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中医临床研究方法的思考与实践——系统生物学湿干研究模式与中医临床研究
海量生物信息获取和计算机技术的发展使得系统生物学的湿干研究模式成为可能,干性的计算机模拟和模型研究一般基于海量的生物学实验数据如基因组、蛋白质组和代谢组的湿性研究,希望能获得高于每一单一数据的生物学知识和系统模型,并能指导新的实验研究.从而形成循环上升的计算机模拟和实验相结合的系统生物学湿干研究模式,大大提升了系统生物学研究生物复杂巨系统的能力和效率.一直以来,传统中医药学的研究以临床诊疗实践为核心,对临床诊疗经验的总结、归纳、提升和再运用,形成了中医药理论发展和研究的主要成功模式.如何利用现代信息和计算机科学技术,依据海量临床信息,在计算机辅助下进行基于数据的干性模拟研究,革命性的提升传统中医学"从临床中来"再回"到临床中去"的能力和效率,这是关乎中医药学发展的重大科技问题.本文对中医临床湿干研究模式的思路进行了探讨,提出基于数字化手段的中医临床科研一体化体系,并着重分析实现中医临床科研一体化的湿干研究模式技术框架和初步研究实践.
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现代中药研发中的文化碰撞现象与系统生物学思路分析
本文从认识论与方法论两方面,探讨了现代中药研发中的文化碰撞现象与系统生物学思路.提出在世界一体化的宏观背景下,我们既要认识科技文化多态性的这样一个事实,又要以"疗效中心论"为基础,重视本土科技文化的发扬,不要盲目发展"高"、"精"、"尖"而忽视复方制剂的研究及其可能产生的社会经济效益.在新的医学模式下,我们还应大力发展系统生物学,使之与传统医学互补,从而推动传统医学研究方法的变革,在此基础上才有可能发展出更好的现代中药研发方法.
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系统生物学在中药ADME性质研究中的应用
本文从中医的研究角度综述了系统生物学的定义、研究框架、范围和方法论特点,并以PB-PK和PBPD研究为实例,详述了系统生物学方法论在药学研究中的新应用和进展,阐明了系统生物学是还原论基础上的整体论.中医药是中医整体辩证理论指导下的复杂体系,拟乘系统生物学之势将面对诸多基础问题的挑战,然而中药ADME性质的阐明将成为中医药系统生物学研究的基石,从而将分子水平和整体水平有力地衔接起来.本文中同时简略地综述了作者研究组在该领域的有益尝试,结果表明中药的早期ADME性质研究方法将是揭开中药之谜并过渡到系统生物学水平的有力手段.
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中药质量控制和评价模式的发展及系统生物学对其的作用
本文综述中药质量控制和评价研究的进展,回顾了我国中药质量标准的历史和现状,并描述了中药质量控制和评价模式向"整体"、"综合"的发展趋势;介绍了具有"整体"特征的指纹图谱在中药的真实性鉴别、质量的一致性和稳定性评价和控制及与药效相关性研究中的应用;描述了系统生物学的各种"组学"在中药材的种质资源和质量控制、中药整体药效物质研究及中药的安全性评价和预测等方面的研究进展.系统生物学的引入将促进中药质量控制和评价模式的发展.
关键词： 中药质量控制和评价模式 中药质量标准 中药指纹图谱 系统生物学 -
2型糖尿病定性模型的建立及应用
糖尿病是一类复杂性疾病,针对糖尿病病理机制的系统建模以及在此基础上的血糖控制策略研究一直是糖尿病研究的重要方向之一.本文针对2型糖尿病治疗药物及其作用分子网络,结合2型糖尿病的病理机制,建立一种2型糖尿病定性模型,以期为2型糖尿病关键靶点识别、糖尿病复方药物的优化提供新的思路.
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药物基因组学、药物代谢组学与辨证施治
药物基因组学(pharmacogenomics)和药物代谢组学(pharmacometabonomics)作为系统生物学中的两个新兴学科,对于中医疗效和安全性进行科学评价具有广阔的应用空间,她们同样以整体和动态的观点来认识、解释、进而预测个体对药物治疗的效应,它们的发展将有力推动个性化治疗,尤其是两者与中医学的辨证施治思想相结合,必将促进现代药物治疗水平的提升以及未来医疗模式向系统化转变,极大地促进中医药学科的现代化发展.
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基于系统生物学探讨中医气化学说在糖尿病的应用
目的：从“系统生物学”角度探讨中医气化学说在糖尿病的应用。方法：系统论述现代医学及传统医学对糖尿病的认识，讨论系统生物学、气化学说与糖尿病的内在联系。结果：糖尿病作为一种全身内分泌代谢综合征，气化失常是糖尿病发病的关键环节之一，涉及消化、血液、免疫、神经、内分泌等多脏器、多系统，系统生物学技术可全程监测物质能量代谢产物的变化，在糖尿病早期诊断、并发症的早期预警和预后判断及药效评价研究方面有不可替代的价值。结论：系统生物学技术为探讨糖尿病气化失常提供了新思路、新方法。
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基于系统药理学的现代中药研究体系
由于系统生物学的高速发展,以及系统生物学对现代药理学领域的深刻影响,近年来正在形成一个新兴的、跨学科分支,即系统药理学(Systems Pharmacology).然而系统药理学无论在理论和方法上均不成熟.尤其是,如何将系统药理学的思想和理论用于中药研究尚缺乏探索性工作.本文将综述当前系统药理学的新进展,同时结合研究者的实践,重点介绍如何将药效学、药动学以及网络、组学以及系统分析综合起来,形成一个统一的完整的、可供开展中药药理学、药效学的预测和验证研究的系统模型.从而为从系统水平研究和分析中药和机体的相互作用,以及新药开发、靶点发现、新的治疗策略等提供新的研究方法.文章后介绍了研究者新开发的中药系统药理学数据库和分析平台软件.
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运用系统生物学研究中医证候的思考
中医的现代化研究和中医理论的更深层次的发展离不开中医证候的研究,而当今对中医证候的研究多注重于某一证型或某一层次的研究,缺乏从整体上或宏观与微观相结合对证候的系统性研究,系统生物学的引入为中医证候学的研究提供了契机,并提供了科学的技术和方法.
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系统生物学与中医药学研究
用系统的思想和方法对多基因复杂性疾病进行研究的关键是要采取中医的整体性策略,完整地把握人体水平的病理生理变化特性,并进行"自上而下式"的还原分析,直至在分子水平上阐明疾病的发生和发展机制."系统生物学"的研究方法更符合多基因复杂性疾病的特点,能够充分发扬中医学的优势,有力推动中医学和西方现代医学研究的汇聚和融合.
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糖尿病肾病中医证候的现代研究
糖尿病肾病是糖尿病重要的微血管并发症,目前尚无令人满意的西医治疗方法.中医中药在糖尿病肾病的治疗上具有一定的优势和特色.中医证候是辨证论治的核心,是中医学对疾病的定位及定性,决策了疾病的治疗方案及用药配伍方法,是现代医学探索中医学、联合中西医的关键切入点之一.运用现代医学的研究技术与手段使糖尿病肾病的中医证候逐步实现客观化及量化,对中医药在糖尿病肾病的认识、诊治及提高疗效中至关重要,更有利于推进中医药发展并促进中西医结合.据此,特结合近年来有关糖尿病肾病中医证候的研究概况,依次从其现代研究方法及证候分布情况、证型与理化指标的相关性,以及代谢组学方法在中医证候研究中的应用3方面展开论述,以期为糖尿病肾病的现代医学研究及临床诊疗提供新思路.
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采用复杂网络方法研究腧穴配伍的可行性探讨
腧穴配伍应用是针灸取得临床疗效的重要基础,本文分别从腧穴配伍的方式、作用属性和作用机制等方面对目前腧穴配伍的研究现状进行了综述,提出“整体性”“非线性”是认识腧穴配伍的关键.同时,笔者借鉴和结合目前复杂网络在中医药领域已有的研究成果,探讨了未来采用复杂网络分析技术开展腧穴配伍文献研究、腧穴配伍生物学数据整合研究的可行性,提出采用现代复杂网络分析方法可能是深入认识腧穴配伍规律和机制的有效手段.
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系统生物学与针灸现代化
作为以整体性研究为特征的一种大科学,系统生物学将对我们目前所认识的生物体系产生深远的影响.针灸现代化研究紧迫而任重道远,然而迄今为止所进行的针灸现代化研究,只能证明传统医学中的部分内容.系统生物学的研究方法和技术可能为通过现代科技手段证明针灸理论和效应提供思路.
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组合药物——现代药物研发的新趋势
人体是一个复杂的网络系统,疾病往往是多个因素综合作用的结果,其发病机制可理解为多途径、多靶点的网络变化,单一靶点的药物治疗模式已不能满足复杂疾病的治疗要求.系统生物学、网络药理学等网络科学的提出,为组合药物的研制和开发提供了强有力的理论和技术支撑.该文将组合药物作为关键问题,介绍了现代组合药物的缘起、概念及目前中、西药物的发展趋势,明确指出组合药物的产生是人体复杂生命系统以及多致病机制的客观要求,其融合了中、西药物的优势特征,是现代药物发展的新趋势,具有广阔的开发和应用前景.
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基于系统生物学“进化树”中基因探讨特发性肺纤维化治疗新靶标构成
系统生物学是通过运用系统论、实验、计算方法整合来研究生物系统的组成与结构、动态的生物学科.20世纪提出了“系统”的概念,并阐述以系统论研究生物学的理论、数学模型与应用计算机方法等.系统生物学不同于个别的基因和蛋白质的分子生物学.宏观上与中医整体观有着异曲同工之妙.系统生物学时代的到来为特发性肺纤维化的中医研究创造了有利的条件并提供了新的研究方向.文章意在借助新时代下生物信息和高新技术,将特发性肺纤维化中医研究带入崭新的阶段,并由此带动中医药学科发生质的飞跃.
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脾阳虚证中阳虚症状群的实验评价
目的:客观评价脾阳虚证大鼠的症状,构建证候系统生物学的动物模式.方法:新生24h内大鼠,腹腔注射等比剂量的131I放射,切除甲状腺,施加胃肠负荷,按生物行为学特征定量观察脾阳虚证候的主要症状,分析产热低下对各症状的决定作用及症状问关系.结果:消瘦(P＜0.01)、形寒(P＜0.05)、肢冷(P＜0.05)、倦怠(P＜0.01)与甲状腺机能低下呈正相关.高脂饮食和隔日禁食加重形寒症状,番泻叶加重倦怠却缓解形寒.消瘦-倦怠(P＜0.05)、肢冷-倦怠(P＜0.01)、形寒-肢冷(P＜0.01)间呈正相关.结论:脾阳虚证具有一般阳虚的症状群,在表症候组学上符合系统生物学规律,是构建中医证候本体的重要线索.
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湿热证的现代研究进展
湿热致病由来已久,在许多疾病中湿热证都占有很大比重.中医对于湿热证的辨证依赖于望、闻、问、切四诊信息及专家的经验,难以量化,大大制约了中医药的现代化.文章从动物实验和临床实验两个方面总结了湿热证的现代研究进展,以期为临床识别和防治提供更客观直接的依据.
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基于系统生物学组学技术的缺血性脑血管病中医药研究新思维
系统生物学是一种整合型大科学,它从系统水平来分析和研究生物学系统;中医学的核心是整体观念和辨证论治,两者的本质具有较好的一致性.系统生物学组学技术为缺血性脑血管病中医药研究提供一个很好的平台,为缺血性脑血管病中医药防治进行有效的指导和反馈,也将成为今后中医药防治缺血性脑血管病现代化研究的重要方向.
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转化医学在现代中医药中的应用与思考
转化医学核心是指从实验室到病床,再到实验室.将这一国际医学领域新概念引入中医学,对其现代化发展将具有深远意义.中医学与转化医学结合模式可建立在整体观、辨证论治的基础上,从系统生物学和个体化医学的角度打开研究思路,鼓励多学科交叉,从而实现中医学的转化.笔者以多年来实践为例,以慢性筋骨病推广方案、中医理论与干细胞结合研究、中医临床与转化医学研究模式探索等几方面为切入点,阐述了转化医学在中医药中的应用,并展望了中医学与转化医学结合的未来将立足于“治未病”,并将与西方医学殊途同归.
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肿瘤系统生物学的发展与中医药的现代化
系统生物学(systems biology)是随着生命科学飞速发展而形成的一门新兴生物学分支,它是研究一个生物系统中所有组成成分(如基因、mRNA、蛋白质等)的构成,以及特定条件下这些组分间相互关系的学科.
