形成一个关于生命体的系统.以生命体为研究对象的生物学和医学,其实就是研究一个生命体的系统,并形成一个关于此系统的知识体系.系统的看待解决医学生物学的问题是一个更符合医学生物学本质需求的思路,而系统生物学的概念也在这样的需求下产生.医学生物学进入21世纪后,首先是医学生物学测量系统化的转变,以基因组为先导的一系列"组"(基因组、蛋白质组、代谢组等)项目的开展、特别是高通量实验技术的发展,使得医学生物学领域内的数据急剧膨胀,而既往的以单一因素为研究重点的研究方法,已经不能适应基于系统测量产生的数据增长速度.这就导致了领域内数据过多而知识和运用相对缺乏.将系统的观念贯彻到科学实践的每一个步骤--从数据测量、数据采集、数据储存、数据分析到知识发现和实际运用的开发--系统的认识生命系统,在系统模型的指导下进行科学实践,已经成为21世纪医学生物学发展的必然趋势.系统生物学也因此再一次兴起,成为21世纪医学生物学的热点和发展方向.然而在憧憬系统生物学给我们带来无限美好未来之前,我们应该了解到离真正的系统生物学的起飞还有一段距离,这包括了实验技术、仪器设备、分析方法和数据资源构建等多方面软硬件条件的成熟.
-
肺间质纤维化系统生物学研究进展
肺间质纤维化的形成机制目前有多种报道,但其系统发病机制和各种活性因子之间的作用机制仍不十分明确.系统生物学是目前复杂疾病调控机制研究的新趋势.通过综述肺间质纤维化的基因组学、蛋白质组学研究进展,以及系统生物学方法,在肺间质纤维化细胞因子网络时空整合、全局分析等方面进行的相关研究,提出了肺间质纤维化系统生物学研究中急需解决的相关问题,如疾病数据库的建立、共享信息标准化程度的提高和研究团队的建立等.
-
系统生物学在癌症预测、预防和个体化治疗中的潜在应用价值
系统生物学以系统策略和新技术为支撑,运用计算机等方法整合大量生物和医学信息,对生物体内调控细胞、器官和机体行为的网络进行综合、分析与研究.系统生物学的出现使“组学”所产生的海量数据在不同层次得以整合,形成“预测”、“预防”、“个性化”和“参与”为一体的P4医学,可用于以社区为基础的个性化癌症预防、早期诊断和治疗.
-
应用系统生物学方法从次生代谢物作用蛋白受体角度探索吴茱萸的归经研究
目的 以吴茱萸的归经研究为例,构建基于系统生物学从次生代谢物作用蛋白受体角度研究中药归经的新方法.方法 建立吴茱萸的次生代谢物成分-作用受体的复杂网络,以至少与5个化合物高度选择为条件选取蛋白受体,并将受体组织器官分布、功能与吴茱萸归经脏腑循经器官与功效互相比较应证.结果 共获得吴茱萸的次生代谢物高度选择作用的34个受体,其分布和功能与吴茱萸传统归经的循经解剖器官组织归位及功效高度一致.结论 应用本方法从成分作用受体角度说明中药归经的现代科学物质基础及机制,将助推归经相关研究,具有重要的参考价值.
-
麝香保心丸研究进展
麝香保心丸具有芳香温通、益气强心之功效,主要用于治疗心肌缺血引起的心绞痛、胸闷及心肌梗死等,是临床上治疗冠心病、心绞痛的常用中成药.自麝香保心丸上市以来,对其化学物质基础、药理作用及系统生物学的研究从未间断.通过文献查阅及研读,对麝香保心丸的研究进展进行综述.
-
可用于中医药系统研究的药物高内涵筛选分析
药物高内涵筛选分析是系统生物学时代的一项领先技术,具有活体、动态、多指标的综合特点,能够全面反映细胞组学的整体变化,非常适用于中药的复杂成分组成和多靶点作用途径的研究.因此,积极将该技术应用于中医药研究,对发现中药的有效组分和毒性成分,阐明中药的复杂作用机制,促进中医药理论的发展均有重要意义.
-
探讨以“药动学先行”的中药创新模式
中药创新是中药现代化的核心驱动力.如何借助现代生命科学的理论技术实现中药研发的创新,成为亟待解决的问题.目前,国际上正在步入以单一靶点发展为多靶点药物组合,以活性成分筛选转变为药动学优化设计为导向的新一轮研发热潮中.面对研发模式的转变,我国中药的研发多数仍停留在以质量控制、药效活性筛选等初始环节.结合系统生物学和黄芩汤提取物(PHY906)中有关中药研发的内容,引入“药动学先行”这一概念,旨在将药动学作为快速筛选定位中药中具有潜在研究价值活性成分的工具.并进一步对中药研发模式为何需要“药动学先行”以及如何展开这一创新模式研究进行探讨.
-
生物医学新兴学科与中药现代化——现代组合成分药物的研究
中药的特色是通过多成分、多靶点的整体调控作用来系统纠正疾病造成的机体失衡.中药在治疗多基因、多因素引起的某些复杂疾病方面相对西药(通常是单一化学成分药物)有独到优势.但以天然动植物为来源的中药在质量控制和疗效科学依据方面的不足严重影响了中药在现代社会的应用.目前,组合治疗现代医学和系统生物学的发展为中药现代化提供了新的机会.提出应用现代组合成分药物和组合治疗新概念,科学阐明中药药效的学术观点;并提出综合应用蛋白质组学和化学生物学等生物医学新兴科技从中药中开发现代组合成分新药的技术.
-
金龙胶囊抗脑肿瘤的系统生物学研究
目的：利用系统生物学技术分析中药复方金龙胶囊抗脑肿瘤的分子机制。方法：取金龙胶囊组及空白对照组小鼠的原位脑肿瘤组织样本进行基因芯片检测，通过比对获取差异基因；使用一步过连通测算和多步骤隐藏节点测算获得拓扑基因；采用富集分析法分析其生物功能；借助MetaCore平台构建分子机制网络图。结果：与对照组相比，金龙胶囊组共有37个差异基因（倍数>2），106个拓扑基因。金龙胶囊的靶点主要集中在细胞粘附和凋亡、免疫应答、神经组织发育等。结论：金龙胶囊通过诱导神经细胞特有基因表达和抑制干扰素信号转导发挥抗脑肿瘤作用。
-
网络药理学研究相关技术与应用
近十几年来,新药的发现周期越来越长,新药候选药物转化为临床有效新药的速率也显著下降,因此从新的角度去认识药物作用机制、采用新的方法发现新药成为了科研工作者们亟待解决的问题.网络药理学与传统药理学大的区别在于它是从系统生物学和生物网络平衡的角度去阐释疾病的发生发展过程、从改善或恢复生物网络平衡的角度认识药物与机体的相互作用并指导新药的发现.
-
系统生物学与中药现代研究(一)
传统医药在疾病治疗中起着整体调节的作用,从整体观来认识,中医药与系统生物学是一完美的整体观的匹配.在中药现代研究开发中,应用系统生物学方法研究中药的药理作用、作用机制、药物安全性和配伍规律将是十分重要的.代谢组学正在快速发展,它将是系统生物学研究中的关键技术.因此,它将是研究中药的有用技术.现介绍一些系统生物学的基础概念和代谢组学应用中药现代研究的一些设想.
-
系统生物学与中药现代研究(二)
传统医药在疾病治疗中起着整体调节的作用,从整体观来认识,中医药与系统生物学是一完美的整体观的匹配.在中药现代研究开发中,应用系统生物学方法研究中药的药理作用、作用机制、药物安全性和配伍规律将是十分重要的.代谢组学正在快速发展,它将是系统生物学研究中的关键技术.因此,它将是研究中药的有用技术.现介绍一些系统生物学的基础概念和代谢组学应用中药现代研究的一些设想.
-
中医证候辨证量表制定的探讨与研究
辨证论治是中医临床诊病的核心,而"证"是患者就诊时疾病综合情况的概括,它反映了病证发展过程中某一阶段的病理变化本质.中医辨证强调对病情资料的全面收集和综合分析,从各个方面体现机体的整体状态,用多个不够精细的模糊信息整合成总的病理状况.
-
脑卒中的代谢类生物标志物研究进展
近年来，分析多种生物分子的“组学”技术受到广泛关注［1-9］，组学作为一些种类个体的系统集合，如构成生物体所有蛋白质的组合即蛋白组学和构成生物体所有代谢物的组合即代谢组学和已经成为还原现象本质的重要方法。目前研究较为成熟的有转录组学、蛋白质组学和随之延伸出的代谢组学及多肽组学等。其中，代谢组学作为研究细胞和生物体代谢中间体和终产物的新学科，是快速发展的系统生物学学科，在诸多生物医学研究中越来越受关注［10］。代谢组学以细胞、组织或生物体等生物体系为研究对象，观察其受刺激或扰动后的代谢产物变化或其随时间的变化，为除基因组学和蛋白质组学以外提供有用定量信息的检测工具［10］。该技术已经广泛地运用于心血管病［11］、糖尿病［12］、肾脏变［13］及肿瘤等［3,14］疾病的研究中，并在多种疾病的诊断以及病理生理机制的研究中取得了重要进展。其中，有关脑卒中的代谢组学研究发现，发病过程中多种代谢物的浓度发生了显著变化，包括与糖代谢、氨基酸代谢及脂类代谢等有关的内源性小分子物质。本文将对近年来国内外代谢组学与脑卒中的相关标志物研究作一归纳。
-
肺癌中医证候的系统生物学研究进展
肺癌是常见的恶性肿瘤之一,据《中国201 1年恶性肿瘤登记年报》报告显示:2011年全国肺癌新发病例约65.1万例,死亡约52.9万例,分别占恶性肿瘤新发病例及死亡病例的19.3％及25.0％,均居恶性肿瘤第一位[1].其中非小细胞性肺癌(NSCLC)约占肺癌总数的85％,而大多数非小细胞肺癌患者,在确诊时已处于进展期,存在近处或远处转移的不可治愈的阶段,缺乏相关早期检测、高转移风险和不满意治疗导致各个阶段5年存活率仅为15％[2].如果确诊时病变局限,生存率可以提高到50％以上[3].因此,早期发现、诊断、治疗至关重要.本文综述了系统生物学中蛋白质组学、代谢组学、基因组学与肺癌中医证型之间的联系.通过研究系统生物学与肺癌在中医证候中的意义,来帮助提高中医诊疗的水平及疗效.
-
方剂图论和拓扑学:方剂结构的化学图论和分子拓扑学原理及其研究方法
方剂现代研究的一个核心问题是在现代药物科学意义上阐明经典方剂的配伍原理并解析其结构和构-效关系,并据此建立一个关于经典方剂学理论与现代药物科学的多组分药物理论和新一代网络药物理论相互融合、统一的药物科学理论及其用于筛选新型多组分药物和新一代网络药物的定量设计模型和方法.有关方剂的配伍原理和机制,已有学者从多学科和不同的角度进行了一系列的研究,提出了包括网络方法在内的许多新的观点和方法,而现代药物科学基于系统生物学的多靶点和多组分药物的研究与经典方剂的配伍思想和理论表现出了完美的一致性.由此,一方面,经典方剂学理论及其配伍方法可以为多组分药物的研究提供宝贵的经验和先导[2-3].
-
运用系统生物学促进中医证候学研究
中医学为中国人民及全人类的健康做出了不可磨灭的贡献.由于受到历史科学条件的限制,中医学内在规律及疗效机理尚不能用现代科学进行解释.证候是中医学里面的重要内容,如何阐释证候的内涵,对于发现中医学与现代科学之间的联通桥梁,进而推动中医药理论的源头创新,具有重要意义.由于系统生物学的自身特点,使得从系统生物学角度来探索疾病的中医证候不仅成为可能,也具有重要的现实意义.中医药学本来就是先进的系统生命科学认知体系,"证"的研究正好可以和系统生物学理论相结合.
-
兄妹肾阳虚证温补作用的系统生物学研究
目的:引入系统生物学的观察方法,研究温补药物治疗肾阳虚证兄妹疗效的分子生物学特征,探索基因芯片在中医诊治学中应用的可能性.方法:用40项肾阳虚证量表和40项寒证量表,调查一对兄妹在治疗前后的症状积分;用18816点阵的基因芯片测试在治疗前后的基因表达水平.结果:评定兄妹温补之后肾阳虚与寒证症状的积分下降1/3～2/3,得到在兄妹治疗前的差异表达治疗后入正常值的84条共同基因,其中38条已知基因功能,包括免疫、生长发育等6类.讨论:肾阳虚与寒证治疗效果可以用38条共同调节的基因表达水平和量表积分来分析,两者之间的相关关系值得深入探讨.从系统生物学的观点,用基因差异表达来评价辨证治疗疗效,为中医证的疗效评价提供了一个新的方法.
